BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-265K21.T7 (MSMg01no265_k21.b1) | MSMg01-265K21.TJ (MSMg01no265_k21.g1) |
ACC | AG406878 | AG406879 |
length | 754 | 1,472 |
length of high quality (start - end) | 315 (46 - 360) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no265_k21.b1 PHD_FILE: MSMg01no265_k21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:03:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no265_k21.g1 PHD_FILE: MSMg01no265_k21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:03:15 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAATGATTCTATTGGATTTAATATATTAAGCAAGTAATACTATTTA
CATATTTGTAGCTTAATAGGGCATTATCATAAGTACAAAACTAAAACGTG
CATATTTCTTCAACATTGTGTCAGATACACTGTTTTACAGTTCTCTTGTT
CAGCCTTGTTGCATACCAACTACCCCAAGACATTTTTGTTTTGTTTTGTT
TTGTTTTGTTTCTTCTCAAAAGGAAAAAAAAATTGTTTTGAAATAAAAAC
GTGTTTTTTTTTAAGTGGTATATGTTATTAGTTACCATTAGCATCTGCTC
TTATAAAAGGTTAGNGTCNGTATCCACAACTANCGCAATTCAGTAGACTT
GGTGAATGTGCAAGCCCACCCCCAAGAAAAAACAAAAACGAAAAGGTAGA
ATAAACTAGCAATTGTATTCTTTCTTGTAGGAAACCAACAATAAGCCATG
TGGCAACAATTCGTCAGTTAAATTTCAGAGCTTCATGTTATGCAAAAAAA
TAAATCCTGCTGTTATACGTGACAGTGACATTGTGCTGAAAATTCAGCTG
TTCCACACAAATGTTGTATATCCTGTAAATTGATGTCTAAAGATAGTTTT
GTTCCTTAATAAAGTGTTGAATGTCAATGTTGCTAAAAACCTTTAATTAT
TCTGAAAATGATTTTACCATCCCATTTTGTTGAGCTCAACTATAATTTAA
TATA
| TAATTGGGATGGGGGAGCGGCGAGGGTAGCAGGGGGAGAGGGGAAGAGAA
CNAGACGATGAGAGCTGATAGAGGAGGCAGGATAATGGGAGAGGGAGAGC
GGGAGGGCATGAGCGCGGACGCGGCGGAGGGAGCCGAGGGAAGGATTACG
GTGTAGAAGCGCACGCTGAAGACAGCGTGCTCGGCGGCCGAGGTACATCA
GAGGCCGTAACCGNTGTTCTCCATATCACTGCGTGAGCTCGAGGGATGTA
GCGTTCATGGAAGACTAACACGCGTGTGATGTATTTGTGTCTGATTTTAT
CTGTCTGTCTTCACGCTTATGCTGTGGGTGCGAGAGAACAAGACAAGGGG
AGGAGGGAGCGGCCTGAGAGTGCGTGAGCAATCATCTTATACGCAAACAA
GTATAGCGCGCGGGCGCTGGGGACCGGGCAGCGGAGCGGCGTGCCCACGA
CCGGGGCGGCTAGTTTATGCGTGCGCAAGACACATTATTACATAACATAG
ATATAATATATAAAAACACGGAGGCACTGCGTCGGCTAAATCTGTTATAG
AGCACCCGATCGCGGGCGCAAAGTAGAGAGGCCAAGACGCAAACATCAGA
TGAAGAACATGCTCTCAAGAACGTTAGTACGAATTAAATAATACGCGGAG
TCGAGCATGACAAATCTTCTATCAGGTGAAGAGCGTTCGGATAGCGCCGG
CGCTCTCCGAATTAGAATGTTGTGGATCTCTACACAATACTATAGCACGG
TGAGGAAATGCCAGGCGACGTTCGACCGTCTTCTCACAGACACGACAACA
GAGGACGATAGTGAATGTGATATAGAATGACAGCAGCAGCGCTTCATGAG
CCGTTACTATGACGTCTGCAGGTGACAGTACAGCTCGTGCAAATACTCTA
CCATCGATCTATATATCGATGCTCCATGAATCTACGTCGGTAACGAGGCG
AGAGGTGGTGTGAGCGCTCTATTCGCACTTATAATGATGTAGGAGTAGCG
CTGAGTGCGAGAGTGATGAGTGGCGAATATCGAGCAANAGACCAGCATCA
GTACGCGACCTGAGTATAGAATATTATGCGCGGCGGCAGCCAACCCCGAG
CGCGGCGCGCCAACATCGCTCGTCGGCGTGATTCAAGAATTCATAATTAG
ATACTGAGGACTACACATATATAACTATGTGACTCACCTACAGTCTCTGT
AAGATTATATAACTACACGACTACTATACTACTCAACATACGAGCTACCA
ATACACGCGTAGATCTGAGCTATGATGTCTCCACTCTCTGCGCCGCGTGT
GCGTGTGCTGACTGCGCACTCCGTATGCGAATACACACGCACGACATAGT
TAGATGCACACGATTGTACTCGGTATCATATCGTGTCGAGTGTGAATTAC
AGACACTCTCGCACGAGCGCGNGAGTCTATCGCGGTGATACAATTCCGCA
GATTTGCGAANCGCGACAGCAN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 12 10 16 25 34 30 39 39 39 37 37 30 30 30 30 33 33 37 37 37 43 36 33 38 42 36 36 44 43 29 28 28 28 28 37 40 26 25 12 19 19 32 30 48 48 42
42 47 42 50 48 48 48 50 50 50 47 47 47 57 57 44 44 37 37 37 42 48 50 57 57 57 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 50 50
47 47 47 50 57 57 57 43 43 43 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 43 44 44 57 57 57 57 57 57 27 27 9 9 11 27 27 54 57 57 57 57 57 68 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 57 52 57 57 57 59 59 62 57 52 52 52 59 59 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 59 59 59 57 48 59 59 43 43 43 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 47 54 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 27 21 9 9 9 21 19 47 47 47 57 44 44 26 32 30 30 35 32 33 21 34 28 57 57 57 59 59 57 57 57 43 43 43 43 47 59 59 59 59 48 48 48
48 48 48 41 41 39 28 24 14 9 9 9 9 3 0 3 9 3 0 3 6 7 7 9 7 11 7 7 9 9 9 3 0 3 8 6 8 8 17 23 39 40 32 32 23 23 23 34 34 47
39 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 33 19 13 12 9 9 11 12 12 14 12 12 12 16 11 11 11 11 12 9 10 11 27 29 33 12 11 11 12 29 30 34 34 22 17 17 19 21
30 32 32 39 39 34 37 35 36 36 43 40 43 43 37 47 35 43 39 48 48 48 48 48 46 37 34 34 32 30 30 27 28 37 37 37 37 33 33 30 30 31 32 24 30 30 39 39 43 43
37 25 25 25 25 33 34 43 43 43 42 37 31 34 23 28 30 35 39 39 43 43 48 48 43 34 23 23 23 32 34 43 43 43 48 48 43 43 43 39 33 28 22 30 30 25 25 19 20 18
17 14 14 19 19 37 37 37 35 31 32 22 28 33 33 22 24 28 23 28 29 28 29 29 34 24 24 8 8 8 19 22 33 43 48 48 37 39 30 28 28 37 37 26 26 17 17 17 24 20
20 20 30 34 29 23 23 10 10 10 22 13 13 13 23 26 31 28 23 22 30 18 15 15 28 25 28 30 21 21 15 15 15 22 15 15 14 14 9 11 9 10 10 10 14 12 12 16 18 18
25 26 18 13 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 12 14 30 16 10 9 10 10 8 8 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 11 15 10 10 11 11 15 10 15
11 13 10 10 11 11 8 10 8 8 8 7 9 11 13 13 15 12 12 10 17 10 10 10 10 10 10 10 15 12 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 6 7 12 11 8 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 19 19 12 12 12 12 12 12 13 13 10 10 8 8 8 8 8 7 8 6
3 0 3 6 8 8 10 10 12 12 9 8 8 8 8 19 8 12 15 8 8 10 10 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 11 12 10 11 9 11 11 11 9 12 13 13 8 8 8 6
6 8 8 8 8 10 10 10 9 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 10 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 6 7 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 11 10 10 10 17 12 10 8 8 8 8 11 8 8 8
7 7 8 8 8 8 9 6 8 8 8 6 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 8
8 8 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 9 9 10 10 10 8 6 6 6 8 8 10 9 9 10 8 8 6 7 10 6 6 10 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 7 10
9 7 13 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 10 10 9 9 10 8 10 8 6 6 8 6 9 9 8 8 8 8 8 10 10 14 9 9 10 10 6 8 6 6 8
6 6 6 6 6 8 8 8 8 12 9 10 11 11 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 7 7 7 7 7 7 10 8 8 6 6 8 8 10 13 13 14 11 8
8 8 8 9 9 11 8 8 8 11 11 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 9 9
9 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 11 11 11 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 8 10 10
8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 10 8 8 10 6 6 8 7 8 8 6 10 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 6 7 8 10 7 6 6 6
8 6 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 6 6 10 8 8 8 6 6 6 8 7 7 8 8 6 7 8 10 11 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 7
9 9 9 9 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 7 7 7 10 9 9 9 6 6 6 6 6 8 11 18 18 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 9
9 10 10 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 10 7 7 7 8 10 8 8 8 6 6 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 9 10 8 8
6 6 8 8 6 6 8 8 8 7 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 10 8 9 10 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 8 8 10 10 13 11 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8
10 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 14 11 8 8 9 9 9 8 11 9 8 8 8 8 8 12 10 10 10 9 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 7 7 8 10 8 8 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8 10 11 10 10 8 14 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 10 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 8 8 6 7 8
8 9 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 10 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 6 6 6 8 6 8 3 0 3 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6
8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 9 9 8 8 8 6 8 8 8 8 11 8 8 8 8 9 8 8 6 7 10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 7 6 6 8 6
8 8 6 6 6 6 8 8 13 10 12 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 7 10 7 6 8 6 6 6 8 6 8 8 7 8 6 8 8 8 8
9 10 8 8 8 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 6 7 10 10 10 10 8 8 6
7 8 6 8 8 8 9 13 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 9 9 6 6 6 6 8 6 12 13 13 10 9 6 6 6 6 8 8 6 6 9 15 11 11 11 7 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 8 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 7 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 7 8 6 6 6 8 8 8 8 8
9 9 10 12 12 15 10 9 9 8 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 15 13 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 6 6 6
8 8 11 12 10 9 9 9 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 9 3 0 |