BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-278H23.T7 (MSMg01no278_h23.b1) | MSMg01-278H23.TJ (MSMg01no278_h23.g1) |
ACC | AG416107 | AG416108 |
length | 744 | 744 |
length of high quality (start - end) | 239 (128 - 366) | 239 (126 - 364) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no278_h23.b1 PHD_FILE: MSMg01no278_h23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:18:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no278_h23.g1 PHD_FILE: MSMg01no278_h23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:18:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCCTGATTTATCTCAATAATTTTAGAAAGTTTTAAGAGACTTTTGTT
GTTTTGCCAGAAAGATTTTTTCCACGTTAGAATCAAGAAAAAAATGTGCC
CATTCCCCATAGAAAATAGTAAGTAAAGGCTGTATAATTAGGAATACAAT
GAGCTTTCACAATTACACTAAAAAGAGAAATAGGCTTGGGACAAACTTGG
GATCAAGGAAAAAATTCTAGGTCAGATCCAAGGATTAAGCCACAGGTGTG
CCCTATGATAAGAGGAGGCCATGTGTTACTGTTGCTTTGAACTTATAATG
AAGTTATAGATTGATTTTCTGCTTCGAACTTAATATCAACATCCTTCTGC
AACTCCCTCTTTGTGTAACATTTTATCCATGAAGTAATTTTCTAAAGAAC
TTTTGCCTAAGAAGATATAAGGCCAGAGAGAAGGAATAAAGTGTGGTATC
TGGGACTCTGCCCCATCCATCCACCAAATGTATGTGTGTGGTTTGAGGGG
CTCTGCCCTATCCACCAAAAGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGT
ATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATACCCCCCCCCTCTCTTTTAT
ATTTTCTTCATTCCCCCTTTTTTTTCCCCCTCTCCCTTCCTCCTTTTTTT
TTTTTTCTCCCATTTTCCTCCCCCCTTTTATTTTTTTCCCCCCC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTCAATCATTAAGTTGCTTTCA
GTGGCTTTGATCAGCATTCCAGCTTCAAATTTGTCTCCAAAGTTCATTAC
CCGAGGAGACTTGTAGAGTCAATCTTTCAGAATCTCAGGTTTCTTAAACA
TATAGTGGAAATAAAATAATATCCAAAGGAACAGACAGATGGGCCTCCTC
TTATAGACTGCGATACAAAGAACAATGGGAAGGAGGGACAAACACGATAG
CTGGGCCCACAACACAATGACCTCATTAAGTGGAATGCTAATAGAGCCCA
AAGGCTAGCTGTTGTATGTAGACCCCCCGCCCTTGTATTGTCTACTTTGT
GCATCAGCTGACTTTCNGGAGACCCAGTCATCATTGACAGAGTGCGAGGC
AGTTTGGGGTCCACAGAACCATGTTCACGAGGTTGAGTGTTCTAGAGAAG
GTCCAGATGTCTGTCTCCTAATCCTTCTCTCCATATTTGAGACACAGAAT
GTGTTATAGTGGAGAGATGGCAGTTACCTGGAAACAGCTTGATCTACATG
CTTGTTTTCCTTGTGCCACATTCTGCCCTCCTCACCCATCATTTCAAAGT
TGTGTTTTGCACTTAAAAGGGTGCTAGCTCTTAGGCCCTCTAGGTTTTGG
AATCCTCCCAACAGCATCATGACCATTTTATAGGCAAGGGAAAG
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 12 10 15 27 37 37 39 39 37 31 31 37 37 30 30 33 37 33 33 43 41 31 31 30 20 22 8 11 10 14 14 10 10 10 16 11 10 10 10 15 16 22 28 41 47 31
31 31 31 33 33 41 33 24 19 7 7 6 6 6 6 6 6 12 9 9 10 21 22 37 30 34 36 41 48 33 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50
50 50 53 57 59 53 53 41 41 37 37 34 30 18 22 21 16 12 12 11 9 9 6 6 6 8 8 13 25 37 37 37 37 37 37 48 48 57 57 59 59 50 37 37 37 40 40 47 47 53
57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 48 48 48 41 42 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 68 57 57 57 59 47 57 57 57 57 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 54 52 52 52 52 52 52 50 50 50 50 50 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 54 54 54 59
59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 32 32 21 23 18 11 11 11 12 18 28 41 48 54 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 53 53 48 48 28 27 16 14 14 9 12 11 9 9 13 23 21 19 11 11 11 16 16 19 13 13 13 13 18 26 30 34 43 43 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 57 57 59 59 59 57 47 39 39 35 28 28 15 15 11 11 12 29 34 54 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 50 44 32 27 27 36 36 43 47 57 46 42 37 32 32 35 37 39 37 39 39 39 42 42 42 44 57 57 57 57 54 47 48 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59
59 68 57 57 48 48 48 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 50 53 47 47 47 50 59 59 59 43 36 36 43 43 50 59 59 59 59 59 43 39 31 31 40 59 59 59 59 59 59
59 59 59 48 48 48 43 43 43 48 43 43 43 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 42 42 32 32 28 36 30 27 18 28 12 12 12 25 24 42 42 54 54 54 47 59 43 33
33 42 32 35 39 40 43 48 48 43 43 43 43 43 33 33 33 33 33 37 28 26 16 15 10 10 8 9 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 12 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8
10 10 11 13 12 8 8 8 9 9 10 15 21 24 19 15 15 10 10 8 14 10 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 20 13 19 15 15 15 17 17 11
11 15 14 12 12 16 16 9 12 8 8 7 7 8 8 8 8 10 8 8 10 26 22 34 28 19 19 10 9 9 9 13 13 16 11 10 9 9 10 10 12 12 14 14 | Open.Hide.10 10 14 15 11 8 8 8 8 13 18 36 37 41 41 37 37 44 37 37 37 37 37 37 39 39 39 39 39 30 26 13 13 8 8 8 8 8 8 10 11 19 19 37 30 30 37 37 36 36
36 33 33 33 50 42 41 27 22 8 6 6 8 8 15 12 11 11 16 12 14 24 24 31 31 48 48 53 22 22 8 8 8 22 22 48 48 53 57 57 59 59 59 59 59 59 50 42 37 36
36 36 59 59 59 59 59 50 50 37 37 37 26 26 12 12 11 11 11 12 9 9 9 9 9 11 23 25 41 46 46 47 48 48 48 47 47 53 53 57 57 59 57 57 53 53 53 53 57 59
57 53 50 68 68 48 48 47 46 54 48 48 54 57 57 54 54 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 37 37 46 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 54 54 48 48 48 59 59 57 57 57 59 57
57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 46 46 43 36 28 23 14 14 14 28 21 28 40 43 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 53 53 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 47 27 27 11 15 12 9 7 6 6 6 6 6 8 12 12 11 11 11 11 10 6 6 6 7 6 12 15 12 21 30 41 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59
59 59 59 57 50 50 50 48 47 47 47 47 59 27 29 3 0 3 27 23 37 37 37 25 25 12 11 11 11 12 12 13 18 22 19 25 25 32 47 48 59 47 28 24 11 11 11 18 18 20
23 28 37 47 59 59 59 54 54 43 59 43 43 46 46 42 42 39 46 42 47 48 59 59 59 54 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 46 48 47 43 39 39 43 43 43 44
43 57 59 59 59 48 43 47 43 47 48 59 47 47 47 47 59 59 44 37 39 44 44 44 47 59 59 59 59 44 47 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 48 39 39 35 35 39 39
43 48 48 46 39 39 34 28 23 28 25 25 32 36 36 37 37 37 37 37 43 43 40 41 40 39 39 39 39 28 28 37 39 39 41 41 40 39 43 39 39 40 43 43 48 48 48 48 46 47
37 37 37 30 30 39 39 39 41 32 31 21 12 12 15 19 31 33 36 36 39 47 39 39 38 34 34 32 37 32 30 30 24 28 28 28 28 37 43 59 59 59 37 34 34 28 22 20 33 37
36 36 36 36 31 36 34 34 30 30 30 22 18 16 21 21 24 31 18 15 10 12 9 10 13 23 23 33 33 33 22 20 16 16 19 21 18 27 24 28 28 30 22 22 23 28 20 24 24 20
18 16 16 16 19 24 28 28 28 19 22 23 28 32 31 28 28 23 25 23 34 23 25 25 34 32 36 34 37 24 24 20 16 20 24 20 20 20 12 11 11 8 8 8 |