BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313H10.T7 (MSMg01no313_h10.b1) | MSMg01-313H10.TJ (MSMg01no313_h10.g1) |
ACC | AG435382 | AG435383 |
length | 1,290 | 1,318 |
length of high quality (start - end) | 263 (494 - 756) | 377 (71 - 447) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h10.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_h10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h10.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_h10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNGCGTACATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTAAAGAACTGTAAGTTGATAGAAAGGGGGAATAAGATTAGGCAAAA
GACACTGGATTGTAGAAAAAACTGCCCAATTAGATCAACCTGTGTATTTA
AAAGTTGTTTTAATGTCAAAAGTCAGAGACTTTCATAAGTCTTACACAAT
GTAAGAAGTTTTGCTTATGAAAGACTAGGGGTTCCATCAAAATTGATAAA
GATATGATCTAAGTAAGAGAAGCTTCCACCCAAAGGCACAACACAAGGAA
GGAAAAGATGAAAAAAGGGAGCAATGTAAATGACACAGAAAGTACACACA
CACACACACACACACACACACACACACACACCATTGAGGCAGCACAACAT
TTTATCTGAAGAAAGCAAGACAAACTACAATAATTTGTAAGAATACAAAT
TGTTTTTTTTTTTCCCCCCCCGNNGCTATTTGCCCATTATATAAAAAAAA
AGTGAGTGACTCCNAAAAAACTACTATAAGACTCCTACAGCTGATAAACA
CACTCAGCCAAGTGGAAATACAAAATTAACAACAACAATAATCAGTAGCC
CTCTTTTACACAAACTGGCATGAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTTA
CAATAGCCCCAAATAATATAAAATATCTTGATGTCGCTCTAACCAAGCAA
GTAAAAGACATGTATGAACAGAACTTCATGACTCTGAAGAAATAAATTTG
AGAAGATATCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGTAGGG
CTAACCATAGTAAAAATGGCCATCTTACCAAAAGCAATCTACAGATTCAG
TGCATTCCCCATCAAAATTCCAACACAATTGTTTACAGAACTTGAAAGAG
CCACTCTCAACTTTATATGGAAAAGAATAAAAACCAAAATAGCTAAAAAA
ATCCGGTATATAAAAGAACTTCTGTAAGTATCACCATCCCTGACTTCCAG
TGTACTGGCAAGCAATAGTAATAAAACTTGCTTGGTATTGTTACAGAAAC
AAATAGTTCCTCCATGCAATCAATTGGAACCCAAAAATAAAACCCCCCCC
CCTCCCCCCCTTGATTTTGAAAAAAAATCCAACCCATTTAGGGAAAAAAA
AAGGTCTTTTCAAAAAAGGGGTGGCTTACAGGGGGTCCGTCCAAAAAAAA
AGAATAAATCCTCTTTTTCTCCTCTTAAAACCAAATCCGTGTGGTAAACA
CACCCCTCCACTGGGTTTTTTCCATTTATAAAAATTGGGT
| NNNCCCCTCAGCGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTGCAGACAATGCTAGCCTTGAACTCTGC
AGTATATACACCTGCCTCTGACCGCTGTGATGAAAGGCATGCACCACCAT
GCCCAGCTGAGATGAAAGGCATGCATCACCATGCCCAGCTGAGATAAGGC
CTATGGTGACAGAGAAAATATTTTATGATCATCAGGGTCTAGACATCGTT
TGAAAACTTTGGAAAGCGAAGTTTGTATTACTTTGATTGATTGATTGATT
GATTGATTGATTGATTTATGAATCTGTGTGTTAGTGCCCCTTTTCTCCCC
AGGGTCTGTCACCTTAAGTCAGAGCTCACACCTTTGGCTAGTGTATTTAA
CCAGCCTGCTCTAGGGGATCAAAGCCAGTTGAAACAAGTGTAGCATTTTT
TATTCCACCCCCCCCTAACCAATGTGCGCCTTGAAAAAAAGGGGGGGCGN
ANTANTCTGCNNCGNTCCCGTTAGTCTCCTTTAGTTCTCACGGATGAACC
ATGAAGGTTTAAAATAAAAACAAATTGGAGGGAAAATGTTGCCCTTTCCA
GGGCCACGATGCTCCCAGATCAAGTGCCTTAGTGGCAGGGATGGGGAAGT
AGGAACGGCTTAGTTACTGTCCAGTCTCTCTGCAGAGACACCAAGACCTA
GGCAGCTAATAAAAGAAAGAATTTTGCCAGGCCCTACACTTGGGAGGCAG
AAGCAGGCGTATCTCTGAGTTTGAGGTCACCCCTGGTTTACAGATTGAGT
TCCAACTACGTCCGGGGCTACCCACAAAAACCCCTGCCTGAATCCCCCCC
CGCCCTGTCCCCCTTTTTTTTATTTGCAGACTTAATTCATTATTCCCTCT
TTCCTCTCCTATGGTGCATTTTTATTCACATCCACTCTCCTCTTTTGCTT
TCTCTCTCTCACTATCCTTTCTATTTCTATTCTTCTTCCTCATAATTCCA
CGTAATCTACTTCTCCCTCCACTCCTTTATCTCCTATTTCTTTCCACCTC
TCATACCCTTCACTCCCTTCTTTCATATTACATATTTCTCCTCCATCCCC
TTTATCTCTCCCTTTCTCTCGCATTTCAACCCCTTTTTCTCCTTCTCTCT
CCTTCACCCTATCTTACACTTTCTGCTCTTCTCTTACGCATTCTCCTCAT
CTTTCCTCTCACTCCTCTCTTCAACGCTCAATATCCTCACACCTCACTTC
ACTCTATTCTTCTCTCATCTATTATCTCTCTACCTCCTTATTTTCCTTTC
TTCTCTCACATCTATCCG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 14 12 14 12 10 10 8 8 8 10 15 17 22 20 23 23 21 18 24 24 37 37 34 34 42 42 42 42 42 42 42 42 42 39 39 48
34 23 15 13 13 19 23 48 57 57 57 48 48 48 50 50 48 42 42 37 42 37 37 44 44 54 57 57 59 57 59 57 57 53 68 68 68 68 48 48 46 46 39 39 39 43 43 48 48 57
57 57 50 50 50 50 43 43 37 36 42 42 38 38 36 53 59 59 59 41 41 23 23 24 23 14 11 11 11 12 18 16 22 34 37 37 48 37 47 47 38 38 38 38 38 42 42 53 53 53
53 53 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 18 19 21 12 15 18 32 32 57 57 46 57 44 44 37 37 35 39 42 46
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 46 43 43 44 59 59 59 59 57 57 54 57 57 68 68 57 57 57 59 59 59 54 54 54
59 59 59 59 59 54 54 54 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 48 48 48 59 59 47 43 43 43 59 57 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 36 26 18 12 11
11 11 12 12 12 12 19 27 27 47 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 47 43 48 48 59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 50 59 59 27 27
11 9 9 9 12 17 37 37 37 16 14 10 11 11 9 10 8 8 8 8 8 3 0 0 3 29 29 30 30 30 28 28 18 12 11 12 12 12 12 12 11 11 11 19 17 34 35 30 26 12
12 9 9 7 8 8 8 15 26 43 27 29 3 0 3 29 29 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 44 44 43 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 54 47 48 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 57 57 44 44 35 42
44 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 48 57 57 57 59 59 48 48 48 43 36 37 37 37 43 59 35 47
39 37 37 37 39 39 36 37 37 32 29 29 35 43 59 47 47 47 44 44 44 41 39 39 39 39 39 40 46 46 48 59 59 59 59 36 38 34 34 32 29 30 37 37 37 59 59 50 39 41
41 47 47 47 48 39 39 30 37 37 41 59 59 44 59 44 41 41 44 59 59 59 47 47 37 37 30 30 37 41 41 46 41 39 41 28 24 12 11 11 11 11 18 23 29 30 31 31 30 37
39 35 24 26 17 17 30 31 23 21 13 19 17 19 22 22 30 20 30 37 39 39 30 30 24 24 28 24 24 21 23 32 37 37 32 30 28 28 24 26 30 27 26 29 21 24 12 12 12 30
30 23 22 19 22 18 21 15 12 13 19 27 24 28 24 26 24 12 9 9 9 9 10 24 22 18 15 13 11 16 16 26 29 30 28 18 17 18 10 10 10 15 18 18 10 10 10 10 10 12
12 12 19 9 9 9 14 17 25 10 10 10 16 15 9 9 9 12 18 15 27 25 19 16 12 12 12 24 24 28 23 25 22 24 22 26 20 18 16 15 18 17 26 39 37 37 19 15 7 7
6 8 10 10 10 12 16 15 10 12 12 12 22 19 30 27 28 17 10 8 8 6 8 8 8 16 16 11 16 17 18 9 9 8 8 8 8 11 11 15 11 16 11 10 10 11 17 9 9 10
10 10 8 9 8 9 10 8 10 8 18 13 18 24 13 11 11 13 17 15 18 11 11 11 11 12 15 12 11 11 18 11 12 13 17 21 30 25 22 20 17 14 10 11 9 15 12 8 8 8
8 8 8 10 13 11 9 9 7 10 6 9 9 12 8 8 8 8 13 8 10 10 10 10 10 11 11 8 8 10 10 10 10 10 10 9 10 9 11 9 10 11 14 13 10 10 10 11 13 11
11 11 11 11 10 12 11 10 11 10 10 10 9 8 8 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 10 12 8 8 6 6 8 8 12 14 19 19 30 23 22 21 19
20 10 10 10 10 11 8 9 8 8 8 8 9 12 15 18 10 8 8 8 8 9 15 21 12 13 9 9 9 11 12 12 11 10 10 10 9 12 10 15 13 13 8 8 8 11 11 11 15 18
16 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 15 11 10 11 10 10 13 11 10 10 8 8 8 8 11 9 9 9 8 8 8 11 11 8 9 9 8 8 8 9 10 18 23 43 21 17
11 9 9 9 9 9 10 11 11 6 12 7 9 12 12 12 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 9 9 7
8 8 8 8 11 8 8 8 10 15 12 12 10 9 9 10 10 10 12 9 11 8 11 6 6 8 10 8 8 9 11 10 8 6 6 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 16 14 15 8 7 7 7 7 7 15 21 21 10 10 10 21 21 33 33 36 33 39 34 36 36 37 37 42 47
47 37 37 33 42 42 48 48 57 57 54 42 42 43 43 57 57 34 59 47 47 43 46 36 36 25 36 33 50 50 50 50 50 42 42 47 42 42 29 33 36 42 42 43 39 42 43 43 39 33
33 37 42 50 50 57 57 57 50 50 36 36 33 33 33 37 37 27 26 17 15 13 10 13 10 21 17 33 37 39 48 50 59 59 59 57 48 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 37 36 30 28 28 28 40 40 57 48 48 48 57 39 44 35 37 42 57 57 59 59 57 57
57 57 57 57 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 57 57 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57
57 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 59 54 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 59 25 23 18 16 14 14 15 23 19
28 30 34 59 43 47 47 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 53 53 57 59 59 48 48 46 46 47 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 41 27 22 9 13 10 11 15 16 11
6 6 6 11 11 9 9 9 19 14 14 10 10 9 15 19 37 37 41 59 59 41 28 15 12 12 11 11 11 12 12 11 12 12 12 10 13 14 12 9 9 12 13 12 12 10 9 9 3 0
3 0 3 3 0 3 27 27 27 3 0 0 3 3 0 3 27 27 59 59 47 47 47 59 43 43 47 47 59 59 59 57 48 57 57 57 57 59 57 59 57 57 57 57 57 48 54 54 54 54
54 54 48 46 43 40 43 43 59 57 57 57 54 54 54 54 59 57 46 43 43 43 44 57 44 44 37 37 39 42 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 43 43 43 46 47 48 43 43 36 42
42 42 59 35 39 43 43 43 43 48 43 57 43 48 42 37 30 37 37 43 43 37 37 37 34 28 34 34 30 30 19 22 22 34 28 37 30 30 18 18 22 30 27 23 23 20 23 23 22 22
19 19 22 23 24 23 15 15 14 19 19 10 10 10 18 18 20 20 31 26 28 19 19 12 11 11 21 20 28 23 11 12 8 8 8 8 19 21 12 10 12 8 10 8 8 10 13 11 13 11
18 12 12 14 14 21 29 37 47 29 23 10 10 9 10 10 18 23 15 12 10 10 10 20 26 16 16 11 13 11 14 9 9 7 7 8 8 10 10 13 15 12 10 10 10 8 8 8 8 10
8 10 10 11 8 8 8 6 6 6 8 10 10 9 9 8 11 8 8 8 10 10 17 10 15 9 9 9 10 10 8 8 8 6 7 6 10 17 15 15 8 8 8 8 8 10 15 13 6 6
8 8 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 15 16 15 15 18 15 15 19 15 15 12 12 9 11 11 13 9 9 10 9 10 10 11 10 15 11 12 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 19 15 12 6 6 8 22 23 31 28 15 12 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 16 17 17 24 14 14 8 8 8 8 8
9 10 10 8 8 10 8 9 9 9 10 8 10 10 10 8 6 7 8 8 10 8 8 8 8 12 11 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 8
8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 12 11 11 11 10 10 9 9 10 8 9 9 11 10 11
11 10 10 10 9 8 8 8 12 8 9 10 12 22 12 10 11 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 14 12 15 18 22 15 11 8 8 6 6 8 8 9 9 10 8 8 8 8
10 10 8 8 8 8 8 6 7 8 10 10 11 14 8 12 7 9 10 10 10 8 8 8 8 13 9 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 10 6 7 8 8 8 10 10
10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 13 8 10 7 6 8 8 8 8 8 7 8 9 13 8 8 6 6 8 8 11 12 11 11 8 8 11 13 10 8 12 12 9 9 15 15 15 13
10 7 7 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 8 8 8 10 8 8 10 13 8 8 6 6 8 8 8 15 13 13 9 12 9 9 9 9 11 13 19 22 17 11 8 8 10 11 6
6 6 8 8 8 8 9 9 8 10 10 10 11 10 12 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 8 11 8 8 8 8 8 12 10 10 10 7 6 8 10 12 7 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 17 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 17 13 9 9 9 7 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 8 10
11 17 11 10 8 8 8 8 6 6 9 6 8 6 6 10 8 6 |