BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323H17.T7 (MSMg01no323_h17.b1) | MSMg01-323H17.TJ (MSMg01no323_h17.g1) |
ACC | AG441892 | AG441893 |
length | 1,291 | 1,298 |
length of high quality (start - end) | 293 (410 - 702) | 514 (319 - 832) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_h17.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_h17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_h17.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_h17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:04 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCATTCTNNNNNNNGCATTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATC
CGCGGAATTAGGGGACTCCCTGCTTCCTTTATCTGCCTCTACAGCAGAAG
TTCTGTGCCCTCTGTCCTTTCTAATGTCTGGCGCACCGGTCCGTTTACGT
GTAGATTCATGTGTGTTTTGTTTCGTTGTCTGAATGACTGAATGTTCTGT
GTTTCATGTTGGATGCAACCTCTTGGTTTTTGGGCAAAAAAGCTGATAGA
TGGTTTTTTGCCTGAAGGGTTCTCTTGCAATTGTGATTAATGTGTTTAGC
AAATGACAAAGTGCTTTTTATTTTATAAGTATAGCTAGAAAAATTAAAAT
TCTCTGATTGGTCTAAGTGTAGCTGCTTCATTTGGCTTTTTACTGGACTT
AGAGATGTATTATGCTCTGCGTGTCTTCATAGTAAAGTATTAGTTATTGG
GTATGATCAAAAAGTTGCAACACTGGTTACTAGAAAGTAAGTTTTAAATT
GGCAACTCAGGAGTCTTTCAAACACGTGGTATAAAGCAGGCAAAAAAAAA
TTAGGCCTCTAAGGATACTTCTAGTTGAGATAATATTTAATGTGATTCTT
ATCCTAGAAAGTAAATTTGAAGATAAGATTTAAAGCAATATCTCTTTAAT
GAAGCATCCAAGCTTGCCCTGTCATGCATTCATAGGTATAAATTGGCAGC
CAAATCTCGCAATGTGGTGGTCAAGTTTTAATGTTGATTCTAAGGTGATC
AATTGTTTTGAAATTGGGTTTTGCTTTCCCAAAGNTGTAGTTATGGTCTA
ATATTTGTAAAGAAACTTAGTAATTCTAAAATCTGTCCTCTTGGCAAGAG
GAACCAAGTCTCAGAGCAGCTTCTGAACGGTTTGTGTGACTTTCTTTTGT
CTTCCAAACTGTGCCTAAGGAAGCTCTAGAAACTTGCCTCCAGGGGGAAA
TTTCTTTTAGCTGAAAGAACCCTATTGCAGATCTACCCAAAGTTGTTCTA
TTAAAGTTTAATTTCCAAGTTTATAAAAAGGTCCACCCGGCTGGAAAATT
TTTCAGGACTTGCCCTTTGACTTTGCCCACTCCTGTAGTTTTTTAAAATT
TAAAAAATTGTTTTTTTCTTTTGCTCCGGAAAAATGAAAAAAATTTTCTT
CTTAGGAACTGGAATCCCCGAAAAAATTTCTGTGGGGATGTTAAAAACAC
CTTTCTTTGTTTAAAAAAATTTATTTATCTTCCTCTCTTTATAAAAACAC
AAAAATACACTCTTTCCTATATGTTTCTACTGGAGAATATT
| NNCCCAATCTNNNNNNNNATCATGTGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTAAATTCCCTTCGTGA
NCCAGAAGGAATACATGGAAAGCCTTGAAAACCCCTCCCAAACATGTTTA
AAGCTGCTCCATAATCTTAAGGCTCTTAAGTATTTTGCTACTAAATGCTT
TAGTTCAGTAAGCTCAGTTTTAAGTAACATGTTTTATAGCACTTGTTAAG
GAAAAAGGTATAATAAAAATTCTAAGACAAAGACACCCAACATTAATTTT
GATAAATAGCAATGGGATCAGAGGAGATCTTCAAAATCCTATTAAACAAT
AAATTATAGTAAGATAGTTGAGTTATAACCTTAGCAGTCTCTTTTTTATT
TTTAATATCTGATGCTTTTTTAGGGAACATGTTTTGTAAAGAATGTGAAA
ATAAAATCTTTCATGCTGTATTAGACTAAAAGAGAATTATCTGATTTCAA
GGTAAAATTCAGAACTTCTATTAACCACCATGATAGTCAAGGAAGTAAAA
GACACAAAGGTGATTTACCTGTAATCTGTTCAATGCCTTAGTGTGCTCAA
TAAAGCAAACCAAATTATTCAGTATAAATCTATTACAGCTGTGGCTGATT
GTTATCTGTATTTGAGTCTCTGTAGTATAACTTTGGGGAAACATATTCAA
AGCCCACCATCAATCATCAATCAACCTTTTAACTGANATTCATTATCTTG
TCAGGCTAGGAGACTCCGATAAAATGCCTTTGATGAATCCTAATGAATCA
TAACCTCTTTTCTAAGAAAGCAATTAGAAACACAATTTTATACCAAGTAG
ATGATAAATGTAAGGTTTACTCACTAAGTCCATTTTCCAATGTCGTTGTC
TTCTAAGTTAACATTTTAATGATTAATAAAATATACCCTCTTACTACCTA
AAATTGCCATCATTTTGCAGGCTATTACTTGAACAACCCAAGTATATTAA
TAAATGTAAAGGTTTTGGTATTTCAATTTGATTGGCAGGAAAGTGTCTAT
GAAAAAATTTGGGGAAGAGCCCCCATTAGGCCTCAACTTCCCCCTATTCT
ACCAGGGTAAATCCGGAAAAAAACTTATACCCAAATTAGGGTGTGGAAAA
AAACTTTAGGGTCTGAAACCCCTTGGTTTCCCACAAACATCCCAGGATTA
AAAAAGGGCCATTTTTTGGTACCTCTCAAAAAAAACAAATTCTGCCGGGT
TAAAAATTTTAATTCCCTAAAAGGAAAAAACACCCCCGTGTATTTTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 8 9 9 9 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 7 7 7 6 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 8 8 12 8 8 8 21 19 17 24 24 24 30 33 37 37
37 33 30 30 28 16 16 10 9 9 15 15 21 29 30 30 28 30 19 19 14 10 10 13 10 10 13 12 12 10 10 8 8 10 9 9 12 14 10 15 17 30 29 34 34 25 24 16 22 12
11 11 26 26 30 21 18 18 18 30 27 20 19 8 6 6 8 8 9 9 10 10 12 12 12 13 18 19 13 10 6 6 8 22 19 25 10 10 10 19 22 28 36 28 28 34 24 26 14 20
16 17 12 12 12 25 24 39 37 42 26 26 25 21 21 20 22 28 41 41 44 28 36 20 21 17 21 19 20 20 36 37 30 25 23 32 28 31 24 31 20 20 20 20 27 28 36 36 22 22
18 19 14 18 14 26 26 37 30 30 27 34 44 34 34 13 13 13 13 24 32 42 27 30 15 14 14 16 30 32 27 15 12 12 12 13 13 21 21 28 44 44 23 38 38 26 26 21 21 21
32 18 23 32 44 59 59 59 43 35 35 27 23 10 10 10 12 13 32 26 24 24 28 35 43 32 32 14 13 13 21 27 23 38 38 43 43 38 27 27 30 30 14 14 14 18 26 32 32 18
18 18 18 38 32 32 17 17 17 18 28 41 27 28 28 43 43 43 43 50 43 43 43 50 43 44 42 27 27 20 32 32 36 36 32 35 32 28 27 27 20 20 28 28 31 20 20 20 41 31
36 37 42 37 32 32 37 36 36 28 27 20 20 30 24 28 30 44 32 24 11 11 11 18 20 30 25 28 21 13 13 21 25 15 18 17 18 29 32 37 35 39 28 28 15 14 13 13 20 20
11 12 11 12 12 15 15 12 12 12 24 25 34 47 36 39 33 34 32 28 23 23 23 28 32 37 47 43 37 37 35 40 40 57 43 42 37 37 37 42 43 68 68 68 68 68 68 59 59 59
44 44 28 36 39 44 59 54 54 54 54 48 48 48 48 46 59 57 47 47 43 43 43 47 43 43 59 59 59 59 57 57 59 68 68 68 68 68 34 28 10 10 10 25 32 57 59 59 68 68
68 59 59 57 57 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 38 32 17 17 38 41 59 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 59 59 57 57 59 59 57 57 57 68 68 57 57 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 11 11 15 27 27 57 48 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 57 57 68 68
57 57 59 59 59 34 21 13 12 12 26 26 68 68 41 41 18 18 18 41 41 57 57 57 48 57 48 57 57 59 48 48 48 48 48 48 48 46 59 59 43 39 37 32 29 32 17 21 8 8
8 8 10 27 31 25 23 11 11 11 23 23 44 39 44 37 41 44 41 41 44 39 44 44 44 37 39 44 44 41 37 39 35 32 29 34 32 32 32 39 34 30 27 21 21 29 39 59 59 39
28 28 28 28 32 32 37 37 44 44 35 21 21 19 17 18 25 36 36 25 25 25 17 17 17 30 24 21 14 21 18 13 17 3 0 3 23 21 16 13 9 10 15 19 28 28 35 36 39 36
37 37 24 22 20 15 12 10 10 10 10 17 10 26 30 39 30 30 16 12 16 11 11 12 19 20 20 28 28 27 25 19 18 19 11 11 11 16 14 23 9 11 8 8 8 11 10 16 16 11
11 9 12 9 9 9 6 8 6 6 8 11 11 11 11 11 10 10 10 9 9 9 13 14 14 27 25 25 14 13 10 8 8 8 12 13 18 19 12 12 14 21 21 27 13 11 10 10 8 8
10 10 10 8 8 8 9 8 14 14 13 13 14 20 20 28 17 15 14 12 12 10 11 11 12 18 15 9 9 9 8 8 8 11 13 14 24 19 18 13 12 13 11 10 10 9 9 9 9 9
6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 11 17 13 17 11 10 10 9 9 9 9 13 16 14 13 8 10 8 8 6 8 8 8 10 9 12 10 12 9 9 10 10 11 21 14 14 11 9 9
9 9 9 10 11 11 10 9 9 11 9 6 6 6 6 7 7 7 7 8 8 8 6 6 6 8 12 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 9 8 8
8 8 8 8 9 6 7 8 8 8 8 8 8 8 16 11 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 13 9 9 9 12 12 11 12 12 11 10 10 10 19 13 10 10
10 10 10 17 15 16 18 19 14 14 14 14 21 15 12 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 9 10 12 12 10 19 11 8 8 8 7 6 6 8 15 10 15 9 9 11 11 9 9 9
9 9 9 9 10 10 10 9 9 8 8 8 13 13 8 9 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 11 10 6 6
7 7 13 10 9 7 7 6 6 6 8 8 18 21 29 19 17 11 8 8 8 8 8 11 16 15 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 11 8 8 8 8 10 10 15 6 6 6 6 6 8
8 8 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 0 0 3 8 8 8 8 9 9 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 15 6 6 6 7 10 9 10 13 8 8 9 8 10 8 12 11 19 8 9 10
22 19 17 10 10 24 24 35 35 36 37 37 37 35 34 35 38 38 36 36 41 41 50 50 47 47 23 21 9 9 9 9 12 10 10 10 15 10 11 10 13 10 10 10 10 9 11 11 21 3
0 3 15 16 17 8 6 6 13 22 29 24 24 14 14 15 19 19 21 27 9 9 9 12 12 9 9 9 15 13 11 11 11 11 13 12 12 12 12 15 22 21 13 12 16 19 18 22 29 37
37 28 30 30 40 33 33 25 31 24 25 25 37 37 39 33 36 36 32 36 33 33 32 28 29 25 24 18 12 14 19 27 21 31 43 43 37 42 48 50 48 48 32 25 22 23 32 36 39 43
42 42 46 44 44 42 37 35 32 32 32 28 35 42 42 43 35 35 35 43 43 43 24 22 23 25 28 32 35 35 42 32 32 24 27 24 32 24 18 16 19 32 36 42 28 37 36 28 30 28
21 27 16 20 20 32 32 24 17 17 24 27 28 28 25 23 23 27 41 44 40 42 24 23 14 18 18 28 28 30 30 30 30 28 22 22 29 22 23 32 23 32 32 40 30 30 30 39 39 48
48 48 46 46 37 34 22 18 18 24 28 23 18 19 15 12 12 19 21 19 28 28 34 37 43 48 39 39 30 25 24 12 12 28 28 43 40 48 48 43 59 40 37 25 30 33 39 43 46 46
43 43 43 43 43 41 37 32 30 32 32 39 39 46 46 43 32 41 20 28 28 40 44 48 48 48 48 43 46 43 36 31 25 31 31 31 22 28 28 30 30 37 37 39 39 37 47 43 48 48
48 46 46 47 47 59 59 39 39 39 30 27 16 11 11 11 17 17 24 27 27 37 37 35 35 35 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 53 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 59 39 39 37 39 39 59 47 43 43 32 34 20 23 32 32 32 21 20 20 20 27 31 40 46 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 50 50 39 39 39 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 57 57 59 57 57 57 57 57 48 48 48 50 50 50 50 42 41 39 39 44 37 39 44 44 47 47 59 59 59 41 37 37
44 59 59 47 47 50 50 50 48 59 50 47 47 47 47 44 59 44 41 41 44 39 37 37 31 31 37 37 37 37 37 37 39 25 25 3 0 3 23 27 43 43 47 47 47 50 59 46 46 41
39 39 39 37 37 39 39 39 34 28 23 23 23 34 34 37 37 37 37 32 31 39 43 59 44 41 37 37 44 44 39 41 36 36 32 36 31 39 35 34 39 32 37 41 41 31 31 35 36 36
27 17 18 18 17 18 32 36 36 37 37 25 23 19 12 15 10 10 10 19 25 37 37 34 30 37 32 29 23 23 25 20 16 12 12 14 21 19 20 24 15 11 10 10 10 10 18 21 11 11
11 23 19 18 16 11 10 10 10 12 10 11 17 17 21 21 24 24 28 23 23 11 11 11 25 18 31 25 24 14 15 23 21 23 14 14 14 16 16 10 10 10 11 11 15 12 11 10 10 10
14 13 17 12 11 16 14 9 8 8 8 8 16 15 21 15 15 13 12 16 16 16 30 22 18 13 12 12 27 27 24 26 23 14 9 9 11 10 11 13 23 24 21 21 14 14 15 17 12 9
9 6 6 6 8 6 8 6 8 8 11 9 9 11 10 11 8 8 8 17 10 10 9 9 9 13 15 10 8 8 8 10 10 20 13 12 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 9 9 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 16 16 26 24 16 11 11 10 10 13 10 13 8 8 8 8 14 11 14 14 14 9 11 11 12 10 10 10 8 9 8 8 8 8 10 10 10 15 10
10 10 15 11 14 18 18 19 21 13 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 6 8 6 6 8 9 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 17 8 7 6 6 8 6 11 11 10
8 8 8 8 8 8 13 12 8 8 8 8 8 6 7 9 11 11 19 13 21 22 14 15 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 17 23 35
27 17 14 13 13 12 9 9 6 6 6 6 6 8 9 9 9 10 11 21 22 15 13 11 11 11 10 12 9 8 7 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 15 8 8 8 8 8 8 8
11 11 10 11 11 8 6 6 6 6 6 6 11 9 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 17 11 6 6 6 8 6 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 8 8 6 6 6 6 7 7 6 8 6 6 6 7 6 7 7 11 9 8 8 10 8 9 11 9 7 6 6 6 8 14 12 11 7 7 6 6 8 8 8 8 11 10 10 10 |