BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332H16.T7 (MSMg01no332_h16.b1) | MSMg01-332H16.TJ (MSMg01no332_h16.g1) |
ACC | AG448502 | AG448503 |
length | 1,287 | 1,333 |
length of high quality (start - end) | 556 (135 - 690) | 571 (134 - 704) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_h16.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_h16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_h16.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_h16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:58 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGCCGGCTTTTTNNNNNACATTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGG
ATCCGCGGAATTCTGGNGNCAATANNNACCTTCATCGCCCCCCNGGNAAN
CANNNANANATCCANCAGGCATTAAACTCCCTCTGGGATGCATGCTTTCT
AGTAGGTACAAGCAGATATTAAAATGAACAAGCTTGATTTTGTATTTGCT
GATGTGGAAAAACATACATGAAACAGTAAGAAAATAACATGCACAGTACA
GTACTCTTTAGAAGTGTAAATCCACCATTTGCACAGCATGGACATGACCT
TGTGTCTAATCTTCAGCACCATAAAGAAAACAAACACAAACCGTGAGTAT
GCATTATACCCAGGGTACACTTAGGCTAGGTGATTTGTTTTGTTTTGTTT
TGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTAATTTTGAGACAGGGTTCCTCTGT
GTAGCCCTAGCTATCCTGGAACTCTCTCTATAGATCAGGCTGGCCTCACA
TTCATAAAGATCTGTAGGCTTAGATTTCCCAAAACCTAATTGAATAAGAC
TTTTTAAATGCTTCAGCCTCCCTTCTAGCCTACTCACCAAAGTTATGGAA
GAAAGATGTTTAGTAGGACAAGGGGAATGTGAACCTGTTTAGAAACCATT
CTTTGGGGGCAATTCCAAACACAAATCAATAGCGGCAGTCCAGTCCAATC
AGCAAACACCAAACATGAATTAGTACCAGCAGCTTGTTTCAGAAGAAACT
GCCAGGTTCCACCAAATTGGNACAAGTCCGAGGAAGTGTTTTGAAGCAGC
CAGAATACCAGGAGGAAGTTCTTTGACATGTTTCTGTCCCTGAAGTCCCG
AAAAGTGAAAAATTAGAAGACTAGTGAAGACCCCTGAAGATCAGGAAAAA
TTGTAGGAACTACCCATCTAAAAGGGGCCTTTTATGGTTATTGGGGGTTA
ATTAAAATTTTTTTAAAAAAAGGGGTCTTTTAGGTGTAGGACTCATTATA
AAATTTTTTTATTAGAAATTTTTAAAAAAATTAATTTGGATGAAGGGGTG
TCTAAAAAAAGTTTTAATTTTTTTTTTTAGANGTTCTGGTCCTGGCTCTT
TTGTAAGGTGATTAAAGGTTTTTATTGATTTAAATGGGGTGGGGGGATTT
ATTTAAAATTTTTTAAAAGTTTATGATTATGAATAAATNNTNGTAATTTT
TTGTATTCTTTATATTTATCTTATTATTATGTGTTGGTGAATTGGTTGTG
TTTATTGATGGATTATTTGTGGTTATAATGAAATTTT
| CCGCTTTCTTNNNNGCGATGGTTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAGAGCCCTTTGNCTACNTA
GNAAATTCCAGGTCAGCCTTGAGAATATCTGGCGAGACTCTGGATCAAAA
GACAAAAGAAGAAGAAATGAAGTATCGAGCCACCTTTCCTGGGTAAGCGT
AGCTACCACCCCTCACTAGAGAAGCCTCTCCTCACAGCAATTGGAGATCA
CCACAGCTGCCCACAGCTGGATGCAAAGCGGAGATCATGGGAGCCCAGCC
CCAGTGGATTCATCTACATCAGAGCGGCTGCATCTATGCATCAGGGAACA
TTGCAGAAGATGGGGTAGATGCAGGCAGTAGGGGCACTGGAAGATTTTTT
GTTTGTTTGTTTGTTTGGTTTTCTGAGACAGGGTTTCTCTGTGCAGCCCT
GGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAA
TCCGCCCGCCTCTGCCTCCCAAATGTTAGGATTAAAGGTGTGTGCCACCA
CTGCCTGGCGCACTAGAAGAATTTTAAAAGCCAGAAAATCAGACAGTCTG
CTGCAAACAGACAGTCTAGAAATAGCTGCATAAAGGAGACCAGAACAGTG
ACCAGATCAATGGGCATGTTAACGTGAAAGGAGAAAACTCATGGGTCCCC
AACCCTAGACAAAGAGCTCTAGGCAACTAACAGTTACTCAGAGAAAGCCC
CTCATTAGTGTCCTATGCAAACTGATCCACCCTGAATCATATACACACCA
ACCAAAACAGATTCCACTAGTTGTATTTATGTATAATTGGGCACATTGTG
CGCATGTGCACACACACACACACACATATTTCCCCAGAGAGAGAGAAAGA
GAGAGAATAGAAGAGACAGAGAGATAAAGAGATGCTGTATTTATAATTCC
AAGAAAAAACAACTTTTCCTTCTGAGCCGAATAATATTCAAAGGCTCCTA
CTCTTGTTTTTTGTCTACCACTTTCTCTTCCTCTTTCTTCACATCCCATC
CCTACCTTCCCACTCCTCTTTTATTCTCTTCTTTCTCCTCCTCTACTCCC
TTTATACCACTCTCTCTTTCTTCCCTTCTCCTCTCTTCTCCTAACTCATA
TTATCACTTCTATCTTCTAATCTTCCTACACCACTTCTCCTCTACTTTAC
TACATCTTCGACTCCTCTATCTACTTCCCTTTTTACCTCTCTCCATACCT
TTCTCTATTATCGATGACTCAACTTATCTGTTCTACGATCTTCTCATTTC
TCTCTCATATTACTTTCCTTATTCTCGTCAATC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 7 16 3 0 0 0 0 0 3 6 7 7 7 7 8 8 11 10 8 8 8 8 8 11 13 9 8 8 8 8 8 8 22 19 23 28 28 28 31
33 37 37 37 37 33 32 32 32 23 19 13 11 11 17 3 0 3 0 3 21 21 23 3 0 0 0 3 7 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 11 3 0 3 3 0 3 3 0
3 3 0 0 0 3 0 3 0 3 25 25 25 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 9 16 12 10 9 9 9 9 9 10 18 12 24 28 41 50 50 50 53 36 50 50 50 53 38 53 43
43 47 47 47 47 53 53 53 53 53 57 57 57 57 50 50 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 57 57 57 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 42 42 33 33 42 42 43 43 48 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 27 27 12 12 13 29 23 23 23 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 39 39 39 42 46 48 59 59 59 59
68 59 59 59 59 59 59 47 39 39 39 47 59 48 54 46 47 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 59 59
59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57 50 57
57 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 47 48 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 47 47 47 57 59 44 47 47 47 47 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 68 59 59 59
68 59 59 43 48 43 43 43 43 40 59 47 48 48 48 48 48 57 57 57 59 57 53 53 44 34 30 26 17 17 19 30 34 37 31 39 37 37 30 34 28 36 36 37 34 27 26 22 22 21
21 25 32 25 32 20 24 23 27 27 30 22 22 21 16 11 16 17 25 15 15 12 28 28 31 28 32 30 34 30 28 23 20 28 28 41 28 23 12 9 9 14 15 17 21 18 17 17 18 10
10 17 19 25 29 31 28 28 12 12 11 20 12 15 15 30 30 28 19 9 9 9 12 12 14 11 10 10 9 9 10 12 9 9 12 10 13 11 11 11 11 12 21 10 10 9 16 11 11 11
17 13 15 11 8 12 9 9 11 15 19 23 14 14 17 24 22 17 8 3 0 3 13 18 28 28 32 31 31 33 30 18 12 15 11 11 11 11 8 8 8 8 10 14 15 23 26 37 22 22
10 10 10 12 12 10 14 12 13 14 11 12 21 15 20 21 17 15 15 14 18 18 23 15 9 10 9 9 9 9 12 11 12 13 15 10 17 15 10 10 10 13 9 9 9 9 13 11 17 17
19 13 13 10 12 11 13 14 12 16 17 19 8 6 6 11 7 10 10 10 12 9 9 9 10 13 13 8 8 8 8 8 8 17 21 13 15 9 11 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8
10 8 8 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 6 7 11 8 8 8 8 10 7 6 6 6 6 11 10 8 8 12 12 11 16 7 9 6 6 6 8 13 15 8 8 7 13 15 19 15 14
9 9 8 8 8 8 8 8 15 19 13 7 6 8 8 12 17 25 25 15 15 16 11 10 8 8 6 6 15 10 10 9 9 9 9 9 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 6 6 6 6 8 19 17 9 9 9 8 8 6 6 8 8 11 21 22 14 14 14 19 19 13 11 9 6 6 6 7 8 8 10 11 10 6 8 6 6 6 6 9 6 6 6 6 8
8 11 6 13 8 9 9 7 10 8 9 9 10 11 13 18 21 22 19 19 22 25 31 37 37 30 26 15 10 10 3 0 3 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7
7 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 18 8 8 8 8 8 8 15 13 6 6 6 6 8 8 14 21 19 17 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 16 10 12 12 15 15 9 9
8 8 8 8 8 10 15 9 9 9 9 10 11 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 15 15 3 0 0 3 0 3 6 6 6 11 12 12 22
13 8 6 6 8 10 15 8 8 10 6 7 6 11 11 8 8 9 9 9 8 8 7 7 7 6 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 6 6 6 6 7 7 8 8 9 9 9 8 8 8
12 8 8 10 21 11 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 9 12 17 11 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 6 9 9 3 0 0 0 0 3 7 7 8 6 6 6 6 6 6 8 14 6 6 6 7 8 13 13 8 8 9 8 11 9 13 13 15 8 8 8 13 15 17 10 15
15 24 24 28 28 33 37 37 30 28 35 35 36 36 36 44 44 39 37 42 41 23 21 9 9 9 9 6 6 6 6 6 7 8 8 8 13 11 9 9 10 3 0 3 21 21 3 0 3 23
3 0 3 29 23 37 37 37 50 31 31 30 21 21 13 9 9 10 12 6 6 6 6 7 7 12 8 8 8 8 7 7 10 10 20 28 37 33 29 24 9 9 9 9 24 23 39 47 47 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 50 68 48 48 54 54 54 46 46 40 39 39 46 46 50 53 68 68 54 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57
57 57 48 57 44 57 54 54 54 57 57 57 57 54 47 46 57 57 57 57 59 57 59 57 57 50 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54
54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 52 59 52 54 57 57 57 57 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 54 59 59 59 44 42 33 33 42 44 57 57 57 57 68 68 57 68
68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 48 57 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 50 50 57 57 57 57 59 37 37
28 37 37 48 48 43 47 47 47 27 25 11 11 11 17 21 27 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 50 57 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 47 43 37 37 39 39 43 46 59 59
47 47 54 54 59 59 57 47 47 39 39 39 28 28 30 26 26 28 30 37 42 32 34 28 20 20 32 34 42 47 44 48 48 59 59 43 43 43 43 43 57 57 57 59 44 43 43 50 57 57
57 57 57 54 54 54 57 57 48 52 52 57 57 52 52 52 59 57 57 52 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 52 59 57 52 52 57 50 57 52 52 52 52 52 50 50
43 52 52 52 38 44 59 43 52 52 57 52 44 44 33 32 35 43 43 48 57 57 57 57 57 47 47 44 44 44 43 43 43 43 42 42 37 39 32 32 17 17 17 30 24 32 18 18 27 32
42 44 44 43 42 40 26 26 26 32 32 23 24 24 36 29 31 24 25 36 31 31 32 33 33 25 27 27 24 26 30 39 37 48 43 43 36 42 35 37 37 32 30 30 30 28 32 28 35 39
32 32 33 28 28 28 34 32 37 37 37 30 27 30 28 28 27 33 33 31 31 31 36 32 32 48 48 43 59 39 39 35 39 39 37 37 37 34 28 30 28 24 28 28 39 30 28 32 32 23
14 18 14 16 17 25 19 23 20 21 11 11 11 24 23 43 43 39 43 43 37 37 33 30 30 32 32 34 33 30 20 18 15 11 11 12 16 18 16 11 11 11 22 21 29 32 18 20 16 19
14 14 11 11 11 27 22 35 35 25 25 14 22 22 24 20 15 10 9 9 10 10 13 18 25 19 17 10 9 9 9 9 10 16 8 8 8 8 8 10 17 10 10 9 9 10 13 13 21 24
15 10 8 8 8 15 13 10 9 9 13 15 15 17 10 10 11 15 10 16 14 19 19 19 22 30 30 33 18 21 11 9 9 10 9 12 18 23 20 22 12 12 21 23 24 22 20 16 16 16
12 12 9 9 8 10 12 12 13 8 8 8 11 8 8 10 11 9 9 9 9 9 10 12 12 8 8 6 6 8 6 7 8 8 8 9 9 11 11 11 16 15 11 10 9 9 9 9 9 9
9 9 9 8 10 10 13 10 8 12 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 21 16 14
11 14 10 9 9 9 15 10 10 8 8 10 10 10 9 10 10 10 11 9 9 9 9 9 9 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 23 13 11 12 10 10 10 10 9 9
9 9 9 9 10 10 12 10 10 16 16 11 9 9 11 11 11 10 10 10 10 10 12 10 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 11 17
17 11 11 11 14 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 10 11 11 10 11 8 13 8 10 8 8 9 7 8 10 8 9 9 10 11 17 17
13 10 8 8 10 9 8 12 8 10 10 10 8 8 8 10 10 18 19 18 15 15 10 10 11 12 11 12 12 12 11 11 8 8 10 15 15 15 14 13 7 6 8 8 10 9 9 9 10 9
6 8 6 6 12 12 8 8 8 8 8 15 8 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 20 17 15 14 11 12 16 10 10 9 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 10 10 10 11
10 7 6 8 8 15 15 11 8 8 9 8 10 10 11 10 10 8 12 8 9 10 9 6 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 9 10 8 9 10 10 12 12 10 11 8 8 6 6 6 6
10 10 11 8 9 9 10 10 9 10 8 8 8 8 10 10 10 12 7 7 8 6 6 8 8 10 12 15 8 8 8 10 10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 11 10 14
18 13 13 13 8 7 7 7 12 12 12 9 9 10 10 8 8 6 8 8 8 8 12 10 8 6 6 6 6 6 10 10 10 |