BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-335F19.T7 (MSMg01no335_f19.b1) | MSMg01-335F19.TJ (MSMg01no335_f19.g1) |
ACC | AG450635 | AG450636 |
length | 705 | 747 |
length of high quality (start - end) | 336 (271 - 606) | 565 (71 - 635) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no335_f19.b1 PHD_FILE: MSMg01no335_f19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:23:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no335_f19.g1 PHD_FILE: MSMg01no335_f19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:23:06 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCTATCACTCCATAGTACAGATCGCGGATTCTTGTCTTTCCAGACCATTT
TTATGGGGTATTGATTTCTGAGTCACCTTCTTGAGTCTTTTATATATGTT
GGAATTAGTCCCTATCTGATTAGGATAGGTAACGATCCTTTCCCATCTGT
TGGTGGTCTTTTTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAACTT
TGGAGTTTCATAAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGC
CATTGATGTTCTGTTCAGGAAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGG
CTTTTCCCCACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTG
AAGATCCTTGATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATG
GATCGATTCGCATTCTTCTACACGATAACAACCAGTTGTGCCAGCACCAA
TTGTTGAAAATGCTGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTC
GAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTC
TATTCCATTGGGCTACTTGTCTGTCTCTATACCAGTACCATGCAGTTTTT
ATCACAATTGCTCTGTAGTAAAGCTTTAGGTCTGGCATGGTGATTCCGCC
AGAAGTTCTTTTATCCTTGAGAAGACTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGG
TATCN
| ATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTATCCATTAGAAGGGCTCTCCTCCTGGG
AATGCAGTCCCTAAAAGCAGGGGTTATTTCTGTAACTCTGGGCTAGCAAA
CTCTTAACTGANAGGAACTACGGCAGTCTGTCTTCCTTTCTTTTCTCTTT
TGGCACAGATTTTTTTAAATCCCTTTGGAAACAAAGAAATATATGCTGTA
AAATAATCAATGGCTTAAAATACTGGGCAGAAACAGAGATACAAGCAGTT
CTTCTATCACAGGAGTTGCTCCTCCATGATTTTCTGTGCTTCTCTTTGAT
CTGTTAACATGCAAAGCTTTTGGTAGATGGGATCTAAAAATAATTCGTTG
GGCATTTTCTTACCAGAACATGTAATTTTCTAACATGATGCCTTTGGCTG
CTGTACACATAATGATGCTAAGACCAGGGCATTTTCAGAGTTGTAAGCTT
GACTAAATAGGATTGTGATTGTGAGTAATGAAAAGGGAAACCTGATGCTG
CAACCCTTTAATACAGTTGCTCAGGTTGTGGTGACCCCCAGCCACAACAT
TATTTTCATTGCTATTTCATGATTATAATTTTACTACTGTTATGAATTGT
AATATAAACATTTGTTTTCTGATGATGGTCTTATGCAACCCATGTATAAA
GGTCATTGTGACCCCCAAGGGGGATATGACTCCCATACTAAGTACCC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 8 8 10 12 10 10 10 10 10 9 6 6 6 6 10 12 9 8 8 10 10 9 11 12 12 10 11 11 21 21 17 17 12 16 18 11 10 8 6 6 6 8 15 8 8 10
21 21 14 9 8 12 8 8 8 8 8 8 15 8 9 9 18 19 19 19 8 8 8 8 8 11 15 21 28 25 30 25 20 15 13 13 14 11 19 31 31 39 39 39 37 34 21 18 11 19
10 8 8 10 19 19 20 24 28 33 33 41 39 33 33 34 34 18 14 10 16 17 12 8 14 15 9 9 10 10 19 23 25 22 11 11 10 16 19 16 23 10 9 8 10 10 21 17 8 8
8 17 19 21 20 15 15 9 9 12 28 28 41 41 41 37 30 30 22 28 25 41 34 28 24 19 27 13 13 11 11 23 26 37 30 27 20 26 16 16 12 18 12 25 21 16 11 11 18 16
18 12 19 18 21 21 15 18 11 12 10 11 9 9 8 10 10 16 17 23 23 19 19 12 15 15 24 24 17 18 18 23 20 20 20 23 23 28 20 16 10 15 15 18 23 28 22 22 19 14
12 19 18 23 19 15 15 13 13 14 15 15 13 18 18 28 12 11 11 12 11 16 27 36 36 30 32 30 41 41 20 20 14 28 21 25 25 28 33 37 29 32 30 41 41 40 25 18 24 13
14 14 34 34 68 68 57 57 54 54 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 43 43 57 44 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 44 36 31 39 39 39 41 41 50 50
41 41 30 30 39 41 59 59 57 57 57 57 57 57 57 50 48 44 43 40 40 41 41 44 59 44 37 39 39 39 39 39 59 59 59 59 44 41 41 37 37 37 37 37 37 59 48 48 48 53
57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 41 41 44 37 37 39 39 39 39 37 37 41 43
47 59 59 59 59 50 50 50 53 57 57 48 48 48 59 59 47 59 59 59 44 44 37 32 32 37 37 37 32 32 32 37 37 37 37 37 37 37 41 47 47 48 57 59 59 59 59 59 59 57
47 47 23 23 11 18 17 31 34 43 43 40 40 40 41 39 39 39 41 41 44 43 59 43 41 34 31 41 34 34 34 39 40 43 43 44 44 36 36 31 35 31 34 34 41 36 37 37 37 43
59 59 59 33 33 30 30 30 19 11 11 11 15 23 20 39 39 41 47 48 48 48 48 39 39 39 37 37 43 43 41 41 39 36 36 39 32 29 29 32 37 37 28 23 17 13 13 19 22 37
30 22 15 15 10 14 16 16 23 20 20 23 26 26 23 16 11 10 10 17 14 22 28 28 37 30 39 35 32 31 30 24 16 15 11 11 12 23 21 32 19 17 11 11 12 19 24 30 22 25
28 26 9 8 8 8 8 11 16 21 30 18 19 10 10 10 10 12 18 13 13 14 14 14 17 26 20 36 43 59 59 36 36 36 36 23 18 11 13 10 10 11 15 21 28 39 17 10 10 10
9 15 8 3 0 | Open.Hide.11 14 11 11 9 8 7 7 6 6 8 15 16 37 37 39 41 41 37 37 37 32 32 37 37 32 34 18 12 9 9 10 12 9 11 11 13 18 18 32 28 28 19 23 11 11 10 21 21 41
42 41 39 33 25 12 9 10 9 9 9 9 10 18 11 10 8 10 13 23 34 47 50 50 31 31 24 24 16 22 28 33 32 30 29 31 35 44 39 39 59 59 59 41 44 44 44 39 39 37
35 31 37 37 37 37 37 37 47 59 59 44 41 41 44 39 39 39 44 32 31 31 37 32 33 37 37 37 37 44 50 50 50 50 50 42 41 39 44 44 41 41 44 59 47 47 42 42 42 42
42 37 37 37 32 28 28 37 23 23 3 0 3 25 23 32 32 37 37 37 47 47 50 50 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57 59 59 59 57
53 50 53 53 53 53 48 48 48 42 42 47 59 44 44 44 35 35 37 37 37 37 47 47 47 44 44 44 32 32 37 37 37 37 37 46 33 33 33 36 36 36 38 42 53 53 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 43 43 43 44 44 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 57 57 44 40 40 57 57 59 54 54 54 59 59 68 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 54 54 54 48 50 48 57 57 57 57 57 48 48 43 47 39 43 43 48 43 48 48 48 48 47 47 46 41 30 30 25 24 24 28 39 39 41 40 40 46 48
48 48 40 42 42 41 39 39 39 37 34 41 39 39 39 40 41 46 46 41 39 39 35 32 32 39 37 28 28 22 22 24 30 30 20 25 31 30 31 20 20 24 22 28 30 37 37 37 37 37
37 37 47 47 39 44 36 36 36 43 37 37 43 43 43 37 37 28 28 23 30 23 25 25 33 33 39 43 43 48 48 28 28 14 13 13 18 16 20 18 18 21 29 31 24 18 17 17 17 18
19 28 24 24 20 20 22 29 33 33 28 22 30 16 15 17 21 14 16 13 13 10 9 10 10 10 8 8 8 8 11 15 9 9 9 18 15 15 15 15 14 16 13 13 10 10 12 12 16 19
20 17 15 15 19 16 13 6 6 6 11 15 27 21 16 13 15 10 10 10 21 19 15 15 10 10 10 12 10 14 14 15 13 8 8 8 8 8 10 9 9 10 12 15 12 11 11 |