BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-344B20.T7 (MSMg01no344_b20.b1) | MSMg01-344B20.TJ (MSMg01no344_b20.g1) |
ACC | AG457257 | AG457258 |
length | 768 | 746 |
length of high quality (start - end) | 394 (75 - 468) | 511 (71 - 581) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no344_b20.b1 PHD_FILE: MSMg01no344_b20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:34:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no344_b20.g1 PHD_FILE: MSMg01no344_b20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:34:12 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNTTTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCTGATCTCTCTCCNNAAAAAAAAAAAAAAAAGACAAAATGA
CTGAAGTGTTCTAAGAGGATAGAACAACAGGATTTCACAGAGAGTACCAC
ACACACACATGTTATTAGAGTATGTGATGTCTGAGAAAGTGTGTTAACTT
AGTTTTTACTAATTAAAAAGTATTTAGCTATTTTTAGGTAAATCACAATA
GTGTCCATTTCTATGAGAGTTATTTTAACTGAAAATAATTTTGTCTATGA
TTCAGTGACCATTGTTCATTGTAAATTTTTCCCCCCTTTGGTTTTTCGAG
ACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCCAGAACTAACTCTGTAGAC
CAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCACTTGGTGC
ATGCCTTTAATCCTTTANCTGNNATTAAANNNATGNNNCNCTACTGCCTG
NCTCATAAATAACATTTACCTTAATAATTAATCTTTATTCATTTTTCATT
AATAACACATTTCTAAATTCTTTAAACCTTTTTTTTTCAATATTAATTTT
CAAATTTTAATAATCTTTATAATCTCCCACCAAATTTTTATTTTATTTCT
TAATATACATATCTTATATTTTTTCCTTCTTTACTTATATTTCCCCTCTT
TTCTTTAATTTACTTTTTTACCCTATTTCTTTTCCATCCTCTCTTCCTTT
TCCTTCTTCTTTATTATT
| AATGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAG
CACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAA
AACAACCCTAAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAAA
ATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTC
CTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCCGT
CTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAA
TACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGAC
ACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTG
GAAAGAACCTAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGT
ACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATG
AAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGT
AACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGCACTCACTGATAAGTGGAT
ATAGCCCAAAACCTAAGATACCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAAACT
CCTGGAATTCCCGAAAAAGGAAAAATGAGGTGTGGACACCATGCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 11 8 8 8 10 9 10 28 39 37 37 32 31 31 37 39 30 21 20 14 18 12 30 30 27 26 21 21 21 21 27 15 14 15 13 16 13 13 21 16 16 14 14 14
29 30 57 57 35 28 35 35 29 29 31 31 31 30 29 19 15 9 9 9 9 3 0 0 3 21 19 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 42 27 27 26 39 42 43
48 48 57 48 48 48 48 48 48 54 68 57 59 59 59 57 42 41 41 41 41 48 57 57 57 57 57 59 57 47 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59
59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 54 54 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 54 50 50 50 50 54 57 57 52 52 52 57 57 59 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 59 59 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68
57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 52 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 68 68 57 57 57 59 59 57 57 47 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 68 68 57 57 48 48 43 43 43 59 59 59 59 59 59 68 59 59 48 48 48 59 47 43 35 32 32 34 33 32 39 43 59 59 33 33 30 32
24 30 28 36 36 59 59 44 41 41 44 59 59 59 27 29 3 0 3 27 3 0 0 3 13 7 7 7 3 0 0 0 3 27 3 0 0 0 3 0 3 17 19 30 33 33 37 23 23 3
0 3 6 6 8 8 8 22 13 13 8 7 7 7 9 15 15 19 15 19 21 26 31 23 23 30 28 19 19 17 13 13 13 18 18 24 12 10 10 10 10 15 15 8 8 6 8 10 15 18
17 12 11 11 8 8 6 6 6 6 10 11 11 16 17 13 10 9 9 9 9 12 15 16 10 8 8 8 8 10 11 14 16 14 17 14 14 14 14 21 12 12 10 10 9 9 9 9 14 14
11 11 10 15 12 9 12 11 10 13 8 8 8 13 14 11 10 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 9 9 9 12 14 10 12 8 8 8 8 8 10
10 10 15 17 10 10 10 8 10 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 16 10 11 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 11 11 11 9 13 11 11 10 14 10 11 10 15 15
8 6 6 6 6 6 8 9 11 11 12 12 12 12 11 14 15 13 11 8 8 8 8 8 13 13 17 10 10 10 15 20 15 9 9 12 9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 12 22 12
9 9 12 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 8 10 10 9 9 9 19 19 41 37 39 37 37 37 37 37 32 32 39 39 29 25 23 9 9 9 9 9 10 19 19 21 21 30 30 44 48 48 48 47 42 42 42 42 42 43 57
57 57 59 59 41 24 23 36 36 36 40 43 48 57 42 42 41 41 50 50 54 68 54 50 47 50 50 51 51 50 50 50 50 50 50 68 50 50 47 42 46 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 39 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 57 68 68 68
57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 57 53 50 53 53 50 50 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 37 37 37 31 31 37 39 39 36 39 39 42 48 48 48 46 46 43 41 59 47 41 41 41 38 37 37 39 37 37 44 43 43 41 41 41 39 39 37 31 34 23 18 16 27 31
41 47 47 46 47 37 37 30 30 30 29 27 37 37 37 39 37 37 35 39 39 47 37 34 28 25 25 34 28 34 15 11 11 11 12 11 19 28 24 25 31 28 24 24 31 31 27 32 14 9
9 9 9 9 13 31 26 34 23 18 14 11 11 11 14 26 22 25 24 24 22 30 31 31 29 32 31 25 27 22 23 18 21 18 18 12 12 12 17 17 23 19 16 11 11 11 13 13 12 12
14 15 16 18 13 13 12 16 11 9 9 8 8 8 8 8 15 20 16 18 11 11 8 8 8 8 8 10 10 13 11 12 12 12 16 11 11 11 18 8 6 6 6 6 6 10 9 15 10 10
10 12 9 9 9 11 10 10 10 10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 10 11 12 10 12 9 9 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 16 11 23 12 17 10 10 9 9 9 10 8 8 8
8 8 19 14 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 16 19 11 9 10 10 9 9 9 8 9 8 8 8 8 6 7 7 7 7 10 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |