BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-447B18.T7 (MSMg01no447_b18.b1) | MSMg01-447B18.TJ (MSMg01no447_b18.g1) |
ACC | AG535645 | AG535646 |
length | 752 | 771 |
length of high quality (start - end) | 558 (50 - 607) | 442 (77 - 518) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no447_b18.b1 PHD_FILE: MSMg01no447_b18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no447_b18.g1 PHD_FILE: MSMg01no447_b18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:51 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AACCCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCGTGAATGGGTATTGGATT
TTGTCAAATGCTTTCTCAGCATCTAACGAGATGATCATGTGATTTTTGTC
TTTGAATTTGTTTATATAGTGGATTAAGTTGATGGATTTCCGTATATTAT
AATATCCCTGCATCCCTGGAATGAAGCCTGCTTGATCATAATGGATGATT
GTTTTAATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAATTTTATTGAGTATTTT
TACATCGATATTCATAAGGGAAATTCTTCTGAAGTTCTACTTCTCTACCT
TTGTTGGGTCTTTTTGTGGTTTAGATATCAGAGTAATTGTGGCTTCATAG
AATGAATTGGGTAGAGTACCTTATGTTTCTATTTTGTGGAATAATTTGAG
GAGAATTAGGTCTTCTTTGAAGGACTGATAGAACTCTGCACTAAACCCAT
CTGGTCCTGGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTGGGAGACTATTATT
AATGACAATTTCTATTTCTTTAGGGGATATGGGTCTGTTTAGGTCATTAT
TCTGATCCTGAATTAACTTTGGTACTTTATATCTGTCTAGAAATTTGTCC
ATGTCACCCAAGTTTTCCCGTTTTGTTGAGAATAACCTTTTGTCATAAGA
TCTGATTATGTTTTGGATTTCTTCCGGTCCGTTGAAATGCCTCCCCTTTC
TT
| NNCCGATGAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGGCGCGTGTTATTGGCAAAGTG
TTTATGCTGGAAAGGGAAAAAGAGCTAGACTTGAAAAATACAACAGGGAT
TAAGTACCCATGAGAAAACAAGAGGCATTGTTTCAGTAGCATGAACATAA
GTCAGGGACAGATTTGTCTGATGTATTCAGACAAAAGCAGGGCTGATACT
GAGCTTGTGAAGTGAATAAATGGAGAAGAAACACTGACAAGAAGACTTTG
GATATGACCTGGGACAAGTTAGAGACCCAGTGTTGGTTCTGAAGTGAGGA
GATACGTATACAGAACTGGCAGTTTAAGAGAGAATAGCCTGGTCATGGCC
TACATTTGAATGGAAAGAGATTGGATCTAAATTTGCACACAAAGTCACTG
AATGATGCAATGCCTGCACTGGAGTGATTACAGTTGTTGCCTCACTGAAG
GTCTGAGATATCTAACAGTTTTTGGATTAATGGTTCACATCTGGGAGGTA
TCTAAAGTATGACTCTGATTCTTCTCCACCATGTTCTATCTGTTCTTAAG
ACTCTACCACGTCCTCAGAGCAATATTGGTGCTGGTTTTCCGAAAATTTT
ATATGTTGGGATCTGGCAACTGAACTGGTTGGAAAAAAAAACAAATAAAA
TTCTTTCTGAAACGGGCCTTTTTTGTCCCACCGGTTTTAAATAAATATTG
GAGGTTTCCCTCCTTGACAAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 10 12 10 10 11 11 15 22 37 30 30 27 25 25 37 37 37 30 29 37 37 37 43 43 28 28 25 24 20 21 22 11 11 12 12 13 15 28 32 25 19 13 16 16 27
31 50 57 36 36 36 36 50 36 53 33 33 33 33 33 37 43 14 14 9 9 12 19 34 41 42 50 50 50 50 53 53 53 53 42 42 42 50 50 53 53 57 53 53 53 53 53 50 50 50
68 68 51 51 42 42 42 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 47 50 50 50 50 50 50 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68
68 68 68 51 51 50 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 43 52 52 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54
59 59 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 43 24 21 12 15 15 27 23 41 37 37 28 30 30 33 34 32 30 28 33
36 39 36 24 18 13 16 16 25 28 32 28 28 28 34 34 37 30 25 16 25 12 14 15 30 30 30 30 30 37 34 31 29 34 28 28 28 30 24 30 22 28 30 28 28 28 22 33 33 33
33 28 30 28 28 23 22 14 12 12 14 10 12 16 19 17 16 21 24 19 14 11 12 12 16 16 18 16 19 14 14 14 17 22 19 19 20 26 17 20 22 20 10 9 9 15 10 12 14 14
14 15 15 16 11 12 11 21 10 10 10 10 15 14 17 18 10 9 10 8 10 10 19 13 11 11 11 12 12 9 9 10 10 10 12 9 9 9 9 19 19 18 16 9 9 9 8 8 10 12
12 12 18 18 11 10 10 10 10 10 10 14 15 19 12 11 14 13 10 10 8 8 6 7 8 9 9 10 8 11 11 12 11 15 10 9 10 10 10 10 10 13 14 15 10 10 10 16 13 12
12 12 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 12 15 10 10 9 8 6 7 6 6 10 9 17 26 31 39 37 37 37 37 39 37 37 44 39 32 27 27 9 9 9 9 9 8 11 11 12 21 21 41 48 48 48 37 39
39 39 39 39 44 59 57 57 53 48 30 23 10 19 16 22 23 24 24 34 22 36 26 26 41 42 42 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 68 68 57 50 50 57 57 57 57 50 42 42 29 38
38 46 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 54 57 57 57 57 54 59 59 57 43 43 43
43 43 57 57 57 57 59 57 57 57 57 50 50 50 50 59 59 37 37 36 37 32 29 34 41 41 47 47 41 41 41 48 48 48 48 48 48 47 39 35 35 35 43 39 39 35 35 35 39 39
48 48 43 43 43 37 37 33 33 32 34 28 25 25 34 34 35 35 35 37 31 31 32 30 30 28 33 28 28 24 16 16 22 17 20 22 22 28 34 29 24 32 23 23 23 34 27 29 22 22
18 21 20 24 22 12 12 11 15 15 28 28 34 34 24 16 16 15 14 18 24 21 27 24 18 28 24 19 17 15 16 11 10 11 11 16 16 23 28 28 32 28 25 27 17 24 17 17 17 30
23 34 23 20 13 21 14 12 9 14 14 17 22 30 37 19 15 8 8 8 13 18 27 28 18 18 11 10 10 12 15 16 16 17 17 30 19 22 22 20 18 14 11 11 14 18 12 14 9 9
9 11 11 15 12 12 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 16 15 18 14 15 10 10 10 10 10 10 14 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 15
11 8 8 10 8 8 9 16 12 10 17 9 9 9 9 11 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 13 18 21 15 14 12 13 11 10 10 12 16 11 11 10 10 10 9
10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 11 10 8 10 10 13 9 9 10 13 15 15 8 8 9 10 9 9 12 12 11 11 13 10 10 9 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9
10 10 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 7 10 11 11 9 9 |