BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-479E09.T7 (MSMg01no479_e09.b1) | MSMg01-479E09.TJ (MSMg01no479_e09.g1) |
ACC | AG560193 | AG560194 |
length | 753 | 756 |
length of high quality (start - end) | 609 (72 - 680) | 309 (326 - 634) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no479_e09.b1 PHD_FILE: MSMg01no479_e09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:59:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no479_e09.g1 PHD_FILE: MSMg01no479_e09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:59:12 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NGATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCTCCATTCCTGGAGCATAGCACCTTTACAAGACCAAGGGCATC
CTCCCCCCCACCCCATTGATGACTGACAAGGCTATCCTTCAACAGAGGAA
TGCTACATATATACCTAGAGCCACAAGTTCTACCATGTGTTTTCTTTGGT
GGTATAATTCCAAGGAGCTCTAGGGGTACTGGTTAGTTAATATTGATGTT
CCACCTATGGGGCTTTAGACCCCTTCAGCTCCCTGGTTATTTCTCTGGCT
CCTTCATTGGGGACCTTGTTCTCTGTCCAATGGATGACTGTGAGCATCCA
CTTCTGTATTTGCAAGGCACTGGCAGAGCCTCACAGGAGACAGCTATATC
AGGTTCCTGGCAGCAGGCTTTTGTTGGCATCTGCCTAATGGCTGGGTTTG
GTGGTTGTTTATGGGATGGATCAGCACGTGGGGCAGTCTCTGGATGGTGG
TTCCTTCAGGGTCTACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTATTTTGT
TCCCTCTTCTAAGAAGGAACAAAGTATCCACACTTTGTCTTCCTTCTTCT
TGAGTTTCATTTGTTTTGCAAATTGTATCTTGAGTATTCTAAGTTTCTGG
GCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGCGAGTTCCTTTGTGAT
TGGGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGCCTAA
GAN
| CACAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXTGCTCCAAAGGATTCTAGAAAACACCGTGTTTGTCTT
ACAGGATGTGCAACAGAAAGGGACCCCAGAGACTGGTGTCCCTTTTCAAT
GCACTCAACCACAGTAAAAAGTACTCATAATGATATTTTGCCTGCAGGAT
GAAGATGAGCTGGATTCACACACTATGGTGAAGACGAGTTCAGAAAGCGT
GTGCACAATGCGGGCCACCAGCACGATGAGTGAAGGAGCCCAGACGATGA
TTGAACATAACAGCACTTGGTTATAGTCGGACCTGGGGACCATGGTTATA
AACAGTGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGACGGAAC
TATGAAAAGTATGGAGCCCTTTCTCTCTGAATGGTGCTTTTCTCTTTTGA
AAGTGTACTCACGAAAACCAGGATAAATTCTGTTTCTTTTTAGAAACAAA
TATGGGAATTTTTGGTTTGGGGATTATTTGACAGCAAATGTCAAAACCTT
TAAAAAAATAAATAAACCTTTAACATGTATGTAGCACTTAACAATACATC
TTTATCTTAGGGTTATGGAACTTTTTTTCTGTTGCAAGCTACAAGCCCAT
AATTTAATTTGTGAAATATTTTTAGGAAGAGGATAGCGTTTCTAACATTT
ACTTTTCCTATTAAAAAGAAAACTTACAATTTTGTTCCACAAATACACCT
AACATT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 9 16 34 32 32 14 19 10 11 11 19 22 20 17 16 23 30 30 22 16 23 14 13 9 9 6 8 8 8 8 9 11 11 12 12 24 25 33 33 59
47 44 23 17 19 20 23 22 16 10 9 9 9 12 13 11 11 9 12 12 15 16 16 26 27 43 43 43 50 50 47 47 37 37 37 31 35 37 32 30 30 30 30 23 28 32 32 33 33 37
59 50 50 50 50 59 38 36 36 36 36 37 29 29 32 37 37 43 43 43 43 48 48 54 54 54 54 54 53 53 68 68 68 68 68 68 68 50 68 68 50 50 50 50 50 51 59 48 36 36
41 42 48 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47
57 43 43 43 47 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 50 50 50 50 28 30 19 15 13 10 10 10 12 13 19 18 30 30 41 44 44 50 50 57 57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 59 59 59 43 43 52 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 59 59 59 48 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 57 50 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 57 47 47 47 47 47 47 48 48 59 59 37 37 37 37 32 29 36 41 41 41 59 59 59 59 43 43
43 59 59 48 48 48 46 33 33 29 27 24 34 59 41 37 37 41 41 41 39 40 41 41 43 43 43 43 47 59 59 59 48 57 57 48 48 48 48 46 47 46 41 39 39 32 28 28 43 43
43 39 37 36 35 31 31 41 41 41 39 39 35 35 35 37 37 37 30 30 35 37 31 29 32 37 37 37 37 46 41 37 37 18 19 14 19 19 27 30 30 30 28 28 28 43 43 41 41 37
31 32 24 18 16 17 21 24 31 28 28 28 28 32 37 28 34 28 28 29 28 33 24 33 22 19 19 13 15 15 22 21 20 20 24 24 28 20 15 15 20 20 28 30 37 35 28 28 23 20
22 31 32 31 31 31 39 31 23 28 23 23 23 25 22 16 16 18 23 19 24 15 15 11 13 13 32 28 26 17 15 11 16 18 17 16 23 15 8 8 10 10 21 17 10 10 10 11 8 8
8 3 0 | Open.Hide. 9 9 9 12 12 8 10 8 8 8 8 15 3 0 3 18 15 19 19 28 37 39 43 59 59 39 37 32 27 19 13 6 6 6 6 7 8 8 9 13 12 12 11 12 12 12 11 9 12 21
28 31 33 30 33 33 30 23 23 9 9 9 9 9 9 9 10 12 15 12 11 6 6 6 6 8 12 18 28 34 41 50 50 44 47 50 57 53 53 59 59 59 59 57 57 53 53 53 53 47
42 42 42 42 47 50 68 68 68 68 50 53 48 48 33 33 25 31 30 36 25 25 25 36 44 32 47 57 57 47 47 47 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 47 47 47 48
57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 48 48 48 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 50 50 50 50
50 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 48 48 54 32 32 18
14 14 14 13 15 27 32 47 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 48 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 59 48 48 48 59 57 57 57
57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 41 39 23 15 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 16 25 32 47 47 50 50 53 59 59 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 43 30 30 17 14 14 21 23 30 39 39 43 43 43 47 48 48 47 47 47 47 43 47 47 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 48 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 50 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 48 57 57 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 43 43 43 43 44 42 44 42 48 48 48 57 57 57 57 57
54 54 57 57 59 59 59 44 44 43 43 46 48 40 40 28 30 30 42 42 37 32 32 35 40 42 43 40 43 43 43 46 32 34 23 31 31 40 40 48 48 57 57 48 37 37 30 30 30 37
37 39 39 37 37 34 25 16 11 11 13 23 30 39 35 37 39 39 43 36 36 36 43 43 48 59 59 43 37 34 28 23 28 21 20 18 19 23 23 15 15 11 15 15 22 18 18 12 12 11
11 11 12 23 15 18 18 18 19 18 22 24 24 33 33 27 27 22 28 22 31 19 24 20 18 18 23 23 30 22 9 9 9 9 11 8 8 8 8 10 10 9 10 10 8 8 8 10 10 10
17 17 23 18 20 16 16 10 11 11 17 17 22 19 18 9 9 10 9 9 17 19 19 12 11 10 10 11 12 17 19 13 13 15 11 11 11 9 9 9 9 15 21 15 15 10 8 8 8 10
9 10 11 11 13 12 |