BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-004E21
Chromosome16 (Build37)
Map Location 79,193,959 - 79,321,553
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039561, Cxadr, Btg3, D16Ertd472e, LOC100039605, 4930570E03Rik, Chodl, Prss7
Downstream geneEG383172, 1700066C05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-004E21.bB6Ng01-004E21.g
ACCDH841755DH841756
length1,162986
definitionDH841755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-004E21, 5' end.DH841756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-004E21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,320,369 - 79,321,553)(79,193,959 - 79,194,939)
sequence
gaattccactaggatgtggaaatgtaagacaaataaaaccttttctccac
atgttgtttcatggtgtttcatcccagccatagtaaacctaacaaagaca
ggcagtcaacaagattctttcagtacactgtttacagtttcataaagcta
ggacaaggtagaagttagaacaagtaattcctaattgttacataaatgac
agcaaaaacatgatgaacctatatcaaccaagttttacatgtgttaaata
ggttttccaaataaataaatttaaatattatctccatgctcttaaaaatt
gatgtactaagcaactagttagtggattctaaagctaagaggtagttttc
tgcttttaacttaatcaattccaaagataaaaaagtattataaacattgg
aataatttcttatttcacccgaaaagtcaattatgttagtacaaggactc
ttctgtctcttggcagaaaattgcatactaacaggtgattttcctatact
tcagaccataattcagtgttaagattagattcaacactgggtaaaatttt
ctgagaagctaatgtttctagtctgaaacattttttttctaatctgaaat
tagcattcaaagatatttctaataagatcaaccaaaatataagtctgcat
gtggtgtttcttcatgttttgtacaggaacgcaccagctatgtaatttta
ttcaaagggacctaagacaaattacataatggaatattattaaaaatcat
gttctctaccaacagttaagaaataatgagattctgtcattttatgttaa
acattactttggactcatgtttcatgactggaaaaaattattcagagtta
aaaaatataatccttgattgaggaattaagattaggagatatcttagtaa
aattgttatagaaacaatattctagtgtagactcagtagaaagcaatcta
tgggatagcacagataaaatcaaatgtgctttcattttcaaatatggtag
aaatgtgcattttcatgggtacatttcaggaaaacattttaattttaaag
taaataatcaaaatcatttgaattgattactattattcaccagctcagca
tgtgatctctgttgtcgtggatatgtgactcatgagttagacagaacctg
aggaaaattcaa
gaattctcttttcagcaactggaaatgagtgtagagacttacgactgctc
aatgtggtgagagttacgatatgttccagtgatcagttctaagcaagtca
tttatgacactttctttaaatctcagaaagctttctagaagagcagagag
agtttaacagatagaagatagggagaatggcttcaaaatgcctttttatg
gctacagtacaaccactgcactcatatatcaggcctgttgcacttactca
gagggctttgagttcacaaataagtacaaacagtctatgctatgtagcaa
gttaccactaccccgatagacctgaagctctaatttctatcacgtcacta
cttttaaacacatcttttcaaatttcaatgctaatctttagcatcaaaat
ggataaatatcagcatttggaggatgatactgacatctgtaaacttgcct
cccatctcatgtgtctttcttccttttagtactgtcccatgggcatacct
acaaacactcccatacctaaggctcaaggaacgttgcacaataggagcag
agagactctaagacacagaagatcagggagttttctgtgacattatgcct
cctggtaatagcagaaactataactataaagtctcaccaacatgactgtc
caaacatgagctgtacaagagtgataccaatgaacatgtcaaattgaata
ggaaaggccaatgaggtctcaactgtacaggaagaactataggtgactaa
ggaaagctggggcaggaagaaagttgttctgtgtcaggaagactccacca
actggttgtccagcgccaaacaatcacctttgaaaaacacatacaggtat
cattgtacagctctacaggttaaatttaggattatatatatatattacat
atatataatgacaattaaaagtcataactttgaaggaagcagggtgatat
aagggaggattgggggaaaaaggaaaagagagtgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_79320369_79321553
seq2: B6Ng01-004E21.b_47_1208 (reverse)

seq1  TTGATTTTTCCTCATGGTGTCTGTCTTAACTCAATTTACAGTCACATAAT  50
      |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||      |||||||||  
seq2  TTGAATTTTCCTCA-GGT-TCTGTC-TAACTCA----TGAGTCACATATC  43

seq1  CACAGCAACAGAGATCACATTGCTGAGCTGTGTGTGATATATAGTATATC  100
      |||  |||||||||||||| ||||||||||   ||||   |||||| |||
seq2  CACGACAACAGAGATCACA-TGCTGAGCTG---GTGAATAATAGTA-ATC  88

seq1  AAATATCAAATGAATTTTTGATTTATTGTACTTTAAAATTAAAATGTATT  150
      ||   ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  AA--TTCAAATGA--TTTTGA-TTATT-TACTTTAAAATTAAAATGT-TT  131

seq1  CCCTGAAATGTACCCATGAAAATGCACATTATCTACCATATTTTGAAAAT  200
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  TCCTGAAATGTACCCATGAAAATGCACATT-TCTACCATA-TTTGAAAAT  179

seq1  GAAAGCACATTTGATTTTTATCTGTGCTATCCCATAGATTGCTTTCTACC  250
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAAAGCACATTTGA-TTTTATCTGTGCTATCCCATAGATTGCTTTCTA-C  227

seq1  TGAGTCTACACTAGAATATTGTTTCTATAACAATTTTACTAAGATATCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTACACTAGAATATTGTTTCTATAACAATTTTACTAAGATATCTC  277

seq1  CTAATCTTAATTCCTCAATCAAGGATTATATTTTTTAACTCTGAATAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATCTTAATTCCTCAATCAAGGATTATATTTTTTAACTCTGAATAATT  327

seq1  TTTTCCAGTCATGAAACATGAGTCCAAAGTAATGTTTAACATAAAATGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAGTCATGAAACATGAGTCCAAAGTAATGTTTAACATAAAATGAC  377

seq1  AGAATCTCATTATTTCTTAACTGTTGGTAGAGAACATGATTTTTAATAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCTCATTATTTCTTAACTGTTGGTAGAGAACATGATTTTTAATAAT  427

seq1  ATTCCATTATGTAATTTGTCTTAGGTCCCTTTGAATAAAATTACATAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCATTATGTAATTTGTCTTAGGTCCCTTTGAATAAAATTACATAGCT  477

seq1  GGTGCGTTCCTGTACAAAACATGAAGAAACACCACATGCAGACTTATATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCGTTCCTGTACAAAACATGAAGAAACACCACATGCAGACTTATATT  527

seq1  TTGGTTGATCTTATTAGAAATATCTTTGAATGCTAATTTCAGATTAGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTGATCTTATTAGAAATATCTTTGAATGCTAATTTCAGATTAGAAA  577

seq1  AAAAATGTTTCAGACTAGAAACATTAGCTTCTCAGAAAATTTTACCCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGTTTCAGACTAGAAACATTAGCTTCTCAGAAAATTTTACCCAGT  627

seq1  GTTGAATCTAATCTTAACACTGAATTATGGTCTGAAGTATAGGAAAATCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAATCTAATCTTAACACTGAATTATGGTCTGAAGTATAGGAAAATCA  677

seq1  CCTGTTAGTATGCAATTTTCTGCCAAGAGACAGAAGAGTCCTTGTACTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTAGTATGCAATTTTCTGCCAAGAGACAGAAGAGTCCTTGTACTAA  727

seq1  CATAATTGACTTTTCGGGTGAAATAAGAAATTATTCCAATGTTTATAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATTGACTTTTCGGGTGAAATAAGAAATTATTCCAATGTTTATAATA  777

seq1  CTTTTTTATCTTTGGAATTGATTAAGTTAAAAGCAGAAAACTACCTCTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTATCTTTGGAATTGATTAAGTTAAAAGCAGAAAACTACCTCTTA  827

seq1  GCTTTAGAATCCACTAACTAGTTGCTTAGTACATCAATTTTTAAGAGCAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAGAATCCACTAACTAGTTGCTTAGTACATCAATTTTTAAGAGCAT  877

seq1  GGAGATAATATTTAAATTTATTTATTTGGAAAACCTATTTAACACATGTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATAATATTTAAATTTATTTATTTGGAAAACCTATTTAACACATGTA  927

seq1  AAACTTGGTTGATATAGGTTCATCATGTTTTTGCTGTCATTTATGTAACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGGTTGATATAGGTTCATCATGTTTTTGCTGTCATTTATGTAACA  977

seq1  ATTAGGAATTACTTGTTCTAACTTCTACCTTGTCCTAGCTTTATGAAACT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGAATTACTTGTTCTAACTTCTACCTTGTCCTAGCTTTATGAAACT  1027

seq1  GTAAACAGTGTACTGAAAGAATCTTGTTGACTGCCTGTCTTTGTTAGGTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAGTGTACTGAAAGAATCTTGTTGACTGCCTGTCTTTGTTAGGTT  1077

seq1  TACTATGGCTGGGATGAAACACCATGAAACAACATGTGGAGAAAAGGTTT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATGGCTGGGATGAAACACCATGAAACAACATGTGGAGAAAAGGTTT  1127

seq1  TATTTGTCTTACATTTCCACATCCTAGTGGAATTC  1185
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGTCTTACATTTCCACATCCTAGTGGAATTC  1162

seq1: chr16_79193959_79194939
seq2: B6Ng01-004E21.g_69_1045

seq1  GAATTCTCTTTTCAGCAACTGGAAATGAGTGTAGAGACTTACGACTGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTTCAGCAACTGGAAATGAGTGTAGAGACTTACGACTGCTC  50

seq1  AATGTGGTGAGAGTTACGATATGTTCCAGTGATCAGTTCTAAGCAAGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGTGAGAGTTACGATATGTTCCAGTGATCAGTTCTAAGCAAGTCA  100

seq1  TTTATGACACTTTCTTTAAATCTCAGAAAGCTTTCTAGAAGAGCAGAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGACACTTTCTTTAAATCTCAGAAAGCTTTCTAGAAGAGCAGAGAG  150

seq1  AGTTTAACAGATAGAAGATAGGGAGAATGGCTTCAAAATGCCTTTTTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAACAGATAGAAGATAGGGAGAATGGCTTCAAAATGCCTTTTTATG  200

seq1  GCTACAGTACAACCACTGCACTCATATATCAGGCCTGTTGCACTTACTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAGTACAACCACTGCACTCATATATCAGGCCTGTTGCACTTACTCA  250

seq1  GAGGGCTTTGAGTTCACAAATAAGTACAAACAGTCTATGCTATGTAGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCTTTGAGTTCACAAATAAGTACAAACAGTCTATGCTATGTAGCAA  300

seq1  GTTACCACTACCCCGATAGACCTGAAGCTCTAATTTCTATCACGTCACTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCACTACCCCGATAGACCTGAAGCTCTAATTTCTATCACGTCACTA  350

seq1  CTTTTAAACACATCTTTTCAAATTTCAATGCTAATCTTTAGCATCAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAACACATCTTTTCAAATTTCAATGCTAATCTTTAGCATCAAAAT  400

seq1  GGATAAATATCAGCATTTGGAGGATGATACTGACATCTGTAAACTTGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAAATATCAGCATTTGGAGGATGATACTGACATCTGTAAACTTGCCT  450

seq1  CCCATCTCATGTGTCTTTCTTCCTTTTAGTACTGTCCCATGGGCATACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCTCATGTGTCTTTCTTCCTTTTAGTACTGTCCCATGGGCATACCT  500

seq1  ACAAACACTCCCATACCTAAGGCTCAAGGAACGTTGCACAATAGGAGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACACTCCCATACCTAAGGCTCAAGGAACGTTGCACAATAGGAGCAG  550

seq1  AGAGACTCTAAGACACAGAAGATCAGGGAGTTTTCTGTGACATTATGCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTCTAAGACACAGAAGATCAGGGAGTTTTCTGTGACATTATGCCT  600

seq1  CCTGGTAATAGCAGAAACTATAACTATAAAGTCTCACCAACATGACTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTAATAGCAGAAACTATAACTATAAAGTCTCACCAACATGACTGTC  650

seq1  CAAACATGAGCTGTACAAGAGTGATACCAATGAACATGTCAAATTGAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACATGAGCTGTACAAGAGTGATACCAATGAACATGTCAAATTGAATA  700

seq1  GGAAAGGCCAATGAGGTCTCAACTGTACAGGAAGAACTATAGGTGACTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGCCAATGAGGTCTCAACTGTACAGGAAGAACTATAGGTGACTAA  750

seq1  GGAAAGCTGGGGCAGGAAGAAAGTTGTTCTGTGTCAGGGAAGACTCCACC  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGAAAGCTGGGGCAGGAAGAAAGTTGTTCTGTGTCA-GGAAGACTCCACC  799

seq1  AACTGGTTGTCCAGCGCCAAACAATCACCTTTGAAAAAACACATACAGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AACTGGTTGTCCAGCGCCAAACAATCACCTTTG-AAAAACACATACAGGT  848

seq1  ATCATTGTACAGCTCTACAGGTTAAATTTAGGATTATATATATATATTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTGTACAGCTCTACAGGTTAAATTTAGGATTATATATATATATTAC  898

seq1  ATATATATAATGACAATTAAAAGTCATAACTTTGAAGGAAAGCAGGGGTG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
seq2  ATATATATAATGACAATTAAAAGTCATAACTTTGAAGG-AAGCA-GGGTG  946

seq1  ATATAAGGGAGGATTGGGGGAAAAAGGAAAA  981
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGGGAGGATTGGGGGAAAAAGGAAAA  977