BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-006K24
Chromosome16 (Build37)
Map Location 32,013,907 - 32,177,046
singlet/doubletdoublet
Overlap genePak2, Pigx, 1500031L02Rik, Lrrc33
Upstream geneAI480653, Centb2, Ppp1r2, Apod, 1700007E05Rik, Bdh1, Gm536, Dlg1, Mfi2, LOC677155, Pigz, 0610012G03Rik, Ncbp2, Senp5
Downstream geneBex6, Fbxo45, Wdr53, 2310010M20Rik, Rnf168, LOC666966, Ubxd7, Tm4sf19, 0610012D17Rik, Pcyt1a, Osta, Zdhhc19, LOC385820, Tfrc, Tnk2, ENSMUSG00000075265, LOC672302, Muc4, Muc20, 1700021K19Rik, Fyttd1, Lrch3, EG625660, Iqcg, Rpl35a, Lmln, LOC638791
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-006K24.bB6Ng01-006K24.g
ACCDH843478DH843479
length819905
definitionDH843478|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006K24, 5' end.DH843479|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006K24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,176,229 - 32,177,046)(32,013,907 - 32,014,808)
sequence
gaattcaccttccgttttgttctttctgactgtgggtattcccttccacg
ggtcatgattccgaactcttaaaaaaagctctaaaagccaaagggctgtt
ttggttatgtagccttaagtggcagaaagctttttgctcagtttctctat
tgcccagtgattgtaaactttgcatttgttaccaaaaatatcacagtatt
tatttggcaccatggccctatacccaattgaaggatttatgtaaccaact
gtgtcatgcctctaaattatgagacattgtgatctttgtcactcttctgg
cccccagaatttagggtgagggatttggaccagtgctaaagggccacgca
aaggaggcctggatagtggaactgtgcagacatgaaaagacaacccaact
gctataaattacaaattataatgcaaatttataagaatcatgatgaatat
gatacaaatgatagatacgtgataatattatatataattatataattgcg
cattgcataggagaagcttgaaaggccatataatgttagcaataggttaa
taggctttttaaaatttttacctttctttagcagtcagaaaaaatactat
atatatttggttttttttgagacagggtttctccatgtagctctagctgt
cctggaacttactctgtagaccaggctggcctcaaaccttcagagctttt
tagaattcagatcatcctggtcatggtgacccagagaagggaatacccat
gggcagaaggaatagagctggaggtgaattcctacagggaggatgtggga
ctgggggtaggaggaggtt
gaattcactccgtagactgggctgccttgaactcccaagtgctgggattc
aaggcatacaccatcacttgctgggcgttctctgatttcttgatggtatt
gcacgcataaacatacacatacacacacacacaccccaaaaaaaaaagat
ctggtaaacttaattaggaagtcattggtaatgttggcaaaggtgtcttt
gctgagaacagcgcggggaatgtgacattgagaagcacacagtaagtcat
aaagtagttgatatcaaccagtgaggcacttctcaactgttcttaggcaa
atgctttgaacactgtaagaagccagtcattggaatgctgtgtctctggt
cctggctactggggaagctaagttaagggcactacataatcaaagagctt
aaggccggtctggggagcacaaacaaataccttgcttcaagaaaaccaag
acaaaataaacaacaaccgcaccaaaagcaaaacaaacaaacacacaaat
aaaaacaaaaaacaacccccccaaactttagaatacagaattatatacgt
attcatgaatgtatgtaaatgaagcgcattagcacccccatctccaggca
gttaatgtttggtgagggagaaaagacatcaagatgctcataatcctata
agcaaccctaattaagttccttagggccccccccaaaaaaactaaacata
aagtatatatggttagttttgtgtcaaattgacacaggctggagttatca
tagagaaaggagattcagttggggaaatgcctccacgagatccagctgta
aggcattttctcaattagtgatcaaggggagatccccttgtgggtggtgc
catctctgggctggtagtcttggtttctataagagaacaggcttgaatca
ggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_32176229_32177046
seq2: B6Ng01-006K24.b_48_865 (reverse)

seq1  ACCTCCTCCTACCCCCAGTCCCACATCCTCCCTGTAGGAATTCACCTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCTCCTACCCCCAGTCCCACATCCTCCCTGTAGGAATTCACCTCCA  50

seq1  GCTCTATTCCTTCTGCCCATGGGTATTCCCTTCTCTGGGTCACCATGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTATTCCTTCTGCCCATGGGTATTCCCTTCTCTGGGTCACCATGACC  100

seq1  AGGATGATCTGAATTCTAAAAAGCTCTGAAGGTTTGAGGCCAGCCTGGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGATCTGAATTCTAAAAAGCTCTGAAGGTTTGAGGCCAGCCTGGTC  150

seq1  TACAGAGTAAGTTCCAGGACAGCTAGAGCTACATGGAGAAACCCTGTCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGTAAGTTCCAGGACAGCTAGAGCTACATGGAGAAACCCTGTCTC  200

seq1  AAAAAAAACCAAATATATATAGTATTTTTTCTGACTGCTAAAGAAAGGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAACCAAATATATATAGTATTTTTTCTGACTGCTAAAGAAAGGTA  250

seq1  AAAATTTTAAAAAGCCTATTAACCTATTGCTAACATTATATGGCCTTTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTTAAAAAGCCTATTAACCTATTGCTAACATTATATGGCCTTTCA  300

seq1  AGCTTCTCCTATGCAATGCGCAATTATATAATTATATATAATATTATCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTCCTATGCAATGCGCAATTATATAATTATATATAATATTATCAC  350

seq1  GTATCTATCATTTGTATCATATTCATCATGATTCTTATAAATTTGCATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTATCATTTGTATCATATTCATCATGATTCTTATAAATTTGCATTA  400

seq1  TAATTTGTAATTTATAGCAGTTGGGTTGTCTTTTCATGTCTGCACAGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTGTAATTTATAGCAGTTGGGTTGTCTTTTCATGTCTGCACAGTTC  450

seq1  CACTATCCAGGCCTCCTTTGCGTGGCCCTTTAGCACTGGTCCAAATCCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATCCAGGCCTCCTTTGCGTGGCCCTTTAGCACTGGTCCAAATCCCT  500

seq1  CACCCTAAATTCTGGGGGCCAGAAGAGTGACAAAGATCACAATGTCTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTAAATTCTGGGGGCCAGAAGAGTGACAAAGATCACAATGTCTCAT  550

seq1  AATTTAGAGGCATGACACAGTTGGTTACATAAATCCTTCAATTGGGTATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGAGGCATGACACAGTTGGTTACATAAATCCTTCAATTGGGTATA  600

seq1  GGGCCATGGTGCCAAATAAATACTGTGATATTTTTGGTAACAAATGCAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATGGTGCCAAATAAATACTGTGATATTTTTGGTAACAAATGCAAA  650

seq1  GTTTACAATCACTGGGCAATAGAGAAACTGAGCAAAAAGCTTTCTGCCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACAATCACTGGGCAATAGAGAAACTGAGCAAAAAGCTTTCTGCCAC  700

seq1  TTAAGGCTACATAACCAAAACAGCCCTTTGGCTTTTAGAGCTTTTTTTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCTACATAACCAAAACAGCCCTTTGGCTTTTAGAGCTTTTTTTAA  750

seq1  GAGTTCGGAATCATGACCCGTGGAAGGGAATACCCACAGTCAGAAAGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCGGAATCATGACCCGTGGAAGGGAATACCCACAGTCAGAAAGAAC  800

seq1  AAAACGGAAGGTGAATTC  818
      ||||||||||||||||||
seq2  AAAACGGAAGGTGAATTC  818

seq1: chr16_32013907_32014808
seq2: B6Ng01-006K24.g_70_974

seq1  GAATTCACTCCGTAGACTGGGCTGCCTTGAACTCCCAAGTGCTGGGATTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCCGTAGACTGGGCTGCCTTGAACTCCCAAGTGCTGGGATTC  50

seq1  AAGGCATACACCATCACTTGCTGGGCGTTCTCTGATTTCTTGATGGTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATACACCATCACTTGCTGGGCGTTCTCTGATTTCTTGATGGTATT  100

seq1  GCACGCATAAACATACACATACACACACACACACCCCAAAAAAAAAAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACGCATAAACATACACATACACACACACACACCCCAAAAAAAAAAGAT  150

seq1  CTGGTAAACTTAATTAGGAAGTCATTGGTAATGTTGGCAAAGGTGTCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAAACTTAATTAGGAAGTCATTGGTAATGTTGGCAAAGGTGTCTTT  200

seq1  GCTGAGAACAGCGCGGGGAATGTGACATTGAGAAGCACACAGTAAGTCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGAACAGCGCGGGGAATGTGACATTGAGAAGCACACAGTAAGTCAT  250

seq1  AAAGTAGTTGATATCAACCAGTGAGGCACTTCTCAACTGTTCTTAGGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAGTTGATATCAACCAGTGAGGCACTTCTCAACTGTTCTTAGGCAA  300

seq1  ATGCTTTGAACACTGTAAGAAGCCAGTCATTGGAATGCTGTGTCTCTGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTGAACACTGTAAGAAGCCAGTCATTGGAATGCTGTGTCTCTGGT  350

seq1  CCTGGCTACTGGGGAAGCTAAGTTAAGGGCACTACATAATCAAAGAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTACTGGGGAAGCTAAGTTAAGGGCACTACATAATCAAAGAGCTT  400

seq1  AAGGCCGGTCTGGGGAGCACAAACAAATACCTTGCTTCAAGAAAACCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCGGTCTGGGGAGCACAAACAAATACCTTGCTTCAAGAAAACCAAG  450

seq1  ACAAAATAAACAACAACCGCACCAAAAGCAAAACAAACAAACACACAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATAAACAACAACCGCACCAAAAGCAAAACAAACAAACACACAAAT  500

seq1  AAAAACAAAAAACAACCCCCCCAAACTTTAGAATACAGAATTATATACGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAAAACAACCCCCCCAAACTTTAGAATACAGAATTATATACGT  550

seq1  ATTCATGAATGTATGTAAATGAAGCGCATTAGCACCCCCATCTCCAGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATGAATGTATGTAAATGAAGCGCATTAGCACCCCCATCTCCAGGCA  600

seq1  GTTAATGTTTGGTGAGGGAGAAAAGACATCAAGATGCTCATAATCCTATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGTTTGGTGAGGGAGAAAAGACATCAAGATGCTCATAATCCTATA  650

seq1  AGCAACCCTAATTAAGTTCCTTAGGGCCCCCCCCAAAAAAACTAAACATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACCCTAATTAAGTTCCTTAGGGCCCCCCCCAAAAAAACTAAACATA  700

seq1  AAGTATATATGGTTAGTTTTGTGTCAAATTGACACAGGCTGGAGTTATCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATATATGGTTAGTTTTGTGTCAAATTGACACAGGCTGGAGTTATCA  750

seq1  TAGAGAAAGGAGATTCAGTTGGGGAAATGCCTCCACGAGATCCAGCTGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAAGGAGATTCAGTTGGGGAAATGCCTCCACGAGATCCAGCTGTA  800

seq1  AGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGAGATCCCCTTGTGGGTGGTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGAGATCCCCTTGTGGGTGGTGC  850

seq1  CATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGG-TTCTATAAGAGAACAGGCT--GATCA  897
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||
seq2  CATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGTTTCTATAAGAGAACAGGCTTGAATCA  900

seq1  GGAGG  902
      |||||
seq2  GGAGG  905