BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015G10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 13,688,509 - 13,829,238
singlet/doubletdoublet
Overlap genePla2g10, A930007A09Rik, LOC622757, Rrn3, Ntan1
Upstream geneEG622509, LOC622553, Ercc4, Gt4-1, Mkl2, Parn, LOC100043196, 3110001I22Rik
Downstream genePdxdc1, Mpv17l, Ifitm7, 2900011O08Rik, 4921513D23Rik, Nde1, Myh11, 0610037P05Rik, Abcc1, Gm1758, Snai2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015G10.bB6Ng01-015G10.g
ACCDH849668DH849669
length1,065865
definitionDH849668|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015G10, 5' end.DH849669|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015G10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,828,169 - 13,829,238)(13,688,509 - 13,689,370)
sequence
gaattcattaactcctgttttaaaagagcatcttgacagtttgtaactgt
agtgggggtgaacttactgagaagctgatgagtaagtttctgtgacagct
gcctgtcatcactgaagcctcccacaagatgtacttccagcctgccaaga
gaggtacagtggtcagagttaggacaagacttgactgtgctggtttgaag
gtgatagttagtggctcccatgaacagatacaacaggcttctcacaacac
atgatgaaactacttgtgggcatgatagggcgccatgggatgttgccaag
gctagtaacaaatctgtcacccagggtcctcagtgcagtgtcacctggcc
tcccacatggaatacgctagaatttctcagtacctctaccaaagagcatc
tgggctgtggctaccatggctttgccacggctcctaccaggctagcctcg
atatccacaataactagacattgtctgcaaacagaccagacagttatgtt
ctgagaacccttgtggctagcctgggccaaagcaaaaggaaaaggcaatt
ttagaaccacacaagtcaaaaagcccgtgaagcttgccagcctatggcac
agacccagccacaaggtttgagttttaaaaagggctcagcgccaacacag
ttagcatatgcaaggcccagaattcaatttctagcatatatatacatata
caaagtttaaacttggtttatatttaaggctagcctcaactaagacatcc
tcctgcctctgtctcccaatactgaaattaaggtgtgctatcatacctct
ccccatttttttaatttacttatttgcactataaagctgaccatatgtgc
cctcagaccctaagtacctgtgtatgactgttactagttctttcaagcta
ccaagaaatatgagccaagcgttataacagagcaagttggaccagttatt
tgagcaagtgggtcacagccagactttacctagctgtgtggctttggtta
attgccatgtggtcacatgtagaatgaaatgctgagggacagttagtcct
gcctgttcttaccct
gaattcttaagagctcacaggtcactgccaatggaaagactgcttaagtc
cagtcctttgaagttcttaatgtttccctgtagaaaaggcaaatgagttg
gtgaagtcagagacacaattgctcctagattgtctgccatgtaccctttc
cagacctttgcacagccatgagcagaaatgaacctagaaacattgtgtcc
tcacttctctaggacttaggttgccttctttcttgaagagacttggtgtc
atttctcagactcagccccttccttgccctgccccatcctcacatcctca
aaaactgacctttcacttctgacctcctgtctccttccaggtcatcctgc
ttgtgtatcattggcgcagcagagaatctgaacatggcctcctggtgcac
aaggctgtagataagtggacgacggaagaagttgtcctctggttagaaca
gctaggaccttgggcctccctgtacagagacaggttcttatctgaaagag
taaatggaaggtgagaaaaaaaacctggcacaccagggtaggtgtggtgg
tgcaggccctaaatcttagaggcaggcagatctcttgtgagtgtaaggcc
agcctggcaagttccaggccacagggtgacataaatcctgtccataccag
acatatttctagatggatttgagatacattctacctgccacaaatcctat
cttatagaagtgaataagcgtgagcttgtaggtctttcacagatatgtaa
aaccattttccagtcatttcctgactctcagaagaaactcatttttcttc
cctggtctaccctcacttcttctccctcagcagattttattatctttatt
caaaaatggctttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_13828169_13829238
seq2: B6Ng01-015G10.b_34_1098 (reverse)

seq1  AGGGTAAGAACCAGCCCGGACTAACTGTCCCTCAGCATTTCATCCTTACC  50
      |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||   |
seq2  AGGGTAAGAA-CAGGCAGGACTAACTGTCCCTCAGCATTTCATTCT--AC  47

seq1  CTGTGA-CACATGGCCATTTACCAAAGCCACACAGCTAGTTAAGTTCTGG  99
       ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||
seq2  ATGTGACCACATGGCAATTAACCAAAGCCACACAGCTAGGTAAAGTCTGG  97

seq1  CCTGTGACCCACTTGCTCACATAACTGGTCC-ACTTGCTCTGTTATTACG  148
       |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||
seq2  -CTGTGACCCACTTGCTCAAATAACTGGTCCAACTTGCTCTGTTATAACG  146

seq1  CTTGGCTCTTATTTTCTTGGTAGCTTTGAAGGAACTAGT-ACAGTCATAC  197
      |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||
seq2  CTTGGCTCATA-TTTCTTGGTAGC-TTGAAAGAACTAGTAACAGTCATAC  194

seq1  ACAGGTACTTAGGGTCTTGAGGGCACTATTGGTCAGCTTTATAGTGC-AA  246
      |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||
seq2  ACAGGTACTTAGGGTC-TGAGGGCACATATGGTCAGCTTTATAGTGCAAA  243

seq1  TAAGTAAATT-AAAAAATGGGGAGAGGTATGATAGCACACCTTTAATTTC  295
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TAAGTAAATTAAAAAAATGGGGAGAGGTATGATAGCACACC-TTAATTTC  292

seq1  AGTATTGGGAGACAGAGGCAGGAGGATGTCTTAGTTTGAGGCTAGCCTTA  345
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
seq2  AGTATTGGGAGACAGAGGCAGGAGGATGTCTTAG-TTGAGGCTAGCCTT-  340

seq1  AAATATAAACCAAGTTTAAACTTTGTATATGTATATATATGCTAGAAATT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATAAACCAAGTTTAAACTTTGTATATGTATATATATGCTAGAAATT  390

seq1  GAATTCTGGGCCTTGCATATGCTAACTGTGTTGGCGCTGAGCCCTTTTTA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGCCTTGCATATGCTAACTGTGTTGGCGCTGAGCCCTTTTTA  440

seq1  AAACTCAAACCTTGTGGCTGGGTCTGTGCCATAGGCTGGCAAGCTTCACG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCAAACCTTGTGGCTGGGTCTGTGCCATAGGCTGGCAAGCTTCACG  490

seq1  GGCTTTTTGACTTGTGTGGTTCTAAAATTGCCTTTTCCTTTTGCTTTGGC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTTTGACTTGTGTGGTTCTAAAATTGCCTTTTCCTTTTGCTTTGGC  540

seq1  CCAGGCTAGCCACAAGGGTTCTCAGAACATAACTGTCTGGTCTGTTTGCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTAGCCACAAGGGTTCTCAGAACATAACTGTCTGGTCTGTTTGCA  590

seq1  GACAATGTCTAGTTATTGTGGATATCGAGGCTAGCCTGGTAGGAGCCGTG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGTCTAGTTATTGTGGATATCGAGGCTAGCCTGGTAGGAGCCGTG  640

seq1  GCAAAGCCATGGTAGCCACAGCCCAGATGCTCTTTGGTAGAGGTACTGAG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGCCATGGTAGCCACAGCCCAGATGCTCTTTGGTAGAGGTACTGAG  690

seq1  AAATTCTAGCGTATTCCATGTGGGAGGCCAGGTGACACTGCACTGAGGAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTAGCGTATTCCATGTGGGAGGCCAGGTGACACTGCACTGAGGAC  740

seq1  CCTGGGTGACAGATTTGTTACTAGCCTTGGCAACATCCCATGGCGCCCTA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGTGACAGATTTGTTACTAGCCTTGGCAACATCCCATGGCGCCCTA  790

seq1  TCATGCCCACAAGTAGTTTCATCATGTGTTGTGAGAAGCCTGTTGTATCT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCCCACAAGTAGTTTCATCATGTGTTGTGAGAAGCCTGTTGTATCT  840

seq1  GTTCATGGGAGCCACTAACTATCACCTTCAAACCAGCACAGTCAAGTCTT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGGGAGCCACTAACTATCACCTTCAAACCAGCACAGTCAAGTCTT  890

seq1  GTCCTAACTCTGACCACTGTACCTCTCTTGGCAGGCTGGAAGTACATCTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTAACTCTGACCACTGTACCTCTCTTGGCAGGCTGGAAGTACATCTT  940

seq1  GTGGGAGGCTTCAGTGATGACAGGCAGCTGTCACAGAAACTTACTCATCA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGGCTTCAGTGATGACAGGCAGCTGTCACAGAAACTTACTCATCA  990

seq1  GCTTCTCAGTAAGTTCACCCCCACTACAGTTACAAACTGTCAAGATGCTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCAGTAAGTTCACCCCCACTACAGTTACAAACTGTCAAGATGCTC  1040

seq1  TTTTAAAACAGGAGTTAATGAATTC  1070
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAACAGGAGTTAATGAATTC  1065

seq1: chr16_13688509_13689370
seq2: B6Ng01-015G10.g_69_932

seq1  GAATTCTTAAGAGCACACAGGTCACTGCCAATGGAAAGACTGCTTAAGTC  50
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAAGAGCTCACAGGTCACTGCCAATGGAAAGACTGCTTAAGTC  50

seq1  CAGTCCTTTGAAGTTCTTAATGTTTCCCTGTAGAAAAGGCAAATGAGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTTTGAAGTTCTTAATGTTTCCCTGTAGAAAAGGCAAATGAGTTG  100

seq1  GTGAAGTCAGAGACACAATTGCTCCTAGATTGTCTGCCATGTACCCTTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGTCAGAGACACAATTGCTCCTAGATTGTCTGCCATGTACCCTTTC  150

seq1  CAGACCTTTGCACAGCCATGAGCAGAAATGAACCTAGAAACATTGTGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTTTGCACAGCCATGAGCAGAAATGAACCTAGAAACATTGTGTCC  200

seq1  TCACTTCTCTAGGACTTAGGTTGCCTTCTTTCTTGAAGAGACTTGGTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTCTCTAGGACTTAGGTTGCCTTCTTTCTTGAAGAGACTTGGTGTC  250

seq1  ATTTCTCAGACTCAGCCCCTTCCTTGCCCTGCCCCATCCTCACATCCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCAGACTCAGCCCCTTCCTTGCCCTGCCCCATCCTCACATCCTCA  300

seq1  AAAACTGACCTTTCACTTCTGACCTCCTGTCTCCTTCCAGGTCATCCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTGACCTTTCACTTCTGACCTCCTGTCTCCTTCCAGGTCATCCTGC  350

seq1  TTGTGTATCATTGGCGCAGCAGAGAATCTGAACATGGCCTCCTGGTGCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTATCATTGGCGCAGCAGAGAATCTGAACATGGCCTCCTGGTGCAC  400

seq1  AAGGCTGTAGATAAGTGGACGACGGAAGAAGTTGTCCTCTGGTTAGAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTGTAGATAAGTGGACGACGGAAGAAGTTGTCCTCTGGTTAGAACA  450

seq1  GCTAGGACCTTGGGCCTCCCTGTACAGAGACAGGTTCTTATCTGAAAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGACCTTGGGCCTCCCTGTACAGAGACAGGTTCTTATCTGAAAGAG  500

seq1  TAAATGGAAGGTGAGAAAAAAAACCTGGCACACCAGGGTAGGTGTGGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGGAAGGTGAGAAAAAAAACCTGGCACACCAGGGTAGGTGTGGTGG  550

seq1  TGCAGGCCCTAAATCTTAGAGGCAGGCAGATCTCTTGTGAGTGTAAGGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGCCCTAAATCTTAGAGGCAGGCAGATCTCTTGTGAGTGTAAGGCC  600

seq1  AGCCTGGCAAGTTCCAGGCCACAGGGTGACATAAATCCTGTCCATACCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGCAAGTTCCAGGCCACAGGGTGACATAAATCCTGTCCATACCAG  650

seq1  ACATATTTCTAGATGGATTTGAGATACATTCTACCTGCCACAAATCCTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTTCTAGATGGATTTGAGATACATTCTACCTGCCACAAATCCTAT  700

seq1  CTTATAGAAGTGAATAAGCGTGAGCTTGTAAGGTC-TTCACAGATATGTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  CTTATAGAAGTGAATAAGCGTGAGCTTGT-AGGTCTTTCACAGATATGTA  749

seq1  AAACCA-TTTCCAGTCATTTCCTGACTCTCAGAAGAAAACTCA-TTTTCT  797
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  AAACCATTTTCCAGTCATTTCCTGACTCTCAGAAG-AAACTCATTTTTCT  798

seq1  T-CCTGGTCTACCCTCACTTCTTCTCCCTCAGCAGATTTTATTATCTTTA  846
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGTCTACCCTCACTTCTTCTCCCTCAGCAGATTTTATTATCTTTA  848

seq1  TTCAAAAATGGCTTTG  862
      ||||||||||||||||
seq2  TTCAAAAATGGCTTTG  864