BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018F16
Chromosome16 (Build37)
Map Location 79,061,455 - 79,220,749
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrss7
Upstream geneLOC435483, LOC100039561, Cxadr, Btg3, D16Ertd472e, LOC100039605, 4930570E03Rik, Chodl
Downstream geneEG383172, 1700066C05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018F16.bB6Ng01-018F16.g
ACCDH851780DH851781
length1,210765
definitionDH851780|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018F16, 5' end.DH851781|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018F16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,219,502 - 79,220,749)(79,061,455 - 79,062,219)
sequence
gaattctgagagcacaacaattaggattccccaagggatgagcctcttaa
ctgattatacatatagtgatacctaaaatcatatgcatacaatcaacaag
actcagaaggctacatttatatgtcatgtatatataaatccacatttatt
tgtgtgaaaatagtgtggttatatttgtatcaaacaagtagtccagtaaa
tggagctttacatgtttgtttctcctgagagttaagtatcctactgtcaa
agatgaatacaggcatatagagaagaatgctaaactccctggtaaaccca
gggaccgtaatcttatgtatcccaacgtggaaagaaagaatacttgggaa
gaaaataagaggataacatccactcaaccactcagcacgtttcctgagca
ttccctccactcagctcatgagttcaacccctgtgcaacaggccgtgagt
tcccttgtgaggcaaaactcctcatgcttgaaacttagttatttcataat
gatgtgaacaaaaagaggaatgcataggaatttgatattaactaatgcgt
tgctccagaaaatttatgtaggtctcagtgaatttttcttgtttcatgtc
tccttttttttttgtttaatttcaaatatctagcacactatttcataatc
attgacaaccaatatgatattaatataatttgaaaatattgaaggtcttg
tgttggacattcagaggtaagaaaagcattaccagaattgattatttagc
agcctacaagagctttatttcttaacgataactccccatagtccctaata
caattcgagctatgaaagtcattttttttctctgtttgcaacttgaatat
aatatctattaaatattaagatggatagagaaaactaaattttaattgtt
caaatccattattcattggaaaatcttaataagaagggctaggatgaaag
tatattaatatataaaatgagtctaggagataaatttcattgatttcatt
tcatgcactttctactgcatacaacataggaaagtggcttgcagctctct
ttcctttcctctctccatccttcttctctctgttctctggccctcttgcg
cctctcgaaccagtctttgactttctcacgaacctcttatgaactgtgcc
aaacatccctcttccctcaaagaagcactctggaatcttttggcttgcat
tgtaatttta
gaattcacacttacatggtgatagattgcacgtggaagaacattatttga
ctagatttttactggtcagctttggtaaatgcaaccaaactaaggtgaac
tatcaatcagagagagattccatttagattatctacattagtctttggtg
tagtgaatgtgttatttaagtgtttactaatgatgcaattaaaataagaa
cagacagaacacagaacaaaacagcggtttttgttcagaagcccttaggt
tgttacaactgtattatttatagagctgcaagagggaaattagaagcaat
gaagaacagtggataatgctcactaatttgcttccatcagaaaggggtaa
ggacagtgatattatatgaatgtgaaaatattatgaaaacacattattag
tgcttggaccttacaatcagagtgcttaagacaaagtgagatgaagaaaa
cgagattccccgcttacctgaatgatgtagcactgatcatagaattcccc
acagtgttctcaaatgcaatggcgtaaaattaattgcaccgagtattatg
caattaagttttaaaataatatatatatatatatattttaggttctgtat
taagttatgcatatggttattgaaaaaaatcactggtttcagctagctga
gatgtaatacatgtgcaggagtttgtgcatgtgtgtgcttacacatgtgt
tttgcagtgtgtttgcttgcaagtgtgttgtgctgtgtgttgtgtatatg
tgtgtgtgtgtgtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_79219502_79220749
seq2: B6Ng01-018F16.b_47_1256 (reverse)

seq1  TAAAATTCACAATGCAAACGCAAAAAAGATCAAGAAGTGCTTCTTTATGA  50
      ||||||| |||||||||  || ||||   || || ||||||||||  |||
seq2  TAAAATT-ACAATGCAA--GCCAAAAGATTCCAG-AGTGCTTCTT--TGA  44

seq1  TGGGGAAGAGGAGTGTTTGTGCAACAAGTGTCCAATAAAAGAGTTTAAGT  100
        |||||||||  |||||| || |||   || |   | ||||| ||  ||
seq2  --GGGAAGAGGGATGTTTG-GC-ACA---GTTC---ATAAGAGGTT-CGT  83

seq1  GAGGGAAAGTCAAAGACATGGGTTCAGGAGAGACGCAAAGGAGGGCAAGG  150
      ||  |||||||||||||   |||||  ||||| |||||  |||||| | |
seq2  GA--GAAAGTCAAAGAC--TGGTTC--GAGAGGCGCAA--GAGGGCCA-G  124

seq1  AGAAACAGAGAGAAGGAGAGATGGGAGAAGAAGGAAAGG-AAGAGAGCTG  199
      || |||||||||||| || ||| |||||   |||||||| ||||||||||
seq2  AG-AACAGAGAGAAGAAG-GAT-GGAGA--GAGGAAAGGAAAGAGAGCTG  169

seq1  CAAGCCACCTTTCCTATGTTGTATGCAGTAGGAAAGTGCATGAAAATGAA  249
      ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  CAAGCCA-CTTTCCTATGTTGTATGCAGTA-GAAAGTGCATG-AAATGAA  216

seq1  AATCATGAAAATTTTATCTCCTAGACTCATTTTTATATATTAAATATACT  299
      |   ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| 
seq2  ATCAATGAAA--TTTATCTCCTAGACTCA-TTTTATATATT-AATATAC-  261

seq1  TTTCATCCTAGCCCTTCTTATTAAGATTTTCCAATGAATAATGGATTTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATCCTAGCCCTTCTTATTAAGATTTTCCAATGAATAATGGATTTGA  311

seq1  ACAATTAAAATTTAGTTTTCTCTATCCATCTTAATATTTAATAGATATTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTAAAATTTAGTTTTCTCTATCCATCTTAATATTTAATAGATATTA  361

seq1  TATTCAAGTTGCAAACAGAGAAAAAAAATGACTTTCATAGCTCGAATTGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCAAGTTGCAAACAGAGAAAAAAAATGACTTTCATAGCTCGAATTGT  411

seq1  ATTAGGGACTATGGGGAGTTATCGTTAAGAAATAAAGCTCTTGTAGGCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGGACTATGGGGAGTTATCGTTAAGAAATAAAGCTCTTGTAGGCTG  461

seq1  CTAAATAATCAATTCTGGTAATGCTTTTCTTACCTCTGAATGTCCAACAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATAATCAATTCTGGTAATGCTTTTCTTACCTCTGAATGTCCAACAC  511

seq1  AAGACCTTCAATATTTTCAAATTATATTAATATCATATTGGTTGTCAATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCTTCAATATTTTCAAATTATATTAATATCATATTGGTTGTCAATG  561

seq1  ATTATGAAATAGTGTGCTAGATATTTGAAATTAAACAAAAAAAAAAGGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGAAATAGTGTGCTAGATATTTGAAATTAAACAAAAAAAAAAGGAG  611

seq1  ACATGAAACAAGAAAAATTCACTGAGACCTACATAAATTTTCTGGAGCAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAACAAGAAAAATTCACTGAGACCTACATAAATTTTCTGGAGCAA  661

seq1  CGCATTAGTTAATATCAAATTCCTATGCATTCCTCTTTTTGTTCACATCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCATTAGTTAATATCAAATTCCTATGCATTCCTCTTTTTGTTCACATCA  711

seq1  TTATGAAATAACTAAGTTTCAAGCATGAGGAGTTTTGCCTCACAAGGGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAAATAACTAAGTTTCAAGCATGAGGAGTTTTGCCTCACAAGGGAA  761

seq1  CTCACGGCCTGTTGCACAGGGGTTGAACTCATGAGCTGAGTGGAGGGAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACGGCCTGTTGCACAGGGGTTGAACTCATGAGCTGAGTGGAGGGAAT  811

seq1  GCTCAGGAAACGTGCTGAGTGGTTGAGTGGATGTTATCCTCTTATTTTCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGGAAACGTGCTGAGTGGTTGAGTGGATGTTATCCTCTTATTTTCT  861

seq1  TCCCAAGTATTCTTTCTTTCCACGTTGGGATACATAAGATTACGGTCCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGTATTCTTTCTTTCCACGTTGGGATACATAAGATTACGGTCCCT  911

seq1  GGGTTTACCAGGGAGTTTAGCATTCTTCTCTATATGCCTGTATTCATCTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTACCAGGGAGTTTAGCATTCTTCTCTATATGCCTGTATTCATCTT  961

seq1  TGACAGTAGGATACTTAACTCTCAGGAGAAACAAACATGTAAAGCTCCAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGTAGGATACTTAACTCTCAGGAGAAACAAACATGTAAAGCTCCAT  1011

seq1  TTACTGGACTACTTGTTTGATACAAATATAACCACACTATTTTCACACAA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGGACTACTTGTTTGATACAAATATAACCACACTATTTTCACACAA  1061

seq1  ATAAATGTGGATTTATATATACATGACATATAAATGTAGCCTTCTGAGTC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTGGATTTATATATACATGACATATAAATGTAGCCTTCTGAGTC  1111

seq1  TTGTTGATTGTATGCATATGATTTTAGGTATCACTATATGTATAATCAGT  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGATTGTATGCATATGATTTTAGGTATCACTATATGTATAATCAGT  1161

seq1  TAAGAGGCTCATCCCTTGGGGAATCCTAATTGTTGTGCTCTCAGAATTC  1248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGGCTCATCCCTTGGGGAATCCTAATTGTTGTGCTCTCAGAATTC  1210

seq1: chr16_79061455_79062219
seq2: B6Ng01-018F16.g_68_832

seq1  GAATTCACACTTACATGGTGATAGATTGCACGTGGAAGAACATTATTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACTTACATGGTGATAGATTGCACGTGGAAGAACATTATTTGA  50

seq1  CTAGATTTTTACTGGTCAGCTTTGGTAAATGCAACCAAACTAAGGTGAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTTTTACTGGTCAGCTTTGGTAAATGCAACCAAACTAAGGTGAAC  100

seq1  TATCAATCAGAGAGAGATTCCATTTAGATTATCTACATTAGTCTTTGGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAATCAGAGAGAGATTCCATTTAGATTATCTACATTAGTCTTTGGTG  150

seq1  TAGTGAATGTGTTATTTAAGTGTTTACTAATGATGCAATTAAAATAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAATGTGTTATTTAAGTGTTTACTAATGATGCAATTAAAATAAGAA  200

seq1  CAGACAGAACACAGAACAAAACAGCGGTTTTTGTTCAGAAGCCCTTAGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAGAACACAGAACAAAACAGCGGTTTTTGTTCAGAAGCCCTTAGGT  250

seq1  TGTTACAACTGTATTATTTATAGAGCTGCAAGAGGGAAATTAGAAGCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACAACTGTATTATTTATAGAGCTGCAAGAGGGAAATTAGAAGCAAT  300

seq1  GAAGAACAGTGGATAATGCTCACTAATTTGCTTCCATCAGAAAGGGGTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACAGTGGATAATGCTCACTAATTTGCTTCCATCAGAAAGGGGTAA  350

seq1  GGACAGTGATATTATATGAATGTGAAAATATTATGAAAACACATTATTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGTGATATTATATGAATGTGAAAATATTATGAAAACACATTATTAG  400

seq1  TGCTTGGACCTTACAATCAGAGTGCTTAAGACAAAGTGAGATGAAGAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGGACCTTACAATCAGAGTGCTTAAGACAAAGTGAGATGAAGAAAA  450

seq1  CGAGATTCCCCGCTTACCTGAATGATGTAGCACTGATCATAGAATTCCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGATTCCCCGCTTACCTGAATGATGTAGCACTGATCATAGAATTCCCC  500

seq1  ACAGTGTTCTCAAATGCAATGGCGTAAAATTAATTGCACCGAGTATTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGTTCTCAAATGCAATGGCGTAAAATTAATTGCACCGAGTATTATG  550

seq1  CAATTAAGTTTTAAAATAATATATATATATATATATTTTAGGTTCTGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTAAGTTTTAAAATAATATATATATATATATATTTTAGGTTCTGTAT  600

seq1  TAAGTTATGCATATGGTTATTGAAAAAAATCACTGGTTTCAGCTAGCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTATGCATATGGTTATTGAAAAAAATCACTGGTTTCAGCTAGCTGA  650

seq1  GATGTAATACATGTGCAGGAGTTTGTGCATGTGTGTGCTTACACATGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAATACATGTGCAGGAGTTTGTGCATGTGTGTGCTTACACATGTGT  700

seq1  TTTGCAGTGTGTTTGCTTGCAAGTGTGTTGTGCTGTGTGTTGTGTATATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAGTGTGTTTGCTTGCAAGTGTGTTGTGCTGTGTGTTGTGTATATG  750

seq1  TGTGTGTGTGTGTTG  765
      ||||||||||||| |
seq2  TGTGTGTGTGTGTGG  765