BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018J24
Chromosome16 (Build37)
Map Location 8,092,900 - 8,235,034
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneA2bp1
Downstream gene4930511J11Rik, BC024814, Abat, LOC665207, Tmem186, Pmm2, Carhsp1, EG436336, Usp7, LOC665231, 1810013L24Rik, LOC100043106
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018J24.bB6Ng01-018J24.g
ACCDH851971DH851972
length1641,062
definitionDH851971|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018J24, 5' end.DH851972|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018J24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(8,234,871 - 8,235,034)(8,092,900 - 8,093,960)
sequence
gaattcctggctaggtttgtgctgtggttaagtctagcagcttaacccag
ggtggcagcatgtctctagatttggcagagctaggtccctcattagtctt
ttctggtgctaacagggccaattctcactctcggctgctgacctggggtg
aggtggggtggagg
gaattcttgtaagtgattgagggaggcaggagcattaggattggaagcaa
atggggagatgatacttaaatgctaatattttattttgtaatagtggagc
atggacccaaagccttgtgagtggcaaacaaacagactgtgactaagtca
tgcctccagcccttcaactttctaatactataattttattgatacgtaat
tgatgaaccaaagcttcggataactaacatatatttttatgcatttagac
atatagataaactcatgaaatcattgtaacaatcagggcttacaatggaa
ctgatagaatgggggaacttatgaagtggtgttgattacatcactggctt
ggacgatggaggggcaaacaaatgaggcagcttctcaaagatggatcaaa
cacaagaagctgttctagagcttccagaatgaactatgtgtggctgccat
catttgtttattcctttagaccagcacagctttctaaccttgagaagtgt
gaggtagcaaacttctgagcttatgctaatctgttacagccactggaagc
tgacacagtcctagttacaaaatgtgcagtaagtgtggttctatcctttc
tcccaaattcagtcctcccactttcaagttggtttcttctctgttttgac
ttaatcctcggtgattcaccaggactcaatacccacatcataaaaattgc
agaacattttcatgccagatttctgggctttggataataattgcccactt
atatactgaccactacctccctgaatcgtcatcacgactgtatctcatgg
gtggagacacagcggtttgttactattaagtacaacattggaagtgctga
gaccatttgttctctcagactccagttttacatgttgacctcctaggagg
cttccccaccctcacttgatcctcctgccactgctgactgctcaccttac
agctagcagagccaaattttgtatctgttacttggaaaccccaacgcttt
ttcactgtagctcagaattacacatgtgttgaaataacaaggaaactatc
taccagagcttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_8234871_8235034
seq2: B6Ng01-018J24.b_46_209 (reverse)

seq1  CCTCCACCCCACCTCACCCCAGGTCAGCAGCCGAGAGTGAGAATTGGCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACCCCACCTCACCCCAGGTCAGCAGCCGAGAGTGAGAATTGGCCC  50

seq1  TGTTAGCACCAGAAAAGACTAATGAGGGACCTAGCTCTGCCAAATCTAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGCACCAGAAAAGACTAATGAGGGACCTAGCTCTGCCAAATCTAGA  100

seq1  GACATGCTGCCACCCTGGGTTAAGCTGCTAGACTTAACCACAGCACAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGCTGCCACCCTGGGTTAAGCTGCTAGACTTAACCACAGCACAAAC  150

seq1  CTAGCCAGGAATTC  164
      ||||||||||||||
seq2  CTAGCCAGGAATTC  164

seq1: chr16_8092900_8093960
seq2: B6Ng01-018J24.g_68_1129

seq1  GAATTCTTGTAAGTGATTGAGGGAGGCAGGAGCATTAGGATTGGAAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTAAGTGATTGAGGGAGGCAGGAGCATTAGGATTGGAAGCAA  50

seq1  ATGGGGAGATGATACTTAAATGCTAATATTTTATTTTGTAATAGTGGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAGATGATACTTAAATGCTAATATTTTATTTTGTAATAGTGGAGC  100

seq1  ATGGACCCAAAGCCTTGTGAGTGGCAAACAAACAGACTGTGACTAAGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACCCAAAGCCTTGTGAGTGGCAAACAAACAGACTGTGACTAAGTCA  150

seq1  TGCCTCCAGCCCTTCAACTTTCTAATACTATAATTTTATTGATACGTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCAGCCCTTCAACTTTCTAATACTATAATTTTATTGATACGTAAT  200

seq1  TGATGAACCAAAGCTTCGGATAACTAACATATATTTTTATGCATTTAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAACCAAAGCTTCGGATAACTAACATATATTTTTATGCATTTAGAC  250

seq1  ATATAGATAAACTCATGAAATCATTGTAACAATCAGGGCTTACAATGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGATAAACTCATGAAATCATTGTAACAATCAGGGCTTACAATGGAA  300

seq1  CTGATAGAATGGGGGAACTTATGAAGTGGTGTTGATTACATCACTGGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAGAATGGGGGAACTTATGAAGTGGTGTTGATTACATCACTGGCTT  350

seq1  GGACGATGGAGGGGCAAACAAATGAGGCAGCTTCTCAAAGATGGATCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGATGGAGGGGCAAACAAATGAGGCAGCTTCTCAAAGATGGATCAAA  400

seq1  CACAAGAAGCTGTTCTAGAGCTTCCAGAATGAACTATGTGTGGCTGCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGAAGCTGTTCTAGAGCTTCCAGAATGAACTATGTGTGGCTGCCAT  450

seq1  CATTTGTTTATTCCTTTAGACCAGCACAGCTTTCTAACCTTGAGAAGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTTATTCCTTTAGACCAGCACAGCTTTCTAACCTTGAGAAGTGT  500

seq1  GAGGTAGCAAACTTCTGAGCTTATGCTAATCTGTTACAGCCACTGGAAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAGCAAACTTCTGAGCTTATGCTAATCTGTTACAGCCACTGGAAGC  550

seq1  TGACACAGTCCTAGTTACAAAATGTGCAGTAAGTGTGGTTCTATCCTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACAGTCCTAGTTACAAAATGTGCAGTAAGTGTGGTTCTATCCTTTC  600

seq1  TCCCAAATTCAGTCCTCCCACTTTCAAGTTGGTTTCTTCTCTGTTTTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAATTCAGTCCTCCCACTTTCAAGTTGGTTTCTTCTCTGTTTTGAC  650

seq1  TTAATCCTCGGTGATTCACCAGGACTCAATACCCACATCATAAAAATTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCCTCGGTGATTCACCAGGACTCAATACCCACATCATAAAAATTGC  700

seq1  AGAACA-TTTCATGCCAGA-TTCTGGGCTTTGGATAATAATTGCCCACTT  748
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACATTTTCATGCCAGATTTCTGGGCTTTGGATAATAATTGCCCACTT  750

seq1  ATATACTGACCACTACCTCCCTGAATCGTCATCACGACTGTATCTCATGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACTGACCACTACCTCCCTGAATCGTCATCACGACTGTATCTCATGG  800

seq1  GTGGAGACACAGCGGTTCGTCACTATTAAGTACAACATTGGAAAGTGCTG  848
      ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGGAGACACAGCGGTTTGTTACTATTAAGTACAACATTGG-AAGTGCTG  849

seq1  AGACCA-TTGGTCTCTCAGACTCCAGTTTTACATG-TGACCTCCTAGGAG  896
      |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGACCATTTGTTCTCTCAGACTCCAGTTTTACATGTTGACCTCCTAGGAG  899

seq1  GCTTCCCCACCCTCACTTGATCCTTCCTGCCACTGCTGACTGCTCACCTT  946
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCCCACCCTCACTTGATCC-TCCTGCCACTGCTGACTGCTCACCTT  948

seq1  ACAGCTTAGCAGAGCCAAA-TCTGTATCTGTTACTTGGAAACCCCAAACG  995
      ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACAGC-TAGCAGAGCCAAATTTTGTATCTGTTACTTGGAAACCCC-AACG  996

seq1  CTTTTTCACTGTAGCTCAG-ATATCACAGGTGGTGAAATGACAAAGGAGA  1044
      ||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||| || ||||| |
seq2  CTTTTTCACTGTAGCTCAGAATTACACATGTGTTGAAATAAC-AAGGAAA  1045

seq1  CTACTTACCAGAGCTTG  1061
      |||  ||||||||||||
seq2  CTATCTACCAGAGCTTG  1062