BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051K02
Chromosome16 (Build37)
Map Location 31,020,431 - 31,119,278
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAI480653, Centb2
Upstream gene9030404E10Rik, Hes1, EG547263, 1700025H01Rik, LOC100043110, Cpn2, Lrrc15, Gp5, Atp13a3, Tmem44, Lsg1, BC022623, LOC100043122
Downstream genePpp1r2, Apod, 1700007E05Rik, Bdh1, Gm536, Dlg1, Mfi2, LOC677155, Pigz, 0610012G03Rik, Ncbp2, Senp5, Pak2, Pigx, 1500031L02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051K02.bB6Ng01-051K02.g
ACCDH875214DH875215
length924783
definitionDH875214|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051K02, 5' end.DH875215|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051K02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,118,506 - 31,119,278)(31,020,431 - 31,021,211)
sequence
gaattctaaattctttttgaaagaaaaaaattcattttcattcctgtgta
catgtatgtccgactgcaagtttgtacaagtgtgactgcattgcccccag
aggcaccagattattattgtaaggcacagcctgcccatgcagccctggct
agcctggaactcgctgtttatgctgggctagcctcactcacagagatctg
ttagcctctgcctccagccagagtgcaggattaaggcctgcatccctgag
ccctgcatccttgtgctcttccttgtttctgttatgtgtacgtacggata
tatctctgtgcatgagagtgcagggagtcacagagacctgtggtgtttga
tccccctggacccagagtcccaggtggttgtgggccacctaacgtgggtg
ctgtgagcagctctggtcttctgtgtgcagtaagtgctcctcaaggtggg
gccatttcttgagtcctacaattatggattcttttttttttttttttaac
attttaaaaattttgcttctttgaatgtatatgggtattttacctgcatg
tgtgtctttataccatgtatacagtgcccacaaaggccagtagttaccct
cagatcccctggaactggagttacagatgctgggaattgaacctgggtcc
tctgaacctaggccagtgctcctaactgctgagacatctctccacctttt
attaggattttatttttattcttaattatgccatatgtttgtgtgtcttg
catgtagatttgtacacttgagtgccccttgtgaggttagaagagggcat
caggtctgctgggaattgaagttaataggcagttgtgagctgcctgaccc
taactcctgtctgctgcaagaagcagtgttcacccttaaccactgagcca
gctttccagctccaattttgaaat
gaattcccaaataactgcagtgaggagccaggtgtaacctgtgaacacaa
gaaacactggatagacagacaagaggaaaaagagctgtcttttatggtca
agggcaacatgtgttttattttgtatcttgtacagttaggttggttacat
tgcattcctgtaatgtaaccagggcctgtcaaaaactctctgctcatttt
gaactgggattttctggccaaggacaagcctttctctttgccttaagaaa
aacctagaactgctcctccttccttctgcacctcatgaggggtttgcaat
gtaatgatgatgacagacaggagaagcagctggaaagtcaggctgctcag
gaggaaaactgctccttcaggaagcggagagtcggttgcactacccctgg
gggatggggtaagtccatgttctcctgggtgcggggtggagggtctgggc
tagaccctctcagtgcacgcactgacggtgcagcaagccacatgtctgat
ggaagtagaacacagaatgcctgtcctggttaccacggggaactctgcat
tctttcaatcagataacatatttataaaccctcctctgtccacttccaca
ggaggaagagctggtgcccagtgatggtgctgagaggcagcagagagcag
gaaggtggcagccctcactcatgctcaccacagccctatttggaaagacc
tgtacatctcctatcaaggtgtaattctggcagccctcctgggcactctg
ggctctccagactggcccccaacattaaagaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_31118506_31119278
seq2: B6Ng01-051K02.b_39_811 (reverse)

seq1  ACTCAAGTGTACAAATCTACATGCAAGACACACAAACATATGGCATAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAGTGTACAAATCTACATGCAAGACACACAAACATATGGCATAATT  50

seq1  AAGAATAAAAATAAAATCCTAATAAAAGGTGGAGAGATGTCTCAGCAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAAAAATAAAATCCTAATAAAAGGTGGAGAGATGTCTCAGCAGTT  100

seq1  AGGAGCACTGGCCTAGGTTCAGAGGACCCAGGTTCAATTCCCAGCATCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCACTGGCCTAGGTTCAGAGGACCCAGGTTCAATTCCCAGCATCTG  150

seq1  TAACTCCAGTTCCAGGGGATCTGAGGGTAACTACTGGCCTTTGTGGGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCCAGTTCCAGGGGATCTGAGGGTAACTACTGGCCTTTGTGGGCAC  200

seq1  TGTATACATGGTATAAAGACACACATGCAGGTAAAATACCCATATACATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATACATGGTATAAAGACACACATGCAGGTAAAATACCCATATACATT  250

seq1  CAAAGAAGCAAAATTTTTAAAATGTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAGCAAAATTTTTAAAATGTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCCAT  300

seq1  AATTGTAGGACTCAAGAAATGGCCCCACCTTGAGGAGCACTTACTGCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTAGGACTCAAGAAATGGCCCCACCTTGAGGAGCACTTACTGCACA  350

seq1  CAGAAGACCAGAGCTGCTCACAGCACCCACGTTAGGTGGCCCACAACCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGACCAGAGCTGCTCACAGCACCCACGTTAGGTGGCCCACAACCAC  400

seq1  CTGGGACTCTGGGTCCAGGGGGATCAAACACCACAGGTCTCTGTGACTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGACTCTGGGTCCAGGGGGATCAAACACCACAGGTCTCTGTGACTCC  450

seq1  CTGCACTCTCATGCACAGAGATATATCCGTACGTACACATAACAGAAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACTCTCATGCACAGAGATATATCCGTACGTACACATAACAGAAACA  500

seq1  AGGAAGAGCACAAGGATGCAGGGCTCAGGGATGCAGGCCTTAATCCTGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAGCACAAGGATGCAGGGCTCAGGGATGCAGGCCTTAATCCTGCA  550

seq1  CTCTGGCTGGAGGCAGAGGCTAACAGATCTCTGTGAGTGAGGCTAGCCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGCTGGAGGCAGAGGCTAACAGATCTCTGTGAGTGAGGCTAGCCCA  600

seq1  GCATAAACAGCGAGTTCCAGGCTAGCCAGGGCTGCATGGGCAGGCTGTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAACAGCGAGTTCCAGGCTAGCCAGGGCTGCATGGGCAGGCTGTGC  650

seq1  CTTACAATAATAATCTGGTGCCTCTGGGGGCAATGCAGTCACACTTGTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAATAATAATCTGGTGCCTCTGGGGGCAATGCAGTCACACTTGTAC  700

seq1  AAACTTGCAGTCGGACATACATGTACACAGGAATGAAAATGAATTTTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGCAGTCGGACATACATGTACACAGGAATGAAAATGAATTTTTTT  750

seq1  CTTTCAAAAAGAATTTAGAATTC  773
      |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAAAAGAATTTAGAATTC  773

seq1: chr16_31020431_31021211
seq2: B6Ng01-051K02.g_63_845

seq1  GAATTCCCAAATAACTGCAGTGAGGAGCCAGGTGTAACCTGTGAACACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAATAACTGCAGTGAGGAGCCAGGTGTAACCTGTGAACACAA  50

seq1  GAAACACTGGATAGACAGACAAGAGGAAAAAGAGCTGTCTTTTATGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACACTGGATAGACAGACAAGAGGAAAAAGAGCTGTCTTTTATGGTCA  100

seq1  AGGGCAACATGTGTTTTATTTTGTATCTTGTACAGTTAGGTTGGTTACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAACATGTGTTTTATTTTGTATCTTGTACAGTTAGGTTGGTTACAT  150

seq1  TGCATTCCTGTAATGTAACCAGGGCCTGTCAAAAACTCTCTGCTCATTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTCCTGTAATGTAACCAGGGCCTGTCAAAAACTCTCTGCTCATTTT  200

seq1  GAACTGGGATTTTCTGGCCAAGGACAAGCCTTTCTCTTTGCCTTAAGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGGGATTTTCTGGCCAAGGACAAGCCTTTCTCTTTGCCTTAAGAAA  250

seq1  AACCTAGAACTGCTCCTCCTTCCTTCTGCACCTCATGAGGGGTTTGCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAGAACTGCTCCTCCTTCCTTCTGCACCTCATGAGGGGTTTGCAAT  300

seq1  GTAATGATGATGACAGACAGGAGAAGCAGCTGGAAAGTCAGGCTGCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGATGATGACAGACAGGAGAAGCAGCTGGAAAGTCAGGCTGCTCAG  350

seq1  GAGGAAAACTGCTCCTTCAGGAAGCGGAGAGTCGGTTGCACTACCCCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAAACTGCTCCTTCAGGAAGCGGAGAGTCGGTTGCACTACCCCTGG  400

seq1  GGGATGGGGTAAGTCCATGTTCTCCTGGGTGCGGGGTGGAGGGTCTGGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGGGTAAGTCCATGTTCTCCTGGGTGCGGGGTGGAGGGTCTGGGC  450

seq1  TAGACCCTCTCAGTGCACGCACTGACGGTGCAGCAAGCCACATGTCTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCCTCTCAGTGCACGCACTGACGGTGCAGCAAGCCACATGTCTGAT  500

seq1  GGAAGTAGAACACAGAATGCCTGTCCTGGTTACCACGGGGAACTCTGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTAGAACACAGAATGCCTGTCCTGGTTACCACGGGGAACTCTGCAT  550

seq1  TCTTTCAATCAGATAACATATTTATAAACCCTCCTCTGTCCACTTCCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAATCAGATAACATATTTATAAACCCTCCTCTGTCCACTTCCACA  600

seq1  GGAGGAAGAGCTGGTGCCCAGTGATGGTGCTGAGAGGCAGCAGAGAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAAGAGCTGGTGCCCAGTGATGGTGCTGAGAGGCAGCAGAGAGCAG  650

seq1  GAAGGTGGCAGCCCTCACTCAGGCTCACCACAGCCCTATTTGG-AAGACC  699
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAAGGTGGCAGCCCTCACTCATGCTCACCACAGCCCTATTTGGAAAGACC  700

seq1  TGTACATCTCCTATCTAGGTGTAATTCTGGCAGCCCTCCTGGGCACTCT-  748
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGTACATCTCCTATCAAGGTGTAATTCTGGCAGCCCTCCTGGGCACTCTG  750

seq1  GGCTCTCCAGACTGGCCCCCAACAGTAAAGACA  781
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGCTCTCCAGACTGGCCCCCAACATTAAAGACA  783