BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051O18
Chromosome16 (Build37)
Map Location 80,076,233 - 80,190,853
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePrss7, EG383172, 1700066C05Rik
Downstream geneLOC621365, LOC100039724
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051O18.bB6Ng01-051O18.g
ACCDH875426DH875427
length1,139572
definitionDH875426|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051O18, 5' end.DH875427|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051O18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,189,710 - 80,190,853)(80,076,233 - 80,076,809)
sequence
gaattctttacacaagagcacttgttcttgcttgtgttgtccatcattag
tgagaccattagtcaggatcactgattaagtccgtgtagtccattagcga
gtctgaatctcacaagaaacaggctagttgcaatatggatacaaaacctg
gcagtatttttgaagaatctggaagaattttatgtgcgtgccttgaaaat
agaggagaatatcgtctttgaaatacaagcctcgattttagagaaaatat
tgatgtagtcattctgttaccaaggaaactacatttaaagagaaattggg
cttaatacaagtacatgatctagggtgtcacattgaatgtcgaccatggt
ggtgccaaagactagtaaagtgaaactaatagaaacattatgtggagcat
ggtggttagttctaattgtcagctttgacataccaggcaatcacctgaag
gaaatatttcagcgagggatcgctacatcatgatgtccttttgttgtgtc
tttgggtgattatcttgattcccctaactggtgacaaaagatgcaggtca
ctgtaggagacaccataccttgggtagggaatctaagactgtgttaagat
ggagaatactaactgggcacgacgggaaagcaaaatagtgaagctcgtga
gtatgcaagcatttgttgcactgttcactgaatgtgactaaacactttag
gcccttgctaagcaggagtaggcttccggatctgtagagctgtgctctct
actactctcctgtccttagcctgagtagctatgagcttgtctgactcatg
caattcaattgaatctaaaggtcaatcagtgaccactgcatcctaccaag
ctttctagagacaatcaagctaaaacagaacctcctaaggtaaccattat
attctcagccacagccaggctcctagtaagtttcatgggctgcaggagtt
tcataggaaatgctcaaagcagttggtcagtaaagatgacagtcggcttc
tgtcactaagatcacaattgttcaaggaaaatacatgaaagagaaatgct
gtttgttccctccctttatcccttgcccctccttcttcctcctggaatgt
gtaaccaattacctataactatgcctgcatctgagggaa
ctgtcattgcttaggaggcatggattaaggtgcatgactgagcatagttc
aaggtgactactaatagtcattggaattacatgactagaaatgcaaaagc
agtgccccattctatgtaaaggtttgcacatgccttttaacactgccaag
tagaaattcatagggaaaagtaggttggggtttcgaaatttggaagaatc
tattttctgttgatttgctaagcagcttcttttagaaagtaattccactt
tcttcttttataaacatagacccatggtatcattagaattgcatacctat
aataacgtggatgctgcttataaacctaactcataattcagaaaaacttg
caagcattctaaggctttattcagaaggagaagaaaagtgcaaaggcaag
aaaatggaggggtagggattaagggggaaagccagagggagggggtgttg
agacagagacagacagagacaggaagacacacagagacatatagagatac
ggacacacatacatacacacacacacacacatgcatgcatagagagacat
agagagaataggtacatggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_80189710_80190853
seq2: B6Ng01-051O18.b_47_1185 (reverse)

seq1  TTCCCTCAAGATGCAGGCATAGTTATA-GTAATGTGTTTACACATATACA  49
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||
seq2  TTCCCTC-AGATGCAGGCATAGTTATAGGTAAT-TGGTTACACAT-TCCA  47

seq1  GAGAGAAGGAGGAGGGGCAAGGGATAGAGGGAGAGAACACAACAGCATTT  99
      |   |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||
seq2  GGAGGAAGAAGGAGGGGCAAGGGATAAAGGGAGGGAACA-AACAGCATTT  96

seq1  CCTCTTTCATGTATTTTCCTTGGAC-ATTGTGATCTTTAGTGACAG-AGC  147
       ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||
seq2  -CTCTTTCATGTATTTTCCTTGAACAATTGTGATC-TTAGTGACAGAAGC  144

seq1  CGACTGTCATCTTTACTGACCAACTGCTTTGAGCATTTCCCTATGAAACT  197
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CGACTGTCATCTTTACTGACCAACTGCTTTGAGCATTT-CCTATGAAACT  193

seq1  CCCTGCAGCCCATGAAACTTACTAGGAGCCTGGCTGTGGCTGAGAATATA  247
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -CCTGCAGCCCATGAAACTTACTAGGAGCCTGGCTGTGGCTGAGAATATA  242

seq1  ATGGTTACCTTAGGAGGTTCTGTTTTAGCTTGATTGTCTCTAGAAAGCTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTACCTTAGGAGGTTCTGTTTTAGCTTGATTGTCTCTAGAAAGCTT  292

seq1  GGTAGGATGCAGTGGTCACTGATTGACCTTTAGATTCAATTGAATTGCAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGATGCAGTGGTCACTGATTGACCTTTAGATTCAATTGAATTGCAT  342

seq1  GAGTCAGACAAGCTCATAGCTACTCAGGCTAAGGACAGGAGAGTAGTAGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGACAAGCTCATAGCTACTCAGGCTAAGGACAGGAGAGTAGTAGA  392

seq1  GAGCACAGCTCTACAGATCCGGAAGCCTACTCCTGCTTAGCAAGGGCCTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACAGCTCTACAGATCCGGAAGCCTACTCCTGCTTAGCAAGGGCCTA  442

seq1  AAGTGTTTAGTCACATTCAGTGAACAGTGCAACAAATGCTTGCATACTCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTTAGTCACATTCAGTGAACAGTGCAACAAATGCTTGCATACTCA  492

seq1  CGAGCTTCACTATTTTGCTTTCCCGTCGTGCCCAGTTAGTATTCTCCATC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCTTCACTATTTTGCTTTCCCGTCGTGCCCAGTTAGTATTCTCCATC  542

seq1  TTAACACAGTCTTAGATTCCCTACCCAAGGTATGGTGTCTCCTACAGTGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACAGTCTTAGATTCCCTACCCAAGGTATGGTGTCTCCTACAGTGA  592

seq1  CCTGCATCTTTTGTCACCAGTTAGGGGAATCAAGATAATCACCCAAAGAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCATCTTTTGTCACCAGTTAGGGGAATCAAGATAATCACCCAAAGAC  642

seq1  ACAACAAAAGGACATCATGATGTAGCGATCCCTCGCTGAAATATTTCCTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAAAGGACATCATGATGTAGCGATCCCTCGCTGAAATATTTCCTT  692

seq1  CAGGTGATTGCCTGGTATGTCAAAGCTGACAATTAGAACTAACCACCATG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGATTGCCTGGTATGTCAAAGCTGACAATTAGAACTAACCACCATG  742

seq1  CTCCACATAATGTTTCTATTAGTTTCACTTTACTAGTCTTTGGCACCACC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACATAATGTTTCTATTAGTTTCACTTTACTAGTCTTTGGCACCACC  792

seq1  ATGGTCGACATTCAATGTGACACCCTAGATCATGTACTTGTATTAAGCCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCGACATTCAATGTGACACCCTAGATCATGTACTTGTATTAAGCCC  842

seq1  AATTTCTCTTTAAATGTAGTTTCCTTGGTAACAGAATGACTACATCAATA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCTCTTTAAATGTAGTTTCCTTGGTAACAGAATGACTACATCAATA  892

seq1  TTTTCTCTAAAATCGAGGCTTGTATTTCAAAGACGATATTCTCCTCTATT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTAAAATCGAGGCTTGTATTTCAAAGACGATATTCTCCTCTATT  942

seq1  TTCAAGGCACGCACATAAAATTCTTCCAGATTCTTCAAAAATACTGCCAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGGCACGCACATAAAATTCTTCCAGATTCTTCAAAAATACTGCCAG  992

seq1  GTTTTGTATCCATATTGCAACTAGCCTGTTTCTTGTGAGATTCAGACTCG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGTATCCATATTGCAACTAGCCTGTTTCTTGTGAGATTCAGACTCG  1042

seq1  CTAATGGACTACACGGACTTAATCAGTGATCCTGACTAATGGTCTCACTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGGACTACACGGACTTAATCAGTGATCCTGACTAATGGTCTCACTA  1092

seq1  ATGATGGACAACACAAGCAAGAACAAGTGCTCTTGTGTAAAGAATTC  1144
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGGACAACACAAGCAAGAACAAGTGCTCTTGTGTAAAGAATTC  1139

seq1: chr16_80076233_80076809
seq2: B6Ng01-051O18.g_67_644

seq1  GAATTCCTGTCATTGCTTAGGAGGCATGGATTAAGGTGCATGACTGAGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTCATTGCTTAGGAGGCATGGATTAAGGTGCATGACTGAGCA  50

seq1  TAGTTCAAGGTGACTACTAATAGTCATTGGAATTACATGACTAGAAATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCAAGGTGACTACTAATAGTCATTGGAATTACATGACTAGAAATGC  100

seq1  AAAAGCAGTGCCCCATTCTATGTAAAGGTTTGCACATGCCTTTTAACACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAGTGCCCCATTCTATGTAAAGGTTTGCACATGCCTTTTAACACT  150

seq1  GCCAAGTAGAAATTCATAGGGAAAAGTAGGTTGGGGTTTCGAAATTTGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTAGAAATTCATAGGGAAAAGTAGGTTGGGGTTTCGAAATTTGGA  200

seq1  AGAATCTATTTTCTGTTGATTTGCTAAGCAGCTTCTTTTAGAAAGTAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCTATTTTCTGTTGATTTGCTAAGCAGCTTCTTTTAGAAAGTAATT  250

seq1  CCACTTTCTTCTTTTATAAACATAGACCCATGGTATCATTAGAATTGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTCTTCTTTTATAAACATAGACCCATGGTATCATTAGAATTGCAT  300

seq1  ACCTATAATAACGTGGATGCTGCTTATAAACCTAACTCATAATTCAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATAATAACGTGGATGCTGCTTATAAACCTAACTCATAATTCAGAAA  350

seq1  AACTTGCAAGCATTCTAAGGCTTTATTCAGAAGGAGAAGAAAAGTGCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGCAAGCATTCTAAGGCTTTATTCAGAAGGAGAAGAAAAGTGCAAA  400

seq1  GGCAAGAAAATGGAGGGGTAGGGATTAAGGGGGAAAGCCAGAGGGAGGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGAAAATGGAGGGGTAGGGATTAAGGGGGAAAGCCAGAGGGAGGGG  450

seq1  GTGTTGAGACAGAGACAGACAGAGACAGGAAGACACACAGAGACATATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGAGACAGAGACAGACAGAGACAGGAAGACACACAGAGACATATAG  500

seq1  AGATACGGACACACATACATACACACACACACACACATGCATGCAGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGATACGGACACACATACATACACACACACACACACATGCATGCATAGAG  550

seq1  AGACAGAGAGAGAA-AGGTACATGGAGA  577
      ||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  AGACATAGAGAGAATAGGTACATGGAGA  578