BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-071I07
Chromosome16 (Build37)
Map Location 59,753,816 - 59,791,130
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEpha6
Upstream geneOlfr172, Olfr173, Olfr174, Olfr178, Olfr180, Olfr1563-ps1, Olfr181, Olfr182-ps1, Olfr183, Olfr185-ps1, Olfr186, Olfr187, Olfr188-ps1, Olfr189-ps1, Olfr190, Olfr191, Olfr192, Olfr193, Olfr1540-ps1, Olfr194, Olfr195, Olfr196, Olfr197, Olfr198, Olfr199, Olfr200-ps1, Olfr201, Olfr202, Olfr203, Olfr204, Olfr205, GA_x5J8B7U0478-6-340, Olfr206, Olfr207, Gabrr3, LOC100043803, Mina, BC043118, LOC672884, Arl6
Downstream geneLOC100043804, EG668168, LOC668170
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-071I07.bB6Ng01-071I07.g
ACCDH889197DH889198
length1,1381,124
definitionDH889197|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071I07, 5' end.DH889198|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071I07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,789,979 - 59,791,130)(59,753,816 - 59,754,957)
sequence
gaattcccagagagttgaacctgcttcaaccttaccaggtcttctgtctg
gtggcaccatccactcacaccacgtgtagtgttttcacttactatgaaat
catgcttcagcttctcctttccttcttctattttgaatagcctttcagct
atgctaactctcatggatctccctgactttaccttgtcaacctttttagt
acctcctgtgctttgaatgcaagagactccagcctgtctggctttcccgt
atcttgccaaactaatcattttttatctcagacaatggtgtgtgctaaga
actgtccacagactccagtacaccattctcttccgaatcgttctgtgata
tttgttttaccaccattatttaaaatgacttcacttatttatttatttat
ttttactctttcttttctagtcttctgtctcctataaatacacagaaact
gctctcggtttggattttcgtgtcaacctctgttaaccagagcaatcatt
gtcccacagtagacacttgaagagtattatctcagggcatggatttgtgc
aaaaggccatctgaaagataatatttgtcatgaaaagctcaagggaagaa
aaaaacaatcaatattccttaatggggaaactgtataagcccaacattta
agttggtaccagttttaagggtgaataaaaaagatggatcaaaacaagga
tgggggactaaagataaaggggagtcacaatttcatattcatgatgaaag
cattgcatcttgctctgtctctgaagactgttaggcaataacagtataag
acttcagtattagtaggacctccaaaaagcaaaactcagcacataattat
atggtagcttcctatagcatgacactctaatccaatatttgttctaaact
cagccagatacctaaactctaaaaagaataaacattgaaaaggctaacat
atctatgggtgcacctcactaaaggggggagagggggccttgagaccatc
aaaacagctggagttgctgcagagatgatgtgacatgccagtgacagctt
aaatctagaggatgctggcccaggtttgaggaagctgatgagctctctgc
agctcgaattgcagttaatatttatgtatagctcagca
gaattccaaggctgcatcgtgtgggaaataatgtcctctagttcagtaaa
aaagaggtaggtgggaatgtagggaaaacgtacttggtatattgcacatg
acaataacacaggagctaatgcaaaaataaagcaaagcaaaatgactcat
gttaaaaaattacttcagactacagagggttgtttatagatcaagaaaag
acaatctgctattgtctttaatattagatataagggtttgttgtgtcttt
aattggtgtctcctctaaatttccatattgaaaaccttatgcccagtatg
tcagaatatgacttttttactgttagagctacatgctgactagggatgaa
ggaaagaagattcaaggctccttcagagagcaagcatactacatggtaca
aagtacatagtatgtgtacatagtacaagcatgatacaaattctctactc
tcataaaagccagacatggctgactgggaccctgagcccctggtggatgc
catggcttcaccagtcagccagtccaaacaaaatagtgagcatagcatga
tgttcagtgagggaccctgctccaaattaagatggagagataactgagga
agatatcaccctttacactccacatgggcctgaaggatcagtacatctgt
atacatacatgcagttatgtctgcagaacacacacacacacacacataca
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcctaagta
aataaattaagaaatatagatttaaaactattcagtaacagtcatatgta
aaattacaattacctgttttttcaacctggtttaaaacataggattcctg
ggtgagggcagtgactcagtgggtaaagtgctcgttgtgcaaacagaaaa
tcctaaatttgaacctcagcgcccaagtaaaaggttctgtacctataatc
ccagtgctagggagtgcatataggctgagtaccgtgttcacaggtcagcc
gatttaccaaaacgatgactactgattccactttgttcaaagataagtag
agactatagaggagccatgtgacatcacctctgtctcccacgtcatgcat
ggagatacctgtacatacaccaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_59789979_59791130
seq2: B6Ng01-071I07.b_43_1180 (reverse)

seq1  TGCTGAAAGCTATACAT-AATAATGACTGCTATTCTGAAAGCTGCAGAGA  49
      |||||  |||||||||| |||| | ||||| ||||    |||||||||||
seq2  TGCTG--AGCTATACATAAATATTAACTGCAATTC---GAGCTGCAGAGA  45

seq1  GCTCCATCAAGCCTTCCCTCAGACCCTGGGGCACAGCATCCTCTAGATCT  99
      ||| |||| |||  | ||||| | ||||||   ||||||||||||||| |
seq2  GCT-CATC-AGC--TTCCTCA-AACCTGGG--CCAGCATCCTCTAGATTT  88

seq1  AAGCTGTCACTGGCATGTCACATCATCTCTGCAGCAACTCCAGCTGTTTT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTCACTGGCATGTCACATCATCTCTGCAGCAACTCCAGCTGTTTT  138

seq1  GATGGTTCTCAAGGCCCCCTCCTCCCCCCTTTAGTGAGGTGCACCCATAG  199
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGG-TCTCAAGGCCCCCT-CTCCCCCCTTTAGTGAGGTGCACCCATAG  186

seq1  ATATGTTAGCCTTTTCAATGTTTATTCTTTTTAGAGTTTAGGTATCTGGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATATGTTAGCCTTTTCAATGTTTATTCTTTTTAGAGTTTAGGTATCTGG-  235

seq1  CTGAGTTTAGAACAAATATTGGATTAGAGTGTCATGCTATAGGAAGCTAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTTTAGAACAAATATTGGATTAGAGTGTCATGCTATAGGAAGCTAC  285

seq1  CATATAATTATGTGCTGAGTTTTGCTTTTTGGAGGTCCTACTAATACTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAATTATGTGCTGAGTTTTGCTTTTTGGAGGTCCTACTAATACTGA  335

seq1  AGTCTTATACTGTTATTGCCTAACAGTCTTCAGAGACAGAGCAAGATGCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTATACTGTTATTGCCTAACAGTCTTCAGAGACAGAGCAAGATGCA  385

seq1  ATGCTTTCATCATGAATATGAAATTGTGACTCCCCTTTATCTTTAGTCCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTCATCATGAATATGAAATTGTGACTCCCCTTTATCTTTAGTCCC  435

seq1  CCATCCTTGTTTTGATCCATCTTTTTTATTCACCCTTAAAACTGGTACCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTTGTTTTGATCCATCTTTTTTATTCACCCTTAAAACTGGTACCA  485

seq1  ACTTAAATGTTGGGCTTATACAGTTTCCCCATTAAGGAATATTGATTGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAATGTTGGGCTTATACAGTTTCCCCATTAAGGAATATTGATTGTT  535

seq1  TTTTTCTTCCCTTGAGCTTTTCATGACAAATATTATCTTTCAGATGGCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTTCCCTTGAGCTTTTCATGACAAATATTATCTTTCAGATGGCCT  585

seq1  TTTGCACAAATCCATGCCCTGAGATAATACTCTTCAAGTGTCTACTGTGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCACAAATCCATGCCCTGAGATAATACTCTTCAAGTGTCTACTGTGG  635

seq1  GACAATGATTGCTCTGGTTAACAGAGGTTGACACGAAAATCCAAACCGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGATTGCTCTGGTTAACAGAGGTTGACACGAAAATCCAAACCGAG  685

seq1  AGCAGTTTCTGTGTATTTATAGGAGACAGAAGACTAGAAAAGAAAGAGTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTTCTGTGTATTTATAGGAGACAGAAGACTAGAAAAGAAAGAGTA  735

seq1  AAAATAAATAAATAAATAAGTGAAGTCATTTTAAATAATGGTGGTAAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAATAAATAAATAAGTGAAGTCATTTTAAATAATGGTGGTAAAAC  785

seq1  AAATATCACAGAACGATTCGGAAGAGAATGGTGTACTGGAGTCTGTGGAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATCACAGAACGATTCGGAAGAGAATGGTGTACTGGAGTCTGTGGAC  835

seq1  AGTTCTTAGCACACACCATTGTCTGAGATAAAAAATGATTAGTTTGGCAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTTAGCACACACCATTGTCTGAGATAAAAAATGATTAGTTTGGCAA  885

seq1  GATACGGGAAAGCCAGACAGGCTGGAGTCTCTTGCATTCAAAGCACAGGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACGGGAAAGCCAGACAGGCTGGAGTCTCTTGCATTCAAAGCACAGGA  935

seq1  GGTACTAAAAAGGTTGACAAGGTAAAGTCAGGGAGATCCATGAGAGTTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTAAAAAGGTTGACAAGGTAAAGTCAGGGAGATCCATGAGAGTTAG  985

seq1  CATAGCTGAAAGGCTATTCAAAATAGAAGAAGGAAAGGAGAAGCTGAAGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCTGAAAGGCTATTCAAAATAGAAGAAGGAAAGGAGAAGCTGAAGC  1035

seq1  ATGATTTCATAGTAAGTGAAAACACTACACGTGGTGTGAGTGGATGGTGC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTCATAGTAAGTGAAAACACTACACGTGGTGTGAGTGGATGGTGC  1085

seq1  CACCAGACAGAAGACCTGGTAAGGTTGAAGCAGGTTCAACTCTCTGGGAA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGACAGAAGACCTGGTAAGGTTGAAGCAGGTTCAACTCTCTGGGAA  1135

seq1  TTC  1152
      |||
seq2  TTC  1138

seq1: chr16_59753816_59754957
seq2: B6Ng01-071I07.g_66_1189

seq1  GAATTCCAAGGCTGCATCGTGTGGGAAATAATGTCCTCTAGTTCAGTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGGCTGCATCGTGTGGGAAATAATGTCCTCTAGTTCAGTAAA  50

seq1  AAAGAGGTAGGTGGGAATGTAGGGAAAACGTACTTGGTATATTGCACATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGGTAGGTGGGAATGTAGGGAAAACGTACTTGGTATATTGCACATG  100

seq1  ACAATAACACAGGAGCTAATGCAAAAATAAAGCAAAGCAAAATGACTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAACACAGGAGCTAATGCAAAAATAAAGCAAAGCAAAATGACTCAT  150

seq1  GTTAAAAAATTACTTCAGACTACAGAGGGTTGTTTATAGATCAAGAAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAAAATTACTTCAGACTACAGAGGGTTGTTTATAGATCAAGAAAAG  200

seq1  ACAATCTGCTATTGTCTTTAATATTAGATATAAGGGTTTGTTGTGTCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTGCTATTGTCTTTAATATTAGATATAAGGGTTTGTTGTGTCTTT  250

seq1  AATTGGTGTCTCCTCTAAATTTCCATATTGAAAACCTTATGCCCAGTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGTGTCTCCTCTAAATTTCCATATTGAAAACCTTATGCCCAGTATG  300

seq1  TCAGAATATGACTTTTTTACTGTTAGAGCTACATGCTGACTAGGGATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAATATGACTTTTTTACTGTTAGAGCTACATGCTGACTAGGGATGAA  350

seq1  GGAAAGAAGATTCAAGGCTCCTTCAGAGAGCAAGCATACTACATGGTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGAAGATTCAAGGCTCCTTCAGAGAGCAAGCATACTACATGGTACA  400

seq1  AAGTACATAGTATGTGTACATAGTACAAGCATGATACAAATTCTCTACTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACATAGTATGTGTACATAGTACAAGCATGATACAAATTCTCTACTC  450

seq1  TCATAAAAGCCAGACATGGCTGACTGGGACCCTGAGCCCCTGGTGGATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAAAGCCAGACATGGCTGACTGGGACCCTGAGCCCCTGGTGGATGC  500

seq1  CATGGCTTCACCAGTCAGCCAGTCCAAACAAAATAGTGAGCATAGCATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTTCACCAGTCAGCCAGTCCAAACAAAATAGTGAGCATAGCATGA  550

seq1  TGTTCAGTGAGGGACCCTGCTCCAAATTAAGATGGAGAGATAACTGAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGTGAGGGACCCTGCTCCAAATTAAGATGGAGAGATAACTGAGGA  600

seq1  AGATATCACCCTTTACACTCCACATGGGCCTGAAGGATCAGTACATCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATCACCCTTTACACTCCACATGGGCCTGAAGGATCAGTACATCTGT  650

seq1  ATACATACATGCAGTTATGTCTGCAGAACACACACACACACACACATACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACATGCAGTTATGTCTGCAGAACACACACACACACACACATACA  700

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCTAAGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCTAAGTA  750

seq1  AATAAATTAAGAAATATAGATTTAAAACTATTCAGTAACAGTCATATGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATTAAGAAATATAGATTTAAAACTATTCAGTAACAGTCATATGTA  800

seq1  AAATTACAATTACCTGTTTTTTCAACCTGGTTTAAAACATAGGATTCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTACAATTACCTGTTTTTTCAACCTGGTTTAAAACATAGGATTCCTG  850

seq1  GGTGAGGGCAGTGACTCAGTGGGTAAAGTGCTCGTTGTGCAAACAGAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGGGCAGTGACTCAGTGGGTAAAGTGCTCGTTGTGCAAACAGAAAA  900

seq1  TCCTAAATTTGAACCTCAGCGCCCAAGTAAAAGGTTCTGTACCTATAATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAAATTTGAACCTCAGCGCCCAAGTAAAAGGTTCTGTACCTATAATC  950

seq1  CCAGTGCTAGGGAGTGCATATAGGCTGAGTACCGTTGTTCACAGGTCAGC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CCAGTGCTAGGGAGTGCATATAGGCTGAGTACCG-TGTTCACAGGTCAGC  999

seq1  CGATTTACCAAAAACGATGAACTACTGATTCCAACTTTGTTTCAAAAGAT  1050
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||
seq2  CGATTTACC-AAAACGATG-ACTACTGATTCC-ACTTTGTT--CAAAGAT  1044

seq1  AAAGTAGAGACTATTAGAGGAAGCCATGTGACATCAACCTCTGGTTCTCC  1100
       |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||
seq2  -AAGTAGAGACTA-TAGAGG-AGCCATGTGACATC-ACCTCTG--TCTCC  1088

seq1  CACGTCCATGCAATGGGAAGATTACCTGTACATACACACAGA  1142
      ||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||
seq2  CACGT-CATGC-ATGG--AGA-TACCTGTACATACAC-CAGA  1124