BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-072K03
Chromosome16 (Build37)
Map Location 18,187,720 - 18,310,137
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG665975, Zdhhc8, Ranbp1, Htf9c, Dgcr8, D16H22S680E
Upstream geneUbe2l3, Gm603, Hic2, D16Bwg1494e, Pik4ca, Serpind1, Snap29, Crkl, Aifm3, Lztr1, Thap7, 4930451C15Rik, P2rxl1, Slc7a4, Smpd4, Pcqap, EG433050, Map1lc3-ps8, EG665892, LOC100042830, Klhl22, Scarf2, Car15, Dgcr2, Tssk1, Tssk2, Es2el, Gscl, Slc25a1, Vpreb2, Dgcr6, Prodh, Rtn4r
Downstream geneLOC100042884, Arvcf, Comt, Txnrd2, Gnb1l, Tbx1, Gp1bb, Sept5, LOC622795, Cldn5, Cdc45l, Ufd1l, 2510002D24Rik, Mrpl40, Hira, Igl, Igl-C1, Igl-J1, Igl-C3, Igl-J3p, Igl-J3, Igl-V1, Igl-C4, Igl-J4, Igl-C2, Igl-J2, Igl-V3, Igl-V2, Olfr164
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-072K03.bB6Ng01-072K03.g
ACCDH889996DH889997
length1,100934
definitionDH889996|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072K03, 5' end.DH889997|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072K03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(18,309,026 - 18,310,137)(18,187,720 - 18,188,654)
sequence
gaattcagtggctatgtcaaacagctggaaaccaggctgctgtttaagct
gagcagatccacattggcttctgcaggtgggcctctggaaatctgaatag
ccttccttgctgtagaccctgcagggtcagagggctgctaaaaagcaatt
tcacaagttaggctgcttttgccatggctgaggctgcaggatatcagttg
ggtactgagaagcctaggttctaagctgggcatgataaagcacaccttta
atcccagcacttgactcagagacaggcagatctcagtggattcaacgaca
gttggtctacataaagagttgtaggccagctaggaccaaacagtgagact
tggtctcaaaacaagcaactaagccctagggctgcagagatggatcagtg
gctccaagtgcatgcagcttttgcagaggacaagagtgcagttcccaaca
cccatgtcaaatgactcctgcaaccggagctccaggggagcctagtttct
ggtgtccacaggcacccatacacatacaataaaaaaataacaacaaatat
ttaaaaacaacttcaaaaacaacaaaaagaaaccaaggcctacaacagag
gtttggcctggccatagttgtccctggactggcctttcccttgtctgtcc
atggcaaggatgacagagaccccaacataagtactcaataccatgggtcc
ttacacaaaaaaaaaaaaataaataaaagaaacaaaacagaataacaacc
cccaaaatcagtatctccaaaatgtattagctaaacatcttaaagtttca
agggtaaggtgaagaagaaaataaaaggaatacgaacccagactgggact
gctgggtctgtaggcaagtcatgcctggtgttcatgtgtaacaagaggaa
tggtctcaataaccaacgccaccatgtccgtgttcatccatttggaaggt
atttcagactcacttctaagtccagcttatcctggccccatagtcaaaca
ccatgagtctatggggcatacctgccatagcataatgcaaatacatttag
tccaccttcaagttcccatagtctatacagtctcacagtgtaaagtctaa

gaattccattcacaatgaaaatatcaagggagttgggaggtgtgaagagg
gcatgcaataggacacttattaggtaggtccttgcattaggttggccctg
tgttacaaaggctctgtattagatacgcccatgtgttaggtaggctttat
gttcgataggctctgagttaggtaggcctgtgtgctaggtagagtctgtg
ttaagtgggctctgttttaggtagacccctgtgttaggtaggtcagtgtg
ttaggtagatcctgtgttaggtaggcccctttgttaagtaggtctctgtg
ttaggtaggatcaagttgcttttctcttcgctctgataaaattacctgac
caagtctggcagtggtgactcatgcctttattccctgctcttgggaggca
gagacaggtggatcttataaatagaggccagcctggcctatggatggagt
tccaggatagccaaggctatccagagaaccctctttccagaaaaacaaaa
caatcattacctggttagagaaactgcatgaaagaagggtttatttttgg
ctcacagtttgagagcataatctatcatgttggaaaggcatggtggctgg
aggatgcagtgactaactactggtcatggggggttgttttagcagtcagg
aagcagagagaagtggacactggtattcagttgtctcctctctcccacac
tccagctcctcaaacgcacaatgagtattccctcatttgttgcccagcag
ttgtcttctagatgttaagttgacaatggctgtggtggttgaatatcctt
ggcccacgggaagcaacactattatggagtgtagccttgttagagtaggt
gtgacctttgtcttagtttgggttttgttgctgtgagcagacaccatgac
aaaggcaactcttatcagggacaacatttaattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_18309026_18310137
seq2: B6Ng01-072K03.b_45_1144 (reverse)

seq1  TTAGACTTTTAACACTGTTGAGACTGTTATAGACTATGGGGACTTTTGAA  50
      |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||
seq2  TTAGACTTT--ACACTG-TGAGACTG-TATAGACTATGGGAAC--TTGAA  44

seq1  GGTGGACTAAATGTATTTTGCATTATGCTATGGCAAGGTATGGCCCCCAT  100
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||
seq2  GGTGGACTAAATGTA-TTTGCATTATGCTATGGC-AGGTATG--CCCCAT  90

seq1  AGACTCAT-GTGTTTGACTATGGGGGCCCAGGATAAGCTGGACCTTAGAA  149
      |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||
seq2  AGACTCATGGTGTTTGACTATGGGG--CCAGGATAAGCTGGA-CTTAGAA  137

seq1  GTGAGTCTGAAATACCTTCCAAATGGATGAACACGGACATGGTGGCGTTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTCTGAAATACCTTCCAAATGGATGAACACGGACATGGTGGCGTTG  187

seq1  GTTATTGAGACCATTCCTCTTGTTACACATGAACACCAGGCATGACTTGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTGAGACCATTCCTCTTGTTACACATGAACACCAGGCATGACTTGC  237

seq1  CTACAGACCCAGCAGTCCCAGTCTGGGTTCGTATTCCTTTTATTTTCTTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGACCCAGCAGTCCCAGTCTGGGTTCGTATTCCTTTTATTTTCTTC  287

seq1  TTCACCTTACCCTTGAAACTTTAAGATGTTTAGCTAATACATTTTGGAGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCTTACCCTTGAAACTTTAAGATGTTTAGCTAATACATTTTGGAGA  337

seq1  TACTGATTTTGGGGGTTGTTATTCTGTTTTGTTTCTTTTATTTATTTTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGATTTTGGGGGTTGTTATTCTGTTTTGTTTCTTTTATTTATTTTTT  387

seq1  TTTTTTTGTGTAAGGACCCATGGTATTGAGTACTTATGTTGGGGTCTCTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTGTGTAAGGACCCATGGTATTGAGTACTTATGTTGGGGTCTCTG  437

seq1  TCATCCTTGCCATGGACAGACAAGGGAAAGGCCAGTCCAGGGACAACTAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTTGCCATGGACAGACAAGGGAAAGGCCAGTCCAGGGACAACTAT  487

seq1  GGCCAGGCCAAACCTCTGTTGTAGGCCTTGGTTTCTTTTTGTTGTTTTTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGGCCAAACCTCTGTTGTAGGCCTTGGTTTCTTTTTGTTGTTTTTG  537

seq1  AAGTTGTTTTTAAATATTTGTTGTTATTTTTTTATTGTATGTGTATGGGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTTTTTAAATATTTGTTGTTATTTTTTTATTGTATGTGTATGGGT  587

seq1  GCCTGTGGACACCAGAAACTAGGCTCCCCTGGAGCTCCGGTTGCAGGAGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGGACACCAGAAACTAGGCTCCCCTGGAGCTCCGGTTGCAGGAGT  637

seq1  CATTTGACATGGGTGTTGGGAACTGCACTCTTGTCCTCTGCAAAAGCTGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGACATGGGTGTTGGGAACTGCACTCTTGTCCTCTGCAAAAGCTGC  687

seq1  ATGCACTTGGAGCCACTGATCCATCTCTGCAGCCCTAGGGCTTAGTTGCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACTTGGAGCCACTGATCCATCTCTGCAGCCCTAGGGCTTAGTTGCT  737

seq1  TGTTTTGAGACCAAGTCTCACTGTTTGGTCCTAGCTGGCCTACAACTCTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGAGACCAAGTCTCACTGTTTGGTCCTAGCTGGCCTACAACTCTT  787

seq1  TATGTAGACCAACTGTCGTTGAATCCACTGAGATCTGCCTGTCTCTGAGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGACCAACTGTCGTTGAATCCACTGAGATCTGCCTGTCTCTGAGT  837

seq1  CAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCTTTATCATGCCCAGCTTAGAACCTAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCTTTATCATGCCCAGCTTAGAACCTAG  887

seq1  GCTTCTCAGTACCCAACTGATATCCTGCAGCCTCAGCCATGGCAAAAGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCAGTACCCAACTGATATCCTGCAGCCTCAGCCATGGCAAAAGCA  937

seq1  GCCTAACTTGTGAAATTGCTTTTTAGCAGCCCTCTGACCCTGCAGGGTCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAACTTGTGAAATTGCTTTTTAGCAGCCCTCTGACCCTGCAGGGTCT  987

seq1  ACAGCAAGGAAGGCTATTCAGATTTCCAGAGGCCCACCTGCAGAAGCCAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAAGGAAGGCTATTCAGATTTCCAGAGGCCCACCTGCAGAAGCCAA  1037

seq1  TGTGGATCTGCTCAGCTTAAACAGCAGCCTGGTTTCCAGCTGTTTGACAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATCTGCTCAGCTTAAACAGCAGCCTGGTTTCCAGCTGTTTGACAT  1087

seq1  AGCCACTGAATTC  1112
      |||||||||||||
seq2  AGCCACTGAATTC  1100

seq1: chr16_18187720_18188654
seq2: B6Ng01-072K03.g_67_1000

seq1  GAATTCCATTCACAATGAAAATATCAAGGGAGTTGGGAGGTGTGAAGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTCACAATGAAAATATCAAGGGAGTTGGGAGGTGTGAAGAGG  50

seq1  GCATGCAATAGGACACTTATTAGGTAGGTCCTTGCATTAGGTTGGCCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCAATAGGACACTTATTAGGTAGGTCCTTGCATTAGGTTGGCCCTG  100

seq1  TGTTACAAAGGCTCTGTATTAGATACGCCCATGTGTTAGGTAGGCTTTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACAAAGGCTCTGTATTAGATACGCCCATGTGTTAGGTAGGCTTTAT  150

seq1  GTTCGATAGGCTCTGAGTTAGGTAGGCCTGTGTGCTAGGTAGAGTCTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCGATAGGCTCTGAGTTAGGTAGGCCTGTGTGCTAGGTAGAGTCTGTG  200

seq1  TTAAGTGGGCTCTGTTTTAGGTAGACCCCTGTGTTAGGTAGGTCAGTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTGGGCTCTGTTTTAGGTAGACCCCTGTGTTAGGTAGGTCAGTGTG  250

seq1  TTAGGTAGATCCTGTGTTAGGTAGGCCCCTTTGTTAAGTAGGTCTCTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTAGATCCTGTGTTAGGTAGGCCCCTTTGTTAAGTAGGTCTCTGTG  300

seq1  TTAGGTAGGATCAAGTTGCTTTTCTCTTCGCTCTGATAAAATTACCTGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTAGGATCAAGTTGCTTTTCTCTTCGCTCTGATAAAATTACCTGAC  350

seq1  CAAGTCTGGCAGTGGTGACTCATGCCTTTATTCCCTGCTCTTGGGAGGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCTGGCAGTGGTGACTCATGCCTTTATTCCCTGCTCTTGGGAGGCA  400

seq1  GAGACAGGTGGATCTTATAAATAGAGGCCAGCCTGGCCTATGGATGGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGGTGGATCTTATAAATAGAGGCCAGCCTGGCCTATGGATGGAGT  450

seq1  TCCAGGATAGCCAAGGCTATCCAGAGAACCCTCTTTCCAGAAAAACAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGATAGCCAAGGCTATCCAGAGAACCCTCTTTCCAGAAAAACAAAA  500

seq1  CAATCATTACCTGGTTAGAGAAACTGCATGAAAGAAGGGTTTATTTTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCATTACCTGGTTAGAGAAACTGCATGAAAGAAGGGTTTATTTTTGG  550

seq1  CTCACAGTTTGAGAGCATAATCTATCATGTTGGAAAGGCATGGTGGCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGTTTGAGAGCATAATCTATCATGTTGGAAAGGCATGGTGGCTGG  600

seq1  AGGATGCAGTGACTAACTACTGGTCATGGGGGGTTGTTTTAGCAGTCAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCAGTGACTAACTACTGGTCATGGGGGGTTGTTTTAGCAGTCAGG  650

seq1  AAGCAGAGAGAAGTGGACACTGGTATTCAGTTGTCTCCTCTCTCCCACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGAGAGAAGTGGACACTGGTATTCAGTTGTCTCCTCTCTCCCACAC  700

seq1  TCCAGCTCCTCAAACGCACAATGAGTATTCCCTCATTTGTTGCCCAGCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTCCTCAAACGCACAATGAGTATTCCCTCATTTGTTGCCCAGCAG  750

seq1  TTGTCTTCTAGATGTTAAGTTGACAATGGCTGTGGTGGTTTGAATATCCT  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTGTCTTCTAGATGTTAAGTTGACAATGGCTGTGGTGG-TTGAATATCCT  799

seq1  TGGCCCACGGGAAGCAACACTATTATGGAGTGTAGCCTTGTTAGAGTAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCACGGGAAGCAACACTATTATGGAGTGTAGCCTTGTTAGAGTAGG  849

seq1  TGTGACCTTTGTCTTAGTTTGGGTTTTGTTGCTGTGAGCAGACACCATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACCTTTGTCTTAGTTTGGGTTTTGTTGCTGTGAGCAGACACCATGA  899

seq1  CAAAGGCAACTCTTATCAGGGACAACATTTAATTG  935
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGCAACTCTTATCAGGGACAACATTTAATTG  934