BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073B12
Chromosome16 (Build37)
Map Location 79,646,700 - 79,804,537
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930570E03Rik, Chodl, Prss7
Downstream geneEG383172, 1700066C05Rik, LOC621365
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073B12.bB6Ng01-073B12.g
ACCDH890324DH890325
length1,1771,092
definitionDH890324|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073B12, 5' end.DH890325|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073B12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,646,700 - 79,647,887)(79,803,444 - 79,804,537)
sequence
gaattccaggacagccagggctatacatagaaaccccgtcttgggaaaaa
aaaaaacatacaaaaaaacaacaacaacaacaaaaaaaaaaccaaacaaa
caatagtttcatactttctgtgctaatactcttaataaaattgcacgcgt
gttattgatgaaacttgtacaatactgagatactactgtgagacaggata
taaaacagctatatcaacaatatattctcacatagttttatcgtaattaa
tgcaatggcatagtgtgccataaggtgcataaagcaataactgtgatcta
ttgttctagtgaatggctctgcttggagtctttcctacacttactattaa
taagaaaagagtaacatcccatacaacatatttccttaaccccattcctt
tacttgagtttatttttcaatgccctttcaatttggcattccttttctta
ttatctgattagttaacctgtcacatgcttccttatggttcgaggaagtt
ctactttgatatacatgactggctcttgactcaagtaagagaaaagtagg
ggcagattcaaccaccagtatgtcagaataacagataatctttagcttat
tatacatggtgtttccacaaggtgtagattggatttcaggcctattggag
cagtcatttgtcactactatggtagacctccaaatgttctatagactaat
acactagttacaagaagtcataaaacaagcataggtacaaaattaaatga
gaagaggggttaatttatataagaacctagaaatcattatttaagactgt
ctggattccatctacattgagaaatgtttgatatttatttaactatttta
tctgataatggataataaatctataagcatacaataattgtgtaaaatta
tctttactttaaacttttgtttaagtttaaaaattcacattaatcagata
tttggtggtgacgatacatacatagataatgggtaatgctcaaaccagcc
taatgaatgaatgcatcatcattttctttatcaacaattattcagaatca
tttcttcttttagcagaaaagttaaattattatctggctttgaattcgtt
tttaattgcctaaaatttctgggtgatatcctttaaaagcatgtaataaa
cctctgattacagaaactgatcaggaa
gaattcccctacattgggacatctagacttcacaagaccaaggacctttc
ctcccattgatacccaacaaggccatcctctgctacccatgctgctgaaa
acattgggctccatgtgtactctttggttggtggtttactaaactcactt
ctggtagtgaaatttttatttttgtaaatgtctcattcacacaagtatta
gagattgttcctaataatatatatatatatatattaggaagaatctactg
tagcagctcccatatggatttattttttgaaaggcttttattgttagcca
tccctctcttcttttttctcctcttcctaaaaccttgattcattttcatt
tgatcaaaaataaatcatctatcttgttatttacaacttacaatagtaag
ttgaagttaataaatggtattacttgggtcaactttcagcaattatatat
cattgtccacttggcttctctatcattatgatagatcaccatgattaaga
gtcacttaggagaaaagagagttgattttaatcatacttccaagtcaatg
tctgtcactgaaagaactcagaacagaaattcaggcagtatcctagaggc
aggaatagaaacagagaacatagtagaaaggtatgtattgctttgtatta
aattcctcgctaaatcaattatcttatatatcctaggactaagtgccgag
aaaaagcactatccagtgtgctggggcctcccctacatcgcatatcaatc
aaagaaatatcctaaaaacatacccatggataattttatgcaagcaattc
tttaagtgaggagagtcaactgcaatttgtcatacgaatgcatcatgttg
gtctcttgggttataaaaggctagtagtattcagcacttgagaggtacac
acacatgaatttttatttttgtgtttttctctttatccttaaataaatga
ggacatcccaaaatgacagtcttactttaacttgcattgactaatcagta
atccatgacctccactctgcaaacacttatgttaaaatgtggatgcctag
cattaacaatagaggtttacctccagatcattagaaaacact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_79646700_79647887
seq2: B6Ng01-073B12.b_46_1222

seq1  GAATTCCAGGACAGCCAGGGCTATACATAGAAACCCCGTCTTGGG-AAAA  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GAATTCCAGGACAGCCAGGGCTATACATAGAAACCCCGTCTTGGGAAAAA  50

seq1  AAAAAACATACAAAAAAACAACAACAACAACAAAAAAAAAACCAAACAAA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACATACAAAAAAACAACAACAACAACAAAAAAAAAACCAAACAAA  100

seq1  CAATAGTTTCATACTTTCTGTGCTAATACTCTTAATAAAATTGCACGCGT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGTTTCATACTTTCTGTGCTAATACTCTTAATAAAATTGCACGCGT  150

seq1  GTTATTGATGAAACTTGTACAATACTGAGATACTACTGTGAGACAGGATA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTGATGAAACTTGTACAATACTGAGATACTACTGTGAGACAGGATA  200

seq1  TAAAACAGCTATATCAACAATATATTCTCACATAGTTTTATCGTAATTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACAGCTATATCAACAATATATTCTCACATAGTTTTATCGTAATTAA  250

seq1  TGCAATGGCATAGTGTGCCATAAGGTGCATAAAGCAATAACTGTGATCTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATGGCATAGTGTGCCATAAGGTGCATAAAGCAATAACTGTGATCTA  300

seq1  TTGTTCTAGTGAATGGCTCTGCTTGGAGTCTTTCCTACACTTACTATTAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTAGTGAATGGCTCTGCTTGGAGTCTTTCCTACACTTACTATTAA  350

seq1  TAAGAAAAGAGTAACATCCCATACAACATATTTCCTTAACCCCATTCCTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAAGAGTAACATCCCATACAACATATTTCCTTAACCCCATTCCTT  400

seq1  TACTTGAGTTTATTTTTCAATGCCCTTTCAATTTGGCATTCCTTTTCTTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGAGTTTATTTTTCAATGCCCTTTCAATTTGGCATTCCTTTTCTTA  450

seq1  TTATCTGATTAGTTAACCTGTCACATGCTTCCTTATGGTTCGAGGAAGTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTGATTAGTTAACCTGTCACATGCTTCCTTATGGTTCGAGGAAGTT  500

seq1  CTACTTTGATATACATGACTGGCTCTTGACTCAAGTAAGAGAAAAGTAGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTTGATATACATGACTGGCTCTTGACTCAAGTAAGAGAAAAGTAGG  550

seq1  GGCAGATTCAACCACCAGTATGTCAGAATAACAGATAATCTTTAGCTTAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGATTCAACCACCAGTATGTCAGAATAACAGATAATCTTTAGCTTAT  600

seq1  TATACATGGTGTTTCCACAAGGTGTAGATTGGATTTCAGGCCTATTGGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATGGTGTTTCCACAAGGTGTAGATTGGATTTCAGGCCTATTGGAG  650

seq1  CAGTCATTTGTCACTACTATGGTAGACCTCCAAATGTTCTATAGACTAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCATTTGTCACTACTATGGTAGACCTCCAAATGTTCTATAGACTAAT  700

seq1  ACACTAGTTACAAGAAGTCATAAAACAAGCATAGGTACAAAATTAAATGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAGTTACAAGAAGTCATAAAACAAGCATAGGTACAAAATTAAATGA  750

seq1  GAAGAGGGGTTAATTTATATAAGAACCTAGAAATCATTATTTAAGACTGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGGGGTTAATTTATATAAGAACCTAGAAATCATTATTTAAGACTGT  800

seq1  CTGGATTCCATCTACATTGAGAAATGTTTGATATTTATTTAACTATTTTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTCCATCTACATTGAGAAATGTTTGATATTTATTTAACTATTTTA  850

seq1  TCTGATAATGGATAATAAATCTATAAGCATACAATAATTGTGTAAAATTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATAATGGATAATAAATCTATAAGCATACAATAATTGTGTAAAATTA  900

seq1  TCTTTACTTTAAACTTTTGTTTTAAGTTTAAAAATTCACATTAATCAGAT  949
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACTTTAAACTTTTG-TTTAAGTTTAAAAATTCACATTAATCAGAT  949

seq1  ATTTGGTGGTGACGATACATACATAGATAATGGGTAATGCTCAAACCAGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGTGGTGACGATACATACATAGATAATGGGTAATGCTCAAACCAGC  999

seq1  CTAATGAATGAATGCATCATCATTTTCTTTATCAACAAATTATTCAGAAT  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTAATGAATGAATGCATCATCATTTTCTTTATCAAC-AATTATTCAGAAT  1048

seq1  CATTTCTTCTGTCAGGCAGAAATAGTATATAATTATTATCTGGCTATGAA  1099
      |||||||||| | | ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||
seq2  CATTTCTTCTTTTA-GCAGAAA-AGT-TA-AATTATTATCTGGCTTTGAA  1094

seq1  TTCGTTTTTAATTGCACTAAAATTTCTGGGTGATTAATCCTTTAAGAGGC  1149
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||
seq2  TTCGTTTTTAATTGC-CTAAAATTTCTGGGTGAT--ATCCTTTAA-AAGC  1140

seq1  ATGTACATAAA-CTCTGATACCAGAAAACTGAACCAGGAA  1188
      ||||| ||||| |||||||  ||| |||||| | ||||||
seq2  ATGTA-ATAAACCTCTGATTACAG-AAACTG-ATCAGGAA  1177

seq1: chr16_79803444_79804537
seq2: B6Ng01-073B12.g_70_1161 (reverse)

seq1  AGTGTTTTCTAATGATCTGGAGGT-AATCTCTAATTGTTAATGCTA-GCA  48
      |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||
seq2  AGTGTTTTCTAATGATCTGGAGGTAAACCTCT-ATTGTTAATGCTAGGCA  49

seq1  ATCACATTTTAACATAAAGTGTATGCAGAGT-GAGGTCATGGATTTAACT  97
        ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  |||
seq2  TCCACATTTTAACAT-AAGTGTTTGCAGAGTGGAGGTCATGGATT--ACT  96

seq1  GAATTAGTCAATGCAAGTTAAAGTAAGACTGTCATTTTGGGGATGTCCTC  147
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  G-ATTAGTCAATGCAAGTTAAAGTAAGACTGTCATTTT-GGGATGTCCTC  144

seq1  ATTTTATTTAAGGATAAAGAGAAAAACAC-AAAATAAAAATTCATGTGTG  196
      | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  A-TTTATTTAAGGATAAAGAGAAAAACACAAAAATAAAAATTCATGTGTG  193

seq1  TGTACCTCTCAAGTGCTGAATACTACTAGCCTTTTATAA-CCAAGAGACC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGTACCTCTCAAGTGCTGAATACTACTAGCCTTTTATAACCCAAGAGACC  243

seq1  AACATGATGCATTCGTATGACAAATTGCAGTTGACTCTCCTCACTTAAAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGATGCATTCGTATGACAAATTGCAGTTGACTCTCCTCACTTAAAG  293

seq1  AATTGCTTGCATAAAATTATCCATGGGTATGTTTTTAGGATATTTCTTTG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTTGCATAAAATTATCCATGGGTATGTTTTTAGGATATTTCTTTG  343

seq1  ATTGATATGCGATGTAGGGGAGGCCCCAGCACACTGGATAGTGCTTTTTC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATATGCGATGTAGGGGAGGCCCCAGCACACTGGATAGTGCTTTTTC  393

seq1  TCGGCACTTAGTCCTAGGATATATAAGATAATTGATTTAGCGAGGAATTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGCACTTAGTCCTAGGATATATAAGATAATTGATTTAGCGAGGAATTT  443

seq1  AATACAAAGCAATACATACCTTTCTACTATGTTCTCTGTTTCTATTCCTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAAAGCAATACATACCTTTCTACTATGTTCTCTGTTTCTATTCCTG  493

seq1  CCTCTAGGATACTGCCTGAATTTCTGTTCTGAGTTCTTTCAGTGACAGAC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTAGGATACTGCCTGAATTTCTGTTCTGAGTTCTTTCAGTGACAGAC  543

seq1  ATTGACTTGGAAGTATGATTAAAATCAACTCTCTTTTCTCCTAAGTGACT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGACTTGGAAGTATGATTAAAATCAACTCTCTTTTCTCCTAAGTGACT  593

seq1  CTTAATCATGGTGATCTATCATAATGATAGAGAAGCCAAGTGGACAATGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATCATGGTGATCTATCATAATGATAGAGAAGCCAAGTGGACAATGA  643

seq1  TATATAATTGCTGAAAGTTGACCCAAGTAATACCATTTATTAACTTCAAC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAATTGCTGAAAGTTGACCCAAGTAATACCATTTATTAACTTCAAC  693

seq1  TTACTATTGTAAGTTGTAAATAACAAGATAGATGATTTATTTTTGATCAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTATTGTAAGTTGTAAATAACAAGATAGATGATTTATTTTTGATCAA  743

seq1  ATGAAAATGAATCAAGGTTTTAGGAAGAGGAGAAAAAAGAAGAGAGGGAT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAATGAATCAAGGTTTTAGGAAGAGGAGAAAAAAGAAGAGAGGGAT  793

seq1  GGCTAACAATAAAAGCCTTTCAAAAAATAAATCCATATGGGAGCTGCTAC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAACAATAAAAGCCTTTCAAAAAATAAATCCATATGGGAGCTGCTAC  843

seq1  AGTAGATTCTTCCTAATATATATATATATATATTATTAGGAACAATCTCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGATTCTTCCTAATATATATATATATATATTATTAGGAACAATCTCT  893

seq1  AATACTTGTGTGAATGAGACATTTACAAAAATAAAAATTTCACTACCAGA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTTGTGTGAATGAGACATTTACAAAAATAAAAATTTCACTACCAGA  943

seq1  AGTGAGTTTAGTAAACCACCAACCAAAGAGTACACATGGAGCCCAATGTT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTTTAGTAAACCACCAACCAAAGAGTACACATGGAGCCCAATGTT  993

seq1  TTCAGCAGCATGGGTAGCAGAGGATGGCCTTGTTGGGTATCAATGGGAGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCAGCATGGGTAGCAGAGGATGGCCTTGTTGGGTATCAATGGGAGG  1043

seq1  AAAGGTCCTTGGTCTTGTGAAGTCTAGATGTCCCAATGTAGGGGAATTC  1094
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCCTTGGTCTTGTGAAGTCTAGATGTCCCAATGTAGGGGAATTC  1092