BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-086L15
Chromosome16 (Build37)
Map Location 75,236,375 - 75,407,230
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRobo2, LOC665042
Downstream geneD930038D03Rik, Rbm11, Stch, LOC546667, Samsn1, 4930578N18Rik, LOC100039457, Nrip1, LOC100039316
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-086L15.bB6Ng01-086L15.g
ACCDH900047DH900048
length7791,150
definitionDH900047|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-086L15, 5' end.DH900048|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-086L15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,236,375 - 75,237,153)(75,406,066 - 75,407,230)
sequence
gaattcctatccaagccagccaaccaagaagggccagcatgatggctctg
caggtaaaggcattctatcgcaagcttgatgattgaactcagtcctaaga
attcacatgctgaaagaagagactcttgctagtttttctctaagctctac
agttacacaaggatatgtgtcccatatacacaagcagaagggcacacata
aaataaaaacacaaacaaaactatataaatgctggtggtaattatatcgg
ggtacccccaaatagaagatccaaataatccacctgggtatatacttaaa
tgaatctaaatcagaacaccatgaggatacataaccatcaatgtttactg
ctggattattcacagtagccagtgtttggaactagccttgatttctttca
atagacagattaaaaactgtgatatagtttatacacaaaagtattttgct
tgggcataaagaataatgtaactacatgatttgtaagaaaggggatagga
ttgcaaatcatacattgagagaaatgaatcagatccttaaagacaattag
tgaatgtatatgacatagacatacaaagatgttaaggcactggataaaga
gtagatgagtaattacaccatttataggaaaagggatggaattggaaatc
atatgttgagagaaataaatcagatacacaagaacaattagtgcatgtat
atatatcacacacacaaacacacttacagaaagaaatggacaaagagtat
atatatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtg
gaattcccagatttatgttgttataaactcccctatccctgcccacctga
aatggcgtatattagaagcaaacctgtttcaaatggagagaaatgtatct
acattaacactttggaatgcaggaaattgatatgaaagcaaatgctctgt
tttccagataagtcagatttattatattaggactgtaggatcacttttca
tttaagtggtatcacttatttgctacaacattcctaatgtatattgtagt
ggtaccataagcaatttctttcaatttttaaaattttcatacagcaaaat
tttcctaaacatgtgatttcagaacctttacaaatcatctcctgcaattt
caataccatgaagtctgtatatttcataaatatttcatatttcaagggaa
gaaaaatagaacaagaatatcagatttctttaagaattcttcccgatcta
tatattgacaagccctcacttcttgaaatcccttaaaatggatatttccg
gtgtgtgtgtcatgtctttagacaggtggttggaccagggagaatggagc
tgataaatgagcagacaaagttcatacaatagtcaacttcattcagggca
tttggcaacttatactctgagggttagaagtccttgtgtgtaaaatcctc
atgatttcaagctgtatgcattcacaacaacaagaacaagctgcatatgg
ctgaaacacgttttccatagaggcaaaataggataccaacagcaagcaat
agcaagcaatctggaaggagcatgaaaacacattccaaagagactctgtg
ttgtgtagaaactgaaatcacaagactcttaccttgctttcctggagtgt
tttcatgagcattcagaattctcctcatatgactctatgcctggactgtg
ttccagcaatggtgcctttttgttgaatatttagcctgaagattttcttc
ctgggttctttcattgtgagttgctagaataatacaatgcctggatctac
ccacagctattttctgttcttcagtctttacatgataagtaaatcccctc
taaaactctgtgatagtttttggtggataaaatttgaagatgttggataa
ataaaacatttcttgctgacatacaagagaagtcagtagtacagctgact

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_75236375_75237153
seq2: B6Ng01-086L15.b_47_825

seq1  GAATTCCTATCCAAGCCAGCCAACCAAGAAGGGCCAGCATGATGGCTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATCCAAGCCAGCCAACCAAGAAGGGCCAGCATGATGGCTCTG  50

seq1  CAGGTAAAGGCATTCTATCGCAAGCTTGATGATTGAACTCAGTCCTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTAAAGGCATTCTATCGCAAGCTTGATGATTGAACTCAGTCCTAAGA  100

seq1  ATTCACATGCTGAAAGAAGAGACTCTTGCTAGTTTTTCTCTAAGCTCTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACATGCTGAAAGAAGAGACTCTTGCTAGTTTTTCTCTAAGCTCTAC  150

seq1  AGTTACACAAGGATATGTGTCCCATATACACAAGCAGAAGGGCACACATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACACAAGGATATGTGTCCCATATACACAAGCAGAAGGGCACACATA  200

seq1  AAATAAAAACACAAACAAAACTATATAAATGCTGGTGGTAATTATATCGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAAACACAAACAAAACTATATAAATGCTGGTGGTAATTATATCGG  250

seq1  GGTACCCCCAAATAGAAGATCCAAATAATCCACCTGGGTATATACTTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCCCCAAATAGAAGATCCAAATAATCCACCTGGGTATATACTTAAA  300

seq1  TGAATCTAAATCAGAACACCATGAGGATACATAACCATCAATGTTTACTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCTAAATCAGAACACCATGAGGATACATAACCATCAATGTTTACTG  350

seq1  CTGGATTATTCACAGTAGCCAGTGTTTGGAACTAGCCTTGATTTCTTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTATTCACAGTAGCCAGTGTTTGGAACTAGCCTTGATTTCTTTCA  400

seq1  ATAGACAGATTAAAAACTGTGATATAGTTTATACACAAAAGTATTTTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACAGATTAAAAACTGTGATATAGTTTATACACAAAAGTATTTTGCT  450

seq1  TGGGCATAAAGAATAATGTAACTACATGATTTGTAAGAAAGGGGATAGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCATAAAGAATAATGTAACTACATGATTTGTAAGAAAGGGGATAGGA  500

seq1  TTGCAAATCATACATTGAGAGAAATGAATCAGATCCTTAAAGACAATTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAATCATACATTGAGAGAAATGAATCAGATCCTTAAAGACAATTAG  550

seq1  TGAATGTATATGACATAGACATACAAAGATGTTAAGGCACTGGATAAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGTATATGACATAGACATACAAAGATGTTAAGGCACTGGATAAAGA  600

seq1  GTAGATGAGTAATTACACCATTTATAGGAAAAGGGATGGAATTGGAAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATGAGTAATTACACCATTTATAGGAAAAGGGATGGAATTGGAAATC  650

seq1  ATATGTTGAGAGAAATAAATCAGATACACAAGAACAATTAGTGCATGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTGAGAGAAATAAATCAGATACACAAGAACAATTAGTGCATGTAT  700

seq1  ATATATCACACACACAAACACACTTACAGAAAGAAATGGACAAAGAGTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATCACACACACAAACACACTTACAGAAAGAAATGGACAAAGAGTAT  750

seq1  ATATATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG  779
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG  779

seq1: chr16_75406066_75407230
seq2: B6Ng01-086L15.g_67_1216 (reverse)

seq1  AGTCAGCTTGTTAAACTAAACTGACTTCCTCTTGTAGTCCAGCAAGAAAA  50
      ||||||| |||   |||  |||||||| ||||||||   ||||||| |||
seq2  AGTCAGC-TGT---ACT--ACTGACTT-CTCTTGTATGTCAGCAAG-AAA  42

seq1  TGTGTTATTTATCCACACATCTCAAAATTTTTATCCACCAAAAGACTAAT  100
      ||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||
seq2  TGTTTTATTTATCCA-ACATCTTCAAA-TTTTATCCACCAAAA-ACT-AT  88

seq1  CACAGAGTTTTAGA-GTGATTTACTTATCATTGTAAAGACTTGGAAGAAC  149
      |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||
seq2  CACAGAGTTTTAGAGGGGATTTACTTATCA-TGTAAAGACT--GAAGAAC  135

seq1  AGAAAATAGCTGTGGGTAGATCCAGGCATTGTATTATTCTAGCAACTCAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATAGCTGTGGGTAGATCCAGGCATTGTATTATTCTAGCAACTCAC  185

seq1  AATGAAAGAACCCAGGAAGAAAATCTTCAGGCTAAATATTCCAACAAAAA  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATGAAAGAACCCAGGAAGAAAATCTTCAGGCTAAATATT-CAACAAAAA  234

seq1  GGCACCATTGCTGGAACACAGTCCAGGCATAGAGTCATATGAGGAGAATT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCATTGCTGGAACACAGTCCAGGCATAGAGTCATATGAGGAGAATT  284

seq1  CTGAATGCTCATGAAAACACTCCAGGAAAGCAAGGTAAGAGTCTTGTGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGCTCATGAAAACACTCCAGGAAAGCAAGGTAAGAGTCTTGTGAT  334

seq1  TTCAGTTTCTACACAACACAGAGTCTCTTTGGAATGTGTTTTCATGCTCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTTTCTACACAACACAGAGTCTCTTTGGAATGTGTTTTCATGCTCC  384

seq1  TTCCAGATTGCTTGCTATTGCTTGCTGTTGGTATCCTATTTTGCCTCTAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGATTGCTTGCTATTGCTTGCTGTTGGTATCCTATTTTGCCTCTAT  434

seq1  GGAAAACGTGTTTCAGCCATATGCAGCTTGTTCTTGTTGTTGTGAATGCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAACGTGTTTCAGCCATATGCAGCTTGTTCTTGTTGTTGTGAATGCA  484

seq1  TACAGCTTGAAATCATGAGGATTTTACACACAAGGACTTCTAACCCTCAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCTTGAAATCATGAGGATTTTACACACAAGGACTTCTAACCCTCAG  534

seq1  AGTATAAGTTGCCAAATGCCCTGAATGAAGTTGACTATTGTATGAACTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATAAGTTGCCAAATGCCCTGAATGAAGTTGACTATTGTATGAACTTT  584

seq1  GTCTGCTCATTTATCAGCTCCATTCTCCCTGGTCCAACCACCTGTCTAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCTCATTTATCAGCTCCATTCTCCCTGGTCCAACCACCTGTCTAAA  634

seq1  GACATGACACACACACCGGAAATATCCATTTTAAGGGATTTCAAGAAGTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGACACACACACCGGAAATATCCATTTTAAGGGATTTCAAGAAGTG  684

seq1  AGGGCTTGTCAATATATAGATCGGGAAGAATTCTTAAAGAAATCTGATAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTTGTCAATATATAGATCGGGAAGAATTCTTAAAGAAATCTGATAT  734

seq1  TCTTGTTCTATTTTTCTTCCCTTGAAATATGAAATATTTATGAAATATAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTCTATTTTTCTTCCCTTGAAATATGAAATATTTATGAAATATAC  784

seq1  AGACTTCATGGTATTGAAATTGCAGGAGATGATTTGTAAAGGTTCTGAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTCATGGTATTGAAATTGCAGGAGATGATTTGTAAAGGTTCTGAAA  834

seq1  TCACATGTTTAGGAAAATTTTGCTGTATGAAAATTTTAAAAATTGAAAGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGTTTAGGAAAATTTTGCTGTATGAAAATTTTAAAAATTGAAAGA  884

seq1  AATTGCTTATGGTACCACTACAATATACATTAGGAATGTTGTAGCAAATA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTTATGGTACCACTACAATATACATTAGGAATGTTGTAGCAAATA  934

seq1  AGTGATACCACTTAAATGAAAAGTGATCCTACAGTCCTAATATAATAAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATACCACTTAAATGAAAAGTGATCCTACAGTCCTAATATAATAAAT  984

seq1  CTGACTTATCTGGAAAACAGAGCATTTGCTTTCATATCAATTTCCTGCAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTATCTGGAAAACAGAGCATTTGCTTTCATATCAATTTCCTGCAT  1034

seq1  TCCAAAGTGTTAATGTAGATACATTTCTCTCCATTTGAAACAGGTTTGCT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGTGTTAATGTAGATACATTTCTCTCCATTTGAAACAGGTTTGCT  1084

seq1  TCTAATATACGCCATTTCAGGTGGGCAGGGATAGGGGAGTTTATAACAAC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATATACGCCATTTCAGGTGGGCAGGGATAGGGGAGTTTATAACAAC  1134

seq1  ATAAATCTGGGAATTC  1165
      ||||||||||||||||
seq2  ATAAATCTGGGAATTC  1150