BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091B10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 93,880,571 - 94,075,400
singlet/doubletdoublet
Overlap geneChaf1b, Cldn14
Upstream geneLOC100040747, Setd4, LOC670912, Cbr1, EG435489, Cbr3, Dopey2, Morc3
Downstream geneSim2, Hlcs, LOC622832, LOC100040857, Dscr6, LOC545178, Pigp, Ttc3, Dscr3, Dyrk1a, Kcnj6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091B10.bB6Ng01-091B10.g
ACCDH903217DH903218
length994694
definitionDH903217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091B10, 5' end.DH903218|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091B10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,074,405 - 94,075,400)(93,880,571 - 93,881,264)
sequence
gaattcactccgtagaccaggctggcctcaaattcagatgcctgcttctg
cctcctgagtactgggattaaatcgctgtgcctggttcaacttttcattt
taaaatgatttattattaatataattaattaaacggctttaattaattaa
tagaattaataataaattgtgttgatataattaacaattaatgtaatata
atgattaagaataattaattcaatgatttataagacagatgagatgacct
gtgatcctaacacccagggaagctgtagcaagtggatcatgagttggaga
tcagtctggacttacacaggcttgtttgaaaaaaaaaaaaaaaaccaaag
tgtctagcccattgcccaggaggaggaagtgtttagtaagtgtagttatt
attgatattttaaataataatagtattattaatttaaaaaaaaccctaat
tctaggatctttatacagataagctgaaaacaaactatcctaatggggta
agggtgggcagctgttgatatttgtgtatgttcagtgaaaaagatgtgca
gctgatacaaagattttaagagtctccaacaacatggcttggtaaaaatg
ccctcctgattcctatctacacacatatgcttcccggactcccctgtaac
actgttgaatagaattaggcatggcatgttggatgtgcttactcaaacac
tgaatggaagacacactgctgctgcctttgtggtttctgctggtagggac
catcagcaaacactctgtgtttatgtatgcacatgcgcgtgtgcccttgt
gcatgtgtgtgtacttgtttgttgttgtataacagatacgagttctatgg
atggaagctccttaaagttagggataaacaattcaaaagcggtaggaagt
ctctgaaactgatcaagattcactaggcccatctaagccacagggtaatg
agagacatttttcaaacaaacagagctgcttgggagaaggctca
gaattccttaaggcagctgagagtagcattagtctgtgggtgcaaaacca
aatataagacagttttatgggctggtgagatggctcagtgggtaagagca
cccgactgttcttccgaaggtctggagttcaaatcccagcaaccacatgg
tggctcacaaccatccgtaacgagatctgactccctcttctggagtgtct
gaagacagctacggtgtacttacattaaataaataaataaatcttaaaaa
aaaaaaaagacagttttacatgatcggttcagccaaacagtattcaagag
cccacaccatttccagttagctctcagtcatggtgtctcttgccagaaat
agaaaagtaactaagacatgggcacatctttttgtgatggttgcccaaat
agcagtggtaccactactacacaagtggacacatcttatttttttgttca
gagctcctggaaagaacctattagttctagaatacatacatacatatgta
tatgtgtatgtatatattagagtacatatatattatgtgcatatatacta
atatactcctatgtataggagtatattgtatatattctagtgtgtgtgta
tatgtatatgtatatacatatatacatacatacatacatacttgatatac
atatgtacacacacatatatacacatacacatatgaggcaatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_94074405_94075400
seq2: B6Ng01-091B10.b_47_1040 (reverse)

seq1  TGAGCC-TCTCCCAAGCAGCTCTGTTTGTTTGAAAAGTGTCTCTCATTAA  49
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
seq2  TGAGCCTTCTCCCAAGCAGCTCTGTTTGTTTGAAAAATGTCTCTCATTA-  49

seq1  CCCTTGTGGCTTAGATGGGCCTAGTGAATCTTGGTCAGTTTCAGAGACTT  99
       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  -CCCTGTGGCTTAGATGGGCCTAGTGAATCTTGATCAGTTTCAGAGACTT  98

seq1  CCTACCGCTTTTGAGTTGTTTATCCCTAACTTTTAAGGAGCTTCCATCCA  149
      |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCTACCGCTTTTGAATTGTTTATCCCTAAC-TTTAAGGAGCTTCCATCCA  147

seq1  TAGAACTCGTATCTGTTATACAACAACAAACAAGTACACACACATGCACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTCGTATCTGTTATACAACAACAAACAAGTACACACACATGCACA  197

seq1  AGGGCACACGCGCATGTGCATACATAAACACAGAGTGTTTGCTGATGGTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCACACGCGCATGTGCATACATAAACACAGAGTGTTTGCTGATGGTC  247

seq1  CCTACCAGCAGAAACCACAAAGGCAGCAGCAGTGTGTCTTCCATTCAGTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCAGCAGAAACCACAAAGGCAGCAGCAGTGTGTCTTCCATTCAGTG  297

seq1  TTTGAGTAAGCACATCCAACATGCCATGCCTAATTCTATTCAACAGTGTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGTAAGCACATCCAACATGCCATGCCTAATTCTATTCAACAGTGTT  347

seq1  ACAGGGGAGTCCGGGAAGCATATGTGTGTAGATAGGAATCAGGAGGGCAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGGAGTCCGGGAAGCATATGTGTGTAGATAGGAATCAGGAGGGCAT  397

seq1  TTTTACCAAGCCATGTTGTTGGAGACTCTTAAAATCTTTGTATCAGCTGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACCAAGCCATGTTGTTGGAGACTCTTAAAATCTTTGTATCAGCTGC  447

seq1  ACATCTTTTTCACTGAACATACACAAATATCAACAGCTGCCCACCCTTAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTTTCACTGAACATACACAAATATCAACAGCTGCCCACCCTTAC  497

seq1  CCCATTAGGATAGTTTGTTTTCAGCTTATCTGTATAAAGATCCTAGAATT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTAGGATAGTTTGTTTTCAGCTTATCTGTATAAAGATCCTAGAATT  547

seq1  AGGGTTTTTTTTAAATTAATAATACTATTATTATTTAAAATATCAATAAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTTTTTTTAAATTAATAATACTATTATTATTTAAAATATCAATAAT  597

seq1  AACTACACTTACTAAACACTTCCTCCTCCTGGGCAATGGGCTAGACACTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACACTTACTAAACACTTCCTCCTCCTGGGCAATGGGCTAGACACTT  647

seq1  TGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAAACAAGCCTGTGTAAGTCCAGACTGATCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAAACAAGCCTGTGTAAGTCCAGACTGATCT  697

seq1  CCAACTCATGATCCACTTGCTACAGCTTCCCTGGGTGTTAGGATCACAGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTCATGATCCACTTGCTACAGCTTCCCTGGGTGTTAGGATCACAGG  747

seq1  TCATCTCATCTGTCTTATAAATCATTGAATTAATTATTCTTAATCATTAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCATCTGTCTTATAAATCATTGAATTAATTATTCTTAATCATTAT  797

seq1  ATTACATTAATTGTTAATTATATCAACACAATTTATTATTAATTCTATTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATTAATTGTTAATTATATCAACACAATTTATTATTAATTCTATTA  847

seq1  ATTAATTAAAGCCGTTTAATTAATTATATTAATAATAAATCATTTTAAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTAAAGCCGTTTAATTAATTATATTAATAATAAATCATTTTAAAA  897

seq1  TGAAAAGTTGAACCAGGCACAGCGATTTAATCCCAGTACTCAGGAGGCAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAGTTGAACCAGGCACAGCGATTTAATCCCAGTACTCAGGAGGCAG  947

seq1  AAGCAGGCATCTGAATTTGAGGCCAGCCTGGTCTACGGAGTGAATTC  996
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGCATCTGAATTTGAGGCCAGCCTGGTCTACGGAGTGAATTC  994

seq1: chr16_93880571_93881264
seq2: B6Ng01-091B10.g_69_762

seq1  GAATTCCTTAAGGCAGCTGAGAGTAGCATTAGTCTGTGGGTGCAAAACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAAGGCAGCTGAGAGTAGCATTAGTCTGTGGGTGCAAAACCA  50

seq1  AATATAAGACAGTTTTATGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAAGACAGTTTTATGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCA  100

seq1  CCCGACTGTTCTTCCGAAGGTCTGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGACTGTTCTTCCGAAGGTCTGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGG  150

seq1  TGGCTCACAACCATCCGTAACGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCACAACCATCCGTAACGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCT  200

seq1  GAAGACAGCTACGGTGTACTTACATTAAATAAATAAATAAATCTTAAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAGCTACGGTGTACTTACATTAAATAAATAAATAAATCTTAAAAA  250

seq1  AAAAAAAAGACAGTTTTACATGATCGGTTCAGCCAAACAGTATTCAAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAGACAGTTTTACATGATCGGTTCAGCCAAACAGTATTCAAGAG  300

seq1  CCCACACCATTTCCAGTTAGCTCTCAGTCATGGTGTCTCTTGCCAGAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACACCATTTCCAGTTAGCTCTCAGTCATGGTGTCTCTTGCCAGAAAT  350

seq1  AGAAAAGTAACTAAGACATGGGCACATCTTTTTGTGATGGTTGCCCAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGTAACTAAGACATGGGCACATCTTTTTGTGATGGTTGCCCAAAT  400

seq1  AGCAGTGGTACCACTACTACACAAGTGGACACATCTTATTTTTTTGTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTGGTACCACTACTACACAAGTGGACACATCTTATTTTTTTGTTCA  450

seq1  GAGCTCCTGGAAAGAACCTATTAGTTCTAGAATACATACATACATATGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCCTGGAAAGAACCTATTAGTTCTAGAATACATACATACATATGTA  500

seq1  TATGTGTATGTATATATTAGAGTACATATATATTATGTGCATATATACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTATGTATATATTAGAGTACATATATATTATGTGCATATATACTA  550

seq1  ATATACTCCTATGTATAGGAGTATATTGTATATATTCTAGTGTGTGTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACTCCTATGTATAGGAGTATATTGTATATATTCTAGTGTGTGTGTA  600

seq1  TATGTATATGTATATACATATATACATACATACATACATACTTGATATAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATATGTATATACATATATACATACATACATACATACTTGATATAC  650

seq1  ATATGTACACACACATATATACACATACACATATGAGGCAATAG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTACACACACATATATACACATACACATATGAGGCAATAG  694