BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097D22
Chromosome16 (Build37)
Map Location 6,433,484 - 6,607,399
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA2bp1
Upstream geneLOC100042436, LOC100042445
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097D22.bB6Ng01-097D22.g
ACCDH907670DH907671
length1691,185
definitionDH907670|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097D22, 5' end.DH907671|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097D22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(6,433,484 - 6,433,652)(6,606,202 - 6,607,399)
sequence
tccctatgtaacaaagcctggcactgttagttattatcaaaatctttaga
aatagctctggaaatagacaaaacaagaagttgccatatttttaacttac
agtagacatcagatggcatggttagcatgcttgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtg
gaattcaatatgcataccgaagtggctttacattcacagagactgccctc
tcactgctatgattaagtcttgtctgtgccctggactactcactgtccgt
acctgcccttggcgagttgaaggtgaagtggcacagagtcaacaacagag
actctgggagcagatgagaatcaccacagcaagctctctgaacattgctg
caagctttttaaatatactccaccagcatcccactggtcccaagaaagca
tgtcttctaaacaaaaaaagtttctgattggctggcattgtctgtaccag
caatccttggtctccaaggcagtccccaactaggtcctattgcaggagat
ccttttgcagctgcaaggccccaggtgtttacatagagttggctttgcct
ttcctgttacaattaagggtggatagcaccaagttcactccaaggagatt
gtccatgttttccttttccttttaaaatggggtctcatgtagcccagctg
gtctcaaactttctgtttgtcaaaatatggccctgaacttattatcctct
tgcctctacctcatgagacctgcaattacaagcatctgtgaggacaccag
gttcaagcgatgcttgtagaacctagagctttgtacactacaggcaagta
ctcaaccaagtactggaccttgaggtgtatctcagtgaaacacattaatt
cttagtacaacaaagtgaccacgtccctttccctaacaagcagtgtacct
tagattagaaagggagaaatttaaacccttgattgaaaagacacctcttt
ctcttatgtcttagtcagggtttctattcctgcacaaacatcatgaccaa
gaagcaagttggggaggaaagggtttattcggcttacacttccatactgc
tgttcatcaccaaggaagtcagactgggaactcaagcaggtcagaaaata
ggagctgatgcagaagccatggaggatgttcttttactgtcttgcttccc
tggctttgcttcagtctgctctcttatagaccagactacagcccagagat
ggttccatccacaagggctttcctctgatcactaattgagaaaatgccta
cagttgatctcatggagggtatttcttaaccgggaagctcttctttgtga
actccagcgtgtcagtgacacaaacctagccagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_6433484_6433652
seq2: B6Ng01-097D22.b_53_221

seq1  TCCCTATGTAACAAAGCCTGGCACTGTTAGTTATTATCAAAATCTTTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTATGTAACAAAGCCTGGCACTGTTAGTTATTATCAAAATCTTTAGA  50

seq1  AATAGCTCTGGAAATAGACAAAACAAGAAGTTGCCATATTTTTAACTTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCTCTGGAAATAGACAAAACAAGAAGTTGCCATATTTTTAACTTAC  100

seq1  AGTAGACATCAGATGGCATGGTTAGCATGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGACATCAGATGGCATGGTTAGCATGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  150

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTG  169
      |||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTG  169

seq1: chr16_6606202_6607399
seq2: B6Ng01-097D22.g_66_1250 (reverse)

seq1  TCCTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGACACAGCTGGAGTTATCACAAAGAA  50
      |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||  ||||||||||
seq2  TCCTGGCTAGGTTTGTGTCA--CTGACAC-GCTGGAGT--TCACAAAGAA  45

seq1  AGGAGCTT-CAGTTGAGGAAATA-CCTCCATGAGATCCAACTGTAAGGCA  98
        |||||| | | | | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||
seq2  --GAGCTTCCCGGTTAAGAAATACCCTCCATGAGAT-CAACTGT-AGGCA  91

seq1  TTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCAT  148
      |||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||| |||||
seq2  TTTTCTCAATTAGTGATCA--GAGGAAAG--CCCTTGTGGATGGAACCAT  137

seq1  CTCTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTATAAGAGAGCAGGCTG-AGC-AAGCC  196
      ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||| ||| |||||
seq2  CTCTGGGCT-GTAGTCT--GGTCTATAAGAGAGCAGACTGAAGCAAAGCC  184

seq1  AGGGGAGGCAAGCCAGT-AAAGAACATCCCTCCATGGCTTCTGCATCAGC  245
      | |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  A-GGGAAGCAAGACAGTAAAAGAACAT-CCTCCATGGCTTCTGCATCAGC  232

seq1  TCCTATTTTCTGACCTGCTTGAGTT-CCAGTCCTGACTTCCTTGGTGATG  294
      ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTTTCTGACCTGCTTGAGTTCCCAGT-CTGACTTCCTTGGTGATG  281

seq1  AACAGCAGTATGGAAGTGTAAGCCGAATAAACCCTTTCCTCCCCAACTTG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCAGTATGGAAGTGTAAGCCGAATAAACCCTTTCCTCCCCAACTTG  331

seq1  CTTCTTGGTCATGATGTTTGTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGACATA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGGTCATGATGTTTGTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGACATA  381

seq1  AGGGAAAGAGGTGTCTTTTCAATCAAGGGTTTAAATTTCTCCCTTTCTAA  444
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGAGGTGTCTTTTCAATCAAGGGTTTAAATTTCTCCCTTTCTAA  431

seq1  TCTAAGGTACACTGCTTGTTAGGGAAAGGGACGTGGTCACTTTGTTGTAC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGGTACACTGCTTGTTAGGGAAAGGGACGTGGTCACTTTGTTGTAC  481

seq1  TAAGAATTAATGTGTTTCACTGAGATACACCTCAAGGTCCAGTACTTGGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAATTAATGTGTTTCACTGAGATACACCTCAAGGTCCAGTACTTGGT  531

seq1  TGAGTACTTGCCTGTAGTGTACAAAGCTCTAGGTTCTACAAGCATCGCTT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTACTTGCCTGTAGTGTACAAAGCTCTAGGTTCTACAAGCATCGCTT  581

seq1  GAACCTGGTGTCCTCACAGATGCTTGTAATTGCAGGTCTCATGAGGTAGA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGGTGTCCTCACAGATGCTTGTAATTGCAGGTCTCATGAGGTAGA  631

seq1  GGCAAGAGGATAATAAGTTCAGGGCCATATTTTGACAAACAGAAAGTTTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGAGGATAATAAGTTCAGGGCCATATTTTGACAAACAGAAAGTTTG  681

seq1  AGACCAGCTGGGCTACATGAGACCCCATTTTAAAAGGAAAAGGAAAACAT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGCTGGGCTACATGAGACCCCATTTTAAAAGGAAAAGGAAAACAT  731

seq1  GGACAATCTCCTTGGAGTGAACTTGGTGCTATCCACCCTTAATTGTAACA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATCTCCTTGGAGTGAACTTGGTGCTATCCACCCTTAATTGTAACA  781

seq1  GGAAAGGCAAAGCCAACTCTATGTAAACACCTGGGGCCTTGCAGCTGCAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGCAAAGCCAACTCTATGTAAACACCTGGGGCCTTGCAGCTGCAA  831

seq1  AAGGATCTCCTGCAATAGGACCTAGTTGGGGACTGCCTTGGAGACCAAGG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATCTCCTGCAATAGGACCTAGTTGGGGACTGCCTTGGAGACCAAGG  881

seq1  ATTGCTGGTACAGACAATGCCAGCCAATCAGAAACTTTTTTTGTTTAGAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGGTACAGACAATGCCAGCCAATCAGAAACTTTTTTTGTTTAGAA  931

seq1  GACATGCTTTCTTGGGACCAGTGGGATGCTGGTGGAGTATATTTAAAAAG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGCTTTCTTGGGACCAGTGGGATGCTGGTGGAGTATATTTAAAAAG  981

seq1  CTTGCAGCAATGTTCAGAGAGCTTGCTGTGGTGATTCTCATCTGCTCCCA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAGCAATGTTCAGAGAGCTTGCTGTGGTGATTCTCATCTGCTCCCA  1031

seq1  GAGTCTCTGTTGTTGACTCTGTGCCACTTCACCTTCAACTCGCCAAGGGC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTCTGTTGTTGACTCTGTGCCACTTCACCTTCAACTCGCCAAGGGC  1081

seq1  AGGTACGGACAGTGAGTAGTCCAGGGCACAGACAAGACTTAATCATAGCA  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTACGGACAGTGAGTAGTCCAGGGCACAGACAAGACTTAATCATAGCA  1131

seq1  GTGAGAGGGCAGTCTCTGTGAATGTAAAGCCACTTCGGTATGCATATTGA  1194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAGGGCAGTCTCTGTGAATGTAAAGCCACTTCGGTATGCATATTGA  1181

seq1  ATTC  1198
      ||||
seq2  ATTC  1185