BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-103O07
Chromosome16 (Build37)
Map Location 46,173,570 - 46,308,269
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAtg3, EG547267, Btla, Cd200, LOC385905, Gm609, LOC628681, Slc9a10, Gcet2, BC016579, Tmprss7, Tagln3, Abhd10, Phldb2, EG667418, Plcxd2, 4930546O09Rik, Cd96, AL024110
Downstream genePvrl3, LOC628757
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-103O07.bB6Ng01-103O07.g
ACCDH912348DH912349
length1,151408
definitionDH912348|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103O07, 5' end.DH912349|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,307,113 - 46,308,269)(46,173,570 - 46,173,983)
sequence
gaattctaacttgtcaaatatatatgggttggaagtcaaggaccatggac
aatcttgagagagaagctgttgtttgttgttgagctacaagctgtgttcc
aagaacagaagatggccataactcattgaatttgactttatcctctcaca
gacccaagatgagagacagacatgagaagcagtaaagagtggaagggctg
gatgccaagaaacggaaatgttcagttcagacagtggcctgcacagggaa
aggcaatcttctatgatggttaaaagcagatctcatcaattagtattaac
cctgctgttggactgaactgagcctgaggtcagtgagtgggccatcctct
gtagccaccatctggcattcacagctacagagtccaaggactaaagaact
taagttttatctatatttgcaactgcatcattttaacaagttgatcaata
cttcaggagaagtacaaagaccagtcattcattcatacaaatatcagtac
tgtgattccttatcacatccctaatattctcctctagctagaacattagc
caactgtatggaggtacaatctggggagtcttgggaatatgagctattct
atcacaaaactgcaaagctaagcatggccataaaggcccttactactcaa
agggaaaatactgaagtgaacacagctctggtggacatcaggtactcatc
caacacaggatcatctggtgggcatcagacactcagccaatacagtatca
ctgccagcataagctacagggtaatcaagaatccataagtctgactgatc
ttttctttctcaagtatctctccctgttacttttctcttgttgtgaagac
acatgatcaaaccaacttactaaacaaagcatttgatttggggctcacat
tcccaagggatgagtccatgatcgtcatggtaggaggcaggcatcaggca
gcagaacatagcactggagcagtagctgagggctttcatccgaagcagga
tcacaaggtggaaagaactaactgcaccacatgaggtttgaagctacctt
catgatgcccttcttcaacaagaccatacctcctaatcttcccaaacggt
ttctatcagctgggatcaagcattcaactaatggacccaagctcttctta
c
tgattagaagagaataatgttgaacactgcatatactatatggatggcat
acatctggtgagatacacgacactaaacttcctgataactgatgcgctct
cagtcactgttagacttgatttggggccactgtggcaggtaaatgactat
gagaagattcaaatgcataaaatggaccacctgcaaaatgccactagctc
cagacacttatgtgagaataaatctcactttcagattcagagatcaggaa
tttctagagcttcttgaaaacatagctgattcttgggtcaagataggaaa
aatagacaattctgagccagcttgtcatgcaaggaggaaagaatgctggc
cttcctttgaaagacgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_46307113_46308269
seq2: B6Ng01-103O07.b_47_1197 (reverse)

seq1  GTAAGAAGAGCCTTGGGTCCATATGTTTGAATGCTTGATCCCAGCTGATA  50
      |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAAGAG-CTTGGGTCCAT-TAGTTGAATGCTTGATCCCAGCTGATA  48

seq1  G-AACCGTTTGGGAAGGATTAGGAGGTATGGTCTTGTTGGAGGAGGGGCA  99
      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||
seq2  GAAACCGTTTGGGAA-GATTAGGAGGTATGGTCTTGTT-GAAGAAGGGCA  96

seq1  TCAATGAAGGTAGGCTTCAAAACCTCATGCTGTTGCAGTTAGTTCTCTCC  149
      || ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||
seq2  TC-ATGAAGGTA-GCTTC-AAACCTCATG-TGGTGCAGTTAGTTCTTTCC  142

seq1  ACCTTGTGATCCTGCTTCGGATGTAAGCCCTCAGCTACTGCTCCAGTGCT  199
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGTGATCCTGCTTCGGATGAAAGCCCTCAGCTACTGCTCCAGTGCT  192

seq1  ATG-TCTGCCTGCCTGATGCCCTGCTTCCTACCATGACGATCATGGACTC  248
      ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCTG-CTGCCTGATG-CCTGCCTCCTACCATGACGATCATGGACTC  240

seq1  ATCCCTTGGGAATGTGAGCCCCAAATCAAATGCTTTGTTTAGTAAGTTGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTTGGGAATGTGAGCCCCAAATCAAATGCTTTGTTTAGTAAGTTGG  290

seq1  TTTGATCATGTGTCTTCACAACAAGAGAAAAGTAACAGGGAGAGATACTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATCATGTGTCTTCACAACAAGAGAAAAGTAACAGGGAGAGATACTT  340

seq1  GAGAA--GAAAGATCAGTCAGACTTATGGATTCTTGATTACCCTGTAGCT  396
      |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGAAAAGATCAGTCAGACTTATGGATTCTTGATTACCCTGTAGCT  390

seq1  TATGCTGGCAGTGATACTGTATTGGCTGAGTGTCTGATGCCCACCAGATG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTGGCAGTGATACTGTATTGGCTGAGTGTCTGATGCCCACCAGATG  440

seq1  ATCCTGTGTTGGATGAGTACCTGATGTCCACCAGAGCTGTGTTCACTTCA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTGTTGGATGAGTACCTGATGTCCACCAGAGCTGTGTTCACTTCA  490

seq1  GTATTTTCCCTTTGAGTAGTAAGGGCCTTTATGGCCATGCTTAGCTTTGC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTCCCTTTGAGTAGTAAGGGCCTTTATGGCCATGCTTAGCTTTGC  540

seq1  AGTTTTGTGATAGAATAGCTCATATTCCCAAGACTCCCCAGATTGTACCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTGTGATAGAATAGCTCATATTCCCAAGACTCCCCAGATTGTACCT  590

seq1  CCATACAGTTGGCTAATGTTCTAGCTAGAGGAGAATATTAGGGATGTGAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACAGTTGGCTAATGTTCTAGCTAGAGGAGAATATTAGGGATGTGAT  640

seq1  AAGGAATCACAGTACTGATATTTGTATGAATGAATGACTGGTCTTTGTAC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATCACAGTACTGATATTTGTATGAATGAATGACTGGTCTTTGTAC  690

seq1  TTCTCCTGAAGTATTGATCAACTTGTTAAAATGATGCAGTTGCAAATATA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTGAAGTATTGATCAACTTGTTAAAATGATGCAGTTGCAAATATA  740

seq1  GATAAAACTTAAGTTCTTTAGTCCTTGGACTCTGTAGCTGTGAATGCCAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAACTTAAGTTCTTTAGTCCTTGGACTCTGTAGCTGTGAATGCCAG  790

seq1  ATGGTGGCTACAGAGGATGGCCCACTCACTGACCTCAGGCTCAGTTCAGT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGGCTACAGAGGATGGCCCACTCACTGACCTCAGGCTCAGTTCAGT  840

seq1  CCAACAGCAGGGTTAATACTAATTGATGAGATCTGCTTTTAACCATCATA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACAGCAGGGTTAATACTAATTGATGAGATCTGCTTTTAACCATCATA  890

seq1  GAAGATTGCCTTTCCCTGTGCAGGCCACTGTCTGAACTGAACATTTCCGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTGCCTTTCCCTGTGCAGGCCACTGTCTGAACTGAACATTTCCGT  940

seq1  TTCTTGGCATCCAGCCCTTCCACTCTTTACTGCTTCTCATGTCTGTCTCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGCATCCAGCCCTTCCACTCTTTACTGCTTCTCATGTCTGTCTCT  990

seq1  CATCTTGGGTCTGTGAGAGGATAAAGTCAAATTCAATGAGTTATGGCCAT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGGGTCTGTGAGAGGATAAAGTCAAATTCAATGAGTTATGGCCAT  1040

seq1  CTTCTGTTCTTGGAACACAGCTTGTAGCTCAACAACAAACAACAGCTTCT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGTTCTTGGAACACAGCTTGTAGCTCAACAACAAACAACAGCTTCT  1090

seq1  CTCTCAAGATTGTCCATGGTCCTTGACTTCCAACCCATATATATTTGACA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAAGATTGTCCATGGTCCTTGACTTCCAACCCATATATATTTGACA  1140

seq1  AGTTAGAATTC  1157
      |||||||||||
seq2  AGTTAGAATTC  1151

seq1: chr16_46173570_46173983
seq2: B6Ng01-103O07.g_67_480

seq1  GAATTCTGATTAGAAGAGAATAATGTTGAACACTGCATATACTATATGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGATTAGAAGAGAATAATGTTGAACACTGCATATACTATATGGA  50

seq1  TGGCATACATCTGGTGAGATACACGACACTAAACTTCCTGATAACTGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATACATCTGGTGAGATACACGACACTAAACTTCCTGATAACTGATG  100

seq1  CGCTCTCAGTCACTGTTAGACTTGATTTGGGGCCACTGTGGCAGGTAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTCTCAGTCACTGTTAGACTTGATTTGGGGCCACTGTGGCAGGTAAAT  150

seq1  GACTATGAGAAGATTCAAATGCATAAAATGGACCACCTGCAAAATGCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATGAGAAGATTCAAATGCATAAAATGGACCACCTGCAAAATGCCAC  200

seq1  TAGCTCCAGACACTTATGTGAGAATAAATCTCACTTTCAGATTCAGAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCAGACACTTATGTGAGAATAAATCTCACTTTCAGATTCAGAGAT  250

seq1  CAGGAATTTCTAGAGCTTCTTGAAAACATAGCTGATTCTTGGGTCAAGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATTTCTAGAGCTTCTTGAAAACATAGCTGATTCTTGGGTCAAGAT  300

seq1  AGGAAAAATAGACAATTCTGAGCCAGCTTGTCATGCAAGGAGGAAAGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAATAGACAATTCTGAGCCAGCTTGTCATGCAAGGAGGAAAGAAT  350

seq1  GCTGGCCTTCCTTTGAAAGACGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCCTTCCTTTGAAAGACGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  400

seq1  TGTGTGTGTGTGTG  414
      ||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTG  414