BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119B23
Chromosome16 (Build37)
Map Location 93,852,045 - 93,997,987
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMorc3, Chaf1b, Cldn14
Upstream geneEG666023, LOC100040747, Setd4, LOC670912, Cbr1, EG435489, Cbr3, Dopey2
Downstream geneSim2, Hlcs, LOC622832, LOC100040857, Dscr6, LOC545178, Pigp, Ttc3, Dscr3, Dyrk1a, Kcnj6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119B23.bB6Ng01-119B23.g
ACCDH923419DH923420
length7571,103
definitionDH923419|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119B23, 5' end.DH923420|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119B23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,997,281 - 93,997,987)(93,852,045 - 93,853,143)
sequence
gaattcagatccacagagctcacataaatcctggatggcctacttgccat
tccagctctcagaagccaaagcaagctggccggccagctcacctgcactg
tgaggtccaagttcagggagaccctgtctcaaaaagtaaactagagagta
gtggaggaagatacccaacatcaacctctagatatgctcacacatgtgct
tgttcacctgcatgcacaactcacatgtctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacttacacacactcactcacaatacat
ataccacaggcatactccacattcacaacacatagagactgcacaccaca
ctcattgacattcccactcacagatacacacacacacacactcatacaca
cacactcacaacacacataacatgtacatcacagacacacccacactcac
aacacatacactacacatcacactcattgacattcccactcacaggtacc
catacacacacacacacacacacacacactcacaacacacataacatgta
catcacagacacacccacactcacaacacatacactacacatcacactca
ttgacattcccactcacagatacccatacacacacacacacacacacaca
ctcacaacacacataacatgtacatcacagacacacccacactcacaaca
catacactacacatcacactcattgacattcccactcacagatacacaca
cacacac
gaattctcctcacatggctccctgtgttccatcaattgagtttatttttt
aatacttttttgagacaaggagatactcccacttcagctctgagagttca
agtaggtgtggtggtgttggacccccaaatacgggaacccccactctagt
ccagggacaggaagcacccacgaacacaagaatcctctcgtgttgcaaga
cgcacgaggctttattggcagagctctgggccgacacgtacctcgtgcag
gaggcaggggattcgaccccggggctcggaagctaagggtttttaaagaa
gcaaagggctaggagtacaaggaattttgacaaaggcacgggattggttc
tttaacagaaagattacaggtcagcaaaaaggggtatcagggctttgttc
ctgtgggctgggggcttatctttgttcacataacaaccagtaaccaattg
atgtatggctttacccggcaccaaggggtaacagacagaggggaggttcc
ggccaggtggtgctgactcagacaagatagccctgcttgtcctcggattg
aggggaggttccagccagatggtgtcgacccagataatgtagccccattt
gtccttgaataccttttcatctttacagccaagatgttcttaggaaatgc
cttaacatcagccctgccctggcatgcctgggcgctgttctgctttgttc
tcagtcccaggccgggcgtgggctcttaaacaagttacaatattccatct
tccttcagtggcgcacacctgtgatgctcacctcagggagacagaagcag
ggcagggcagagcctcccttatctgtatgttgactttttaggtagattat
gctattttgagaaactgtctcagtttttttctaaaaatcagaataactaa
tataattttgtgctgttatttacctgagttctaaattctagggcctaaat
accatgtttacctctgaactatggccccattctctgtagactgtactatt
ttatatgaaattatgtgttttgttacaaagaatgtactttctttttttgg
tgtttgatattgtttttggtttgttttccgagacaggtttttctcctgtg
tag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_93997281_93997987
seq2: B6Ng01-119B23.b_45_751 (reverse)

seq1  GTGTATGTGTTGTGAGTGTGGGTGTGTCTGTGATGTACATGTTATGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTGTTGTGAGTGTGGGTGTGTCTGTGATGTACATGTTATGTGTG  50

seq1  TTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGGGTATCTGTGAGTGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGGGTATCTGTGAGTGGGA  100

seq1  ATGTCAATGAGTGTGATGTGTAGTGTATGTGTTGTGAGTGTGGGTGTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAATGAGTGTGATGTGTAGTGTATGTGTTGTGAGTGTGGGTGTGTC  150

seq1  TGTGATGTACATGTTATGTGTGTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGTACATGTTATGTGTGTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  200

seq1  GTGTATGGGTACCTGTGAGTGGGAATGTCAATGAGTGTGATGTGTAGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGGGTACCTGTGAGTGGGAATGTCAATGAGTGTGATGTGTAGTGT  250

seq1  ATGTGTTGTGAGTGTGGGTGTGTCTGTGATGTACATGTTATGTGTGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTGTGAGTGTGGGTGTGTCTGTGATGTACATGTTATGTGTGTTGT  300

seq1  GAGTGTGTGTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCTGTGAGTGGGAATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGTGTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCTGTGAGTGGGAATGT  350

seq1  CAATGAGTGTGGTGTGCAGTCTCTATGTGTTGTGAATGTGGAGTATGCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGTGTGGTGTGCAGTCTCTATGTGTTGTGAATGTGGAGTATGCCT  400

seq1  GTGGTATATGTATTGTGAGTGAGTGTGTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTATATGTATTGTGAGTGAGTGTGTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGT  450

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGACATGTGAGTTGTGCATGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGACATGTGAGTTGTGCATGCAG  500

seq1  GTGAACAAGCACATGTGTGAGCATATCTAGAGGTTGATGTTGGGTATCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACAAGCACATGTGTGAGCATATCTAGAGGTTGATGTTGGGTATCTT  550

seq1  CCTCCACTACTCTCTAGTTTACTTTTTGAGACAGGGTCTCCCTGAACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACTACTCTCTAGTTTACTTTTTGAGACAGGGTCTCCCTGAACTTG  600

seq1  GACCTCACAGTGCAGGTGAGCTGGCCGGCCAGCTTGCTTTGGCTTCTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCACAGTGCAGGTGAGCTGGCCGGCCAGCTTGCTTTGGCTTCTGAG  650

seq1  AGCTGGAATGGCAAGTAGGCCATCCAGGATTTATGTGAGCTCTGTGGATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAATGGCAAGTAGGCCATCCAGGATTTATGTGAGCTCTGTGGATC  700

seq1  TGAATTC  707
      |||||||
seq2  TGAATTC  707

seq1: chr16_93852045_93853143
seq2: B6Ng01-119B23.g_70_1172

seq1  GAATTCTCCTCACATGGCTCCCTGTGTTCCATCAATTGAGTTTATTTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTCACATGGCTCCCTGTGTTCCATCAATTGAGTTTATTTTTT  50

seq1  AATACTTTTTTGAGACAAGGAGATACTCCCACTTCAGCTCTGAGAGTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTTTTTTGAGACAAGGAGATACTCCCACTTCAGCTCTGAGAGTTCA  100

seq1  AGTAGGTGTGGTGGTGTTGGACCCCCAAATACGGGAACCCCCACTCTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGTGTGGTGGTGTTGGACCCCCAAATACGGGAACCCCCACTCTAGT  150

seq1  CCAGGGACAGGAAGCACCCACGAACACAAGAATCCTCTCGTGTTGCAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGACAGGAAGCACCCACGAACACAAGAATCCTCTCGTGTTGCAAGA  200

seq1  CGCACGAGGCTTTATTGGCAGAGCTCTGGGCCGACACGTACCTCGTGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCACGAGGCTTTATTGGCAGAGCTCTGGGCCGACACGTACCTCGTGCAG  250

seq1  GAGGCAGGGGATTCGACCCCGGGGCTCGGAAGCTAAGGGTTTTTAAAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAGGGGATTCGACCCCGGGGCTCGGAAGCTAAGGGTTTTTAAAGAA  300

seq1  GCAAAGGGCTAGGAGTACAAGGAATTTTGACAAAGGCACGGGATTGGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGGCTAGGAGTACAAGGAATTTTGACAAAGGCACGGGATTGGTTC  350

seq1  TTTAACAGAAAGATTACAGGTCAGCAAAAAGGGGTATCAGGGCTTTGTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACAGAAAGATTACAGGTCAGCAAAAAGGGGTATCAGGGCTTTGTTC  400

seq1  CTGTGGGCTGGGGGCTTATCTTTGTTCACATAACAACCAGTAACCAATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGCTGGGGGCTTATCTTTGTTCACATAACAACCAGTAACCAATTG  450

seq1  ATGTATGGCTTTACCCGGCACCAAGGGGTAACAGACAGAGGGGAGGTTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGGCTTTACCCGGCACCAAGGGGTAACAGACAGAGGGGAGGTTCC  500

seq1  GGCCAGGTGGTGCTGACTCAGACAAGATAGCCCTGCTTGTCCTCGGATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGGTGGTGCTGACTCAGACAAGATAGCCCTGCTTGTCCTCGGATTG  550

seq1  AGGGGAGGTTCCAGCCAGATGGTGTCGACCCAGATAATGTAGCCCCATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGTTCCAGCCAGATGGTGTCGACCCAGATAATGTAGCCCCATTT  600

seq1  GTCCTTGAATACCTTTTCATCTTTACAGCCAAGATGTTCTTAGG-AATGC  649
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTCCTTGAATACCTTTTCATCTTTACAGCCAAGATGTTCTTAGGAAATGC  650

seq1  CTTAACATCAGCCCTGCCCTGGCATGCCTGGGCGCTGTTCTGCTTTGTTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACATCAGCCCTGCCCTGGCATGCCTGGGCGCTGTTCTGCTTTGTTC  700

seq1  TCAGTCCCAGGCCGGGCGTGGGCTCTTAAACAAGTTACAATATTCCATCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCCAGGCCGGGCGTGGGCTCTTAAACAAGTTACAATATTCCATCT  750

seq1  TCCTTCAGTGGCGCACACCTGTGATGCTCACCTCAGGGAGACAGAAGCAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCAGTGGCGCACACCTGTGATGCTCACCTCAGGGAGACAGAAGCAG  800

seq1  GGCAGGGCAGAGCCTCCCTTATCTGTATGTTGAC-TTTTAGGTAGATTAT  848
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGCAGGGCAGAGCCTCCCTTATCTGTATGTTGACTTTTTAGGTAGATTAT  850

seq1  GCTATTTTGAGAAACTGTCTCAG-TTTTTTCTAAAAATCAGAATAACTAA  897
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTTGAGAAACTGTCTCAGTTTTTTTCTAAAAATCAGAATAACTAA  900

seq1  TATAATTTTGTGCTGTTA-TTACCTGAGTCCTAAA-TCTAGGGCCT-AAT  944
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||
seq2  TATAATTTTGTGCTGTTATTTACCTGAGTTCTAAATTCTAGGGCCTAAAT  950

seq1  ACCATGTTTACCTCTGAACTATGCCCCCA-TCTCTGTAGACTGTACTATT  993
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTTTACCTCTGAACTATGGCCCCATTCTCTGTAGACTGTACTATT  1000

seq1  TTATTAAGGAATTATGTG-TTTGTTACAAAGAATGTACTTTCTTTTTTTG  1042
      ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTA-TATGAAATTATGTGTTTTGTTACAAAGAATGTACTTTCTTTTTTTG  1049

seq1  TTTGTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTCCGAGACAGG-GTTTCT  1091
       |   |||| | |||||||| ||||    ||||||||||||||  |||||
seq2  GT--GTTTGATATTGTTTTTGGTTT---GTTTTCCGAGACAGGTTTTTCT  1094

seq1  -CTGTGTAG  1099
       ||||||||
seq2  CCTGTGTAG  1103