BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-120L02
Chromosome16 (Build37)
Map Location 78,202,523 - 78,203,627
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream gene2810055G20Rik, LOC435483
Downstream geneLOC100039561, Cxadr, Btg3, D16Ertd472e, LOC100039605, 4930570E03Rik, Chodl, Prss7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-120L02.bB6Ng01-120L02.g
ACCDH924571DH924572
length1,094219
definitionDH924571|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120L02, 5' end.DH924572|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120L02, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcttggttcgattgagacacaatgtttactctgctgttgctgtcgt
tcctatcagaaccgagtcacacaggggttggacaacgatttgctgtggac
ctttcacatatgcttacggtcagagagttttggtgttagacttctctgcc
aagcctacaggtaaagaagtgtgcccccctaccccccatgctctcaggct
agcaggagatctcgactttgctcttctttcaatagaaactgtattttaaa
acttgaccttctgcagctcagaacctgtagttgatactctctcttgggca
gagctgggcagtggcagctggctgtagctccccttcagagggtttccctg
tccttaggagggaaaccaagaggtgctctgtagtgtcctgtgttgttgta
gtgtcctgagctgtggtttccaggtctttagtaatattaacctcattgac
aacttaaatccactttaaatatgtgatttgtttgttgggtgcagaggcca
acataaacacatgcagcctatttgtatagtaagcgacaggtgagtgcttg
cttagctctgttgctttgaacatttggaacttgtaccagagaaacctgct
cacctcatgagggctaggagtcagaaagagggatttagaccgagggtctg
atctttcaaaggcatgcctccagttgcaaaacgtctctccactaggctct
gcctcctttgttagtcactgatctgttgtgaagagaccatgaccaaggta
gctcttataaaagaaagcattaagaggggggcttgtttgcagttccagag
gcttcatccattagcatcatggcaggaagcatgttagcaggcatgcatgg
tgctggagaagtagctaagagctacaccctgagccatagtggctagacac
taggactagcataggcatttgaaacctcaagctcaccaaccccagtgaga
cacttcttccacacgccataccttttaattctttgttatctcttaaacgg
ttccattcccaggagaccgaatctacacccttggcgggcagcatgtatat
gaccttatgggctcatgtcattctctagtgcatcaccctcctac
tgttcctaaatggcctgccttgtctggactcagtgggagaggatatgcct
agtcctgaagagacttgatgtactgtggggagctaatacccagagaaggg
ctccccttcacaaaggagaaggggagggtgggatgaagggaggatctgca
ttagccctacttggaggagagggggctgctccggcccatcgccctttcca
ttgcttttacagtctgatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_78202523_78203627
seq2: B6Ng01-120L02.b_46_1139 (reverse)

seq1  GTAGGA-GGTGATGGCACCTAGAGGAATATGACAATGAGCCCCATAGGGT  49
      |||||| |||||| ||| ||||||    ||||| ||||| |||||| |||
seq2  GTAGGAGGGTGAT-GCA-CTAGAG---AATGAC-ATGAG-CCCATAAGGT  43

seq1  CATATACAATGCCTGCCCGCC-AGGGTGTAGATTCGGTCTCCTGGGAATG  98
      ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAC-ATG-CTGCCCGCCAAGGGTGTAGATTCGGTCTCCTGGGAATG  91

seq1  GAACCGTTTAAAGAGATAACAAAG-ATTAAAAGGTATGGCCCTGT-TGGA  146
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||
seq2  GAACCGTTT-AAGAGATAACAAAGAATTAAAAGGTATGGC---GTGTGGA  137

seq1  AGAAGTGTCTCACTGGGGTTGGTGAGCTTTGAGGTTTCAAATGCCTATGC  196
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGTCTCACTGGGGTTGGTGAGC-TTGAGGTTTCAAATGCCTATGC  186

seq1  TAGTCCTAGTGTCTAGCCACCTATGGCTCAGGGTGTAGCTCTTAGCTACT  246
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCTAGTGTCTAGCCA-CTATGGCTCAGGGTGTAGCTCTTAGCTACT  235

seq1  TCTCCAGCACCATGCATGCCTGCTAACATGCTTCCTGCCATGATGCTAAT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGCACCATGCATGCCTGCTAACATGCTTCCTGCCATGATGCTAAT  285

seq1  GGATGAAGCCTCTGGAACTGCAAACAAGCCCCCCTCTTAATGCTTTCTTT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGAAGCCTCTGGAACTGCAAACAAGCCCCCCTCTTAATGCTTTCTTT  335

seq1  TATAAGAGCTACCTTGGTCATGGTCTCTTCACAACAGATCAGTGACTAAC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGAGCTACCTTGGTCATGGTCTCTTCACAACAGATCAGTGACTAAC  385

seq1  AAAGGAGGCAGAGCCTAGTGGAGAGACGTTTTGCAACTGGAGGCATGCCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAGGCAGAGCCTAGTGGAGAGACGTTTTGCAACTGGAGGCATGCCT  435

seq1  TTGAAAGATCAGACCCTCGGTCTAAATCCCTCTTTCTGACTCCTAGCCCT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAGATCAGACCCTCGGTCTAAATCCCTCTTTCTGACTCCTAGCCCT  485

seq1  CATGAGGTGAGCAGGTTTCTCTGGTACAAGTTCCAAATGTTCAAAGCAAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGGTGAGCAGGTTTCTCTGGTACAAGTTCCAAATGTTCAAAGCAAC  535

seq1  AGAGCTAAGCAAGCACTCACCTGTCGCTTACTATACAAATAGGCTGCATG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTAAGCAAGCACTCACCTGTCGCTTACTATACAAATAGGCTGCATG  585

seq1  TGTTTATGTTGGCCTCTGCACCCAACAAACAAATCACATATTTAAAGTGG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATGTTGGCCTCTGCACCCAACAAACAAATCACATATTTAAAGTGG  635

seq1  ATTTAAGTTGTCAATGAGGTTAATATTACTAAAGACCTGGAAACCACAGC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGTTGTCAATGAGGTTAATATTACTAAAGACCTGGAAACCACAGC  685

seq1  TCAGGACACTACAACAACACAGGACACTACAGAGCACCTCTTGGTTTCCC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGACACTACAACAACACAGGACACTACAGAGCACCTCTTGGTTTCCC  735

seq1  TCCTAAGGACAGGGAAACCCTCTGAAGGGGAGCTACAGCCAGCTGCCACT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAAGGACAGGGAAACCCTCTGAAGGGGAGCTACAGCCAGCTGCCACT  785

seq1  GCCCAGCTCTGCCCAAGAGAGAGTATCAACTACAGGTTCTGAGCTGCAGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGCTCTGCCCAAGAGAGAGTATCAACTACAGGTTCTGAGCTGCAGA  835

seq1  AGGTCAAGTTTTAAAATACAGTTTCTATTGAAAGAAGAGCAAAGTCGAGA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAAGTTTTAAAATACAGTTTCTATTGAAAGAAGAGCAAAGTCGAGA  885

seq1  TCTCCTGCTAGCCTGAGAGCATGGGGGGTAGGGGGGCACACTTCTTTACC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGCTAGCCTGAGAGCATGGGGGGTAGGGGGGCACACTTCTTTACC  935

seq1  TGTAGGCTTGGCAGAGAAGTCTAACACCAAAACTCTCTGACCGTAAGCAT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGCTTGGCAGAGAAGTCTAACACCAAAACTCTCTGACCGTAAGCAT  985

seq1  ATGTGAAAGGTCCACAGCAAATCGTTGTCCAACCCCTGTGTGACTCGGTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAAAGGTCCACAGCAAATCGTTGTCCAACCCCTGTGTGACTCGGTT  1035

seq1  CTGATAGGAACGACAGCAACAGCAGAGTAAACATTGTGTCTCAATCGAAC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAGGAACGACAGCAACAGCAGAGTAAACATTGTGTCTCAATCGAAC  1085

seq1  CAAGAATTC  1105
      |||||||||
seq2  CAAGAATTC  1094