BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-125B22
Chromosome16 (Build37)
Map Location 37,649,301 - 37,741,483
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNdufb4, LOC100043709
Upstream geneCd86, Ildr1, LOC667246, Slc15a2, LOC667023, Eaf2, Iqcb1, LOC628101, Golgb1, Hcls1, Fbxo40, LOC100043252, Polq, Stxbp5l, Gtf2e1, Rabl3, Hgd
Downstream geneFstl1, LOC100043264, Lrrc58, Gpr156, LOC100043271, LOC100043713, Gsk3b, Nr1i2, 4932425I24Rik, Cox17, LOC100043715, Popdc2, Pla1a, Adprh, Cd80, LOC667353, Ck-ps3, 4930455C21Rik, 9630046K23Rik, Tmem39a, Cdgap
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-125B22.bB6Ng01-125B22.g
ACCDH927847DH927848
length1,023884
definitionDH927847|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125B22, 5' end.DH927848|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125B22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,649,301 - 37,650,348)(37,740,595 - 37,741,483)
sequence
gaattcaccggggctgctgtgaaggagcccaccaaccttgaacccaggct
ttctgatctccccctcccaagtctggaatcacaggactgtgccatgactc
ccacctgactggttctactattcagaaactttattccccccccctccttt
tttcccttttcttttggttttggtttttattaaatacggtcttgctctgt
agccttggctaacctatagctcaagctggcctcaaactcatgacaaccct
cctgtgtctcagcttcccaagtgctgggatcataggtatgcacaactttc
tgatgatcctgttcaaattctgcgtgatttaaagattcttttctcccctc
tagctttctatttccaatgtaagattcctaattttaaactatccgagaag
ccacctctcccgattcatcacttttaaatgtcccacagacttaacctcct
atctctcttggaagtggccatgagacccaccccacagcccagatgaagag
agatctcagatgctctatcaagcttcctattttgcttctagcatcctttc
taacgctgtcacaagcggccttccctgctaagtcagttgcaggaagatga
aagcaggcttaccctaactctgaattatatgtttttgctttcttttggtt
cagaagatcaaaccaggggcattatgtaaataaggcatgagccctaacac
tgagctatacctctcgccatgaaccctaagtttctaaactaacttggctg
gtgtttgaaaagcaaactgttaccttccacactactaaagtcttggggaa
aaaaaaggtcaaaaggtcaaaattgtaaaaaaaatcagcttatcttggct
aagaaaaagtaatttaatatatttatactaaataatctcctaagatagaa
atctaccccaaacacataattaaacttatagctaatccccaaatgatcta
caaatatctcgccataactgcagataaatagcaataaatcagcttagtct
cagtatgcagcatgacatctaag
gaattctctgtgctttccaggttgtagaaacctgggaaataaagccattc
aaagaatttatgtagtgactgtgttaacctatgatgatgctgagaggaca
gttccaggaacttcttaggatccaagtcagaatgcagaaggactggtttc
acacccctaccctgtatctcttccattattgtgaccaaaaagacatctga
gacaatatggcttcctctgagtttagaagactaagtatctggttttcagt
agataaagaagtaataattagggtctagagagatagctcagcagttaaga
gttttaagagcactggctgttcttccagaggacctgagtcaaattcccag
cacccacatgacagctcacaagtgtctgtaactctggttccaagaatctt
ccaccattgcacagacctgcaaacagaaaacaaatgcacataaaaataaa
taaatcttaagaagtagtaattacatcaaaaagaagatcgcagattgaaa
gtaggcaacacgaggaacccaggaggttctatcagaataatagtacaatg
caaatgtatagatgtgggatgtattagtgagggggtctctagagtcacag
aacttatggaatgtctctgcatgtcaagggaaatattagaatgacttaga
gtctccaatccaactaacccaacagtgagcagctgtgaatggaaagtcca
agaatctagtagttgctcagtcccatgaggctaggtattcagctggtctt
ctgtgttagctggaatcctgaagaatggattgcaacagatgtgctggcaa
gtaagtacagcagagaagaagatcaaacccttcctttttccattgtctta
ggtaagccttcagcagaggcatggcccatattaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_37649301_37650348
seq2: B6Ng01-125B22.b_47_1069

seq1  GAATTCACCGGGGCTGCTGTGAAGGAGCCCACCAACCTTGAACCCAGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCGGGGCTGCTGTGAAGGAGCCCACCAACCTTGAACCCAGGCT  50

seq1  TTCTGATCTCCCCCTCCCAAGTCTGGAATCACAGGACTGTGCCATGACTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATCTCCCCCTCCCAAGTCTGGAATCACAGGACTGTGCCATGACTC  100

seq1  CCACCTGACTGGTTCTACTATTCAGAAACTTTATTCCCCCCCCCTCCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTGACTGGTTCTACTATTCAGAAACTTTATTCCCCCCCCCTCCTTT  150

seq1  TTTCCCTTTTCTTTTGGTTTTGGTTTTTATTAAATACGGTCTTGCTCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTTTTCTTTTGGTTTTGGTTTTTATTAAATACGGTCTTGCTCTGT  200

seq1  AGCCTTGGCTAACCTATAGCTCAAGCTGGCCTCAAACTCATGACAACCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTGGCTAACCTATAGCTCAAGCTGGCCTCAAACTCATGACAACCCT  250

seq1  CCTGTGTCTCAGCTTCCCAAGTGCTGGGATCATAGGTATGCACAACTTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTCTCAGCTTCCCAAGTGCTGGGATCATAGGTATGCACAACTTTC  300

seq1  TGATGATCCTGTTCAAATTCTGCGTGATTTAAAGATTCTTTTCTCCCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATCCTGTTCAAATTCTGCGTGATTTAAAGATTCTTTTCTCCCCTC  350

seq1  TAGCTTTCTATTTCCAATGTAAGATTCCTAATTTTAAACTATCCGAGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTCTATTTCCAATGTAAGATTCCTAATTTTAAACTATCCGAGAAG  400

seq1  CCACCTCTCCCGATTCATCACTTTTAAATGTCCCACAGACTTAACCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTCTCCCGATTCATCACTTTTAAATGTCCCACAGACTTAACCTCCT  450

seq1  ATCTCTCTTGGAAGTGGCCATGAGACCCACCCCACAGCCCAGATGAAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTCTTGGAAGTGGCCATGAGACCCACCCCACAGCCCAGATGAAGAG  500

seq1  AGATCTCAGATGCTCTATCAAGCTTCCTATTTTGCTTCTAGCATCCTTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTCAGATGCTCTATCAAGCTTCCTATTTTGCTTCTAGCATCCTTTC  550

seq1  TAACGCTGTCACAAGCGGCCTTCCCTGCTAAGTCAGTTGCAGGAAGATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACGCTGTCACAAGCGGCCTTCCCTGCTAAGTCAGTTGCAGGAAGATGA  600

seq1  AAGCAGGCTTACCCTAACTCTGAATTATATGTTTTTGCTTTCTTTTGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGCTTACCCTAACTCTGAATTATATGTTTTTGCTTTCTTTTGGTT  650

seq1  CAGAAGATCAAACCAGGGGCATTATGTAAATAAGGCATGAGCCCTAACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGATCAAACCAGGGGCATTATGTAAATAAGGCATGAGCCCTAACAC  700

seq1  TGAGCTATACCTCTCGCCATGAACCCTAAGTTTCTAAACTAACTTGGCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTATACCTCTCGCCATGAACCCTAAGTTTCTAAACTAACTTGGCTG  750

seq1  GTGTTTGAAAAGCAAACTGTTACCTTCCACACTACTAAAGTCTTGGGGAA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GTGTTTGAAAAGCAAACTGTTACCTTCCACACTACTAAAGTCTTGGGG-A  799

seq1  AAAAAAAGGTCAAAAGGTCAAAATTGTAAAAAAAAAATCAGCTTATCTTG  850
      |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGGTCAAAAGGTCAAAATTGT--AAAAAAAATCAGCTTATCTTG  847

seq1  GCTAAGAAAAAAGTAATTTAATATATTTATACTAAAATAATCTCCTAAGA  900
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  GCTAAG-AAAAAGTAATTTAATATATTTATACT-AAATAATCTCCTAAG-  894

seq1  ATAGAAAATCTACCCCAAACACATAATTAAACTTAATTAGCTAAATCCCC  950
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||
seq2  ATAG-AAATCTACCCCAAACACATAATTAAACTTA--TAGCT-AATCCCC  940

seq1  AAATGATTCTACAAAATTATTCTCGCCAATTAACTGGCAGATTAAAATAA  1000
      |||||| ||||||||  || ||||||||  ||||| ||||||  |||| |
seq2  AAATGA-TCTACAAA--TA-TCTCGCCA--TAACT-GCAGAT--AAAT-A  980

seq1  GCAAATAAAATCAGCTTTAGTCTTCAGTATGCAGCATGAACATCTAAG  1048
      ||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCAA--TAAATCAGC-TTAGTC-TCAGTATGCAGCATG-ACATCTAAG  1023

seq1: chr16_37740595_37741483
seq2: B6Ng01-125B22.g_69_952 (reverse)

seq1  TTAATATGGGCCATGCCTCTGCTGAAGGCCTACCTAAGGACAATGGAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  TTAATATGGGCCATGCCTCTGCTGAAGGCTTACCTAA-GACAATGGAAAA  49

seq1  AGGAAGGGTTTGATCTTCTTCTCCTGCTTGTACTTACTTGCCAGCACATC  100
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGGTTTGATCTTCTTCT-CTGC-TGTACTTACTTGCCAGCACATC  97

seq1  TGTTGCAATCCACTTCTTCAGGATTCCAGCTTACACAGAAGACCAGCTGA  150
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  TGTTGCAATCCA-TTCTTCAGGATTCCAGCTAACACAGAAGACCAGCTG-  145

seq1  AATACCTAGCCTCATGGGACTGAGCAACTACTAGATTCTTGGACTTTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCTAGCCTCATGGGACTGAGCAACTACTAGATTCTTGGACTTTCCA  195

seq1  TTCACAGCTGCTCACTGTTGGGTTAGTTGGATTGGAGACTCTAAGTCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGCTGCTCACTGTTGGGTTAGTTGGATTGGAGACTCTAAGTCATT  245

seq1  CTAATATTTCCCTTGACATGCAGAGACATTCCATAAGTTCTGTGACTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATATTTCCCTTGACATGCAGAGACATTCCATAAGTTCTGTGACTCTA  295

seq1  GAGACCCCCTCACTAATACATCCCACATCTATACATTTGCATTGTACTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCCCCTCACTAATACATCCCACATCTATACATTTGCATTGTACTAT  345

seq1  TATTCTGATAGAACCTCCTGGGTTCCTCGTGTTGCCTACTTTCAATCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGATAGAACCTCCTGGGTTCCTCGTGTTGCCTACTTTCAATCTGC  395

seq1  GATCTTCTTTTTGATGTAATTACTACTTCTTAAGATTTATTTATTTTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTCTTTTTGATGTAATTACTACTTCTTAAGATTTATTTATTTTTAT  445

seq1  GTGCATTTGTTTTCTGTTTGCAGGTCTGTGCAATGGTGGAAGATTCTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATTTGTTTTCTGTTTGCAGGTCTGTGCAATGGTGGAAGATTCTTGG  495

seq1  AACCAGAGTTACAGACACTTGTGAGCTGTCATGTGGGTGCTGGGAATTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGAGTTACAGACACTTGTGAGCTGTCATGTGGGTGCTGGGAATTTG  545

seq1  ACTCAGGTCCTCTGGAAGAACAGCCAGTGCTCTTAAAACTCTTAACTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGTCCTCTGGAAGAACAGCCAGTGCTCTTAAAACTCTTAACTGCT  595

seq1  GAGCTATCTCTCTAGACCCTAATTATTACTTCTTTATCTACTGAAAACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTATCTCTCTAGACCCTAATTATTACTTCTTTATCTACTGAAAACCA  645

seq1  GATACTTAGTCTTCTAAACTCAGAGGAAGCCATATTGTCTCAGATGTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTTAGTCTTCTAAACTCAGAGGAAGCCATATTGTCTCAGATGTCTT  695

seq1  TTTGGTCACAATAATGGAAGAGATACAGGGTAGGGGTGTGAAACCAGTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCACAATAATGGAAGAGATACAGGGTAGGGGTGTGAAACCAGTCC  745

seq1  TTCTGCATTCTGACTTGGATCCTAAGAAGTTCCTGGAACTGTCCTCTCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCATTCTGACTTGGATCCTAAGAAGTTCCTGGAACTGTCCTCTCAG  795

seq1  CATCATCATAGGTTAACACAGTCACTACATAAATTCTTTGAATGGCTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCATAGGTTAACACAGTCACTACATAAATTCTTTGAATGGCTTTA  845

seq1  TTTCCCAGGTTTCTACAACCTGGAAAGCACAGAGAATTC  889
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCAGGTTTCTACAACCTGGAAAGCACAGAGAATTC  884