BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-133K04
Chromosome16 (Build37)
Map Location 28,818,773 - 28,953,770
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1600021P15Rik, EG666717
Upstream geneFgf12
Downstream geneHrasls, Atp13a5, Atp13a4, Opa1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-133K04.bB6Ng01-133K04.g
ACCDH934132DH934133
length9811,112
definitionDH934132|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133K04, 5' end.DH934133|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133K04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,952,787 - 28,953,770)(28,818,773 - 28,819,896)
sequence
gaattcagtgatccacctgcctctgccttaggaatgctgggattaaaggc
atgtaccaccctggcctagaagattagtatcttttcttattgctgtgact
aaatgcttgataacagccaacttaaaggagaaagagcttattttgacttt
aaagaatataatctattttgcgtggaaggcatgccaatcaaataggaggc
agcaaagtatatcacctctacaaccaaaggtgcgatctacacacagagca
gagaggaaacagaatttggctacaaaagctcaaagctcaccctcagtgac
tcactttctgcagcaaggctctgtctcctaaaggttccacagccctccaa
aacagttcagcaaactgggctgctaggctcacatttgaccttcaaaacac
aacagcctgctttattcttaattgaagcattagatttctcttttcatgga
cattagggatagcttaaataaaggttggggaagcggcattctttacaata
catatttactgaatggaatctggaataactggctctggttcatttatgat
cacatttcaaattaacaacagattctgagggtaaaggggaaaatggcttg
tctaagtcaatgttctattgctatgaagagacaccatgacaacaactctc
atagaaatgcgtttaattggggcttgcttacagtgagatttagtccattt
ttatgatggtagatagcagggtggcatgcaggtagatatggtactggata
agaaacctgagagatctgcatcagcagcagcagaggaaactgagatacac
tgggcatggcttgagcatctaaaacctcaaagcccaccctccagtgacac
acttcctccaacaagaccacacctactccaacaaagccagacctacacca
gcaaggcacactctgttagcccctcccaagtagcacacacacacacacac
acacacattttaattagcaccttacaattgt
gaattctcttattaggcacttccttctcctaaggctgactaacaagatcc
agctattaaagtattgaagaccagcaatcaaaaactccctttggctcacc
taattaacatgatcaattaagattaaacgccatatcctagcctgaggttt
cctctttactttataccctgctatttgcctgtggatgggctgtcttcctc
ctctttatccagacgcgatcctcggtgcctccctcccccttcccttgccc
tctgtctttgtcttctactccttgccctttgtccctctagggcaaataca
tttcctatgttctgaaaacttagtcttggaggtcctgaggcaattaggga
aataagaggcaattgggaccagagttcagtcaggctaagactttcttttc
aagatgcagaagccattctcagacttgcctctttctaattcctctgctgt
tcttggtaggtttcctcccaaagccattagcatagaggagaaggtcagaa
tgtgaatatgacccagaggaaggattgtccaggctggactcacgctgtga
ttctgtcagagtcacagggttttgatgggagacattgtccccagaggttt
ccatcacaaggtgaacacatgcgaggtaaagaacaaatttaagtaaatta
tagacacaatctagtcactgtcacatgatcccaaatggcactttcttttt
cttttagaattcccatataaaactaaacaaaactgatgcgtgagttagtc
aaggtcaacgctttagctatctttcaataacttaagagccacaaaacctt
gagttttccagtaaaatacttttgtatgcaataactttttaaatgggaac
aaacagctatttgtaaagtacagagattgtcctgtacctgtgacaatgag
cctgattctggagagttctcagaaccatatgccaccatagaataaagact
ggagcatgactctcattactatgcccattactatgccctatctgagagat
actacatctcttcgttctcaactcactagagtcatgctgctgagtctgta
aattctacccataagactgttatattatctctcctgtgtgcatcttctgt
ccagttaaatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_28952787_28953770
seq2: B6Ng01-133K04.b_48_1028 (reverse)

seq1  ACAATTGTTATGTGCTAATTAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCT  50
      |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTGTAAGGTGCTAATTAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCT  50

seq1  ACTTGGGAGGGGCTAACAGAGGTGTGGCCTTGCTGGTGTAGGTCTGGCTT  100
      |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGAGGGGCTAACAGA-GTGT-GCCTTGCTGGTGTAGGTCTGGCTT  98

seq1  TGTTGGAGTAGGTGTGGTCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACTGGAGGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGAGTAGGTGTGGTCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACTGGAGGGTGG  148

seq1  GCTTTGAGGTTTTAGATGCTCAAGCCATGCCCAGTGTATCTCAGTTTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGAGGTTTTAGATGCTCAAGCCATGCCCAGTGTATCTCAGTTTCCT  198

seq1  CCTGCTGCCTGCTGATGCAGATCTCTCAGG-TTCTTATCCAGTACCATAT  249
       |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  -CTGCTG-CTGCTGATGCAGATCTCTCAGGTTTCTTATCCAGTACCATAT  246

seq1  CTACCTGCATGCCACCCTGCTATCTACCATCATAAAAATGGACTAAATCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTGCATGCCACCCTGCTATCTACCATCATAAAAATGGACTAAATCT  296

seq1  CACTGTAAGCAAGCCCCAATTAAACGCATTTCTATGAGAGTTGTTGTCAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTAAGCAAGCCCCAATTAAACGCATTTCTATGAGAGTTGTTGTCAT  346

seq1  GGTGTCTCTTCATAGCAATAGAACATTGACTTAGACAAGCCATTTTCCCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTCTTCATAGCAATAGAACATTGACTTAGACAAGCCATTTTCCCC  396

seq1  TTTACCCTCAGAATCTGTTGTTAATTTGAAATGTGATCATAAATGAACCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCCTCAGAATCTGTTGTTAATTTGAAATGTGATCATAAATGAACCA  446

seq1  GAGCCAGTTATTCCAGATTCCATTCAGTAAATATGTATTGTAAAGAATGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGTTATTCCAGATTCCATTCAGTAAATATGTATTGTAAAGAATGC  496

seq1  CGCTTCCCCAACCTTTATTTAAGCTATCCCTAATGTCCATGAAAAGAGAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTTCCCCAACCTTTATTTAAGCTATCCCTAATGTCCATGAAAAGAGAA  546

seq1  ATCTAATGCTTCAATTAAGAATAAAGCAGGCTGTTGTGTTTTGAAGGTCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATGCTTCAATTAAGAATAAAGCAGGCTGTTGTGTTTTGAAGGTCA  596

seq1  AATGTGAGCCTAGCAGCCCAGTTTGCTGAACTGTTTTGGAGGGCTGTGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAGCCTAGCAGCCCAGTTTGCTGAACTGTTTTGGAGGGCTGTGGA  646

seq1  ACCTTTAGGAGACAGAGCCTTGCTGCAGAAAGTGAGTCACTGAGGGTGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTAGGAGACAGAGCCTTGCTGCAGAAAGTGAGTCACTGAGGGTGAG  696

seq1  CTTTGAGCTTTTGTAGCCAAATTCTGTTTCCTCTCTGCTCTGTGTGTAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGCTTTTGTAGCCAAATTCTGTTTCCTCTCTGCTCTGTGTGTAGA  746

seq1  TCGCACCTTTGGTTGTAGAGGTGATATACTTTGCTGCCTCCTATTTGATT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCACCTTTGGTTGTAGAGGTGATATACTTTGCTGCCTCCTATTTGATT  796

seq1  GGCATGCCTTCCACGCAAAATAGATTATATTCTTTAAAGTCAAAATAAGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGCCTTCCACGCAAAATAGATTATATTCTTTAAAGTCAAAATAAGC  846

seq1  TCTTTCTCCTTTAAGTTGGCTGTTATCAAGCATTTAGTCACAGCAATAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTCCTTTAAGTTGGCTGTTATCAAGCATTTAGTCACAGCAATAAG  896

seq1  AAAAGATACTAATCTTCTAGGCCAGGGTGGTACATGCCTTTAATCCCAGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGATACTAATCTTCTAGGCCAGGGTGGTACATGCCTTTAATCCCAGC  946

seq1  ATTCCTAAGGCAGAGGCAGGTGGATCACTGAATTC  984
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTAAGGCAGAGGCAGGTGGATCACTGAATTC  981

seq1: chr16_28818773_28819896
seq2: B6Ng01-133K04.g_67_1178

seq1  GAATTCTCTTATTAGGCACTTCCTTCTCCTAAGGCTGACTAACAAGATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTATTAGGCACTTCCTTCTCCTAAGGCTGACTAACAAGATCC  50

seq1  AGCTATTAAAGTATTGAAGACCAGCAATCAAAAACTCCCTTTGGCTCACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTAAAGTATTGAAGACCAGCAATCAAAAACTCCCTTTGGCTCACC  100

seq1  TAATTAACATGATCAATTAAGATTAAACGCCATATCCTAGCCTGAGGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAACATGATCAATTAAGATTAAACGCCATATCCTAGCCTGAGGTTT  150

seq1  CCTCTTTACTTTATACCCTGCTATTTGCCTGTGGATGGGCTGTCTTCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTTACTTTATACCCTGCTATTTGCCTGTGGATGGGCTGTCTTCCTC  200

seq1  CTCTTTATCCAGACGCGATCCTCGGTGCCTCCCTCCCCCTTCCCTTGCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTATCCAGACGCGATCCTCGGTGCCTCCCTCCCCCTTCCCTTGCCC  250

seq1  TCTGTCTTTGTCTTCTACTCCTTGCCCTTTGTCCCTCTAGGGCAAATACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTTTGTCTTCTACTCCTTGCCCTTTGTCCCTCTAGGGCAAATACA  300

seq1  TTTCCTATGTTCTGAAAACTTAGTCTTGGAGGTCCTGAGGCAATTAGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTATGTTCTGAAAACTTAGTCTTGGAGGTCCTGAGGCAATTAGGGA  350

seq1  AATAAGAGGCAATTGGGACCAGAGTTCAGTCAGGCTAAGACTTTCTTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGAGGCAATTGGGACCAGAGTTCAGTCAGGCTAAGACTTTCTTTTC  400

seq1  AAGATGCAGAAGCCATTCTCAGACTTGCCTCTTTCTAATTCCTCTGCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGCAGAAGCCATTCTCAGACTTGCCTCTTTCTAATTCCTCTGCTGT  450

seq1  TCTTGGTAGGTTTCCTCCCAAAGCCATTAGCATAGAGGAGAAGGTCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTAGGTTTCCTCCCAAAGCCATTAGCATAGAGGAGAAGGTCAGAA  500

seq1  TGTGAATATGACCCAGAGGAAGGATTGTCCAGGCTGGACTCACGCTGTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAATATGACCCAGAGGAAGGATTGTCCAGGCTGGACTCACGCTGTGA  550

seq1  TTCTGTCAGAGTCACAGGGTTTTGATGGGAGACATTGTCCCCAGAGGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCAGAGTCACAGGGTTTTGATGGGAGACATTGTCCCCAGAGGTTT  600

seq1  CCATCACAAGGTGAACACATGCGAGGTAAAGAACAAATTTAAGTAAATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCACAAGGTGAACACATGCGAGGTAAAGAACAAATTTAAGTAAATTA  650

seq1  TAGACACAATCTAGTCACTGTCACATGATCCCAAATGGCACTTTCTTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACACAATCTAGTCACTGTCACATGATCCCAAATGGCACTTTCTTTTT  700

seq1  CTTTTAGAATTCCCATATAAAACTAAACAAAACTGATGCGTGAGTTAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAGAATTCCCATATAAAACTAAACAAAACTGATGCGTGAGTTAGTC  750

seq1  AAGGTCAACGCTTTAGCTATCTTTCAATAACTTAAGAGCCACAAAACCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCAACGCTTTAGCTATCTTTCAATAACTTAAGAGCCACAAAACCTT  800

seq1  GAGTTTTCCAGTAAAATACTTTTGTATGCAATAACTTTTTAAAT-GGAAC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAGTTTTCCAGTAAAATACTTTTGTATGCAATAACTTTTTAAATGGGAAC  850

seq1  AAACAGCTATTTGTAAAGTACAGAGATTGTCCTGTACCTGTGACAATGAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGCTATTTGTAAAGTACAGAGATTGTCCTGTACCTGTGACAATGAG  900

seq1  CCTGATTCTGGAGAGTTCTCAGAACCATATGCCACCATAGAATAAAGACT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATTCTGGAGAGTTCTCAGAACCATATGCCACCATAGAATAAAGACT  950

seq1  GGAGCAATGACTTCTCATTACTATGCCCATTACTATGCCCTATCTGAGAG  999
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGC-ATGAC-TCTCATTACTATGCCCATTACTATGCCCTATCTGAGAG  998

seq1  ATACCTACCATCTTCTTTCCTTCTCAACTCACCTAGAGTCCATGCCTGCC  1049
      ||| ||| |||||   ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |
seq2  ATA-CTA-CATCT--CTTCGTTCTCAACTCA-CTAGAGT-CATG-CTG-C  1040

seq1  TGAGTCTGTAAATTCTACCCAT-AGACTGTTATTATTTAATCTTCTCCTG  1098
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||
seq2  TGAGTCTGTAAATTCTACCCATAAGACTGTTA-TATT--ATC-TCTCCTG  1086

seq1  TGTGCATCTTCTGTCCAGGTAAATAG  1124
      |||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGTGCATCTTCTGTCCAGTTAAATAG  1112