BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136O24
Chromosome16 (Build37)
Map Location 67,214,766 - 67,372,639
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCadm2
Upstream genenone
Downstream gene9330155M09Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136O24.bB6Ng01-136O24.g
ACCDH936581DH936582
length1,1391,029
definitionDH936581|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136O24, 5' end.DH936582|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136O24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,371,497 - 67,372,639)(67,214,766 - 67,215,806)
sequence
gaattctagtatatctttccatcaaatagcataacataaacctgatttta
aattaaccaattagtgtattaaacaatacaactagttgacctctgatata
aaaataagcacattttcaaaagtcaggctctcgatgagtcaggctctgtc
ttcaaagtggaatattctatggttgagttgtttttgtttagtctattctt
tcagttcatcccacacccagggtatatctctcttgtccaggaaacagatt
tccaaaaggaatgtgataactatatcatttctatctatgtatctgtctat
atctatatatctatataaaaatctccaaaactaaactgtattcatctgtt
taatcctctcaaatgttttatttaatattttgatactttcatgttaatat
gcatatcttacctgcatatacattaaataatctatccatatattaaataa
caactactcagtcaatcttattccagaaatagtttgatttgaaattattg
atatacttttaccttcatttacatattacatctgtgggaattgccttgtg
aatggaaacaaattgtctttccctattaatatgagaatcattagtatcaa
catgatgtgttgcaggtgtgtaagacattggaataaacagcaaaaacact
tggggaaatcacctgtgactatttggttatccatgtacttacaaatttaa
tatttctaattattcctccttttcagcattattttagcttgtatttaaag
accctggcaagcataactggaaagtaaaagctataatttaaaaacaatga
acttatattgttattgcattgtagttggttactttcaaatcaatgaaaaa
tttatgcttcacatttataattttttttaaatggtggtcatttgtttttt
ccaaccttgtacatttggagattaactcttcggattcactcataaagttc
aaactcaagtatctttccatgataattgcttttggatgctgagactgtaa
ttcacttgtagagtgatttacactacaacttgtaaactagtgctgacata
ttagtatgaaattcacgcctcaaaataatcaatggacatgatgatgtatt
tgggaaattaacacatttctattccgatttgtcattcaa
gaattcagaagtaaaaaacagcagagtctcagtcttgatgtaaggaaaat
aatgcacaaatgtgtttatagattattcttgttataatatttattatgtg
aacatgaacataaggtagtctctctacctttttgggtgactattctaata
tttggtatacaataactttttataagttgtgcattaacacaaaaatgaat
gataattaattcggagtccaaaaaattaatgcaaccaacattttaagtta
taaattgagaatgtggattaagagatactaaagagccctaccaaagttga
tactaattataaattatgtcttatctttaattataaaaggaagatgcaat
atttgagcattgtttatatagattactcaatgaggcatatattatgttat
ctttctccaaaaccccagccttcaaaagataacatacaaatatactattt
gtttcaacaggggattagttttatgcttctttgcaaattttatatcactg
tattttgtaatattttataatttatttcatcatgttactaagtcacgatg
aatataatgttactgttataaatgataaaactgagcacagaaagaatcat
gtgacttttctaatcttgataacaaagctacagcatgacattcgggaccc
tgccccaatcttctgatcagaaataccagatctcattataaatcagcttc
ctccatatcaaaagcaggcatctattgaattcccaaataaagttctttca
aaattaaaatgacgttttcctggtgatatgaaaagcaattaagctaggac
tttaacggtccccatggaatactttttgccctgttatattttgaagtatc
catcatagaacttaactattgttaatgatcctgaactttcttttccactc
agctagcagcaaaattgcctggattatgcttcatgtttgctcatatatat
caataccaaccagacagcaagcaatgttagaaaactccttagaactaagg
atacagaagtagcaatgatgagatggtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_67371497_67372639
seq2: B6Ng01-136O24.b_47_1185 (reverse)

seq1  TTGAATGACAAAATCGAATAGATATGTGTTATATTTCCAAATACATCATC  50
      ||||||||||||   ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||
seq2  TTGAATGACAAATCGGAATAGAAATGTGTTAATTTCCCAAATACATCATC  50

seq1  ATGTCAATTGATTATTTTTGAGCGTTGGAAATTCATACTAATATGTCAAG  100
      ||||| ||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||| ||
seq2  ATGTCCATTGATTATTTTGAGGCGT--GAATTTCATACTAATATGTC-AG  97

seq1  CACTAGTTTACAAGTTGTAGTGTAAATCACTCTACAAGTGAATTACAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGTTTACAAGTTGTAGTGTAAATCACTCTACAAGTGAATTACAGTC  147

seq1  TCAGCATCCAAAAGCAATTATCATGGAAAGATACTTGAGTTTGAACTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATCCAAAAGCAATTATCATGGAAAGATACTTGAGTTTGAACTTTA  197

seq1  TGAGTGAATCCGAAGAGTTAATCTCCAAATGTACAAGGTTGGAAAAAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGAATCCGAAGAGTTAATCTCCAAATGTACAAGGTTGGAAAAAACA  247

seq1  AATGACCACCATTTAAAAAAAATTATAAATGTTGAAGCATAAATTTTTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AATGACCACCATTTAAAAAAAATTATAAATG-TGAAGCATAAATTTTTCA  296

seq1  TTGATTTGAAAGTAACCAACTACAATGCAATAACAATATAAGTTCATTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTGAAAGTAACCAACTACAATGCAATAACAATATAAGTTCATTGT  346

seq1  TTTTAAATTATAGCTTTTACTTTCCAGTTATGCTTGCCAGGGTCTTTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATTATAGCTTTTACTTTCCAGTTATGCTTGCCAGGGTCTTTAAA  396

seq1  TACAAGCTAAAATAATGCTGAAAAGGAGGAATAATTAGAAATATTAAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGCTAAAATAATGCTGAAAAGGAGGAATAATTAGAAATATTAAATT  446

seq1  TGTAAGTACATGGATAACCAAATAGTCACAGGTGATTTCCCCAAGTGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTACATGGATAACCAAATAGTCACAGGTGATTTCCCCAAGTGTTT  496

seq1  TTGCTGTTTATTCCAATGTCTTACACACCTGCAACACATCATGTTGATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTTTATTCCAATGTCTTACACACCTGCAACACATCATGTTGATAC  546

seq1  TAATGATTCTCATATTAATAGGGAAAGACAATTTGTTTCCATTCACAAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGATTCTCATATTAATAGGGAAAGACAATTTGTTTCCATTCACAAGG  596

seq1  CAATTCCCACAGATGTAATATGTAAATGAAGGTAAAAGTATATCAATAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCCCACAGATGTAATATGTAAATGAAGGTAAAAGTATATCAATAAT  646

seq1  TTCAAATCAAACTATTTCTGGAATAAGATTGACTGAGTAGTTGTTATTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAATCAAACTATTTCTGGAATAAGATTGACTGAGTAGTTGTTATTTA  696

seq1  ATATATGGATAGATTATTTAATGTATATGCAGGTAAGATATGCATATTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGGATAGATTATTTAATGTATATGCAGGTAAGATATGCATATTAA  746

seq1  CATGAAAGTATCAAAATATTAAATAAAACATTTGAGAGGATTAAACAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAAGTATCAAAATATTAAATAAAACATTTGAGAGGATTAAACAGAT  796

seq1  GAATACAGTTTAGTTTTGGAGATTTTTATATAGATATATAGATATAGACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACAGTTTAGTTTTGGAGATTTTTATATAGATATATAGATATAGACA  846

seq1  GATACATAGATAGAAATGATATAGTTATCACATTCCTTTTGGAAATCTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACATAGATAGAAATGATATAGTTATCACATTCCTTTTGGAAATCTGT  896

seq1  TTCCTGGACAAGAGAGATATACCCTGGGTGTGGGATGAACTGAAAGAATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGGACAAGAGAGATATACCCTGGGTGTGGGATGAACTGAAAGAATA  946

seq1  GACTAAACAAAAACAACTCAACCATAGAATATTCCACTTTGAAGACAGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAACAAAAACAACTCAACCATAGAATATTCCACTTTGAAGACAGAG  996

seq1  CCTGACTCATCGAGAGCCTGACTTTTGAAAATGTGCTTATTTTTATATCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACTCATCGAGAGCCTGACTTTTGAAAATGTGCTTATTTTTATATCA  1046

seq1  GAGGTCAACTAGTTGTATTGTTTAATACACTAATTGGTTAATTTAAAATC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCAACTAGTTGTATTGTTTAATACACTAATTGGTTAATTTAAAATC  1096

seq1  AGGTTTATGTTATGCTATTTGATGGAAAGATATACTAGAATTC  1143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTATGTTATGCTATTTGATGGAAAGATATACTAGAATTC  1139

seq1: chr16_67214766_67215806
seq2: B6Ng01-136O24.g_69_1097

seq1  GAATTCAGAAGTAAAAAACAGCAGAGTCTCAGTCTTGATGTAAGGAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAGTAAAAAACAGCAGAGTCTCAGTCTTGATGTAAGGAAAAT  50

seq1  AATGCACAAATGTGTTTATAGATTATTCTTGTTATAATATTTATTATGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCACAAATGTGTTTATAGATTATTCTTGTTATAATATTTATTATGTG  100

seq1  AACATGAACATAAGGTAGTCTCTCTACCTTTTTGGGTGACTATTCTAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGAACATAAGGTAGTCTCTCTACCTTTTTGGGTGACTATTCTAATA  150

seq1  TTTGGTATACAATAACTTTTTATAAGTTGTGCATTAACACAAAAATGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTATACAATAACTTTTTATAAGTTGTGCATTAACACAAAAATGAAT  200

seq1  GATAATTAATTCGGAGTCCAAAAAATTAATGCAACCAACATTTTAAGTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATTAATTCGGAGTCCAAAAAATTAATGCAACCAACATTTTAAGTTA  250

seq1  TAAATTGAGAATGTGGATTAAGAGATACTAAAGAGCCCTACCAAAGTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGAGAATGTGGATTAAGAGATACTAAAGAGCCCTACCAAAGTTGA  300

seq1  TACTAATTATAAATTATGTCTTATCTTTAATTATAAAAGGAAGATGCAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATTATAAATTATGTCTTATCTTTAATTATAAAAGGAAGATGCAAT  350

seq1  ATTTGAGCATTGTTTATATAGATTACTCAATGAGGCATATATTATGTTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAGCATTGTTTATATAGATTACTCAATGAGGCATATATTATGTTAT  400

seq1  CTTTCTCCAAAACCCCAGCCTTCAAAAGATAACATACAAATATACTATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCCAAAACCCCAGCCTTCAAAAGATAACATACAAATATACTATTT  450

seq1  GTTTCAACAGGGGATTAGTTTTATGCTTCTTTGCAAATTTTATATCACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAACAGGGGATTAGTTTTATGCTTCTTTGCAAATTTTATATCACTG  500

seq1  TATTTTGTAATATTTTATAATTTATTTCATCATGTTACTAAGTCACGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTGTAATATTTTATAATTTATTTCATCATGTTACTAAGTCACGATG  550

seq1  AATATAATGTTACTGTTATAAATGATAAAACTGAGCACAGAAAGAATCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAATGTTACTGTTATAAATGATAAAACTGAGCACAGAAAGAATCAT  600

seq1  GTGACTTTTCTAATCTTGATAACAAAGCTACAGCATGACATTCGGGACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTTTCTAATCTTGATAACAAAGCTACAGCATGACATTCGGGACCC  650

seq1  TGCCCCAATCTTCTGATCAGAAATACCAGATCTCATTATAAATCAGCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCAATCTTCTGATCAGAAATACCAGATCTCATTATAAATCAGCTTC  700

seq1  CTCCATATCAAAAGCAGGCATCTATTGAATTCCCAAATAAAGTTCTTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATATCAAAAGCAGGCATCTATTGAATTCCCAAATAAAGTTCTTTCA  750

seq1  AAATTAAAATGACGTTTTCCTGGTGATATGAAAAGCAATTAAGCTAGGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAAATGACGTTTTCCTGGTGATATGAAAAGCAATTAAGCTAGGAC  800

seq1  TTTAACGGTCCCCATGGAATACTTTTTGCCCTGTTATATTTTGAAGTATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACGGTCCCCATGGAATACTTTTTGCCCTGTTATATTTTGAAGTATC  850

seq1  CATCATAGAACTTAACTATTGTTAATGATCCTGAACTTTCTTTTCCACTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATAGAACTTAACTATTGTTAATGATCCTGAACTTTCTTTTCCACTC  900

seq1  AGCTAGCAGCAAAATTGCCTGGTTTATGCTTCATGTTTGCTCATAATATT  950
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
seq2  AGCTAGCAGCAAAATTGCCTGGATTATGCTTCATGTTTGCTCAT-ATA-T  948

seq1  ATCAATACCAACCAGAACAAGCAAAGCAATGTTAAGGAAAAACTCCTTAG  1000
      ||||||||||||||||   ||| |||||||||||    ||||||||||||
seq2  ATCAATACCAACCAGA--CAGC-AAGCAATGTTA---GAAAACTCCTTAG  992

seq1  AACTAAGGATTACAGAAGTTAGCAATGAATGAGAATGGTCT  1041
      ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||
seq2  AACTAAGGA-TACAGAAG-TAGCAATG-ATGAG-ATGGTCT  1029