BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-141N02
Chromosome16 (Build37)
Map Location 28,204,440 - 28,375,901
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFgf12
Upstream geneOstn, Uts2d, Ccdc50
Downstream gene1600021P15Rik, EG666717, Hrasls, Atp13a5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-141N02.bB6Ng01-141N02.g
ACCDH940174DH940175
length1,1041,103
definitionDH940174|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141N02, 5' end.DH940175|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141N02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,204,440 - 28,205,563)(28,374,789 - 28,375,901)
sequence
gaattcaactaaaggaatcattgtctttcatctgatgagacaaagaaaat
gctaaattccattatttcaaatgaggagtacatgtgcacacacacacaca
cacacacacacacacacatacacacaccatggtagctttgactacaagtc
tagttttatacctttttttttttaaaaagcctatacaaatatgggaacct
ctgtctaaacattttgagacttttctttttcctggaaaattactgagagt
ggactcctctaaaactcaagattccttgttaacacattttttgaagtgtc
tgatgacttagcagagtaagtatatagcacatgaagcaatgctacctggg
agtgttggaactacaatttcttcagaggcagcaaaacacaaagatttaag
tttccactgttataccttgatcatgtttcctaacttctctgacactccat
tttaacatctgtaagtcagagctaaaccttacctcccctgtaaggctgcc
actgctatacaagacaaggctatgtgttaggcctattctatctgctgttt
tgctctttactccccgtgacaagtttaaggcactaactgatatcacagct
gagaatggggccaccacaagcagcaaggaatccaaacacagtcctgcata
agtcataaactatgaagggctgaccaagactaagttatacaaggttccat
atggccatctgtctgtagaacccacagagaatctcagtgtcggcttcttg
acaccgcctacagaagagtcatatcctaaagacacatgacttgcccccag
caagaaaaccctaagaataacagaggtgaatgtggaaaacaagaggagcc
cagtgcgtgagaggatgcatcatcttacatttcactgctctcagaattat
ttctgaaaatctgactggtggagaggcaatgtttctacaatggtgatgga
cgacacgaacaccaaaatacctgcatgtagctaagaaatgctgggacaac
agagttagctgcaaatccagtgtacactcctttgaccacttctgaatgta
gatgaattagaggcaataggttcaaatgaggtgctgagatttatttcata
gcaa
gaattccagagttcctatggtgagatgggaaatggagagaaacctgcaag
cttgtggaccagatagactagcacacatacctgggaacaacccagaaacc
gtgtttcaaaagaaggtggaaggtgggcacatacacctgagggtgccctg
tagctggcacatgtgcactgtggtgtgtgtgctctcatgtatatacatca
tcatccatatatacagaatatatacatcatccatatatacagaaaggaac
atttactgttaatggtaaataactctgtttctgaaacattttagagggca
ttgtagctttttgaaattcttttgttaccaacaggtacagtaaattgtta
cacctgcctaacatgctcattttaaagagaggaaactaatgacataatgc
agtgcatggagcttaaactcacgtgactctgagtggccgcctgctctaga
aacatccacttcaaaactctccatcctttgattcgctctagtctttctgt
gtccatttggtaaagtcgaactctgtatgattagaagaatccttgtttat
ttacatgctgtgctttctcctttctcacaagaaagagtgtaaccttcttc
tcctttcctaaatgtcacctcccatctcatgtttgctgtgaaacatttcc
tggatgcctcacgccacaaaactcttccatgctttttttttttttttccc
ctgatcttccacaacaaacaaactatatatagaaagaagcacatattaca
tttaattatagaaataaattatacagtgtgtttggttactccatatgtct
tagctatgcctccttaaggagactgttttatatttcttaagcaatttaaa
atgtgcaagctcaatggtgaagcttataggaaggactcaaattagcttag
ctcttaaattgagtcaaaattatttccttagcaactgttatcagcatagt
tccacactttcacgagaatgagcaaccaggtttcaaagagtcgtgtctta
gctgtgtcatcactaggtgtctatctcgctacagggatctgagtctaaag
ttttcctctgccgatcacttgaaatttgacaaaatcagggcagtacctgc
ctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_28204440_28205563
seq2: B6Ng01-141N02.b_49_1152

seq1  GAATTCAACTAAAGGAATCATTGTCTTTCATCTGATGAGACAAAGAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTAAAGGAATCATTGTCTTTCATCTGATGAGACAAAGAAAAT  50

seq1  GCTAAATTCCATTATTTCAAATGAGGAGTACATGTGCACACACACACACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAATTCCATTATTTCAAATGAGGAGTACATGTGCACACACACACACA  100

seq1  CACACACACACACACACATACACACACCATGGTAGCTTTGACTACAAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACATACACACACCATGGTAGCTTTGACTACAAGTC  150

seq1  TAGTTTTATACCTTTTTTTTTTTAAAAAGCCTATACAAATATGGGAACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTATACCTTTTTTTTTTTAAAAAGCCTATACAAATATGGGAACCT  200

seq1  CTGTCTAAACATTTTGAGACTTTTCTTTTTCCTGGAAAATTACTGAGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTAAACATTTTGAGACTTTTCTTTTTCCTGGAAAATTACTGAGAGT  250

seq1  GGACTCCTCTAAAACTCAAGATTCCTTGTTAACACATTTTTTGAAGTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCCTCTAAAACTCAAGATTCCTTGTTAACACATTTTTTGAAGTGTC  300

seq1  TGATGACTTAGCAGAGTAAGTATATAGCACATGAAGCAATGCTACCTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGACTTAGCAGAGTAAGTATATAGCACATGAAGCAATGCTACCTGGG  350

seq1  AGTGTTGGAACTACAATTTCTTCAGAGGCAGCAAAACACAAAGATTTAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGGAACTACAATTTCTTCAGAGGCAGCAAAACACAAAGATTTAAG  400

seq1  TTTCCACTGTTATACCTTGATCATGTTTCCTAACTTCTCTGACACTCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACTGTTATACCTTGATCATGTTTCCTAACTTCTCTGACACTCCAT  450

seq1  TTTAACATCTGTAAGTCAGAGCTAAACCTTACCTCCCCTGTAAGGCTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACATCTGTAAGTCAGAGCTAAACCTTACCTCCCCTGTAAGGCTGCC  500

seq1  ACTGCTATACAAGACAAGGCTATGTGTTAGGCCTATTCTATCTGCTGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTATACAAGACAAGGCTATGTGTTAGGCCTATTCTATCTGCTGTTT  550

seq1  TGCTCTTTACTCCCCGTGACAAGTTTAAGGCACTAACTGATATCACAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTTACTCCCCGTGACAAGTTTAAGGCACTAACTGATATCACAGCT  600

seq1  GAGAATGGGGCCACCACAAGCAGCAAGGAATCCAAACACAGTCCTGCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGGGGCCACCACAAGCAGCAAGGAATCCAAACACAGTCCTGCATA  650

seq1  AGTCATAAACTATGAAGGGCTGACCAAGACTAAGTTATACAAGGTTCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATAAACTATGAAGGGCTGACCAAGACTAAGTTATACAAGGTTCCAT  700

seq1  ATGGCCATCTGTCTGTAGAACCCACAGAGAATCTCAGTGTCGGCTTCTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCATCTGTCTGTAGAACCCACAGAGAATCTCAGTGTCGGCTTCTTG  750

seq1  ACACCGCCTACAGAAGAGTCATATCCTAAAGACACATGACTTGCCCCCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCGCCTACAGAAGAGTCATATCCTAAAGACACATGACTTGCCCCCAG  800

seq1  CAAGAAAACCCTAAGAATAACAGAGGTGAATGTGGAAAACAAGAGGAGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAAACCCTAAGAATAACAGAGGTGAATGTGGAAAACAAGAGGAGCC  850

seq1  CAGTGCGTGAGAGGATGCATCATCTTACATTTCACTGCTCTCAGAATTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCGTGAGAGGATGCATCATCTTACATTTCACTGCTCTCAGAATTAT  900

seq1  TTCTGAAAATCTGACTGGTGGAGAGGCAATGTTTCTACAATGGTGATTGG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCTGAAAATCTGACTGGTGGAGAGGCAATGTTTCTACAATGGTGA-TGG  949

seq1  ACGGACACGGAACACCAAAATACCTGCATGTAGCTAAAGAAATGCTGGGA  1000
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  AC-GACAC-GAACACCAAAATACCTGCATGTAGCT-AAGAAATGCTGGG-  995

seq1  ACAAACAAGAGTTAAGCTTGCACATTCCAGTGTACACTCCCTTTGACCCA  1050
      ||||   |||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||
seq2  ACAA--CAGAGTT-AGC-TGCA-AATCCAGTGTACACT-CCTTTGA-CCA  1038

seq1  CTTCTGAAAATGTAGATAGATATAGAGGC-ATATGTTCAAATTAGAGGGT  1099
      ||||||  ||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||| |   |||
seq2  CTTCTG--AATGTAGAT-GAATTAGAGGCAATAGGTTCAAATGA---GGT  1082

seq1  GCTGAGGATTTTATATTCATAGCAA  1124
      ||||||   ||||| ||||||||||
seq2  GCTGAG--ATTTAT-TTCATAGCAA  1104

seq1: chr16_28374789_28375901
seq2: B6Ng01-141N02.g_71_1173 (reverse)

seq1  CAGGCAGGTACTGCCCTTGAATTTTAGTCAAATTTTCAAGTGAATCTGGC  50
      |||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||| ||| |||
seq2  CAGGCAGGTACTGCCC-TGA--TTTTGTCAAA-TTTCAAGTG-ATC-GGC  44

seq1  AGAAGATAAACTTTTAGACTTCAGGTTCCCTGTAGCAGGATTAGACACCT  100
      ||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||  || |||||||||
seq2  AGAGGA-AAAC-TTTAGAC-TCA-GATCCCTGTAGCGAGA-TAGACACCT  89

seq1  AGTTGATGACACTGGCTAAGACACGGCCTCTTTG-AACCTGTTTGCTCAT  149
      || |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||
seq2  AG-TGATGACAC-AGCTAAGACAC-GACTCTTTGAAACCTGGTTGCTCAT  136

seq1  TCCTCGTGAAAGTGTGG-ACTATGCTG-TAACAGTTGCTTAAGGATTAAT  197
      | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||   | 
seq2  T-CTCGTGAAAGTGTGGAACTATGCTGATAACAGTTGC-TAAGGAAATAA  184

seq1  TTTTGACTCAATTT-AGAGCTAAGCTAATTTGAGTTCTTCCTATAGGC-T  245
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |
seq2  TTTTGACTCAATTTAAGAGCTAAGCTAATTTGAGTCCTTCCTATAAGCTT  234

seq1  CACCATTGAGCTTGCACATTTTAAATTGCTTAAGAAATATAAAACAGTCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATTGAGCTTGCACATTTTAAATTGCTTAAGAAATATAAAACAGTCT  284

seq1  CCTTAAGGAGGCATAGCTAAGACATATGGAGTAACCTAACACACTGTATA  345
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCTTAAGGAGGCATAGCTAAGACATATGGAGTAACCAAACACACTGTATA  334

seq1  ATTTATTTCTATAATTAAATGTAATATGTGCTTCTTTCTATATATAGTTT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTTCTATAATTAAATGTAATATGTGCTTCTTTCTATATATAGTTT  384

seq1  GTTTGTTGTGGAAGATCAGGGG-AAAAAAAAAAAAAAGCATGGAAGAGTT  444
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTGTGGAAGATCAGGGGAAAAAAAAAAAAAAAGCATGGAAGAGTT  434

seq1  TTGTGGCCTGAGGCATCCAGGAAATGTTTCACAGCAAACATGAGATGGGA  494
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCGTGAGGCATCCAGGAAATGTTTCACAGCAAACATGAGATGGGA  484

seq1  GGTGACATTTAGGAAAGGAGAAGAAGGTTACACTCTTTCTTGTGAGAAAG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACATTTAGGAAAGGAGAAGAAGGTTACACTCTTTCTTGTGAGAAAG  534

seq1  GAGAAAGCACAGCATGTAAATAAACAAGGATTCTTCTAATCATACAGAGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGCACAGCATGTAAATAAACAAGGATTCTTCTAATCATACAGAGT  584

seq1  TCGACTTTACCAAATGGACACAGAAAGACTAGAGCGAATCAAAGGATGGA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGACTTTACCAAATGGACACAGAAAGACTAGAGCGAATCAAAGGATGGA  634

seq1  GAGTTTTGAAGTGGATGTTTCTAGAGCAGGCGGCCACTCAGAGTCACGTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTTGAAGTGGATGTTTCTAGAGCAGGCGGCCACTCAGAGTCACGTG  684

seq1  AGTTTAAGCTCCATGCACTGCATTATGTCATTAGTTTCCTCTCTTTAAAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAAGCTCCATGCACTGCATTATGTCATTAGTTTCCTCTCTTTAAAA  734

seq1  TGAGCATGTTAGGCAGGTGTAACAATTTACTGTACCTGTTGGTAACAAAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATGTTAGGCAGGTGTAACAATTTACTGTACCTGTTGGTAACAAAA  784

seq1  GAATTTCAAAAAGCTACAATGCCCTCTAAAATGTTTCAGAAACAGAGTTA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTCAAAAAGCTACAATGCCCTCTAAAATGTTTCAGAAACAGAGTTA  834

seq1  TTTACCATTAACAGTAAATGTTCCTTTCTGTATATATGGATGATGTATAT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCATTAACAGTAAATGTTCCTTTCTGTATATATGGATGATGTATAT  884

seq1  ATTCTGTATATATGGATGATGATGTATATACATGAGAGCACACACACCAC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGTATATATGGATGATGATGTATATACATGAGAGCACACACACCAC  934

seq1  AGTGCACATGTGCCAGCTACAGGGCACCCTCAGGTGTATGTGCCCACCTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCACATGTGCCAGCTACAGGGCACCCTCAGGTGTATGTGCCCACCTT  984

seq1  CCACCTTCTTTTGAAACACGGTTTCTGGGTTGTTCCCAGGTATGTGTGCT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTTCTTTTGAAACACGGTTTCTGGGTTGTTCCCAGGTATGTGTGCT  1034

seq1  AGTCTATCTGGTCCACAAGCTTGCAGGTTTCTCTCCATTTCCCATCTCAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTATCTGGTCCACAAGCTTGCAGGTTTCTCTCCATTTCCCATCTCAC  1084

seq1  CATAGGAACTCTGGAATTC  1113
      |||||||||||||||||||
seq2  CATAGGAACTCTGGAATTC  1103