BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150A14
Chromosome16 (Build37)
Map Location 35,548,913 - 35,670,914
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSema5b, EG546663
Upstream geneRopn1, Ccdc14, Mylk, Ptplb, Adcy5, Sec22a, Pdia5
Downstream geneDirc2, Hspbap1, Parp14, LOC667133, LOC100043217, Dtx3l, Parp9, Kpna1, Wdr5b, 2310056P07Rik, Ccdc58, Csta, Stfa2l1, EG433016, EG627962, EG408196, 2010005H15Rik, Stfa1, EG209324, LOC100038854, BC100530, LOC639105, Stfa2, Stfa3, Casr, EG667232, Cd86
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150A14.bB6Ng01-150A14.g
ACCDH946218DH946219
length1,153661
definitionDH946218|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150A14, 5' end.DH946219|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150A14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,669,759 - 35,670,914)(35,548,913 - 35,549,573)
sequence
gaattctcaaatgcaatttatttttgaaagactcataacctaaatggaat
taaactgcccaaaattaacataattcttaaaagtaatttcattcaatgta
atgaatgtgagacagtcatcaagcccgttgacaaatattagacccatgat
ttcatcaaatctctattattctgccttagatcattgaaaactgttcaaca
aatattggctccaaagaatataataatgttctttctgaatttactccact
aatattcttttaaactctcaataatttctgcagttcacttgctatttcca
tgtgctggattattttcaacataaattaattgcttttgtaatcagcatta
attatgatggcattcacatcttgcaatctcaagtgcacacatgtaacttg
actattagtgtccacgtagtaggaaaaatgagagagatcctcactggaga
tttacctagacatttacagtattttctattaataaacctcaaagcaagcc
tcgtgcatgttgctactgtggatgtggtggctagattcagtgatgacctc
ctataaccacaactgtccatcaagctcagctccaaatgctgagggcaaag
gggcaatttgcagatttggagctgaactcccagtgtgtctcatgagcaaa
ttcagagggtctcccatatgtagcaatcttctctctctctctctctctct
ctctctctctctctctctctcatttatatgagtacattgtagctgtcttc
agacacaccagaagagggcatatgatcccattacagatggttgtgagcca
ccatgtgattgctgagaattggaaattggactcaggaccactggaagagc
agtcggtgctcttaaccactaagccatctctcctgccccttgctttcttg
ggtttttgactgtatggaagcaataagaatgcagttagagccgcacttta
catttattcttttccaatctacagtatgtggtatcacacacttagaatcc
tggacagggttagtgagctactatgccatccagatatgtgagctactcag
tgctaattgggaaaatgtgttttgctttagttgatttgctcaaatacagg
ctatgcatgtatattccaggaccgtttggatagtctcaggaagccatgta
tgt
gaattcactggtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtagacatatatatgacaaggactaggaagatggctcagtgagtaagact
gcttacaagactgacaacctgagttcagtccccagaatccatattaaaat
ctagcgactgtgaagtgtatctttaatccctgtactcttactgcaagatg
ggaggtagaggaaggaaaaccacctggaagttcatgggccagctagcttg
gagtatgctatgctgtggtagacactgagcagcagctcctgaaaattgtc
ctctgacctctgcgtacatgcaagagcatattaatgcctacactcacata
catacatacacatggtaaagtaaaatatataagggcatggtagcacatgc
ctttaaccccaacatgaggaaggcagaagcaggtggatctctgagctcaa
gggtagcctgccacccatttacataaccgattacagacagaccaaggcta
tatgtcccccaaaacaaaacagaaacctgaatactatatgcatttgacca
tgtatttgaatatgataattacacacaactgtcctatcctagacttcaac
tgagttagaattcctgaagatagagcctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_35669759_35670914
seq2: B6Ng01-150A14.b_47_1199 (reverse)

seq1  ACAT-CATGGCTTCCTTGAGCCTATCACAAACGTACTTGGA--ATACATG  47
      |||| |||||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||  |||||||
seq2  ACATACATGGCTTCC-TGAGACTATC-CAAACGGTCCTGGAATATACATG  48

seq1  CATTAGCCTGTATTTGAGCAAAATCAACTAAAACAAAACACATTTTCCAA  97
      || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
seq2  CA-TAGCCTGTATTTGAGC-AAATCAACTAAAGCAAAACACATTTTCCCA  96

seq1  TTAAGCACTGAGTAGCTCACATATCTGGATGGCATGGTAGCTCACTAACC  147
       | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATTAGCACTGAGTAGCTCACATATCTGGATGGCATAGTAGCTCACTAACC  146

seq1  CTGTCCAGGATTCTGAGTGTGTGATACCACATACTGTTAGATTTGGAAAG  197
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| 
seq2  CTGTCCAGGATTCTAAGTGTGTGATACCACATACTG-TAGA-TTGGAAAA  194

seq1  GAATAAATTGTAAAGTGCGGCTCTAACTGCATTCTTATTGCTTCCATACA  247
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAA-TGTAAAGTGCGGCTCTAACTGCATTCTTATTGCTTCCATACA  243

seq1  GTCAAAAACCC-AGAAAGCAAGGGGCAGGAGAGATGGCTTAGTGGTTAAG  296
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAAACCCAAGAAAGCAAGGGGCAGGAGAGATGGCTTAGTGGTTAAG  293

seq1  AGCACCGACTGCTCTTCCAGTGGTCCTGAGTCCAATTTCCAATTCTCAGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCGACTGCTCTTCCAGTGGTCCTGAGTCCAATTTCCAATTCTCAGC  343

seq1  AATCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCATATGCCCTCTTC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCATATGCCCTCTTC  393

seq1  TGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAATGTACTCATATAAATGAGAGAGAGAG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAATGTACTCATATAAATGAGAGAGAGAG  443

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGATTGCTACATATGGGAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGATTGCTACATATGGGAG  493

seq1  ACCCTCTGAATTTGCTCATGAGACACACTGGGAGTTCAGCTCCAAATCTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCTGAATTTGCTCATGAGACACACTGGGAGTTCAGCTCCAAATCTG  543

seq1  CAAATTGCCCCTTTGCCCTCAGCATTTGGAGCTGAGCTTGATGGACAGTT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTGCCCCTTTGCCCTCAGCATTTGGAGCTGAGCTTGATGGACAGTT  593

seq1  GTGGTTATAGGAGGTCATCACTGAATCTAGCCACCACATCCACAGTAGCA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTATAGGAGGTCATCACTGAATCTAGCCACCACATCCACAGTAGCA  643

seq1  ACATGCACGAGGCTTGCTTTGAGGTTTATTAATAGAAAATACTGTAAATG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCACGAGGCTTGCTTTGAGGTTTATTAATAGAAAATACTGTAAATG  693

seq1  TCTAGGTAAATCTCCAGTGAGGATCTCTCTCATTTTTCCTACTACGTGGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTAAATCTCCAGTGAGGATCTCTCTCATTTTTCCTACTACGTGGA  743

seq1  CACTAATAGTCAAGTTACATGTGTGCACTTGAGATTGCAAGATGTGAATG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAATAGTCAAGTTACATGTGTGCACTTGAGATTGCAAGATGTGAATG  793

seq1  CCATCATAATTAATGCTGATTACAAAAGCAATTAATTTATGTTGAAAATA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATAATTAATGCTGATTACAAAAGCAATTAATTTATGTTGAAAATA  843

seq1  ATCCAGCACATGGAAATAGCAAGTGAACTGCAGAAATTATTGAGAGTTTA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGCACATGGAAATAGCAAGTGAACTGCAGAAATTATTGAGAGTTTA  893

seq1  AAAGAATATTAGTGGAGTAAATTCAGAAAGAACATTATTATATTCTTTGG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATATTAGTGGAGTAAATTCAGAAAGAACATTATTATATTCTTTGG  943

seq1  AGCCAATATTTGTTGAACAGTTTTCAATGATCTAAGGCAGAATAATAGAG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAATATTTGTTGAACAGTTTTCAATGATCTAAGGCAGAATAATAGAG  993

seq1  ATTTGATGAAATCATGGGTCTAATATTTGTCAACGGGCTTGATGACTGTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGATGAAATCATGGGTCTAATATTTGTCAACGGGCTTGATGACTGTC  1043

seq1  TCACATTCATTACATTGAATGAAATTACTTTTAAGAATTATGTTAATTTT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTCATTACATTGAATGAAATTACTTTTAAGAATTATGTTAATTTT  1093

seq1  GGGCAGTTTAATTCCATTTAGGTTATGAGTCTTTCAAAAATAAATTGCAT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGTTTAATTCCATTTAGGTTATGAGTCTTTCAAAAATAAATTGCAT  1143

seq1  TTGAGAATTC  1156
      ||||||||||
seq2  TTGAGAATTC  1153

seq1: chr16_35548913_35549573
seq2: B6Ng01-150A14.g_69_729

seq1  GAATTCACTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  50

seq1  GTAGACATATATATGACAAGGACTAGGAAGATGGCTCAGTGAGTAAGACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACATATATATGACAAGGACTAGGAAGATGGCTCAGTGAGTAAGACT  100

seq1  GCTTACAAGACTGACAACCTGAGTTCAGTCCCCAGAATCCATATTAAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTACAAGACTGACAACCTGAGTTCAGTCCCCAGAATCCATATTAAAAT  150

seq1  CTAGCGACTGTGAAGTGTATCTTTAATCCCTGTACTCTTACTGCAAGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCGACTGTGAAGTGTATCTTTAATCCCTGTACTCTTACTGCAAGATG  200

seq1  GGAGGTAGAGGAAGGAAAACCACCTGGAAGTTCATGGGCCAGCTAGCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTAGAGGAAGGAAAACCACCTGGAAGTTCATGGGCCAGCTAGCTTG  250

seq1  GAGTATGCTATGCTGTGGTAGACACTGAGCAGCAGCTCCTGAAAATTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGCTATGCTGTGGTAGACACTGAGCAGCAGCTCCTGAAAATTGTC  300

seq1  CTCTGACCTCTGCGTACATGCAAGAGCATATTAATGCCTACACTCACATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGACCTCTGCGTACATGCAAGAGCATATTAATGCCTACACTCACATA  350

seq1  CATACATACACATGGTAAAGTAAAATATATAAGGGCATGGTAGCACATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACATACACATGGTAAAGTAAAATATATAAGGGCATGGTAGCACATGC  400

seq1  CTTTAACCCCAACATGAGGAAGGCAGAAGCAGGTGGATCTCTGAGCTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAACCCCAACATGAGGAAGGCAGAAGCAGGTGGATCTCTGAGCTCAA  450

seq1  GGGTAGCCTGCCACCCATTTACATAACCGATTACAGACAGACCAAGGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGCCTGCCACCCATTTACATAACCGATTACAGACAGACCAAGGCTA  500

seq1  TATGTCCCCCAAAACAAAACAGAAACCTGAATACTATATGCATTTGACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCCCCAAAACAAAACAGAAACCTGAATACTATATGCATTTGACCA  550

seq1  TGTATTTGAATATGATAATTACACACAACTGTCCTATCCTAGACTTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTGAATATGATAATTACACACAACTGTCCTATCCTAGACTTCAAC  600

seq1  TGAGTTAGAATTCCTGAAGATAGAGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTAGAATTCCTGAAGATAGAGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  650

seq1  GTGTGTGTGTG  661
      |||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTG  661