BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150N23
Chromosome16 (Build37)
Map Location 74,086,744 - 74,227,138
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRobo2
Upstream geneLOC100039310, LOC100039318, LOC100039326
Downstream geneLOC665042
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150N23.bB6Ng01-150N23.g
ACCDH946840DH946841
length1,1101,167
definitionDH946840|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150N23, 5' end.DH946841|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150N23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,226,015 - 74,227,138)(74,086,744 - 74,087,922)
sequence
gaattctgagttcagcctaattgtctctaggtgccagtgtattaattcta
tcagagattggattgaaagatcatcgtcctataatggcagcaaaaggaaa
attacaatggtgtatttttttaaatcagcagactaatagttaaaataata
tttaggaactggattttaataatccacaatgttttttgaaatatcctttg
ctacaaacttgcctcccaaaggcagaggatgtaactggtgaggattttgg
gagctcttttataaatgatgaacatgaggacattggagaaataaaaacgg
atagcagcagtcaagactccatgtccttctcagtagctctgtgtaaatag
gcattatcaggagcatcttgacatcttaaacctcacttcaattaaagatg
atgggaggcattagcattagtctgaagtctattatatggtgctgtgttgg
tggagaagaccaatggacaaaatcacaaagacagaaggccaatgctacta
gagctgtcaactgagaggacaaagccagagggttttagggaatgtcaaaa
gaccaacaactccagccagggaagaataaacctgggattgttatctacat
catgttgtggcatccctggtgattttctaggcaaattttaaagccatttt
gacaaacgatccctgaattataccttaactacatctcctaacaaagcccc
ccacccccccaagcagccaccccttagctcctatgatttattctagtcca
ccatttctacccatcctgctgggtacctggcaatgcaccctccacgctca
acctccatattgcagcagagaggagactgccaaagatcagagggagggtt
catattacttaggtgtgttgtttctgcagagtcttcccggagactgtctg
ttgtcgataattaagagctatcaaacacttggatatttgcacttggtaat
ctgacatgaggagccttgtgatcgccagcttctgttcattatttagatag
acaggtgcaaagcaggcctaagcagaccctttctggcaaagctgggtttt
cattcaagtcgtgtagccaaagcttgggagcctatgaagcaaacgagtca
ggcagacaag
gaattcccaagatacaattcacacaaaccacatgaaactcaagaaggaag
accaaagtgtggatgctttggtccttcttagaagggggaacaaaatacca
atgaaaggagttacagagacaaagtgtggagcagagactgaaggaaaatg
ccatccagagactgcctcacccatctgcggatccattccacatacagtca
ccaaacccagacactaatgtggatgccaagaagtgcttactgacaggagc
ctgctataactatctcctgagaggctctgccactagagtgaatttaagca
tatacaaattcacaccataaggatggccacatactgaaagttttaaatgt
aaaagacacatagtaacacagtcattgaactttctgtgaatatcaaggaa
aataccaagtacatatacggctcccactgagacctagcagaggaaattat
tctattcagaataagctggacaggggatattggccatataggacagggca
tatggccagtaggacaagcatacactaaggtttagatgtgaatatgtata
agatgctaagtaaaaataatataaaattgcacactaagtcaaattcatgc
aagtcaacaatgttgattctattagtctacttttattttataactattat
ttgacaaatattttataaatattacatatttatcacaatatataaatgtt
aaaagtgcttgaaatctcttcccttgattttgttttgttatttgagataa
ggtgttactacctaacccaactgtcccagaatgcaggtctatattctagc
gtagcctcaaacttatggttatccctctgcctctgccactgcagtgctat
gactttaggtgtgctccaccatatactttttactcattgttatttatttt
atacaaatgccatgctcgttactactattaagcataacataaaattaaac
acagagacacctaataaataaggactagattattagactagtaataccta
atacttataattacacacatggtacttattttgtctttaatgtttctaat
ttatcctaggaaccaggtagtatatttagcctttatttttatatatacat
gtgagcagtgttttgtgtgtaataaacaaggtgtgtctggcaccatgagt
ccaaaaaacatggacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_74226015_74227138
seq2: B6Ng01-150N23.b_45_1154 (reverse)

seq1  CTTGCTCTGCCTGGCTCCTGTCTGCTTCACTAGCTCCCAAGCTTTTGGGC  50
      |||| |||||||| |||  || |||||||   |||||||||||||  |||
seq2  CTTG-TCTGCCTGACTC--GTTTGCTTCATAGGCTCCCAAGCTTT--GGC  45

seq1  TACACCCGACTTG-ATGAAAACCCAGCCTTTGCCAGATAGGGTCTGCTTA  99
      ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  TACA--CGACTTGAATGAAAACCCAG-CTTTGCCAGAAAGGGTCTGCTTA  92

seq1  GGCCCTTGCTTTTGCACCTTGTCTATCTAAATAATGAAACAGAAGCTGGC  149
      ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGCC--TGC-TTTGCACC-TGTCTATCTAAATAATG-AACAGAAGCTGGC  137

seq1  GATCACAAGGCTCCTCATGTCAGATTACCAAGTGCAAATTATCCAAGTGT  199
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  GATCACAAGGCTCCTCATGTCAGATTACCAAGTGCAAA-TATCCAAGTG-  185

seq1  TTTGATAGCTCTTAATTATCGACAACAGACAGTCTCCGGGAAGACTCTGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATAGCTCTTAATTATCGACAACAGACAGTCTCCGGGAAGACTCTGC  235

seq1  AGAAACAACACACCTAAGTAATATGAACCCTCCCTCTGATCTTTGGCAGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACAACACACCTAAGTAATATGAACCCTCCCTCTGATCTTTGGCAGT  285

seq1  CTCCTCTCTGCTGCAATATGGAGGTTGAGCGTGGAGGGTGCATTGCCAGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTCTGCTGCAATATGGAGGTTGAGCGTGGAGGGTGCATTGCCAGG  335

seq1  TACCCAGCAGGATGGGTAGAAATGGTGGACTAGAATAAATCATAGGAGCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCAGCAGGATGGGTAGAAATGGTGGACTAGAATAAATCATAGGAGCT  385

seq1  AAGGGGTGGCTGCTTGGGGGGGTGGGGGGCTTTGTTAGGAGATGTAGTTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGTGGCTGCTTGGGGGGGTGGGGGGCTTTGTTAGGAGATGTAGTTA  435

seq1  AGGTATAATTCAGGGATCGTTTGTCAAAATGGCTTTAAAATTTGCCTAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATAATTCAGGGATCGTTTGTCAAAATGGCTTTAAAATTTGCCTAGA  485

seq1  AAATCACCAGGGATGCCACAACATGATGTAGATAACAATCCCAGGTTTAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCACCAGGGATGCCACAACATGATGTAGATAACAATCCCAGGTTTAT  535

seq1  TCTTCCCTGGCTGGAGTTGTTGGTCTTTTGACATTCCCTAAAACCCTCTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCCTGGCTGGAGTTGTTGGTCTTTTGACATTCCCTAAAACCCTCTG  585

seq1  GCTTTGTCCTCTCAGTTGACAGCTCTAGTAGCATTGGCCTTCTGTCTTTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTCCTCTCAGTTGACAGCTCTAGTAGCATTGGCCTTCTGTCTTTG  635

seq1  TGATTTTGTCCATTGGTCTTCTCCACCAACACAGCACCATATAATAGACT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTGTCCATTGGTCTTCTCCACCAACACAGCACCATATAATAGACT  685

seq1  TCAGACTAATGCTAATGCCTCCCATCATCTTTAATTGAAGTGAGGTTTAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACTAATGCTAATGCCTCCCATCATCTTTAATTGAAGTGAGGTTTAA  735

seq1  GATGTCAAGATGCTCCTGATAATGCCTATTTACACAGAGCTACTGAGAAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCAAGATGCTCCTGATAATGCCTATTTACACAGAGCTACTGAGAAG  785

seq1  GACATGGAGTCTTGACTGCTGCTATCCGTTTTTATTTCTCCAATGTCCTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGGAGTCTTGACTGCTGCTATCCGTTTTTATTTCTCCAATGTCCTC  835

seq1  ATGTTCATCATTTATAAAAGAGCTCCCAAAATCCTCACCAGTTACATCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCATCATTTATAAAAGAGCTCCCAAAATCCTCACCAGTTACATCCT  885

seq1  CTGCCTTTGGGAGGCAAGTTTGTAGCAAAGGATATTTCAAAAAACATTGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTTGGGAGGCAAGTTTGTAGCAAAGGATATTTCAAAAAACATTGT  935

seq1  GGATTATTAAAATCCAGTTCCTAAATATTATTTTAACTATTAGTCTGCTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTATTAAAATCCAGTTCCTAAATATTATTTTAACTATTAGTCTGCTG  985

seq1  ATTTAAAAAAATACACCATTGTAATTTTCCTTTTGCTGCCATTATAGGAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAAAAATACACCATTGTAATTTTCCTTTTGCTGCCATTATAGGAC  1035

seq1  GATGATCTTTCAATCCAATCTCTGATAGAATTAATACACTGGCACCTAGA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATCTTTCAATCCAATCTCTGATAGAATTAATACACTGGCACCTAGA  1085

seq1  GACAATTAGGCTGAACTCAGAATTC  1124
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATTAGGCTGAACTCAGAATTC  1110

seq1: chr16_74086744_74087922
seq2: B6Ng01-150N23.g_69_1235

seq1  GAATTCCCAAGATACAATTCACACAAACCACATGAAACTCAAGAAGGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAGATACAATTCACACAAACCACATGAAACTCAAGAAGGAAG  50

seq1  ACCAAAGTGTGGATGCTTTGGTCCTTCTTAGAAGGGGGAACAAAATACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAGTGTGGATGCTTTGGTCCTTCTTAGAAGGGGGAACAAAATACCA  100

seq1  ATGAAAGGAGTTACAGAGACAAAGTGTGGAGCAGAGACTGAAGGAAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAGGAGTTACAGAGACAAAGTGTGGAGCAGAGACTGAAGGAAAATG  150

seq1  CCATCCAGAGACTGCCTCACCCATCTGCGGATCCATTCCACATACAGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCAGAGACTGCCTCACCCATCTGCGGATCCATTCCACATACAGTCA  200

seq1  CCAAACCCAGACACTAATGTGGATGCCAAGAAGTGCTTACTGACAGGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACCCAGACACTAATGTGGATGCCAAGAAGTGCTTACTGACAGGAGC  250

seq1  CTGCTATAACTATCTCCTGAGAGGCTCTGCCACTAGAGTGAATTTAAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTATAACTATCTCCTGAGAGGCTCTGCCACTAGAGTGAATTTAAGCA  300

seq1  TATACAAATTCACACCATAAGGATGGCCACATACTGAAAGTTTTAAATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAAATTCACACCATAAGGATGGCCACATACTGAAAGTTTTAAATGT  350

seq1  AAAAGACACATAGTAACACAGTCATTGAACTTTCTGTGAATATCAAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACACATAGTAACACAGTCATTGAACTTTCTGTGAATATCAAGGAA  400

seq1  AATACCAAGTACATATACGGCTCCCACTGAGACCTAGCAGAGGAAATTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCAAGTACATATACGGCTCCCACTGAGACCTAGCAGAGGAAATTAT  450

seq1  TCTATTCAGAATAAGCTGGACAGGGGATATTGGCCATATAGGACAGGGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTCAGAATAAGCTGGACAGGGGATATTGGCCATATAGGACAGGGCA  500

seq1  TATGGCCAGTAGGACAAGCATACACTAAGGTTTAGATGTGAATATGTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCCAGTAGGACAAGCATACACTAAGGTTTAGATGTGAATATGTATA  550

seq1  AGATGCTAAGTAAAAATAATATAAAATTGCACACTAAGTCAAATTCATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTAAGTAAAAATAATATAAAATTGCACACTAAGTCAAATTCATGC  600

seq1  AAGTCAACAATGTTGATTCTATTAGTCTACTTTTATTTTATAACTATTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAACAATGTTGATTCTATTAGTCTACTTTTATTTTATAACTATTAT  650

seq1  TTGACAAATATTTTATAAATATTACATATTTATCACAATATATAAATGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAAATATTTTATAAATATTACATATTTATCACAATATATAAATGTT  700

seq1  AAAAGTGCTTGAAATCTCTTCCCTTGATTTTGTTTTGTTATTTGAGATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGCTTGAAATCTCTTCCCTTGATTTTGTTTTGTTATTTGAGATAA  750

seq1  GGTGTTACTACCTAACCCAACTGTCCCAGAATGCAGGTCTATATTCTAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTTACTACCTAACCCAACTGTCCCAGAATGCAGGTCTATATTCTAGC  800

seq1  GTAGCCTCAAACTTATGGTTATCCCTCTGCCTCTGCCACTGCAGTGCTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCTCAAACTTATGGTTATCCCTCTGCCTCTGCCACTGCAGTGCTAT  850

seq1  GACTTTAGGTGTGCTCCACCATATACTTTTTACTCATTGTTATTTATTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTAGGTGTGCTCCACCATATACTTTTTACTCATTGTTATTTATTTT  900

seq1  ATACAAATGCCATGCTCGTTACTACTATTAAGCATAACATAAAATTAAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAATGCCATGCTCGTTACTACTATTAAGCATAACATAAAATTAAAC  950

seq1  ACAGAAGACACCTAATAAATAAGGACTAGATATTAAGAACTAGTAATACC  1000
      |||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||
seq2  ACAG-AGACACCTAATAAATAAGGACTAGATTATTAG-ACTAGTAATACC  998

seq1  TAATACTTAATAATTACACAACATGGTAACTTATTTTGTTCTTTTAATGT  1050
      |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||
seq2  TAATACTT-ATAATTACAC-ACATGGT-ACTTATTTTGT--CTTTAATGT  1043

seq1  TTCTAAATTTAATCCTAGGAACCAGGTAGTAATATTTTAAGCTTTATTTT  1100
      ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||
seq2  TTCTAA--TTTATCCTAGGAACCAGGTAGT-ATA-TTTAGCCTTTATTTT  1089

seq1  TATATATACATGTGAGCATGTG-TTTGTGTGTAAT-AACAAGTGTGTG-C  1147
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |
seq2  TATATATACATGTGAGCA-GTGTTTTGTGTGTAATAAACAAG-GTGTGTC  1137

seq1  TGGCACCTATGGAGTCCAAAAAAACAGGACAG  1179
      ||||||| || ||||||||||||   ||||||
seq2  TGGCACC-AT-GAGTCCAAAAAACATGGACAG  1167