BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152F09
Chromosome16 (Build37)
Map Location 95,766,698 - 95,917,758
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDyrk1a, Kcnj6, LOC666201, Kcnj15, Erg
Downstream geneEts2, LOC625548, LOC100040997, Dscr2, Brwd1, LOC100041318, Hmgn1, Wrb, 4921526F01Rik, Sh3bgr, B3galt5, Jam4, Itgb2l, Pcp4, Dscam
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152F09.bB6Ng01-152F09.g
ACCDH947935DH947936
length6151,008
definitionDH947935|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152F09, 5' end.DH947936|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152F09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,917,144 - 95,917,758)(95,766,698 - 95,767,715)
sequence
gaattcatttatttttatctaaacccctgacgctgtttaatactctttat
agtcccgactgtttgttttgtcatgcgggagatgggaccttgcccttgtc
aggcaggtgttcctcaacaacatttcctagtcctttctttcaattaattg
ataattaattaattaattaattaattagctaattgattattttatcatgt
taattaattctttgtctttccagcatagatctcattccattagggccaga
attgtgtctggtttggtattacctttctgcagcgctggaaaaatttccaa
cacagcatttaataaatatctttggaatgaatctccccaattaattctca
gcatggctctttgtcacctttcaaatgtaaacatgttggttagcaagcac
tggtatatattaaagttccattggttaaacacacacatacacacactatg
taacatcagtcagtctgtgtgctgttgctacagcgaggtgctggagacag
agtaattaataaaggatagacttttattaattaagcccatagctggagag
gttgggagcatggtgctgacatctggtgaggtcttcttcctgctttggag
gggggaggggttgtt
gaattccaagcccagagagaccctgtctcaaaaagtaaaaagaaattgag
aaagacaacctggacagagttaaagaggggactacgtcccgcaggtcctt
gacagttcagtgtatatgggaggtagtgattgggactgggaaggcagaga
attgtggagcagcaaaggcttgaagttccgatgaaagcagtgcagaccaa
cacagagaagaaggaattacagttgtctccgtgctgacaagacaatgaag
ttttgatccagactctgtggtgtgagaaaagaatgctgaacaggaacagg
ccctcaccttctggtgaccatagcgattaaatgtgccctcggaagcctcc
ggagcaacgcaaccctgaccacatggtttctctccccttcctgaagagtt
ctgggcatgatacaaggaactgcttcggtctctttggccaaggacaacaa
gaatgggccttgagagacacccaacaggacgaaggaagtgttttacataa
cagagggcatgaagatggtggaatgagggcttagccaccacttccccact
gatctacaaaaaacacccccagtgagaagcaaattccactgcccttaaac
caccaggattggctaaaggtgggggctaatgtggggtccttttgaaacta
tcaaacctggggtgttggctatatccctggatgcatagcttccttcctgg
ctgcacatcccagcatggtcagaataaaaccacacagcttcatcctccga
catgatcacagccctgcccccactccccacgcccaccccattcctcgctc
acactccagaaaaccactgttcacccagcagccaccgagattctggtgac
atcagtgtcaatctgaacagtggtcaactctccatgctaaaacctctaaa
gttagagtccataccaaattctggagcctcttggcagcctgtgaacactc
ttgcggctgtcccctctttctctggactccacttcattctttttcttgac
cacctaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_95917144_95917758
seq2: B6Ng01-152F09.b_46_660 (reverse)

seq1  AACAACCCCTCCCCCCTCCAAAGCAGGAAGAAGACCTCACCAGATGTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACCCCTCCCCCCTCCAAAGCAGGAAGAAGACCTCACCAGATGTCAG  50

seq1  CACCATGCTCCCAACCTCTCCAGCTATGGGCTTAATTAATAAAAGTCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGCTCCCAACCTCTCCAGCTATGGGCTTAATTAATAAAAGTCTAT  100

seq1  CCTTTATTAATTACTCTGTCTCCAGCACCTCGCTGTAGCAACAGCACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATTAATTACTCTGTCTCCAGCACCTCGCTGTAGCAACAGCACACA  150

seq1  GACTGACTGATGTTACATAGTGTGTGTATGTGTGTGTTTAACCAATGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGACTGATGTTACATAGTGTGTGTATGTGTGTGTTTAACCAATGGAA  200

seq1  CTTTAATATATACCAGTGCTTGCTAACCAACATGTTTACATTTGAAAGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAATATATACCAGTGCTTGCTAACCAACATGTTTACATTTGAAAGGT  250

seq1  GACAAAGAGCCATGCTGAGAATTAATTGGGGAGATTCATTCCAAAGATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAGAGCCATGCTGAGAATTAATTGGGGAGATTCATTCCAAAGATAT  300

seq1  TTATTAAATGCTGTGTTGGAAATTTTTCCAGCGCTGCAGAAAGGTAATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAAATGCTGTGTTGGAAATTTTTCCAGCGCTGCAGAAAGGTAATAC  350

seq1  CAAACCAGACACAATTCTGGCCCTAATGGAATGAGATCTATGCTGGAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCAGACACAATTCTGGCCCTAATGGAATGAGATCTATGCTGGAAAG  400

seq1  ACAAAGAATTAATTAACATGATAAAATAATCAATTAGCTAATTAATTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAATTAATTAACATGATAAAATAATCAATTAGCTAATTAATTAAT  450

seq1  TAATTAATTAATTATCAATTAATTGAAAGAAAGGACTAGGAAATGTTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAATTAATTATCAATTAATTGAAAGAAAGGACTAGGAAATGTTGTT  500

seq1  GAGGAACACCTGCCTGACAAGGGCAAGGTCCCATCTCCCGCATGACAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAACACCTGCCTGACAAGGGCAAGGTCCCATCTCCCGCATGACAAAA  550

seq1  CAAACAGTCGGGACTATAAAGAGTATTAAACAGCGTCAGGGGTTTAGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGTCGGGACTATAAAGAGTATTAAACAGCGTCAGGGGTTTAGATA  600

seq1  AAAATAAATGAATTC  615
      |||||||||||||||
seq2  AAAATAAATGAATTC  615

seq1: chr16_95766698_95767715
seq2: B6Ng01-152F09.g_69_1076

seq1  GAATTCCAAGCCCAGAGAGACCCTGTCTCAAAAAGTAAAAAGAAATTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGCCCAGAGAGACCCTGTCTCAAAAAGTAAAAAGAAATTGAG  50

seq1  AAAGACAACCTGGACAGAGTTAAAGAGGGGACTACGTCCCGCAGGTCCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACAACCTGGACAGAGTTAAAGAGGGGACTACGTCCCGCAGGTCCTT  100

seq1  GACAGTTCAGTGTATATGGGAGGTAGTGATTGGGACTGGGAAGGCAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTTCAGTGTATATGGGAGGTAGTGATTGGGACTGGGAAGGCAGAGA  150

seq1  ATTGTGGAGCAGCAAAGGCTTGAAGTTCCGATGAAAGCAGTGCAGACCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGGAGCAGCAAAGGCTTGAAGTTCCGATGAAAGCAGTGCAGACCAA  200

seq1  CACAGAGAAGAAGGAATTACAGTTGTCTCCGTGCTGACAAGACAATGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGAAGAAGGAATTACAGTTGTCTCCGTGCTGACAAGACAATGAAG  250

seq1  TTTTGATCCAGACTCTGTGGTGTGAGAAAAGAATGCTGAACAGGAACAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATCCAGACTCTGTGGTGTGAGAAAAGAATGCTGAACAGGAACAGG  300

seq1  CCCTCACCTTCTGGTGACCATAGCGATTAAATGTGCCCTCGGAAGCCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCACCTTCTGGTGACCATAGCGATTAAATGTGCCCTCGGAAGCCTCC  350

seq1  GGAGCAACGCAACCCTGACCACATGGTTTCTCTCCCCTTCCTGAAGAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAACGCAACCCTGACCACATGGTTTCTCTCCCCTTCCTGAAGAGTT  400

seq1  CTGGGCATGATACAAGGAACTGCTTCGGTCTCTTTGGCCAAGGACAACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCATGATACAAGGAACTGCTTCGGTCTCTTTGGCCAAGGACAACAA  450

seq1  GAATGGGCCTTGAGAGACACCCAACAGGACGAAGGAAGTGTTTTACATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGGCCTTGAGAGACACCCAACAGGACGAAGGAAGTGTTTTACATAA  500

seq1  CAGAGGGCATGAAGATGGTGGAATGAGGGCTTAGCCACCACTTCCCCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGCATGAAGATGGTGGAATGAGGGCTTAGCCACCACTTCCCCACT  550

seq1  GATCTACAAAAAACACCCCCAGAGAGAAGCAAATTCCACTGCCCTTAAAC  600
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTACAAAAAACACCCCCAGTGAGAAGCAAATTCCACTGCCCTTAAAC  600

seq1  CACCAGGATTGGCTAAAGGTGGGGGCTAATGTGGGGTCC-TTTGAAACTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CACCAGGATTGGCTAAAGGTGGGGGCTAATGTGGGGTCCTTTTGAAACTA  650

seq1  TCAAACCTGGGGTGTTGGCTATAT-CCTGGATGCATAGCTTCCTTCCTGG  698
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACCTGGGGTGTTGGCTATATCCCTGGATGCATAGCTTCCTTCCTGG  700

seq1  CTGCACATCCCAGCATGGTCAGAATAAAACCACACAGCTTCATCCTCCGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACATCCCAGCATGGTCAGAATAAAACCACACAGCTTCATCCTCCGA  750

seq1  CATGATCACAGCCCTGCCCCCACTCCCCACGCCCACCCCATTCCCCGCAT  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
seq2  CATGATCACAGCCCTGCCCCCACTCCCCACGCCCACCCCATTCCTCGC-T  799

seq1  CACACTCCAG-AAACCACTGTTCACCCAGCAGCCACCGAGA-TCTGGTGA  846
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CACACTCCAGAAAACCACTGTTCACCCAGCAGCCACCGAGATTCTGGTGA  849

seq1  CATCAGCTGTCAATCTGAACAGTGGTACACACTCTCCATGCTCAAAACAC  896
      |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |
seq2  CATCAG-TGTCAATCTGAACAGTGGT-CA-ACTCTCCATGCT-AAAAC-C  894

seq1  TCTAAAGTCCAGAGTCCAAACCAAAGTCTGGAGCCTCATGGCAGCCTGTG  946
      ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCTAAAGT-TAGAGTCCATACCAAATTCTGGAGCCTCTTGGCAGCCTGTG  943

seq1  GACACTCCTTCGCGGTCTGTCCCCTCTTTCCTCT-GACTCCACCTTCATT  995
       ||||||  | |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||
seq2  AACACTC--TTGCGG-CTGTCCCCTCTTT-CTCTGGACTCCA-CTTCATT  988

seq1  CTTCTTCCTTCTAACCACCTACA  1018
      ||| |||    | ||||||||||
seq2  CTTTTTC---TTGACCACCTACA  1008