BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-156I10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 12,005,573 - 12,140,632
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2700045P11Rik
Upstream geneLOC100043147, LOC100042597, Snn, Txndc11, Zc3h7a, LOC665450, LOC622271, Rsl1d1, Gspt1, Tnfrsf17, 4933437K13Rik, LOC100043171, C530044N13Rik
Downstream geneEG622509, LOC622553, Ercc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-156I10.bB6Ng01-156I10.g
ACCDH951008DH951009
length1,119896
definitionDH951008|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156I10, 5' end.DH951009|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156I10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,139,520 - 12,140,632)(12,005,573 - 12,006,466)
sequence
gaattctctataacaagaatatatttgctgaaaagaaggagtacgtttgt
ttggcatgttatttaaataaataggctggccagcatgttaaagatgctag
attcaaacctgcatctcttgttttctagaggtgtcagctccagtgacact
gatgtcacaagctcctccctctaatagcgacaacctgctggggctggaga
gaagccatctttaaaagcatggtgtgttctttcttttattctatgcctgc
cccacagcttctctctgtgtctcacccaacaggacctctgtttggtatct
gaattcttggcgctattgaaattgtgaagggaaactgcaaagggtagatg
tcttggagattcaatgtggagattctgggattttaaactctaggcttctg
ccccagagaccctgtgaaatgcaaagtgtgattctgtgctggctcgggcc
tgtaagcccaacactcagtagactgaagcaggaggattgcttttctatgt
ctgggcccattctgggctaaagaatgtaacaaaaacaagcaaggtgccag
cagccccagtcccccagccaagcatgagtctacttcaggatctcttccct
tagcctggaacagtcatccctggacatcttagccctacagctccttctac
ctaaggctgaagtcactcctggtcaacatgcagagtcataccacacccta
catatccttgccttccacacacaccttatttccccccatcatgcatacta
tagtccaacatagtgtatttgcataacacatggaagggaggccttatgga
gctcctatgctttctaggcacctaaaggcagttggtgactctaggggaga
gtaaagcattgatttttttttcagtgctgtgacccctgggtaagtttccc
atgcttccagaattaacttctcactttaaggtcttgtagggcatcctaat
aatattctgctgggcatatatcaggaaacatgagggtagacaggggaacc
tgggttacagggagatgaatctttggtaagagggagataaaagatgatac
cagatgatgtggtcaaaatccatttactatcattagtgaaatgtcctgta
tgaaacctcattgcttata
gaattctcagactcttttctacactacaaaaggagtatattgaatgaaca
tgtaaaaggggtgtggaaccatgcatgcctgtgtgatagaaacatgactt
gttagtactgttgcttgtggaatgaatgaccattcactagagagcaacag
tgtggacagagatgcattcactggacgtgcagctgtacttaatgttttca
ttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgaagggggttcatgtacactgc
atatgctgtcaacaaagaaacagggcccgtattgactagtttaatgtcag
tttgacatgctagggtcatcaaaggatggagcctcaactgagagaatgcc
tccataagatcaggctgtgagccagtctgtacagcagtttttaaattgtg
agtggtgccatccctggactggtggtcttaggttctataagaaatcaggc
tgagcaagccatgtggagcaagccagtaagcagcaccctccatggcctct
gcattatctcctgcctccaggttcctgccctgcttgggtttctgtcttga
ctaactttggtgatgaactgtgatgtggaagcataagctgaataaaccct
ttcctctcaagttgatttagtcatggtatttttatcacagtgatagtaac
attaagactgagccctaaaagaaaaaaaatcactttctgtaagttctttc
taaaactttccttctaatgtgcccacctaagctgtcttaatcagtctcgt
gctgcttttccagcagcctatagcctatctgtgatgaaatccgaatgctc
aacactaatgtgttggtggagttctaagataccaggtcatgatcctggca
ctgcagggatgtgattccttctaggaaaatatttctgtctcatgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_12139520_12140632
seq2: B6Ng01-156I10.b_47_1165 (reverse)

seq1  TATATAGCAATGA-GCTTCAT-CATGACATTTCACATATG-TATGTAATG  47
      |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||  ||| ||   ||||
seq2  TATA-AGCAATGAGGTTTCATACAGGACATTTCACTAATGATAGTAAATG  49

seq1  GATTTTGACCACATTCACTCTGGTATCATCTCTTATCTCCCTCTTACCAA  97
      ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GATTTTGACCACA-TCA-TCTGGTATCATCTTTTATCTCCCTCTTACCAA  97

seq1  AGATTCATCTCCCTTGTAACC--AGTTCCCCTGTCTACCCTCATGTTT-C  144
      ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGATTCATCTCCC-TGTAACCCAGGTTCCCCTGTCTACCCTCATGTTTCC  146

seq1  TG-TATATGCCCAGCAG-ATATTATTAGGGTGCCTTACAGGACCTT-AAG  191
      || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |||
seq2  TGATATATGCCCAGCAGAATATTATTAGGATGCCCTACAAGACCTTAAAG  196

seq1  TGAGAAGTTATTTCTGGAAGCATGGGAAACTTA-CCAGGGGTCACAGCAC  240
      |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGTTAATTCTGGAAGCATGGGAAACTTACCCAGGGGTCACAGCAC  246

seq1  TGAAAAAAAAATCAATGCTTTACTCTCCCCTAGAGTCACCAACTGCCTTT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAAAAAATCAATGCTTTACTCTCCCCTAGAGTCACCAACTGCCTTT  296

seq1  AGGTGCCTAGAGAGCATAGGAGCTCCATAAGGCCTCCCTTCCATGTGTTA  340
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCCTAGAAAGCATAGGAGCTCCATAAGGCCTCCCTTCCATGTGTTA  346

seq1  TGCAAATACACTATGTTGGACTATAGTATGCATGATGGGGGGAAATAAGG  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATACACTATGTTGGACTATAGTATGCATGATGGGGGGAAATAAGG  396

seq1  TGTGTGTGGAAGGCAAGGATATGTAGGGTGTGGTATGACTCTGCATGTTG  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGGAAGGCAAGGATATGTAGGGTGTGGTATGACTCTGCATGTTG  446

seq1  ACCAGGAGTGACTTCAGCCTTAGGTAGAAGGAGCTGTAGGGCTAAGATGT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGAGTGACTTCAGCCTTAGGTAGAAGGAGCTGTAGGGCTAAGATGT  496

seq1  CCAGGGATGACTGTTCCAGGCTAAGGGAAGAGATCCTGAAGTAGACTCAT  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGATGACTGTTCCAGGCTAAGGGAAGAGATCCTGAAGTAGACTCAT  546

seq1  GCTTGGCTGGGGGACTGGGGCTGCTGGCACCTTGCTTGTTTTTGTTACAT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGCTGGGGGACTGGGGCTGCTGGCACCTTGCTTGTTTTTGTTACAT  596

seq1  TCTTTAGCCCAGAATGGGCCCAGACATAGAAAAGCAATCCTCCTGCTTCA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAGCCCAGAATGGGCCCAGACATAGAAAAGCAATCCTCCTGCTTCA  646

seq1  GTCTACTGAGTGTTGGGCTTACAGGCCCGAGCCAGCACAGAATCACACTT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACTGAGTGTTGGGCTTACAGGCCCGAGCCAGCACAGAATCACACTT  696

seq1  TGCATTTCACAGGGTCTCTGGGGCAGAAGCCTAGAGTTTAAAATCCCAGA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTCACAGGGTCTCTGGGGCAGAAGCCTAGAGTTTAAAATCCCAGA  746

seq1  ATCTCCACATTGAATCTCCAAGACATCTACCCTTTGCAGTTTCCCTTCAC  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCACATTGAATCTCCAAGACATCTACCCTTTGCAGTTTCCCTTCAC  796

seq1  AATTTCAATAGCGCCAAGAATTCAGATACCAAACAGAGGTCCTGTTGGGT  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCAATAGCGCCAAGAATTCAGATACCAAACAGAGGTCCTGTTGGGT  846

seq1  GAGACACAGAGAGAAGCTGTGGGGCAGGCATAGAATAAAAGAAAGAACAC  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACACAGAGAGAAGCTGTGGGGCAGGCATAGAATAAAAGAAAGAACAC  896

seq1  ACCATGCTTTTAAAGATGGCTTCTCTCCAGCCCCAGCAGGTTGTCGCTAT  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCTTTTAAAGATGGCTTCTCTCCAGCCCCAGCAGGTTGTCGCTAT  946

seq1  TAGAGGGAGGAGCTTGTGACATCAGTGTCACTGGAGCTGACACCTCTAGA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGGAGGAGCTTGTGACATCAGTGTCACTGGAGCTGACACCTCTAGA  996

seq1  AAACAAGAGATGCAGGTTTGAATCTAGCATCTTTAACATGCTGGCCAGCC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGAGATGCAGGTTTGAATCTAGCATCTTTAACATGCTGGCCAGCC  1046

seq1  TATTTATTTAAATAACATGCCAAACAAACGTACTCCTTCTTTTCAGCAAA  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTTAAATAACATGCCAAACAAACGTACTCCTTCTTTTCAGCAAA  1096

seq1  TATATTCTTGTTATAGAGAATTC  1113
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCTTGTTATAGAGAATTC  1119

seq1: chr16_12005573_12006466
seq2: B6Ng01-156I10.g_69_964

seq1  GAATTCTCAGACTCTTTTCTACACTACAAAAGGAGTATATTGAATGAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGACTCTTTTCTACACTACAAAAGGAGTATATTGAATGAACA  50

seq1  TGTAAAAGGGGTGTGGAACCATGCATGCCTGTGTGATAGAAACATGACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAAGGGGTGTGGAACCATGCATGCCTGTGTGATAGAAACATGACTT  100

seq1  GTTAGTACTGTTGCTTGTGGAATGAATGACCATTCACTAGAGAGCAACAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGTACTGTTGCTTGTGGAATGAATGACCATTCACTAGAGAGCAACAG  150

seq1  TGTGGACAGAGATGCATTCACTGGACGTGCAGCTGTACTTAATGTTTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGACAGAGATGCATTCACTGGACGTGCAGCTGTACTTAATGTTTTCA  200

seq1  TTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGGGGGTTCATGTACACTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGGGGGTTCATGTACACTGC  250

seq1  ATATGCTGTCAACAAAGAAACAGGGCCCGTATTGACTAGTTTAATGTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTGTCAACAAAGAAACAGGGCCCGTATTGACTAGTTTAATGTCAG  300

seq1  TTTGACATGCTAGGGTCATCAAAGGATGGAGCCTCAACTGAGAGAATGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACATGCTAGGGTCATCAAAGGATGGAGCCTCAACTGAGAGAATGCC  350

seq1  TCCATAAGATCAGGCTGTGAGCCAGTCTGTACAGCAGTTTTTAAATTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAAGATCAGGCTGTGAGCCAGTCTGTACAGCAGTTTTTAAATTGTG  400

seq1  AGTGGTGCCATCCCTGGACTGGTGGTCTTAGGTTCTATAAGAAATCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTGCCATCCCTGGACTGGTGGTCTTAGGTTCTATAAGAAATCAGGC  450

seq1  TGAGCAAGCCATGTGGAGCAAGCCAGTAAGCAGCACCCTCCATGGCCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAAGCCATGTGGAGCAAGCCAGTAAGCAGCACCCTCCATGGCCTCT  500

seq1  GCATTATCTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCCTGCTTGGGTTTCTGTCTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTATCTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCCTGCTTGGGTTTCTGTCTTGA  550

seq1  CTAACTTTGGTGATGAACTGTGATGTGGAAGCATAAGCTGAATAAACCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTTTGGTGATGAACTGTGATGTGGAAGCATAAGCTGAATAAACCCT  600

seq1  TTCCTCTCAAGTTGATTTAGTCATGGTA-TTTTATCACAGTGATAGTAAC  649
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTCAAGTTGATTTAGTCATGGTATTTTTATCACAGTGATAGTAAC  650

seq1  ATTAAGACTGAGCCCTAAAAGAAAAAAAATCACTTTCTGTAAGTTCTTTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGACTGAGCCCTAAAAGAAAAAAAATCACTTTCTGTAAGTTCTTTC  700

seq1  TAAAAC-TTCCTTCTAATGTGCCCACCTAAGCTGTC-TAATCAGTCTCGT  747
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAAAACTTTCCTTCTAATGTGCCCACCTAAGCTGTCTTAATCAGTCTCGT  750

seq1  GCTGCTTTTCCAGCAGCCTATAGCCTATCTGTGATGAAAGTCCGAAGGCT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
seq2  GCTGCTTTTCCAGCAGCCTATAGCCTATCTGTGATGAAA-TCCGAATGCT  799

seq1  CAACACT-ATGTGTTGGTTGAGTTTCAAAGATACCAAGTCATGATCCTTG  846
      ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |
seq2  CAACACTAATGTGTTGGTGGAG-TTCTAAGATACCAGGTCATGATCCTGG  848

seq1  CACTGCAGGGATGTGATTCCTTC-AGGAGAATATTTCTGTCTTCATGTT  894
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||
seq2  CACTGCAGGGATGTGATTCCTTCTAGGAAAATATTTCTGTC-TCATGTT  896