BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163O07
Chromosome16 (Build37)
Map Location 16,207,255 - 16,390,869
singlet/doubletdoublet
Overlap genePkp2, EG433003, Yars2, Dnm1l, LOC665743
Upstream geneLOC665653, LOC385748, LOC100042743, LOC547302, EG632352, Ube2v2, LOC665682, Mcm4, Prkdc, 2410018G20Rik, Cebpd, 2310008H04Rik, LOC100043266, LOC224010, D16Ertd727e
Downstream geneFgd4, Olfr19, 4933404G15Rik, Spag6, EG665562, EG436405, Vpreb1, Top3b, Ppm1f, LOC100042783, EG623519, Mapk1, Ypel1, Ppil2, 2610318N02Rik, Sdf2l1, LOC623568, Ccdc116, 1810015A11Rik, Ube2l3, Gm603, Hic2, D16Bwg1494e, Pik4ca, Serpind1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163O07.bB6Ng01-163O07.g
ACCDH956364DH956365
length1,1211,037
definitionDH956364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163O07, 5' end.DH956365|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,389,743 - 16,390,869)(16,207,255 - 16,208,288)
sequence
gaattcctatctccttcaaggccttcaatccttcccccaacttttccata
agagattccaagacatccgtccatgtttggttgtgggtctctgcatctgt
ttcagtcagctgctggatagagtctcacagaggcagttgtgctaggctcc
tttctgcaagcctaacagagtgtcattaattgttgtagaccataccgtga
gaaagcaagcctttcactgtctcccaccctgacaagccaaatggccttgt
gctaggagccggtcgtcactcccttcttcctgttcccttcctggcacctg
aagctgtaaaagctgaattatagtcccctcttccttatctcttcctgact
ccagtgacatccaaggacatgagttacatgctgagcctggcttgacaccc
taggctgttaaggaggattccaccttccggagataagacacagagtgccc
accgcctggctcctgacttcggccctcgtgtcccctgatgcccacttctt
tgttctttgttaatttctcctctacccctccctattcccctctatgtatg
ctttaaaaactggcgtttcagcctaataaacgaagaccttgataggaacg
atctacttggtcttcgcttctcttttctctcccatcccattttctcccag
gtttgcagtccccctcgcacccacgaataactgagtcctgctggacagga
caattaatagtgtcagggattggtattttcccatgggatgactctcaagc
tgtgccagttattgactggccattctgttggtctctgctgcatctttgcc
cttgcatttagacaggacaaattttgggtcaaatgttttgtgggtaggtt
ggtgcccttatccctgcttgactataggaggtggtctcttcaggtccata
tgcccactgttaggcatctcagctaagtcacctacattgactcctgggag
cctccctcatcccaggtctctgggacttcttagagatcccctccaccact
acctccccaacctggcagtcaaattttctataatttcttcctgggccctc
tggcctctttctggctcctcctatatgaatcgaagtgatcctcctcccct
tcccactaactccctccctcc
gaattctcacaactggggagacatcaccagtctgtccagtataaacatgg
tgtcttagttatttttctattactatgataaaacagcatgaccaagacaa
cttatagataaaatagcttatttggggtttattgtttcagtgggatagac
tccatgacagtgcaacaaaggaatagctaatattttgagacacaaccaca
aggcagagaaagagacatagaaatggtacaagtattttgaaacatcagac
ctgcccccagtgacacagtctttctaataaggtcacatatcccaatcctt
cccaaacagtttcaccaactgaaaagcaagtatttaaacatatgaggtta
tgggatcatcctaattcaaaccacgatgtctgggataactaatgctgagt
ctttttcctgagtcagatgctatgaacccacccatgtagtcattggggca
tgggacattttctaaaactttagtgcctgttcttccctccagacatctct
agggacatcctcaccctgaataagacagtgcaaagtttaaagacattaat
acaaatagcatctatgttattgttttgacacaagaacacatgaatctaaa
catgtttcagcctttcttcatggtttgtttttctagagctgtgataaact
tgggatagaaaggatttatctggtatacacttccccattatagtgcattg
gtagaagccagggcagggattcaagatagagacttggagacagcagagga
atgctgcttactggcatgcctgtgtgtgtgtgcatgtgcgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaacactagctcaaggcatgactacatt
aaaactctttgcaagtacatatgatctcttccaaaaaataaatactacag
actgagaaacaatgctcaagataactggttcaaggaagaatgacttgaag
gagtcaggtgtgccctggccttacggatagcatcagagtatctaggctct
gcctccatggaaagatcatgagtcattctcaaataag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_16389743_16390869
seq2: B6Ng01-163O07.b_42_1162 (reverse)

seq1  GGAGGGAGGGAGTTAGGTGGGAGGGGGAGGAGAATCAAGGTTCAGAATCA  50
      ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||| || |||
seq2  GGAGGGAGGGAGTTA-GTGGGAAGGGGAGGAGGATCA--CTTC-GATTCA  46

seq1  TATAGGGAGAGGCAGGAAAGAGGGCCAGAGGG-CCAGG-AGAATGTATAG  98
      ||||||  ||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||
seq2  TATAGGAGGAGCCA-GAAAGA-GGCCAGAGGGCCCAGGAAGAAATTATAG  94

seq1  AAAATTTTGACTGCCAGGTTGGGGA-GTAGTGGTGGAGGGGATCTCTAAG  147
      |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAA-TTTGACTGCCAGGTTGGGGAGGTAGTGGTGGAGGGGATCTCTAAG  143

seq1  AAGTCCCAGAGACCTGGGATGAGGGAGGCTCCCAGGAGTCAATGTAGGTG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCCAGAGACCTGGGATGAGGGAGGCTCCCAGGAGTCAATGTAGGTG  193

seq1  ACCTTAGCTGAGATGCCTAACAGTGGGCATATGGAACCTGAAGAGACCAC  247
      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  A-CTTAGCTGAGATGCCTAACAGTGGGCATATGG-ACCTGAAGAGACCAC  241

seq1  CTCCTATAGTCAAGCAGGGATAAGGGCACCAACCTACCCACAAAACATTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTATAGTCAAGCAGGGATAAGGGCACCAACCTACCCACAAAACATTT  291

seq1  GACCCAAAATTTGTCCTGTCTAAATGCAAGGGCAAAGATGCAGCAGAGAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCAAAATTTGTCCTGTCTAAATGCAAGGGCAAAGATGCAGCAGAGAC  341

seq1  CAACAGAATGGCCAGTCAATAACTGGCACAGCTTGAGAGTCATCCCATGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGAATGGCCAGTCAATAACTGGCACAGCTTGAGAGTCATCCCATGG  391

seq1  GAAAATACCAATCCCTGACACTATTAATTGTCCTGTCCAGCAGGACTCAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATACCAATCCCTGACACTATTAATTGTCCTGTCCAGCAGGACTCAG  441

seq1  TTATTCGTGGGTGCGAGGGGGACTGCAAACCTGGGAGAAAATGGGATGGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCGTGGGTGCGAGGGGGACTGCAAACCTGGGAGAAAATGGGATGGG  491

seq1  AGAGAAAAGAGAAGCGAAGACCAAGTAGATCGTTCCTATCAAGGTCTTCG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAAGAGAAGCGAAGACCAAGTAGATCGTTCCTATCAAGGTCTTCG  541

seq1  TTTATTAGGCTGAAACGCCAGTTTTTAAAGCATACATAGAGGGGAATAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTAGGCTGAAACGCCAGTTTTTAAAGCATACATAGAGGGGAATAGG  591

seq1  GAGGGGTAGAGGAGAAATTAACAAAGAACAAAGAAGTGGGCATCAGGGGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGTAGAGGAGAAATTAACAAAGAACAAAGAAGTGGGCATCAGGGGA  641

seq1  CACGAGGGCCGAAGTCAGGAGCCAGGCGGTGGGCACTCTGTGTCTTATCT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGAGGGCCGAAGTCAGGAGCCAGGCGGTGGGCACTCTGTGTCTTATCT  691

seq1  CCGGAAGGTGGAATCCTCCTTAACAGCCTAGGGTGTCAAGCCAGGCTCAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGAAGGTGGAATCCTCCTTAACAGCCTAGGGTGTCAAGCCAGGCTCAG  741

seq1  CATGTAACTCATGTCCTTGGATGTCACTGGAGTCAGGAAGAGATAAGGAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAACTCATGTCCTTGGATGTCACTGGAGTCAGGAAGAGATAAGGAA  791

seq1  GAGGGGACTATAATTCAGCTTTTACAGCTTCAGGTGCCAGGAAGGGAACA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGACTATAATTCAGCTTTTACAGCTTCAGGTGCCAGGAAGGGAACA  841

seq1  GGAAGAAGGGAGTGACGACCGGCTCCTAGCACAAGGCCATTTGGCTTGTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAGGGAGTGACGACCGGCTCCTAGCACAAGGCCATTTGGCTTGTC  891

seq1  AGGGTGGGAGACAGTGAAAGGCTTGCTTTCTCACGGTATGGTCTACAACA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGGAGACAGTGAAAGGCTTGCTTTCTCACGGTATGGTCTACAACA  941

seq1  ATTAATGACACTCTGTTAGGCTTGCAGAAAGGAGCCTAGCACAACTGCCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGACACTCTGTTAGGCTTGCAGAAAGGAGCCTAGCACAACTGCCT  991

seq1  CTGTGAGACTCTATCCAGCAGCTGACTGAAACAGATGCAGAGACCCACAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGACTCTATCCAGCAGCTGACTGAAACAGATGCAGAGACCCACAA  1041

seq1  CCAAACATGGACGGATGTCTTGGAATCTCTTATGGAAAAGTTGGGGGAAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACATGGACGGATGTCTTGGAATCTCTTATGGAAAAGTTGGGGGAAG  1091

seq1  GATTGAAGGCCTTGAAGGAGATAGGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGAAGGCCTTGAAGGAGATAGGAATTC  1121

seq1: chr16_16207255_16208288
seq2: B6Ng01-163O07.g_70_1106

seq1  GAATTCTCACAACTGGGGAGACATCACCAGTCTGTCCAGTATAAACATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACAACTGGGGAGACATCACCAGTCTGTCCAGTATAAACATGG  50

seq1  TGTCTTAGTTATTTTTCTATTACTATGATAAAACAGCATGACCAAGACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTAGTTATTTTTCTATTACTATGATAAAACAGCATGACCAAGACAA  100

seq1  CTTATAGATAAAATAGCTTATTTGGGGTTTATTGTTTCAGTGGGATAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAGATAAAATAGCTTATTTGGGGTTTATTGTTTCAGTGGGATAGAC  150

seq1  TCCATGACAGTGCAACAAAGGAATAGCTAATATTTTGAGACACAACCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGACAGTGCAACAAAGGAATAGCTAATATTTTGAGACACAACCACA  200

seq1  AGGCAGAGAAAGAGACATAGAAATGGTACAAGTATTTTGAAACATCAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGAGAAAGAGACATAGAAATGGTACAAGTATTTTGAAACATCAGAC  250

seq1  CTGCCCCCAGTGACACAGTCTTTCTAATAAGGTCACATATCCCAATCCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCCCAGTGACACAGTCTTTCTAATAAGGTCACATATCCCAATCCTT  300

seq1  CCCAAACAGTTTCACCAACTGAAAAGCAAGTATTTAAACATATGAGGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAACAGTTTCACCAACTGAAAAGCAAGTATTTAAACATATGAGGTTA  350

seq1  TGGGATCATCCTAATTCAAACCACGATGTCTGGGATAACTAATGCTGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATCATCCTAATTCAAACCACGATGTCTGGGATAACTAATGCTGAGT  400

seq1  CTTTTTCCTGAGTCAGATGCTATGAACCCACCCATGTAGTCATTGGGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCCTGAGTCAGATGCTATGAACCCACCCATGTAGTCATTGGGGCA  450

seq1  TGGGACATTTTCTAAAACTTTAGTGCCTGTTCTTCCCTCCAGACATCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACATTTTCTAAAACTTTAGTGCCTGTTCTTCCCTCCAGACATCTCT  500

seq1  AGGGACATCCTCACCCTGAATAAGACAGTGCAAAGTTTAAAGACATTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACATCCTCACCCTGAATAAGACAGTGCAAAGTTTAAAGACATTAAT  550

seq1  ACAAATAGCATCTATGTTATTGTTTTGACACAAGAACACATGAATCTAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATAGCATCTATGTTATTGTTTTGACACAAGAACACATGAATCTAAA  600

seq1  CATGTTTCAGCCTTTCTTCATGGTTTGTTTTTCTAGAGCTGTGATAAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTCAGCCTTTCTTCATGGTTTGTTTTTCTAGAGCTGTGATAAACT  650

seq1  TGGGATAGAAAGGATTTATCTGGTATACACTTCCCCATTATAGTGCATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATAGAAAGGATTTATCTGGTATACACTTCCCCATTATAGTGCATTG  700

seq1  GTAGAAGCCAGGGCAGGGATTCAAGATAGAGACTTGGAGACAGCAGAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAAGCCAGGGCAGGGATTCAAGATAGAGACTTGGAGACAGCAGAGGA  750

seq1  ATGCTGCTTACTGGCATGCCTGTGTGTGTGTGCATGTGCGTGTGTGTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGCTTACTGGCATGCCTGTGTGTGTGTGCATGTGCGTGTGTGTGTG  800

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACACTAGCTCAAGGCATGACTACATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACACTAGCTCAAGGCATGACTACATT  850

seq1  AAAACTCTTTGCAAAGTACATATGATCTCTTCCATAAAATAAATACTACA  900
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAAACTCTTTGC-AAGTACATATGATCTCTTCCAAAAAATAAATACTACA  899

seq1  GACTGAGAAACAATGCTCAAGATAACT-GTTCAAGG-AGAATGAC-TGAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| 
seq2  GACTGAGAAACAATGCTCAAGATAACTGGTTCAAGGAAGAATGACTTGAA  949

seq1  GGAGTCAGGTGTGCCCTGGCCTTACGGATAGCA-CAGAGGTATCTAGGCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
seq2  GGAGTCAGGTGTGCCCTGGCCTTACGGATAGCATCAGA-GTATCTAGGCT  998

seq1  CTG-CTCCATTGTGAAGTACATGAGTCA-TCTCAAATAAG  1034
      ||| ||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||||
seq2  CTGCCTCCA-TGGAAAGATCATGAGTCATTCTCAAATAAG  1037