BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-165M04
Chromosome16 (Build37)
Map Location 47,627,415 - 47,792,269
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC628757, LOC628776
Downstream geneEG667741, EG639644, EG637273, Dppa4, Dppa2, EG433023, Morc1, Trat1, EG667501
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-165M04.bB6Ng01-165M04.g
ACCDH957733DH957734
length1,1841,077
definitionDH957733|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165M04, 5' end.DH957734|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165M04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,627,415 - 47,628,593)(47,791,191 - 47,792,269)
sequence
gaattcaggaaaatagttaatatatgggtttattgaaaggaaaaaatctg
ctggataaaagcatgagtctgtcggtattgtagatttttgaagttctgaa
tgtattttaagaacatagaaacaaaattagtaatgaaacaatctcatcca
tatgaatatattatatctcagcaaatcaacatatgagctgaaaaagaagt
ttccagaatccttcctgcagatacagcaaataaaaggctataataaaata
tactaattgaactttagttcttaatttccagtatagctgctgtaatttag
tatgaactagtattagaaaagacaggatttaaaggaaataaatgtttctg
aggcaattatgcagatacagaaatgggtaggagatggagctctcagtctt
ccatcatcacatacgctcattcaatatggtaacaaggaacaggaaaatct
gctcaaatagagttgtcagcctttgagtgaagtaaaggaaattggccaaa
aatcactgtctttcctttctatgccacccttgataaatcatgaaaatggc
ttgccatggtttccagtggctaattataaagctgctgctaaaaataacct
tctatatccagcaattagggattcacaatgcatgaacattctgctaagta
atagaagctgagataagaatataatactgcaccaatctgggagaaagaaa
aacactatttatttaagtgacacattctggaataaaaatattatcagagt
gatgcagaaaattttcaggataaattaaacaccaaactcacatctattac
atagacagtaaaaataaaacactagcttcgaataactatttcataagtgt
tacattaaacttgggaaatgaatggcttagttggaaaaataaattataca
tgaagattgtagttaggaaatggatgaaattatcagcattaaagaaaact
ttctacaagtgagttgggtttcacacagctatggacatcattgtagtaca
taaagaatgggagactatggaaattgtgtgcatcataaattgtcatttgc
atataaattgacggttttggtctttggattaacaaatggaacactgtatt
tttttatccaggaaacagtctatgttatggaagattcttcttggaagata
gtgaacctcatacatgtcaatgaagacattctaa
gaattcagttttccaaggttataagaccttataaaaaggggtcaagaaag
tctatgtgtataatgggatatatttaatgactaattatgattcagtctaa
ttacaaaaactctattaaacgaagactagttaacaggaggaagggagcaa
caaaagagtcaactttcttaatttctcactttcctttgaaaagctttcct
gggagtttgatatacattttagtagttacattgagtcacaaatatcttta
cggaattctggaaaatctaattgtttagtctaaaaaaaattatgtgccaa
tcaagacaagaatatatatatatatatatacacacacatacacacatata
tatatatatacctcacatcatcttccttgtcattgtatgaaatcatatct
tgcctatctggaggtggactttgaagttgatttaggctgtgtgtggagga
gctgggagtaggaggtgatattctttaaagctaggcatagggccatttag
caggaatgtgcattagataaacgtatattcttagctcatccgtccatttc
tctgtaccttctctctgaggcacatttatcttccaagtcaggagactctt
cagttactttcctaagttgacttctggaagtttcttgccggaaaggattg
gataagtccaagttccttgggcttcagagacaacaaagactcacacattt
aaacagagtaaatgttttaaaggaaataaaacctggaggtgaaagcagca
gcaatttgttgagtgaatgcttggcttagggtgttgatattgtaaggata
ggatctgttgagcaaaaccatcttgcccctccctcctgaatgttcctagg
gatgtcttttctttcagactgccaatctggcaatgtctattaaattccat
gtgagaccaagtgaaaggagcagtttacaattggaccgaataaaggtaat
agtgtaaaagaggtagaaatcacgctcagagtgccgtgaactcagacttc
tcaccgtccaatctgggcatgcctcctagttgacttaccttatggcagcc
agtagaattgggccaggacaagtttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_47627415_47628593
seq2: B6Ng01-165M04.b_47_1230

seq1  GAATTCAGGAAAATAGTTAATATATGGGTTTATTGAAAGGAAAAAATCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGAAAATAGTTAATATATGGGTTTATTGAAAGGAAAAAATCTG  50

seq1  CTGGATAAAAGCATGAGTCTGTCGGTATTGTAGATTTTTGAAGTTCTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATAAAAGCATGAGTCTGTCGGTATTGTAGATTTTTGAAGTTCTGAA  100

seq1  TGTATTTTAAGAACATAGAAACAAAATTAGTAATGAAACAATCTCATCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTTAAGAACATAGAAACAAAATTAGTAATGAAACAATCTCATCCA  150

seq1  TATGAATATATTATATCTCAGCAAATCAACATATGAGCTGAAAAAGAAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATATATTATATCTCAGCAAATCAACATATGAGCTGAAAAAGAAGT  200

seq1  TTCCAGAATCCTTCCTGCAGATACAGCAAATAAAAGGCTATAATAAAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGAATCCTTCCTGCAGATACAGCAAATAAAAGGCTATAATAAAATA  250

seq1  TACTAATTGAACTTTAGTTCTTAATTTCCAGTATAGCTGCTGTAATTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATTGAACTTTAGTTCTTAATTTCCAGTATAGCTGCTGTAATTTAG  300

seq1  TATGAACTAGTATTAGAAAAGACAGGATTTAAAGGAAATAAATGTTTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAACTAGTATTAGAAAAGACAGGATTTAAAGGAAATAAATGTTTCTG  350

seq1  AGGCAATTATGCAGATACAGAAATGGGTAGGAGATGGAGCTCTCAGTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAATTATGCAGATACAGAAATGGGTAGGAGATGGAGCTCTCAGTCTT  400

seq1  CCATCATCACATACGCTCATTCAATATGGTAACAAGGAACAGGAAAATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATCACATACGCTCATTCAATATGGTAACAAGGAACAGGAAAATCT  450

seq1  GCTCAAATAGAGTTGTCAGCCTTTGAGTGAAGTAAAGGAAATTGGCCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAATAGAGTTGTCAGCCTTTGAGTGAAGTAAAGGAAATTGGCCAAA  500

seq1  AATCACTGTCTTTCCTTTCTATGCCACCCTTGATAAATCATGAAAATGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTGTCTTTCCTTTCTATGCCACCCTTGATAAATCATGAAAATGGC  550

seq1  TTGCCATGGTTTCCAGTGGCTAATTATAAAGCTGCTGCTAAAAATAACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCATGGTTTCCAGTGGCTAATTATAAAGCTGCTGCTAAAAATAACCT  600

seq1  TCTATATCCAGCAATTAGGGATTCACAATGCATGAACATTCTGCTAAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATATCCAGCAATTAGGGATTCACAATGCATGAACATTCTGCTAAGTA  650

seq1  ATAGAAGCTGAGATAAGAATATAATACTGCACCAATCTGGGAGAAAGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAGCTGAGATAAGAATATAATACTGCACCAATCTGGGAGAAAGAAA  700

seq1  AACACTATTTATTTAAGTGACACATTCTGGAATAAAAATATTATCAGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTATTTATTTAAGTGACACATTCTGGAATAAAAATATTATCAGAGT  750

seq1  GATGCAGAAAATTTTCAGGATAAATTAAACACCAAACTCACATCTATTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGAAAATTTTCAGGATAAATTAAACACCAAACTCACATCTATTAC  800

seq1  ATAGACAGTAAAAATAAAACACTAGCTTCGAATAACTATTTCATAAGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACAGTAAAAATAAAACACTAGCTTCGAATAACTATTTCATAAGTGT  850

seq1  TACATTAAACTTGGGAAATGAATGGCTTAGTTGGAAAAAATAAATTATAC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TACATTAAACTTGGGAAATGAATGGCTTAGTTGG-AAAAATAAATTATAC  899

seq1  ATGAAGATTGTAGTTAGGAAATGGATGAAATTATCAGCATTAAAGAAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATGAAGATTGTAGTTAGGAAATGGATGAAATTATCAGCATTAAAG-AAAA  948

seq1  CTTTCTACAAGTGAGTTGGGTTTCACACAGCTATGGACATCA-TGTAGTA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTTTCTACAAGTGAGTTGGGTTTCACACAGCTATGGACATCATTGTAGTA  998

seq1  CATAAAGAATGGGAGACTATGGGAAAATGTGTGCATCAT-AATTGTCATT  1048
      |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  CATAAAGAATGGGAGACTAT-GGAAATTGTGTGCATCATAAATTGTCATT  1047

seq1  TGCAATATAAATTGACG--TTATGTCTTTGGATGA--CAATTGAACACTG  1094
      ||| |||||||||||||  ||  |||||||||| |   ||| ||||||||
seq2  TGC-ATATAAATTGACGGTTTTGGTCTTTGGATTAACAAATGGAACACTG  1096

seq1  TATTTTTTAATCCAGGAAACAGTCCATG-TATG--AGATTCTTCCTTGGA  1141
      |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||
seq2  TATTTTTTTATCCAGGAAACAGTCTATGTTATGGAAGATTCTT-CTTGGA  1145

seq1  AGATAGTGA--CTCAATACATGTAAATG-AGACATTTCTAA  1179
      |||||||||  ||| |||||||| |||| ||||| ||||||
seq2  AGATAGTGAACCTC-ATACATGTCAATGAAGACA-TTCTAA  1184

seq1: chr16_47791191_47792269
seq2: B6Ng01-165M04.g_70_1146 (reverse)

seq1  AGAAACTTGTCCTGGGCCAATTCTACTGGCTG-CATAAGGTTAAGTCAAC  49
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||
seq2  AGAAACTTGTCCTGGCCCAATTCTACTGGCTGCCATAAGG-TAAGTCAAC  49

seq1  TAGGAGGCATGCCCAGATTGGACGGTGAGAAGTCTGAGTTCCACGGCACT  99
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAGGAGGCATGCCCAGATTGGACGGTGAGAAGTCTGAGTT-CACGGCACT  98

seq1  CTGAGCGTGATTTCTACCTCTTTTACACTATTAACCTTTATTCGGTCCAA  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTGAGCGTGATTTCTACCTCTTTTACACTATT-ACCTTTATTCGGTCCAA  147

seq1  TTGTAAACTGCTCCTTTCACTTGGTCTCACATGGAATTTAATAGACATTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAACTGCTCCTTTCACTTGGTCTCACATGGAATTTAATAGACATTG  197

seq1  CCAGATTGGCAGTCTGAAAGAAAAGACATCCCTAGGAACATTCAGGAGGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTGGCAGTCTGAAAGAAAAGACATCCCTAGGAACATTCAGGAGGG  247

seq1  AGGGGCAAGATGGTTTTGCTCAACAGATCCTATCCTTACAATATCAACAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCAAGATGGTTTTGCTCAACAGATCCTATCCTTACAATATCAACAC  297

seq1  CCTAAGCCAAGCATTCACTCAACAAATTGCTGCTGCTTTCACCTCCAGGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGCCAAGCATTCACTCAACAAATTGCTGCTGCTTTCACCTCCAGGT  347

seq1  TTTATTTCCTTTAAAACATTTACTCTGTTTAAATGTGTGAGTCTTTGTTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTCCTTTAAAACATTTACTCTGTTTAAATGTGTGAGTCTTTGTTG  397

seq1  TCTCTGAAGCCCAAGGAACTTGGACTTATCCAATCCTTTCCGGCAAGAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAAGCCCAAGGAACTTGGACTTATCCAATCCTTTCCGGCAAGAAA  447

seq1  CTTCCAGAAGTCAACTTAGGAAAGTAACTGAAGAGTCTCCTGACTTGGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGAAGTCAACTTAGGAAAGTAACTGAAGAGTCTCCTGACTTGGAA  497

seq1  GATAAATGTGCCTCAGAGAGAAGGTACAGAGAAATGGACGGATGAGCTAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATGTGCCTCAGAGAGAAGGTACAGAGAAATGGACGGATGAGCTAA  547

seq1  GAATATACGTTTATCTAATGCACATTCCTGCTAAATGGCCCTATGCCTAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATACGTTTATCTAATGCACATTCCTGCTAAATGGCCCTATGCCTAG  597

seq1  CTTTAAAGAATATCACCTCCTACTCCCAGCTCCTCCACACACAGCCTAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAAGAATATCACCTCCTACTCCCAGCTCCTCCACACACAGCCTAAA  647

seq1  TCAACTTCAAAGTCCACCTCCAGATAGGCAAGATATGATTTCATACAATG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTTCAAAGTCCACCTCCAGATAGGCAAGATATGATTTCATACAATG  697

seq1  ACAAGGAAGATGATGTGAGGTATATATATATATATGTGTGTATGTGTGTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGAAGATGATGTGAGGTATATATATATATATGTGTGTATGTGTGTG  747

seq1  TATATATATATATATATATTCTTGTCTTGATTGGCACATAATTTTTTTTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATTCTTGTCTTGATTGGCACATAATTTTTTTTA  797

seq1  GACTAAACAATTAGATTTTCCAGAATTCCGTAAAGATATTTGTGACTCAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAACAATTAGATTTTCCAGAATTCCGTAAAGATATTTGTGACTCAA  847

seq1  TGTAACTACTAAAATGTATATCAAACTCCCAGGAAAGCTTTTCAAAGGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACTACTAAAATGTATATCAAACTCCCAGGAAAGCTTTTCAAAGGAA  897

seq1  AGTGAGAAATTAAGAAAGTTGACTCTTTTGTTGCTCCCTTCCTCCTGTTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGAAATTAAGAAAGTTGACTCTTTTGTTGCTCCCTTCCTCCTGTTA  947

seq1  ACTAGTCTTCGTTTAATAGAGTTTTTGTAATTAGACTGAATCATAATTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTCTTCGTTTAATAGAGTTTTTGTAATTAGACTGAATCATAATTAG  997

seq1  TCATTAAATATATCCCATTATACACATAGACTTTCTTGACCCCTTTTTAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAAATATATCCCATTATACACATAGACTTTCTTGACCCCTTTTTAT  1047

seq1  AAGGTCTTATAACCTTGGAAAACTGAATTC  1079
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTTATAACCTTGGAAAACTGAATTC  1077