BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-165P09
Chromosome16 (Build37)
Map Location 83,176,263 - 83,317,737
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG665260
Downstream geneEG545172, LOC100039572, EG621729, LOC640489
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-165P09.bB6Ng01-165P09.g
ACCDH957873DH957874
length1,0131,127
definitionDH957873|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165P09, 5' end.DH957874|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165P09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,176,263 - 83,177,276)(83,316,609 - 83,317,737)
sequence
gaattcaccatacaaaatggaagctgactggaagaagtttgtctcacaaa
atcacatttatcccataaattctgatggcagttgaaggactcttctgggt
tatataggttctaatcttttggtttaagttaattgtttaaaaataacaaa
ttttaacacatttttacttatttttgtcttattactattatcttgcttaa
cacagaggcattaaaatcaccatgggaaactcaaatgaatattaagacaa
agttatttattcgttagtattgacatttttctctatactatcaaacacca
cacaataaagttatttgaaaactaccactgaataagttatttcctataca
tatataaaaacagctgaaactgagttatcctgtaacaagctatcttagat
agagtcgttattgtctaaagtgaagttctcttctttctggtgactttaac
tggcatcaagttttctgagccagaaaacagagcttctaatagaccctatg
gaataaaagaaataagccaggaaggggctatgcttattggtgttggtgat
tagtaaagaccctcaaatattggaggatattgtgatttttatttttgacc
actccctgaaaactcgatgacactgcactgttactgaagttactatcata
tcatatatttgagttatgaaaatgaggaaataaaggtcgaaagtgacatg
atagttctgtcccttctggctagctttcctagtacgggaaggtgctatgc
ctgctaacaggaagaaaagtaatcttcagtcacacaaagctgtgaaccct
agagcttataataaagatcttcacgcaagttatgaccactgatacagtag
ggcattgcccataaacacgttctgattgtgcttaaagcccactctacacc
tggcatatgtttccaaattgtatggctagacaagtcctaggatttaggcc
agaacctatgactcttactttgctcctatgagagagcagtaaataaacat
ttcatgatgtttt
gaattctcatatgttggatcttttcaggagaccaaaaagagcacatctct
aaccacctttaacaccaatacctttccttagaacagcagccaatgaccaa
acaacccttaggaatcttttttggtattaggtatcaatatttatctgctt
tggttgtattttagtagcagatacacataagcaactattcaggggatttt
taggtgtattattccatgagtttttgttttgtcttattaaattataaacg
aaaatgtcggtctatgctcagattacatgcatgtatgcaaatctttatac
aagaaataaattgtatggttatttttatatcagtgaatttgacacaagca
cacagatcattaattcatatccagattatgcttactcccctctctgtaac
tcaaactgtgctaccccaaaccttctactctaaaagtcatcttttaattt
ctacttcattgattgtaatgtgtatgtggaaagcacaacatgcataactg
aaacaagttttagataatgtagaatatttataatgcatagatgtaattgc
atttgagtcttgcataatccactgggacttgtgactaaaagaataaaatc
taaagcttgatgtttaaaagattttcagttttgaaattgggaagaagtac
agagttgcaatatcaggatttcaaaactgtcttgaaatgggagtgaaatg
aaccaagcttacgtgatgatgaaaattagccagattattctgtttcttac
tggagaatcaggaaaacacacaaatatttaaacaggaactgcacaaacac
agagaaaagaaaaccctgtgctggttaaaaaaacaaagcaaaccaaacca
aaacaaaacaaaaaacctaatatgacagtttgtgacagcaaaatcaaagg
cagaagcagtgagtcaagctaacggcatgagtcattgtgcaccacactgc
cagaaagtcattttcatcgggtatattgatagacatgcagaatagaacag
tgatgtgagctcaagtcaggacagtgaagctctgcctgtccttgggtaga
aatctccggggtggtcagttatatcactgaacgtttagagagataattga
taagaaggatgacatttcaaagctgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_83176263_83177276
seq2: B6Ng01-165P09.b_47_1059

seq1  GAATTCACCATACAAAATGGAAGCTGACTGGAAGAAGTTTGTCTCACAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCATACAAAATGGAAGCTGACTGGAAGAAGTTTGTCTCACAAA  50

seq1  ATCACATTTATCCCATAAATTCTGATGGCAGTTGAAGGACTCTTCTGGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATTTATCCCATAAATTCTGATGGCAGTTGAAGGACTCTTCTGGGT  100

seq1  TATATAGGTTCTAATCTTTTGGTTTAAGTTAATTGTTTAAAAATAACAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGGTTCTAATCTTTTGGTTTAAGTTAATTGTTTAAAAATAACAAA  150

seq1  TTTTAACACATTTTTACTTATTTTTGTCTTATTACTATTATCTTGCTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAACACATTTTTACTTATTTTTGTCTTATTACTATTATCTTGCTTAA  200

seq1  CACAGAGGCATTAAAATCACCATGGGAAACTCAAATGAATATTAAGACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGGCATTAAAATCACCATGGGAAACTCAAATGAATATTAAGACAA  250

seq1  AGTTATTTATTCGTTAGTATTGACATTTTTCTCTATACTATCAAACACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTTATTCGTTAGTATTGACATTTTTCTCTATACTATCAAACACCA  300

seq1  CACAATAAAGTTATTTGAAAACTACCACTGAATAAGTTATTTCCTATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATAAAGTTATTTGAAAACTACCACTGAATAAGTTATTTCCTATACA  350

seq1  TATATAAAAACAGCTGAAACTGAGTTATCCTGTAACAAGCTATCTTAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAAAAACAGCTGAAACTGAGTTATCCTGTAACAAGCTATCTTAGAT  400

seq1  AGAGTCGTTATTGTCTAAAGTGAAGTTCTCTTCTTTCTGGTGACTTTAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCGTTATTGTCTAAAGTGAAGTTCTCTTCTTTCTGGTGACTTTAAC  450

seq1  TGGCATCAAGTTTTCTGAGCCAGAAAACAGAGCTTCTAATAGACCCTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATCAAGTTTTCTGAGCCAGAAAACAGAGCTTCTAATAGACCCTATG  500

seq1  GAATAAAAGAAATAAGCCAGGAAGGGGCTATGCTTATTGGTGTTGGTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAAGAAATAAGCCAGGAAGGGGCTATGCTTATTGGTGTTGGTGAT  550

seq1  TAGTAAAGACCCTCAAATATTGGAGGATATTGTGATTTTTATTTTTGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAAAGACCCTCAAATATTGGAGGATATTGTGATTTTTATTTTTGACC  600

seq1  ACTCCCTGAAAACTCGATGACACTGCACTGTTACTGAAGTTACTATCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCTGAAAACTCGATGACACTGCACTGTTACTGAAGTTACTATCATA  650

seq1  TCATATATTTGAGTTATGAAAATGAGGAAATAAAGGTCGAAAGTGACATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATATTTGAGTTATGAAAATGAGGAAATAAAGGTCGAAAGTGACATG  700

seq1  ATAGTTCTGTCCCTTCTGGCTAGCTTTCCTAGTACGGGAAGGTGCTATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTCTGTCCCTTCTGGCTAGCTTTCCTAGTACGGGAAGGTGCTATGC  750

seq1  CTGCTAACAGGAAGAAAAGTAATCTTCAGTCACACAAAGCTGTGAACCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTAACAGGAAGAAAAGTAATCTTCAGTCACACAAAGCTGTGAACCCT  800

seq1  AGAGCTTATAATAAAGATCTTCAGGCAAGTTATGACCACTGATACAGTAG  850
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTTATAATAAAGATCTTCACGCAAGTTATGACCACTGATACAGTAG  850

seq1  GGCATTGCCCATAAACACGTTCTGATTGTGCTTAAAGCCCACTCTACACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTGCCCATAAACACGTTCTGATTGTGCTTAAAGCCCACTCTACACC  900

seq1  TGGCATATGTTTCCAAAATTGTATGGCTAGACAAGTCCTAGGATTTAGGC  950
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATATGTTTCC-AAATTGTATGGCTAGACAAGTCCTAGGATTTAGGC  949

seq1  CAGAACCTATGACTCTTACTTTGCTCCTATGAGAGAGCAGTAAATAAACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACCTATGACTCTTACTTTGCTCCTATGAGAGAGCAGTAAATAAACA  999

seq1  TTTCATGATGTTTT  1014
      ||||||||||||||
seq2  TTTCATGATGTTTT  1013

seq1: chr16_83316609_83317737
seq2: B6Ng01-165P09.g_68_1194 (reverse)

seq1  TCCAGCTCTG-AATGTCATCCTCTTTATCAA-TATCTCTCTAAACG-TCA  47
      ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||
seq2  TCCAGCTTTGAAATGTCATCCTTCTTATCAATTATCTCTCTAAACGTTCA  50

seq1  GTGATTATAACTGAACACACC-GAGA-TTCTACCCAAGGACAGGCAGAGC  95
      |||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGA-TATAACTGACCACCCCGGAGATTTCTACCCAAGGACAGGCAGAGC  99

seq1  TGTCACTGTCCTGACTTTGAGCTCACATCACTGTTCTTATTCTGCATGTC  145
      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  T-TCACTGTCCTGAC-TTGAGCTCACATCACTGTTC-TATTCTGCATGTC  146

seq1  TATCAATATAACCCGATGAAAATGACTTTTCTTGGCAGTGTGGTGCACAA  195
      ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||
seq2  TATCAATAT-ACCCGATGAAAATGACTTT--CTGGCAGTGTGGTGCACAA  193

seq1  TGACTCATGCCGTTAGCTTGACTCACTGCTTCTGCCTTTGATTTTGCTGT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCATGCCGTTAGCTTGACTCACTGCTTCTGCCTTTGATTTTGCTGT  243

seq1  CACAAACTGTCATATTAGGTTTTTTGTTTTGTTTTGGTTTGGTTTGCTTT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAACTGTCATATTAGGTTTTTTGTTTTGTTTTGGTTTGGTTTGCTTT  293

seq1  GTTTTTTTAACCAGCACAGGGTTTTCTTTTCTCTGTGTTTGTGCAGTTCC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTTTAACCAGCACAGGGTTTTCTTTTCTCTGTGTTTGTGCAGTTCC  343

seq1  TGTTTAAATATTTGTGTGTTTTCCTGATTCTCCAGTAAGAAACAGAATAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAAATATTTGTGTGTTTTCCTGATTCTCCAGTAAGAAACAGAATAA  393

seq1  TCTGGCTAATTTTCATCATCACGTAAGCTTGGTTCATTTCACTCCCATTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTAATTTTCATCATCACGTAAGCTTGGTTCATTTCACTCCCATTT  443

seq1  CAAGACAGTTTTGAAATCCTGATATTGCAACTCTGTACTTCTTCCCAATT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACAGTTTTGAAATCCTGATATTGCAACTCTGTACTTCTTCCCAATT  493

seq1  TCAAAACTGAAAATCTTTTAAACATCAAGCTTTAGATTTTATTCTTTTAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACTGAAAATCTTTTAAACATCAAGCTTTAGATTTTATTCTTTTAG  543

seq1  TCACAAGTCCCAGTGGATTATGCAAGACTCAAATGCAATTACATCTATGC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAGTCCCAGTGGATTATGCAAGACTCAAATGCAATTACATCTATGC  593

seq1  ATTATAAATATTCTACATTATCTAAAACTTGTTTCAGTTATGCATGTTGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAAATATTCTACATTATCTAAAACTTGTTTCAGTTATGCATGTTGT  643

seq1  GCTTTCCACATACACATTACAATCAATGAAGTAGAAATTAAAAGATGACT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCACATACACATTACAATCAATGAAGTAGAAATTAAAAGATGACT  693

seq1  TTTAGAGTAGAAGGTTTGGGGTAGCACAGTTTGAGTTACAGAGAGGGGAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAGTAGAAGGTTTGGGGTAGCACAGTTTGAGTTACAGAGAGGGGAG  743

seq1  TAAGCATAATCTGGATATGAATTAATGATCTGTGTGCTTGTGTCAAATTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCATAATCTGGATATGAATTAATGATCTGTGTGCTTGTGTCAAATTC  793

seq1  ACTGATATAAAAATAACCATACAATTTATTTCTTGTATAAAGATTTGCAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATATAAAAATAACCATACAATTTATTTCTTGTATAAAGATTTGCAT  843

seq1  ACATGCATGTAATCTGAGCATAGACCGACATTTTCGTTTATAATTTAATA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATGTAATCTGAGCATAGACCGACATTTTCGTTTATAATTTAATA  893

seq1  AGACAAAACAAAAACTCATGGAATAATACACCTAAAAATCCCCTGAATAG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAAACAAAAACTCATGGAATAATACACCTAAAAATCCCCTGAATAG  943

seq1  TTGCTTATGTGTATCTGCTACTAAAATACAACCAAAGCAGATAAATATTG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTATGTGTATCTGCTACTAAAATACAACCAAAGCAGATAAATATTG  993

seq1  ATACCTAATACCAAAAAAGATTCCTAAGGGTTGTTTGGTCATTGGCTGCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTAATACCAAAAAAGATTCCTAAGGGTTGTTTGGTCATTGGCTGCT  1043

seq1  GTTCTAAGGAAAGGTATTGGTGTTAAAGGTGGTTAGAGATGTGCTCTTTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAAGGAAAGGTATTGGTGTTAAAGGTGGTTAGAGATGTGCTCTTTT  1093

seq1  TGGTCTCCTGAAAAGATCCAACATATGAGAATTC  1129
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTCCTGAAAAGATCCAACATATGAGAATTC  1127