BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167P22
Chromosome16 (Build37)
Map Location 78,746,992 - 78,867,983
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC435483, LOC100039561, Cxadr, Btg3, D16Ertd472e, LOC100039605, 4930570E03Rik
Downstream geneChodl, Prss7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167P22.bB6Ng01-167P22.g
ACCDH959351DH959352
length1,0841,131
definitionDH959351|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167P22, 5' end.DH959352|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167P22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(78,746,992 - 78,748,084)(78,866,844 - 78,867,983)
sequence
gaattccccctgcacctaaacatgtccttccatattgctactgttctggt
cttgtttacgcagccatttctaggaaaggctatttcacagtagattttgt
agtattatgtctcttacattctttcaaactacctcccaaaatgttccctg
aaccataaattaaggcatcatgatataaatgcaggtgttggaactggact
ccccatgatctattgatccctgcattgtatgcagttgtagtttcctgtga
tggtacccattttctacatagggaggcttttttttttccttttgatgacg
ggtggtagctacacttactcttttattcattggccagggcagagtggatg
gtcagccatgaaaatgactatacaaaccaccaatgaaaatgaactcgtta
ggttgtatttacatatagctgtgtgcacaagcgtatgtaacacccatatg
caactataataataaaagaaaagaggctacgagtttaagggtaggtggag
aggttcaagagaagctggataggtggagctagaaagaggaaatggatagg
gaaagtgacatgatctattacagttaacatatattagaaaaaaagttata
acagctaaatacaacaaatactgatttaatgcattgaaggtagctccctt
ctccaagaaaaaaaacctaagcaagtaaacaaacaaaaaaatcgtactta
ccagatttttttcctgtatttggaagaaatagctttcacagatgtaacta
ctgttctagagatgagagtgttatttgttcgtgggtttagcctttagtct
agtggaaaatgatgttatgacaaacaagaggaggtgactctgggaggtat
caagtacagtctggagttaaattgttacaagctaaggagcatgcggaacc
acccaccatcaggcaggaagggaaaaagaggagatgttccctcgcttcta
cagacaaagcacagtcctgctaatatgtgatttagatttttcctttcatg
tgcatcacgatatattttgttattttaagcataatggtgtgaatgtgaca
tgcaaagaaggcagaaggagattagagaaacagc
gaattctcagacagtacacactctgctctcacgtggcatctctatttttg
ttagaatacttcttactttattatttggattctaatcgcaaacctgtcat
ttttagcatattgatagccctccgaaatatagtccctaggcttctcattt
gtttcgcagaacataatcaaatcataaattggaccttatacattttgttt
taaaaaacaaatacattagacattatatgaaggtgcccagcagcaaacat
tgattgcattttaaatgaaagcaactgaaaaaattgtcactgggcagaaa
gtgattcataagccctgacaaggatattctaaattaactctaaagtaata
ctgtgtgtggcaagaggattctaaattaactaaagtaatttaatatgttt
tttaaatggactttaggcataattatagtaaataaagtattttaggtatt
tgctctccttaagactctcacagtataccatctactttaggacattataa
atgataagcaactgagatatgcagacgtaatttggttttactactgaaaa
gataaaatcaacaggtacttttggccttcttaacctggtaaatgatctaa
cagttgtcttcagggtttaaggtccatgtctggataaatagatactaaca
gataatttaccttaacatgcaaaggaaatactagcattctttaaatcaag
aaccttgtgaagtaaattcctagagggcacacaagtatctaccacaactg
ctttcatcttcctttctaaggagcgaccctctcccccccattcacataat
ccagatgcaggttggcatactctatgtcaactagagtggccagttgtggg
acatttgggctatgcaaagacagtcttgtccccaacagagctgagatgtt
gaaccctgggacccggtggtgataattcacctacatggcatggtaggcgt
tccctcatgctcctgggacttgagctcctgtcgagtaaccaccccctcag
cccctcacagagagcatggtcagtagtcagtaggccatgtctcagcttct
gatctttcaagctaaacttcttcccagttactagcacagtaagaacataa
gagggactgtttgccctccacctccttgctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_78746992_78748084
seq2: B6Ng01-167P22.b_44_1127

seq1  GAATTCCCCCTGCACCTAAACATGTCCTTCCATATTGCTACTGTTCTGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCCTGCACCTAAACATGTCCTTCCATATTGCTACTGTTCTGGT  50

seq1  CTTGTTTACGCAGCCATTTCTAGGAAAGGCTATTTCACAGTAGATTTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTACGCAGCCATTTCTAGGAAAGGCTATTTCACAGTAGATTTTGT  100

seq1  AGTATTATGTCTCTTACATTCTTTCAAACTACCTCCCAAAATGTTCCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTATGTCTCTTACATTCTTTCAAACTACCTCCCAAAATGTTCCCTG  150

seq1  AACCATAAATTAAGGCATCATGATATAAATGCAGGTGTTGGAACTGGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATAAATTAAGGCATCATGATATAAATGCAGGTGTTGGAACTGGACT  200

seq1  CCCCATGATCTATTGATCCCTGCATTGTATGCAGTTGTAGTTTCCTGTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGATCTATTGATCCCTGCATTGTATGCAGTTGTAGTTTCCTGTGA  250

seq1  TGGTACCCATTTTCTACATAGGGAGGCTTTTTTTTTTCCTTTTGATGACG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACCCATTTTCTACATAGGGAGGCTTTTTTTTTTCCTTTTGATGACG  300

seq1  GGTGGTAGCTACACTTACTCTTTTATTCATTGGCCAGGGCAGAGTGGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTAGCTACACTTACTCTTTTATTCATTGGCCAGGGCAGAGTGGATG  350

seq1  GTCAGCCATGAAAATGACTATACAAACCACCAATGAAAATGAACTCGTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCCATGAAAATGACTATACAAACCACCAATGAAAATGAACTCGTTA  400

seq1  GGTTGTATTTACATATAGCTGTGTGCACAAGCGTATGTAACACCCATATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTATTTACATATAGCTGTGTGCACAAGCGTATGTAACACCCATATG  450

seq1  CAACTATAATAATAAAAGAAAAGAGGCTACGAGTTTAAGGGTAGGTGGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTATAATAATAAAAGAAAAGAGGCTACGAGTTTAAGGGTAGGTGGAG  500

seq1  AGGTTCAAGAGAAGCTGGATAGGTGGAGCTAGAAAGAGGAAATGGATAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCAAGAGAAGCTGGATAGGTGGAGCTAGAAAGAGGAAATGGATAGG  550

seq1  GAAAGTGACATGATCTATTACAGTTAACATATATTAGAAAAAAAGTTATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGACATGATCTATTACAGTTAACATATATTAGAAAAAAAGTTATA  600

seq1  ACAGCTAAATACAACAAATACTGATTTAATGCATTGAAGGTAGCTCCCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTAAATACAACAAATACTGATTTAATGCATTGAAGGTAGCTCCCTT  650

seq1  CTCCAAGAAAAAAAACCTAAGCAAGTAAACAAACAAAAAAATCGTACTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGAAAAAAAACCTAAGCAAGTAAACAAACAAAAAAATCGTACTTA  700

seq1  CCAGATTTTTTTCCTGTATTTGGAAGAAATAGCTTTCACAGATGTAACTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTTTTTTCCTGTATTTGGAAGAAATAGCTTTCACAGATGTAACTA  750

seq1  CTGTTCTAGAGATGAGAGTGTTATTTGTTCGTGGGTTTAGCCTTTAGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCTAGAGATGAGAGTGTTATTTGTTCGTGGGTTTAGCCTTTAGTCT  800

seq1  AGTGGAAAATGATGTTATGACAAACAAGAGGAGGTGACTCTGGGAGGTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAAATGATGTTATGACAAACAAGAGGAGGTGACTCTGGGAGGTAT  850

seq1  CAAGTACAGTCTGGAGTTAAATTGTTACAAGCTAAGGAGCATGCGGAACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTACAGTCTGGAGTTAAATTGTTACAAGCTAAGGAGCATGCGGAACC  900

seq1  ACCCACCATCAGGCAGGAAGGGAAAAAGAGGAGATGTTCCCTCGCTTCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACCATCAGGCAGGAAGGGAAAAAGAGGAGATGTTCCCTCGCTTCTA  950

seq1  CAGACAAAGCACAGTCCTGCTAATATGTTGATTTTAAGATTTTTCCTTTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||
seq2  CAGACAAAGCACAGTCCTGCTAATATG-TGATTT--AGATTTTTCCTTTC  997

seq1  ATGGTGCATCACGATATATTTTGTTATTTTAAGCCATTAAATGTGTTGAA  1050
      || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||   ||||
seq2  AT-GTGCATCACGATATATTTTGTTATTTTAAG-CAT--AATGGTGTGAA  1043

seq1  TGTGACCATGCAAAGAAGGCAGAAAGGAGATTAGAGAAACAGC  1093
      ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGTGA-CATGCAAAGAAGGCAG-AAGGAGATTAGAGAAACAGC  1084

seq1: chr16_78866844_78867983
seq2: B6Ng01-167P22.g_70_1200 (reverse)

seq1  AAGCAAGAGAGTGAGGAGGGGCCAAACAGTCCCTCTTATGGTCTTTACTG  50
      ||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||
seq2  AAGCAAG-GAG-GTGGAGGG--CAAACAGTCCCTCTTATGTTC-TTACTG  45

seq1  TTGCTAGGTAACTGGGGAGGAGTTTAGCCTG-AAGATCAGAAGCTTGAGA  99
       ||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||
seq2  -TGCTA-GTAACTGGGAAGAAGTTTAGCTTGAAAGATCAGAAGC-TGAGA  92

seq1  CATGGCCTACTTGACTACTGACCATGCTTCTCCTGTG-GGGGCTGAGGGG  148
      |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||
seq2  CATGGCCTAC-TGACTACTGACCATGC-TCT-CTGTGAGGGGCTGAGGGG  139

seq1  GTGGTTACTTCGACAGGAGCTCAAGTTCCAGGAGCATGAGGGAACGCCTA  198
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTAC-TCGACAGGAGCTCAAGTCCCAGGAGCATGAGGGAACGCCTA  188

seq1  CCATGCCATGTAGGTGAATTATCACCACCGGGTCCCAGGGTTCAACATCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCATGTAGGTGAATTATCACCACCGGGTCCCAGGGTTCAACATCT  238

seq1  CAGCTCTGTTGGGGACAAGACTGTCTTTGCATAGCCC-AATGTCCCACAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAGCTCTGTTGGGGACAAGACTGTCTTTGCATAGCCCAAATGTCCCACAA  288

seq1  CTGGCCACTCTAGTTGACATAGAGTATGCCAACCTGCATCTGGATTATGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCACTCTAGTTGACATAGAGTATGCCAACCTGCATCTGGATTATGT  338

seq1  GAATGGGGGGGAGAGGGTCGCTCCTTAGAAAGGAAGATGAAAGCAGTTGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGGGGGGAGAGGGTCGCTCCTTAGAAAGGAAGATGAAAGCAGTTGT  388

seq1  GGTAGATACTTGTGTGCCCTCTAGGAATTTACTTCACAAGGTTCTTGATT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATACTTGTGTGCCCTCTAGGAATTTACTTCACAAGGTTCTTGATT  438

seq1  TAAAGAATGCTAGTATTTCCTTTGCATGTTAAGGTAAATTATCTGTTAGT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAATGCTAGTATTTCCTTTGCATGTTAAGGTAAATTATCTGTTAGT  488

seq1  ATCTATTTATCCAGACATGGACCTTAAACCCTGAAGACAACTGTTAGATC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATTTATCCAGACATGGACCTTAAACCCTGAAGACAACTGTTAGATC  538

seq1  ATTTACCAGGTTAAGAAGGCCAAAAGTACCTGTTGATTTTATCTTTTCAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACCAGGTTAAGAAGGCCAAAAGTACCTGTTGATTTTATCTTTTCAG  588

seq1  TAGTAAAACCAAATTACGTCTGCATATCTCAGTTGCTTATCATTTATAAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAAAACCAAATTACGTCTGCATATCTCAGTTGCTTATCATTTATAAT  638

seq1  GTCCTAAAGTAGATGGTATACTGTGAGAGTCTTAAGGAGAGCAAATACCT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTAAAGTAGATGGTATACTGTGAGAGTCTTAAGGAGAGCAAATACCT  688

seq1  AAAATACTTTATTTACTATAATTATGCCTAAAGTCCATTTAAAAAACATA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATACTTTATTTACTATAATTATGCCTAAAGTCCATTTAAAAAACATA  738

seq1  TTAAATTACTTTAGTTAATTTAGAATCCTCTTGCCACACACAGTATTACT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTACTTTAGTTAATTTAGAATCCTCTTGCCACACACAGTATTACT  788

seq1  TTAGAGTTAATTTAGAATATCCTTGTCAGGGCTTATGAATCACTTTCTGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGTTAATTTAGAATATCCTTGTCAGGGCTTATGAATCACTTTCTGC  838

seq1  CCAGTGACAATTTTTTCAGTTGCTTTCATTTAAAATGCAATCAATGTTTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGACAATTTTTTCAGTTGCTTTCATTTAAAATGCAATCAATGTTTG  888

seq1  CTGCTGGGCACCTTCATATAATGTCTAATGTATTTGTTTTTTAAAACAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGGCACCTTCATATAATGTCTAATGTATTTGTTTTTTAAAACAAA  938

seq1  ATGTATAAGGTCCAATTTATGATTTGATTATGTTCTGCGAAACAAATGAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATAAGGTCCAATTTATGATTTGATTATGTTCTGCGAAACAAATGAG  988

seq1  AAGCCTAGGGACTATATTTCGGAGGGCTATCAATATGCTAAAAATGACAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTAGGGACTATATTTCGGAGGGCTATCAATATGCTAAAAATGACAG  1038

seq1  GTTTGCGATTAGAATCCAAATAATAAAGTAAGAAGTATTCTAACAAAAAT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCGATTAGAATCCAAATAATAAAGTAAGAAGTATTCTAACAAAAAT  1088

seq1  AGAGATGCCACGTGAGAGCAGAGTGTGTACTGTCTGAGAATTC  1140
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGCCACGTGAGAGCAGAGTGTGTACTGTCTGAGAATTC  1131