BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168C10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 8,092,900 - 8,228,988
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneA2bp1
Downstream gene4930511J11Rik, BC024814, Abat, LOC665207, Tmem186, Pmm2, Carhsp1, EG436336, Usp7, LOC665231, 1810013L24Rik, LOC100043106
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168C10.bB6Ng01-168C10.g
ACCDH959465DH959466
length1,1451,158
definitionDH959465|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168C10, 5' end.DH959466|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168C10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(8,227,825 - 8,228,988)(8,092,900 - 8,094,083)
sequence
gaattcctgggtgaaaaggactgatgaactgatctctgccagaaataggg
agctggggacctctcctccacatcccccccagagaagagagtaaagtaac
ccatttcagaaagaaaaatctcggttgcaagtcaaatatttatgttgtac
gtaggatagtagaaattcctttttctatcagcctcttcctaacattcatt
ggcacagtgccaataaaaagtgattgctcttggagaaacttttatgatgt
gattttgactaacaaagggaagaggaaaaaaaaaacaaattaaattccag
gaagaatgacagagggcgattaagatggggccacactgtcccagacaggt
tcctctgttggaacagacaatgtagcagagttaacactcctgtagacagc
aggtgccaggacacagtgtcctgtacaaatgagtagggtaggagagatag
aaaagtacagtatgctttttaggatgcctaaggttcagaaatctcattaa
aatatcgttttaatgtaataaaaactgtaaattcactgccttcccatcct
gataataagggatatttagatcatactgaacaattgaaactcacagtaac
aagaaaataagtggttgctagacaatgttgtagagggacccttatgtggg
agggaatcggactgctgtgtaacactgagatgtgaataaatacatgctca
cctgtcaggaaaccagtgacaaaacaaagtaatgattccaccaaagccca
actttattaagtaatgagtttattggcattactatagacacataggtgag
ggtttatgtagtaggtgtgtggacaactcaaaggtggctgtagcactgaa
cacttactccagtatgcgacaactcacgaaagctggaacttaggagctat
ttgagtaattttttaaaaagatagtttgagaggctaaagctgctaacctt
tagagacttcctgatatgtatgagttgtttgccctgagtcatatagcctc
attttagacgtctgtgttatgagcttcctacatggtggatgtttgattag
gagacaattgctaccaacagactttgaactggagaagaatggggatcagg
tcttaggaaagtggtattcagtggtaatagtcagctctaatgaaa

gaattcttgtaagtgattgagggaggcaggagcattaggattggaagcaa
atggggagatgatacttaaatgctaatattttattttgtaatagtggagc
atggacccaaagccttgtgagtggcaaacaaacagactgtgactaagtca
tgcctccagcccttcaactttctaatactataattttattgatacgtaat
tgatgaaccaaagcttcggataactaacatatatttttatgcatttagac
atatagataaactcatgaaatcattgtaacaatcagggcttacaatggaa
ctgatagaatgggggaacttatgaagtggtgttgattacatcactggctt
ggacgatggaggggcaaacaaatgaggcagcttctcaaagatggatcaaa
cacaagaagctgttctagagcttccagaatgaactatgtgtggctgccat
catttgtttattcctttagaccagcacagctttctaaccttgagaagtgt
gaggtagcaaacttctgagcttatgctaatctgttacagccactggaagc
tgacacagtcctagttacaaaatgtgcagtaagtgtggttctatcctttc
tcccaaattcagtcctcccactttcaagttggtttcttctctgttttgac
ttaatcctcggtgattcaccaggactcaatacccacatcataaaaattgc
agaacatttcatgccagattctgggctttggataataattgcccacttat
atactgaccactacctccctgaatcgtcatcacgactgtatctcatgggt
ggagacacagcggttcgtcactattaagtacaacattggaaagtgctgag
accattggtctctcagactccagttttacatgtgacctcctaggaggctt
ccccaccctcacttgatccttctgcactgctgactgctcaccttacagct
tagcagagccaaatctgtatctgttacttgaaaccccaaacgcttttcac
tgtagctcagatattcacaggtggtgaaatgacaagagactacttacaag
cttgagaaacaaacatgtaacagctaagctgcagtttgttctcttcactc
tatttagcttgatgacgaataattcagggtcaaattgagctgctctaact
tatttgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_8227825_8228988
seq2: B6Ng01-168C10.b_46_1190 (reverse)

seq1  TTTCATTTTTAAGAGCTGTAACTATTAACAACTGAATAACACTTTCCT-A  49
      |||||||    |||||||  |||||| || |||||||| ||||||||| |
seq2  TTTCATT----AGAGCTG--ACTATT-ACCACTGAATACCACTTTCCTAA  43

seq1  GACCTGGATTCCCAATCTTCTCCAAGTTTCAAAGTCTGTGTGTAGCAATT  99
      ||||| ||| |||| |||||||||   ||||||||||||  |||||||||
seq2  GACCT-GATCCCCATTCTTCTCCA--GTTCAAAGTCTGTTGGTAGCAATT  90

seq1  GTCTCCTAATCAAAACATCCCACCATGTAGGGAAGCTCATTAAAACACAG  149
      ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||
seq2  GTCTCCTAATC-AAACAT-CCACCATGTA-GGAAGCTCAT---AACACAG  134

seq1  ACGTCTTAAAATGAGGGCTTATTATGACTCAGGGCAAACAACTCATACAT  199
      ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTC-TAAAATGA-GGCT--ATATGACTCAGGGCAAACAACTCATACAT  180

seq1  ATCAGGAAGTCTCTAAAGGTTAGCAGCTTTAGCCTCTCAAACTATCTTTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGAAGTCTCTAAAGGTTAGCAGCTTTAGCCTCTCAAACTATCTTTT  230

seq1  TAAAAAATTACTCAAATAGCTCCTAAGTTCCAGCTTTCGTGAGTTGTCGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAATTACTCAAATAGCTCCTAAGTTCCAGCTTTCGTGAGTTGTCGC  280

seq1  ATACTGGAGTAAGTGTTCAGTGCTACAGCCACCTTTGAGTTGTCCACACA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGAGTAAGTGTTCAGTGCTACAGCCACCTTTGAGTTGTCCACACA  330

seq1  CCTACTACATAAACCCTCACCTATGTGTCTATAGTAATGCCAATAAACTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTACATAAACCCTCACCTATGTGTCTATAGTAATGCCAATAAACTC  380

seq1  ATTACTTAATAAAGTTGGGCTTTGGTGGAATCATTACTTTGTTTTGTCAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTTAATAAAGTTGGGCTTTGGTGGAATCATTACTTTGTTTTGTCAC  430

seq1  TGGTTTCCTGACAGGTGAGCATGTATTTATTCACATCTCAGTGTTACACA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTCCTGACAGGTGAGCATGTATTTATTCACATCTCAGTGTTACACA  480

seq1  GCAGTCCGATTCCCTCCCACATAAGGGTCCCTCTACAACATTGTCTAGCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCCGATTCCCTCCCACATAAGGGTCCCTCTACAACATTGTCTAGCA  530

seq1  ACCACTTATTTTCTTGTTACTGTGAGTTTCAATTGTTCAGTATGATCTAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTTATTTTCTTGTTACTGTGAGTTTCAATTGTTCAGTATGATCTAA  580

seq1  ATATCCCTTATTATCAGGATGGGAAGGCAGTGAATTTACAGTTTTTATTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCCTTATTATCAGGATGGGAAGGCAGTGAATTTACAGTTTTTATTA  630

seq1  CATTAAAACGATATTTTAATGAGATTTCTGAACCTTAGGCATCCTAAAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAAACGATATTTTAATGAGATTTCTGAACCTTAGGCATCCTAAAAA  680

seq1  GCATACTGTACTTTTCTATCTCTCCTACCCTACTCATTTGTACAGGACAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACTGTACTTTTCTATCTCTCCTACCCTACTCATTTGTACAGGACAC  730

seq1  TGTGTCCTGGCACCTGCTGTCTACAGGAGTGTTAACTCTGCTACATTGTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTGGCACCTGCTGTCTACAGGAGTGTTAACTCTGCTACATTGTC  780

seq1  TGTTCCAACAGAGGAACCTGTCTGGGACAGTGTGGCCCCATCTTAATCGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCAACAGAGGAACCTGTCTGGGACAGTGTGGCCCCATCTTAATCGC  830

seq1  CCTCTGTCATTCTTCCTGGAATTTAATTTGTTTTTTTTTTCCTCTTCCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTCATTCTTCCTGGAATTTAATTTGTTTTTTTTTTCCTCTTCCCT  880

seq1  TTGTTAGTCAAAATCACATCATAAAAGTTTCTCCAAGAGCAATCACTTTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAGTCAAAATCACATCATAAAAGTTTCTCCAAGAGCAATCACTTTT  930

seq1  TATTGGCACTGTGCCAATGAATGTTAGGAAGAGGCTGATAGAAAAAGGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGCACTGTGCCAATGAATGTTAGGAAGAGGCTGATAGAAAAAGGAA  980

seq1  TTTCTACTATCCTACGTACAACATAAATATTTGACTTGCAACCGAGATTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTACTATCCTACGTACAACATAAATATTTGACTTGCAACCGAGATTT  1030

seq1  TTCTTTCTGAAATGGGTTACTTTACTCTCTTCTCTGGGGGGGATGTGGAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTGAAATGGGTTACTTTACTCTCTTCTCTGGGGGGGATGTGGAG  1080

seq1  GAGAGGTCCCCAGCTCCCTATTTCTGGCAGAGATCAGTTCATCAGTCCTT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTCCCCAGCTCCCTATTTCTGGCAGAGATCAGTTCATCAGTCCTT  1130

seq1  TTCACCCAGGAATTC  1164
      |||||||||||||||
seq2  TTCACCCAGGAATTC  1145


seq1: chr16_8092900_8094083
seq2: B6Ng01-168C10.g_67_1224

seq1  GAATTCTTGTAAGTGATTGAGGGAGGCAGGAGCATTAGGATTGGAAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTAAGTGATTGAGGGAGGCAGGAGCATTAGGATTGGAAGCAA  50

seq1  ATGGGGAGATGATACTTAAATGCTAATATTTTATTTTGTAATAGTGGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAGATGATACTTAAATGCTAATATTTTATTTTGTAATAGTGGAGC  100

seq1  ATGGACCCAAAGCCTTGTGAGTGGCAAACAAACAGACTGTGACTAAGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACCCAAAGCCTTGTGAGTGGCAAACAAACAGACTGTGACTAAGTCA  150

seq1  TGCCTCCAGCCCTTCAACTTTCTAATACTATAATTTTATTGATACGTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCAGCCCTTCAACTTTCTAATACTATAATTTTATTGATACGTAAT  200

seq1  TGATGAACCAAAGCTTCGGATAACTAACATATATTTTTATGCATTTAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAACCAAAGCTTCGGATAACTAACATATATTTTTATGCATTTAGAC  250

seq1  ATATAGATAAACTCATGAAATCATTGTAACAATCAGGGCTTACAATGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGATAAACTCATGAAATCATTGTAACAATCAGGGCTTACAATGGAA  300

seq1  CTGATAGAATGGGGGAACTTATGAAGTGGTGTTGATTACATCACTGGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAGAATGGGGGAACTTATGAAGTGGTGTTGATTACATCACTGGCTT  350

seq1  GGACGATGGAGGGGCAAACAAATGAGGCAGCTTCTCAAAGATGGATCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGATGGAGGGGCAAACAAATGAGGCAGCTTCTCAAAGATGGATCAAA  400

seq1  CACAAGAAGCTGTTCTAGAGCTTCCAGAATGAACTATGTGTGGCTGCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGAAGCTGTTCTAGAGCTTCCAGAATGAACTATGTGTGGCTGCCAT  450

seq1  CATTTGTTTATTCCTTTAGACCAGCACAGCTTTCTAACCTTGAGAAGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTTATTCCTTTAGACCAGCACAGCTTTCTAACCTTGAGAAGTGT  500

seq1  GAGGTAGCAAACTTCTGAGCTTATGCTAATCTGTTACAGCCACTGGAAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAGCAAACTTCTGAGCTTATGCTAATCTGTTACAGCCACTGGAAGC  550

seq1  TGACACAGTCCTAGTTACAAAATGTGCAGTAAGTGTGGTTCTATCCTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACAGTCCTAGTTACAAAATGTGCAGTAAGTGTGGTTCTATCCTTTC  600

seq1  TCCCAAATTCAGTCCTCCCACTTTCAAGTTGGTTTCTTCTCTGTTTTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAATTCAGTCCTCCCACTTTCAAGTTGGTTTCTTCTCTGTTTTGAC  650

seq1  TTAATCCTCGGTGATTCACCAGGACTCAATACCCACATCATAAAAATTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCCTCGGTGATTCACCAGGACTCAATACCCACATCATAAAAATTGC  700

seq1  AGAACATTTCATGCCAGATTCTGGGCTTTGGATAATAATTGCCCACTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACATTTCATGCCAGATTCTGGGCTTTGGATAATAATTGCCCACTTAT  750

seq1  ATACTGACCACTACCTCCCTGAATCGTCATCACGACTGTATCTCATGGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGACCACTACCTCCCTGAATCGTCATCACGACTGTATCTCATGGGT  800

seq1  GGAGACACAGCGGTTCGTCACTATTAAGTACAACATTGGAAAGTGCTGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACACAGCGGTTCGTCACTATTAAGTACAACATTGGAAAGTGCTGAG  850

seq1  ACCATTGGTCTCTCAGACTCCAGTTTTACATGTGACCTCCTAGGAGGCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTGGTCTCTCAGACTCCAGTTTTACATGTGACCTCCTAGGAGGCTT  900

seq1  CCCCACCCTCACTTGATCCTTCCTGCCACTGCTGACTGCTCACCTTACAG  950
      ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACCCTCACTTGATCCTT-CTG-CACTGCTGACTGCTCACCTTACAG  948

seq1  CTTAGCAGAGCCAAATCTGTATCTGTTACTTGGAAACCCCAAACGCTTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
seq2  CTTAGCAGAGCCAAATCTGTATCTGTTACTT-GAAACCCCAAACGC-TTT  996

seq1  TCACTGTAGCTCAGATA-TCACAGGTGGTGAAATGACAAAGGAGACTACT  1049
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  TCACTGTAGCTCAGATATTCACAGGTGGTGAAATGACAA--GAGACTACT  1044

seq1  TACCAGAGCTTGGAGAAACAACACCATGGAAACAGGCTAAAGCTGCAAGG  1099
      |||   ||||| ||||||||  | ||| | |||| ||| ||||||||  |
seq2  TAC--AAGCTT-GAGAAACA--AACAT-GTAACA-GCT-AAGCTGCA--G  1084

seq1  TTTGTTCTCTTTCAACTCTATTTTAGCTGTGATGACCGGATATAAATCAG  1149
      |||||||||||   |||||| ||||||| |||||||  || |||| ||||
seq2  TTTGTTCTCTT--CACTCTA-TTTAGCT-TGATGAC--GA-ATAATTCAG  1127

seq1  TGTTTCACAATTGACAGCTGCT-ACACTTATTTGTG  1184
       |  ||| |||||  |||||||   |||||||||||
seq2  GG--TCA-AATTG--AGCTGCTCTAACTTATTTGTG  1158


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |