BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-171L10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 28,475,504 - 28,476,453
singlet/doubletsinglet
Overlap geneFgf12
Upstream genenone
Downstream gene1600021P15Rik, EG666717, Hrasls, Atp13a5, Atp13a4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-171L10.g
ACCGA000520
length953
definitionB6Ng01-171L10.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcactgctcagtattggggtctggactgagcgaggtgggttgatgc
ccatcagtggctctgaggaaacatccttggtgacatgaacggcattgttc
ctgggaaggatatgggtcatcacaactatggctgaaatgaagcggccatc
tcagcaaggaccttgctctttcaaatcaactgcttcatttcattcaagga
gatggtactcaccttattttttatactatgtaatcaattattttgagttt
gatgatttaaggcatcagatattccccatcacgtggtaccggtgggtaca
gtttagccaggtaccatgcttagtctgctcggagactccccagactggag
catagtgtctgacatgttttagttcccaagattccttttgaagtccattc
aggctgctggcagcaattctgtccccatggttgtcaagccaggaggtagg
gcttttttgtttgtttgtttttgttttttgttttttttttcctagctgtt
agctgtgaccactctgggcttctacagcctgctctgaggcactgccatgt
ggctctctccataggtagttcacagcatggaagcttgatcatctccagat
cagcaggaaaatctcttccaggctgctaagaaggagtcttacatagcata
acccaatccaggctgccatctcatccaattcagatttcccactcccactc
aaaaagcagcaggttgcataggccacgtatgccaaggaatagagagacac
cagggatttcttagagtcctgacctgccaggagagggaagggcaatgcaa
ttggagcaccaaccatatgcacactatttttatttgtttatttatatcta
aagctgggtttcctgggtgcttgggattgccccatgttttccaagatcaa
gaaagcacattttattaaaattgttcagtcaaaccttgtgtgtaggcctg
cca
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_28475504_28476453
seq2: B6Ng01-171L10.g_65_1017 (reverse)

seq1  TGGCAGGCCTACACCACAAGGTTTGACTG-ACA--TTTTATAAAATGTGC  47
      ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||
seq2  TGGCAGGCCTACA-CACAAGGTTTGACTGAACAATTTTAATAAAATGTGC  49

seq1  TTTCTTGATCTTGGAAAACATGGGGCAATCCCAAGCACCCA-GAAACCCA  96
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTTCTTGATCTTGGAAAACATGGGGCAATCCCAAGCACCCAGGAAACCCA  99

seq1  GCTTTAAGATATAAAT-AACAAATAAAAATAGTGTGCATATGGTTGGTGC  145
      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTT-AGATATAAATAAACAAATAAAAATAGTGTGCATATGGTTGGTGC  148

seq1  TCCAATTGCATTGCCCTTCCCTCTCCTGGCAGGTCAGGACTCTAAGAAAT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATTGCATTGCCCTTCCCTCTCCTGGCAGGTCAGGACTCTAAGAAAT  198

seq1  CCCTGGTGTCTCTCTATTCCTTGGCATACGTGGCCTATGCAACCTGCTGC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGTGTCTCTCTATTCCTTGGCATACGTGGCCTATGCAACCTGCTGC  248

seq1  TTTTTGAGTGGGAGTGGGAAATCTGAATTGGATGAGATGGCAGCCTGGAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAGTGGGAGTGGGAAATCTGAATTGGATGAGATGGCAGCCTGGAT  298

seq1  TGGGTTATGCTATGTAAGACTCCTTCTTAGCAGCCTGGAAGAGATTTTCC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTATGCTATGTAAGACTCCTTCTTAGCAGCCTGGAAGAGATTTTCC  348

seq1  TGCTGATCTGGAGATGATCAAGCTTCCATGCTGTGAACTACCTATGGAGA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATCTGGAGATGATCAAGCTTCCATGCTGTGAACTACCTATGGAGA  398

seq1  GAGCCACATGGCAGTGCCTCAGAGCAGGCTGTAGAAGCCCAGAGTGGTCA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCACATGGCAGTGCCTCAGAGCAGGCTGTAGAAGCCCAGAGTGGTCA  448

seq1  CAGCTAACAGCTAGGAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAACAAACAAACAAA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAACAGCTAGGAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAACAAACAAACAAA  498

seq1  AAAGCCCTACCTCCTGGCTTGACAACCATGGGGACAGAATTGCTGCCAGC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCCTACCTCCTGGCTTGACAACCATGGGGACAGAATTGCTGCCAGC  548

seq1  AGCCTGAATGGACTTCAAAAGGAATCTTGGGAACTAAAACATGTCAGACA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGAATGGACTTCAAAAGGAATCTTGGGAACTAAAACATGTCAGACA  598

seq1  CTATGCTCCAGTCTGGGGAGTCTCCGAGCAGACTAAGCATGGTACCTGGC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCTCCAGTCTGGGGAGTCTCCGAGCAGACTAAGCATGGTACCTGGC  648

seq1  TAAACTGTACCCACCGGTACCACGTGATGGGGAATATCTGATGCCTTAAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGTACCCACCGGTACCACGTGATGGGGAATATCTGATGCCTTAAA  698

seq1  TCATCAAACTCAAAATAATTGATTACATAGTATAAAAAATAAGGTGAGTA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAAACTCAAAATAATTGATTACATAGTATAAAAAATAAGGTGAGTA  748

seq1  CCATCTCCTTGAATGAAATGAAGCAGTTGATTTGAAAGAGCAAGGTCCTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCCTTGAATGAAATGAAGCAGTTGATTTGAAAGAGCAAGGTCCTT  798

seq1  GCTGAGATGGCCGCTTCATTTCAGCCATAGTTGTGATGACCCATATCCTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGATGGCCGCTTCATTTCAGCCATAGTTGTGATGACCCATATCCTT  848

seq1  CCCAGGAACAATGCCGTTCATGTCACCAAGGATGTTTCCTCAGAGACACT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCCAGGAACAATGCCGTTCATGTCACCAAGGATGTTTCCTCAGAGCCACT  898

seq1  GATGGGCATCAACCCACCTCGCTCAGTCCAGACCCCAATACTCTGCACTG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||
seq2  GATGGGCATCAACCCACCTCGCTCAGTCCAGACCCCAATACTGAGCAGTG  948

seq1  AATTC  950
      |||||
seq2  AATTC  953