seq1: chr16_80324496_80325608
seq2: B6Ng01-178D22.b_45_1161
seq1 GAATTCTAGAGATTAGAGAAAAATAGAACTGTTAGAAAGAGTTGGGACAG 50
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seq2 GAATTCTAGAGATTAGAGAAAAATAGAACTGTTAGAAAGAGTTGGGACAG 50
seq1 TATCTGTATTAAGTATAGGTTTATCTTACCAGTGTTTATTTTCATTGAAC 100
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seq2 TATCTGTATTAAGTATAGGTTTATCTTACCAGTGTTTATTTTCATTGAAC 100
seq1 TATTGAAGATGTTGAGTATACACAACACATTTTTGCAACTCACTACCAAC 150
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seq2 TATTGAAGATGTTGAGTATACACAACACATTTTTGCAACTCACTACCAAC 150
seq1 AATCATTTCCAACTATATTTCTGGTGACATTTTCTGGAGGAGGAACAAAA 200
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seq2 AATCATTTCCAACTATATTTCTGGTGACATTTTCTGGAGGAGGAACAAAA 200
seq1 TTTCTATGTGTTATCATGATTTCAAGTGGATTTATTATTATTATAATTAT 250
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seq2 TTTCTATGTGTTATCATGATTTCAAGTGGATTTATTATTATTATAATTAT 250
seq1 TATCATTAATACTACATGGGATAAAGGTCATTTTTTACTTAATTCTGAGA 300
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seq2 TATCATTAATACTACATGGGATAAAGGTCATTTTTTACTTAATTCTGAGA 300
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seq2 GATGGAAAATCTCTTTTTTAATTTAAATTTATTTTATTTTATTTTATTTT 350
seq1 ATTTTATTTTATTTTTGAGGTAGGGTCTAACTATGTAGCTCTGGCTGGCC 400
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seq2 ATTTTATTTTATTTTTGAGGTAGGGTCTAACTATGTAGCTCTGGCTGGCC 400
seq1 TGGAACTCTCTGTATATACAGAGATCTGCCTTTGCCTTCCAAGTGCTGGT 450
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seq2 TGGAACTCTCTGTATATACAGAGATCTGCCTTTGCCTTCCAAGTGCTGGT 450
seq1 ATTAAAAGTCATGCCACCACAGCAGCAAGAAGAGATCCCTCCTTTTTAAT 500
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seq2 ATTAAAAGTCATGCCACCACAGCAGCAAGAAGAGATCCCTCCTTTTTAAT 500
seq1 TAAACATAGATTATTTTTTTGAACAATATAATATCAATACAGCCCCTCAC 550
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seq2 TAAACATAGATTATTTTTTTGAACAATATAATATCAATACAGCCCCTCAC 550
seq1 TCTTCCCAGTTAAAAATCTCTTAAGATTTAGGATGAAAAATGGCTAATGT 600
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seq2 TCTTCCCAGTTAAAAATCTCTTAAGATTTAGGATGAAAAATGGCTAATGT 600
seq1 TCAAAACTGATTCATCTTTTTTTTGTAATTAATTTTTTATTAGGTATTTT 650
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seq2 TCAAAACTGATTCATCTTTTTTTTGTAATTAATTTTTTATTAGGTATTTT 650
seq1 CCTCATTTACATTTCCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCACCCCA 700
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seq2 CCTCATTTACATTTCCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCACCCCA 700
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seq2 CTCCCCCTTTTTGGCCCTGGTGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTT 750
seq1 GCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTGCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTT 800
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seq2 GCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTGCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTT 800
seq1 TGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGTGGTACTGGTTAGTTCAT 850
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seq2 TGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGTGGTACTGGTTAGTTCAT 850
seq1 AATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGTTCCTTGGGTGCT 900
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seq2 AATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGTTCCTTGGGTGCT 900
seq1 TTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCCTATGATCCATCTTA-ATGAATCAA 949
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seq2 TTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCTTATGATCCATCTTATATGAATCAA 950
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seq2 CAAAGTCCAAATCAGAAGAAAGGGCTAAGGAAAAGACATGGTGTTTATTC 1000
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seq2 ATAGACGGATTTAATAATGGAAAAGATTGGAGGAACATAAAAGTTGTGAG 1050
seq1 ATTAGCCAGGCTAGGAAAGACAGATGTTCTCTCCAACGTGTA-GAAACTA 1094
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seq2 ATAGCCCAGGCTAGTGAAGACGAATGTTCTCTCCACCG-GTACGAACCTA 1099
seq1 CGTTTCAGTTGTTACATAC 1113
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seq2 C-CGTCAGTTGTTACATAC 1117
| seq1: chr16_6347405_6347781
seq2: B6Ng01-178D22.g_145_307 (reverse)
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seq2 -------------------------------------------------- 0
seq1 GCGTAGAATGATTACATCCAACTCATATACACTTGAAAAAGCAAGGGCAT 100
seq2 -------------------------------------------------- 0
seq1 TCTCATGAATGTATACTGCAGTTCCCACTATTAGAAAGAGAGAAAATAAG 150
seq2 -------------------------------------------------- 0
seq1 AACATTAATTGCTTTACATTCAAAAGCCCTGCTTCCATGAATGAAGGTTT 200
|
seq2 -------------------------------------------------T 1
seq1 AGACCCTACACAGGATCTTTGTTTGGTTGTGGCAGTTAGACCATGTGCCA 250
| || | ||||| || | | | | || | | | |
seq2 ACACAC-ACACACACACTATAACCCTCTCTCCC-------CCCTCT-CTA 42
seq1 TTAACACGTAACTGATACCTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 300
| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCTCTGTTCGCT-----CTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 87
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seq2 CTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACA-GAGAGAGAG 136
seq1 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA 377
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seq2 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA 163
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