BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185C05
Chromosome16 (Build37)
Map Location 4,278,424 - 4,402,222
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdcy9, EG620313
Upstream geneLOC100042251, LOC100042925, LOC100042270, LOC100042937, LOC100042283, Olfr161, Olfr162-ps1, Olfr163-ps1, LOC100042949, Mefv, EG620395, Zfp263, Olfr15, Zfp174, Zfp597, 1200013P24Rik, 1700037C18Rik, Cluap1, LOC664851, Nlrc3, Btbd12, Dnase1, Trap1, Crebbp, EG436332
Downstream geneSrl, Tcfap4, Glis2, Magmas, Coro7, Vasn, Dnaja3, Nmral1, Hmox2, 5730403B10Rik, 4930562C15Rik, 1500031H01Rik, Mgrn1, Nudt16l1, Anks3, 4930451G09Rik, Sept12, EG432995, Rogdi, 3930401K13Rik, Ubn1, Ppl, Sec14l5, Nagpa, AU021092, Alg1, 5730409G15Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185C05.bB6Ng01-185C05.g
ACCGA010330GA010331
length1,0961,091
definitionB6Ng01-185C05.b B6Ng01-185C05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,278,424 - 4,279,520)(4,401,133 - 4,402,222)
sequence
gaattcaagactagcctggtctatggagtggagtgtggctcaggacagcc
agctgttacagagaaactctgtctcaaaaacaagacaaacaagcaaacac
aaacgcattttgcaacacataatcaccttatctcctccagccgcacaaga
agatatcccccacgttgacaatgtcatgcgaggcaaaatgcgtaaggacc
aggccaggtggggtcctaccccatagggacccatgcgccctgaattatgc
tgctgtgaggactacagctggaagagggggctgcatcatcacaggctaaa
acccagctggccctacaagacggacacaggttattatttattattaaaag
tcttatttatctgtatgtgtctgctgtgagagaaggtgcttgcagaggga
aagggtgtcagatcccttggagctggggttataggcagttataagctgct
tgatgtgggtgttgggaactgaacacaggtccttcgcaagagcaatgtgt
gtccttaagcacttagccatctctccagcctaatacagggatctcaagga
agatacgttaaggctttaattttctgttttgtgctcatccataactccat
tagtggtttggtttaacgctgtggttaaaaaaggttcacatggagtcatg
gctggcgtgcctggatgatggctctgacctgctccaagctgcagtgtaca
ggactgccagcttctgcaggatgcctgctctgttgtgttttccctgggtc
caagtggcccgttctacagtcacatccggctgtctgtcatggctctctcc
taactgcaaggacatctgtggctcaccttagtggagatgaggaattctct
gcttaagttccaagttgattcaaggtcttgcctgggctggcccaggagtg
caggtgacatttttcctttgtatgctcaaagctctcaggaggtcacagtg
gcagctttttctggctgacctgagaaagactgggggtgattctctgagtt
tcacagagtatactcaatacacatgggaaaccttatgagagtagcttgta
ctgtttccacctgggccatgaatgacgactagacctatgaaaatgt
gaattcactagaaacatctggaaaactgtagaaactgttacacatatagt
aattttgtatgttctctgacacatcaccatggagaattggctacttttct
tcttctctggtttaaattgaaggtatgtgtggagttttgtcctggaaatc
ttgtcacctgatgttcagtgtactgacagtgctggcttgtcacatgtgtt
gggaaggtctgtgcttgtggaggggcactgtgcacggctagctctccccg
tgcaggctgtcagtgcctaagttgtcaatgtagtctgtcatttaaaaatg
gtgtctagcagaggtaggtggatttctgagttcaaggacagcctggtcta
caaagtgagttctaggacagccaggaagggctatacagagaaaccctgtc
tcgaaaaacaaaaaaaacaaaacaaaaacaaaacaaaacaaagcaaacaa
aaatggtgtctagttacttaggcaatttgagtatctattttctccttgga
aaagattcactaagcttgaagggtgtggatagaactgatgagatcatgtg
taggaccattggtcttactggttgttgggagaacatggattttaccctgc
tgtcctctcccaaaacctgttttcatcagcactgaaattcacatataaac
taccttgtatatgggggctcaggatatatctgattctcacattagatatg
ctcgccagagggagcatggctgccctcactctgactttcagggatggtcc
ctgaatgcctagcagaactgtgcccttcttgtggcctccttaaaccataa
tctcagtgtgccatcatcctccaggccaagacactggtgcagggcagcat
actgtgactgcagctaagaggcacattcaacaactactgctgcagtcaga
cacatgccaggtcccttcctcaccacacaaaagtccctgcctgaggaact
cgccccaaggtgagggagaccagtgatagacagatgcaaggtcagctgga
cactgcatccagtggttggtgtgaggtagggcctcagaaggtgagtgagc
aaacatgcctgaacctgccttcagtttccaagaaatgttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_4278424_4279520
seq2: B6Ng01-185C05.b_45_1140

seq1  GAATTCAAGACTAGCCTGGTCTATGGAGTGGAGTGTGGCTCAGGACAGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACTAGCCTGGTCTATGGAGTGGAGTGTGGCTCAGGACAGCC  50

seq1  AGCTGTTACAGAGAAACTCTGTCTCAAAAACAAGACAAACAAGCAAACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTTACAGAGAAACTCTGTCTCAAAAACAAGACAAACAAGCAAACAC  100

seq1  AAACGCATTTTGCAACACATAATCACCTTATCTCCTCCAGCCGCACAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGCATTTTGCAACACATAATCACCTTATCTCCTCCAGCCGCACAAGA  150

seq1  AGATATCCCCCACGTTGACAATGTCATGCGAGGCAAAATGCGTAAGGACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATCCCCCACGTTGACAATGTCATGCGAGGCAAAATGCGTAAGGACC  200

seq1  AGGCCAGGTGGGGTCCTACCCCATAGGGACCCATGCGCCCTGAATTATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAGGTGGGGTCCTACCCCATAGGGACCCATGCGCCCTGAATTATGC  250

seq1  TGCTGTGAGGACTACAGCTGGAAGAGGGGGCTGCATCATCACAGGCTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGAGGACTACAGCTGGAAGAGGGGGCTGCATCATCACAGGCTAAA  300

seq1  ACCCAGCTGGCCCTACAAGACGGACACAGGTTATTATTTATTATTAAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGCTGGCCCTACAAGACGGACACAGGTTATTATTTATTATTAAAAG  350

seq1  TCTTATTTATCTGTATGTGTCTGCTGTGAGAGAAGGTGCTTGCAGAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTTATCTGTATGTGTCTGCTGTGAGAGAAGGTGCTTGCAGAGGGA  400

seq1  AAGGGTGTCAGATCCCTTGGAGCTGGGGTTATAGGCAGTTATAAGCTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTGTCAGATCCCTTGGAGCTGGGGTTATAGGCAGTTATAAGCTGCT  450

seq1  TGATGTGGGTGTTGGGAACTGAACACAGGTCCTTCGCAAGAGCAATGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGGGTGTTGGGAACTGAACACAGGTCCTTCGCAAGAGCAATGTGT  500

seq1  GTCCTTAAGCACTTAGCCATCTCTCCAGCCTAATACAGGGATCTCAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTAAGCACTTAGCCATCTCTCCAGCCTAATACAGGGATCTCAAGGA  550

seq1  AGATACGTTAAGGCTTTAATTTTCTGTTTTGTGCTCATCCATAACTCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACGTTAAGGCTTTAATTTTCTGTTTTGTGCTCATCCATAACTCCAT  600

seq1  TAGTGGTTTGGTTTAACGCTGTGGTTAAAAAAGGTTCACATGGAGTCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGTTTGGTTTAACGCTGTGGTTAAAAAAGGTTCACATGGAGTCATG  650

seq1  GCTGGCGTGCCTGGATGATGGCTCTGACCTGCTCCAAGCTGCAGTGTACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCGTGCCTGGATGATGGCTCTGACCTGCTCCAAGCTGCAGTGTACA  700

seq1  GGACTGCCAGCTTCTGCAGGATGCCTGCTCTGTTGTGTTTTCCCTGGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGCCAGCTTCTGCAGGATGCCTGCTCTGTTGTGTTTTCCCTGGGTC  750

seq1  CAAGTGGCCCGTTCTACAGTCACATCCGGCTGTCTGTCATGGCTCTCTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGGCCCGTTCTACAGTCACATCCGGCTGTCTGTCATGGCTCTCTCC  800

seq1  TAACTGCAAGGACATCTGTGGCTCACCTTAGTGGAGATGAGGAATTCTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGCAAGGACATCTGTGGCTCACCTTAGTGGAGATGAGGAATTCTCT  850

seq1  GCTTAAGTTCCAAGTTGATTCAAGGTCTTGCCTGGGCTGGCCCAGGAGTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAGTTCCAAGTTGATTCAAGGTCTTGCCTGGGCTGGCCCAGGAGTG  900

seq1  CAGGTGACATTTTTCCTTTGTATGCTCAAAGCTCTCAGGAGGTCACAGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGACATTTTTCCTTTGTATGCTCAAAGCTCTCAGGAGGTCACAGTG  950

seq1  GCAGCTTTTTCTGGCTGACCTGAGAAAGAACTGGGGGTGATTCTCTGAGT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTTTTTCTGGCTGACCTGAGAAAG-ACTGGGGGTGATTCTCTGAGT  999

seq1  TTCACAGGAGTATACTCAATACACATGGGAA--CCTATGAGGAGTAAGCT  1048
      |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||
seq2  TTCACA-GAGTATACTCAATACACATGGGAAACCTTATGA-GAGT-AGCT  1046

seq1  TGTACTGTTTCCACCTGGGCCATGAATGACGACTAGACCTA-GAAAATGT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGTACTGTTTCCACCTGGGCCATGAATGACGACTAGACCTATGAAAATGT  1096

seq1: chr16_4401133_4402222
seq2: B6Ng01-185C05.g_65_1155 (reverse)

seq1  TAAACATCTCCTGGAAACTGAA-GCAGTTTCA-GCATGTTTTCCCTCACT  48
      ||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||
seq2  TAAACATTTCTTGGAAACTGAAGGCAGGTTCAGGCATGTTT--GCTCACT  48

seq1  CACCTTCTGA-GCCCTACCTCACACC-ACCACTGGATGCAGTGTCCAGCT  96
      |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTCTGAGGCCCTACCTCACACCAACCACTGGATGCAGTGTCCAGCT  98

seq1  GACCTTGCATCTGTCTATCACTGGTCTCCCTCACCTTGGGGCGAGTTCCC  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GACCTTGCATCTGTCTATCACTGGTCTCCCTCACCTTGGGGCGAGTT-CC  147

seq1  TCAGGCAGGGACTTTTGTTGTGGTGA-GAAGGGACCTGGCATGTGTCTGA  195
      ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCAGGGACTTTTG-TGTGGTGAGGAAGGGACCTGGCATGTGTCTGA  196

seq1  CTGCAGCAGTAGTTGTTGAATGTGCCTCTTAGCTGCAGTCACAGTATGCT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGCAGTAGTTGTTGAATGTGCCTCTTAGCTGCAGTCACAGTATGCT  246

seq1  GCCCTGCACCAGTGTCTTGGCCTGGAGGATGATGGCACACTGAGATTATG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGCACCAGTGTCTTGGCCTGGAGGATGATGGCACACTGAGATTATG  296

seq1  GTTTAAGGAGGCCACAAGAAGGGCACAGTTCTGCTAGGCATTCAGGGACC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAGGAGGCCACAAGAAGGGCACAGTTCTGCTAGGCATTCAGGGACC  346

seq1  ATCCCTGAAAGTCAGAGTGAGGGCAGCCATGCTCCCTCTGGCGAGCATAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGAAAGTCAGAGTGAGGGCAGCCATGCTCCCTCTGGCGAGCATAT  396

seq1  CTAATGTGAGAATCAGATATATCCTGAGCCCCCATATACAAGGTAGTTTA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGTGAGAATCAGATATATCCTGAGCCCCCATATACAAGGTAGTTTA  446

seq1  TATGTGAATTTCAGTGCTGATGAAAACAGGTTTTGGGAGAGGACAGCAGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAATTTCAGTGCTGATGAAAACAGGTTTTGGGAGAGGACAGCAGG  496

seq1  GTAAAATCCATGTTCTCCCAACAACCAGTAAGACCAATGGTCCTACACAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATCCATGTTCTCCCAACAACCAGTAAGACCAATGGTCCTACACAT  546

seq1  GATCTCATCAGTTCTATCCACACCCTTCAAGCTTAGTGAATCTTTTCCAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCATCAGTTCTATCCACACCCTTCAAGCTTAGTGAATCTTTTCCAA  596

seq1  GGAGAAAATAGATACTCAAATTGCCTAAGTAACTAGACACCATTTTTGTT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAATAGATACTCAAATTGCCTAAGTAACTAGACACCATTTTTGTT  646

seq1  TGCTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTTTTTCGAGACAG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTTTTTCGAGACAG  696

seq1  GGTTTCTCTGTATAGCCCTTCCTGGCTGTCCTAGAACTCACTTTGTAGAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCTCTGTATAGCCCTTCCTGGCTGTCCTAGAACTCACTTTGTAGAC  746

seq1  CAGGCTGTCCTTGAACTCAGAAATCCACCTACCTCTGCTAGACACCATTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGTCCTTGAACTCAGAAATCCACCTACCTCTGCTAGACACCATTT  796

seq1  TTAAATGACAGACTACATTGACAACTTAGGCACTGACAGCCTGCACGGGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATGACAGACTACATTGACAACTTAGGCACTGACAGCCTGCACGGGG  846

seq1  AGAGCTAGCCGTGCACAGTGCCCCTCCACAAGCACAGACCTTCCCAACAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTAGCCGTGCACAGTGCCCCTCCACAAGCACAGACCTTCCCAACAC  896

seq1  ATGTGACAAGCCAGCACTGTCAGTACACTGAACATCAGGTGACAAGATTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACAAGCCAGCACTGTCAGTACACTGAACATCAGGTGACAAGATTT  946

seq1  CCAGGACAAAACTCCACACATACCTTCAATTTAAACCAGAGAAGAAGAAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACAAAACTCCACACATACCTTCAATTTAAACCAGAGAAGAAGAAA  996

seq1  AGTAGCCAATTCTCCATGGTGATGTGTCAGAGAACATACAAAATTACTAT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCCAATTCTCCATGGTGATGTGTCAGAGAACATACAAAATTACTAT  1046

seq1  ATGTGTAACAGTTTCTACAGTTTTCCAGATGTTTCTAGTGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTAACAGTTTCTACAGTTTTCCAGATGTTTCTAGTGAATTC  1091