BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-199H23
Chromosome16 (Build37)
Map Location 22,492,226 - 22,633,556
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDgkg, LOC671242
Upstream geneVps8, 2510009E07Rik, Ehhadh, LOC100043489, LOC546659, Map3k13, LOC624037, Tmem41a, Liph, Senp2, EG239760, Igf2bp2, EG545152, EG666421, Sfrs10, LOC100043507, Etv5
Downstream geneLOC666459, Crygs, Tbccd1, Dnajb11, Ahsg, Fetub, Hrg, Kng2, LOC624311, LOC666486, LOC666489, Kng1, LOC666493, Eif4a2, Rfc4, Adipoq, LOC100043541, EG625835, BC106179, St6gal1, Rtp1, Masp1, LOC100043018, Rtp4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-199H23.bB6Ng01-199H23.g
ACCGA020817GA020818
length1,0011,087
definitionB6Ng01-199H23.b B6Ng01-199H23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,632,594 - 22,633,556)(22,492,226 - 22,493,292)
sequence
gaattcttagatattactcatatttgttattcatgaactcaaattagctc
attactaagttccctggcagctctaattcaattatctgtgaagttagctt
ggtctaaaggttccagagctcctgccccgacactgacacatgcctcaaac
cctgtgaccgagggaagaccacactggtatcattttaatgtcagttctgt
tctgagtcatttgtagctttcagctactcatatggttgcttttaagttag
gagttataactcccttggcttcataggtatcatttagtcagagaaggtga
atcagttagccctactgcgtgtggtgacatttgcatcaaagttattttta
gcctacgattttccagtgagtaggttttaagacacaaactagttgcagtt
tgagatgaaccatgcaaatccataccgagaagatacatgggaaattttca
ttcagaagaacttgtagagctgtttggttatctgtgactgcaactaacta
ccccaaaacttagtggctcaacagtcactttactaatccacataatgata
tgcactgggaatgtaggcaaggtatagcaggaaccagttgtctttgctcc
atgcagttcatgttaaagctacagaatccaagatggcatctctcctgaca
tgctcagcaccatggctaagacagcttttgtgattcagtgagtgatgtga
ctggagtcttcagatttcatcgtcatctgggttccttggttctctctgtg
atggtaatccttgccctgccctgtggtcttcccatgtggtctctatgggc
tatctccaaccatgtgtggctgaacttcttccaaggaggtttggaaacct
caataagacaaatggaaaggcactggctctggtcgaagctttcaacctga
tagtcacaatgttgttcagtatctttgtggttcaagtaggtcacaagcac
agttctagacttcaaggctctaaaatacaggacaagtggttagtgggtga
t
gaattccatgtttggaaagctagaacttagactctagatccagacccagc
aattgagctgtgtaacttctccacacgtcatttttctagtatataaaact
ttatcatgacatttttggggggttgagggaggagccaggccaaccagcaa
agtcctccccatgactggagagggtgctgggaatgcagattctgatccag
catgtctgtgtgggccttgacagtctgcactgcactcaagtgatgcccat
cctcttgggtcatggaccatttgaagttctagagcacagactagctggcc
atggcatgaaggccaaatacagcccgctatttgtttttgttaataaagct
ttattgaaactcagacccatacactcattcaattattctccagggctact
tttacggctaagtcaactgagttgggaagttgcattggagactctggcac
acaaagcctagttacatatcttaatatagaaaatattttctgccccctag
gagactgaagaggagtgaagattgttctctgtggactagaagacctatat
ttcaatccaagtttgaccaagggcaagccgctctaccttgctgtctcttt
ctcctcatctagaggataaaattatcactaaaaatttaagagacctatgg
ttccggtttcagaactacgtagaaaagtgtgtttctactgaaagcaggca
tctaaaacccacattgtgcagccttcatctggacactacaaaaaatgggg
gtggggcgggaggattggccttacctgcagaatcctgctggtcactttca
tagaccacagttccctttctgacagagtcaattgggaatagagaagagct
tagagggggaggccagaggcaggctttcccaagctgcaacacaggctgtc
cactgtcagagagggtcctggggatcctgagtgctgccatcaattcttca
caggaacttccatttttccttgatagtccaaccttaaaaacagtctccct
agcacacccaatgactccattgtgtccccgctccatggtgaccaaccagt
acttcagaagcccatcctgagctctcagagacctctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_22632594_22633556
seq2: B6Ng01-199H23.b_40_1004 (reverse)

seq1  TTGAAGTCTAG-ACTGTGCTTGTGACCTACTTGAACCACAAAGATACTGA  49
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTGAAGTCTAGAACTGTGCTTGTGACCTACTTGAACCACAAAGATACTG-  49

seq1  AACAACATTGTGACTATCAGGTTG-AAGCTTCGACCAGAGCCAGTGCC-T  97
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
seq2  AACAACATTGTGACTATCAGGTTGAAAGCTTCGACCAGAGCCAGTGCCTT  99

seq1  TCCATTTGTCTTATTGAGGTTTCCAAACCTCCTTGGAAGAAGTTCAGCCA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTGTCTTATTGAGGTTTCCAAACCTCCTTGGAAGAAGTTCAGCCA  149

seq1  CACATGGTTGGAGATAGCCCATAGAGACCACATGGGAAGACCACAGGGCA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGTTGGAGATAGCCCATAGAGACCACATGGGAAGACCACAGGGCA  199

seq1  GGGCAAGGATTACCATCACAGAGAGAACCAAGGAACCCAGATGACGATGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGGATTACCATCACAGAGAGAACCAAGGAACCCAGATGACGATGA  249

seq1  AATCTGAAGACTCCAGTCACATCACTCACTGAATCACAAAAGCTGTCTTA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGAAGACTCCAGTCACATCACTCACTGAATCACAAAAGCTGTCTTA  299

seq1  GCCATGGTGCTGAGCATGTCAGGAGAGATGCCATCTTGGATTCTGTAGCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGTGCTGAGCATGTCAGGAGAGATGCCATCTTGGATTCTGTAGCT  349

seq1  TTAACATGAACTGCATGGAGCAAAGACAACTGGTTCCTGCTATACCTTGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATGAACTGCATGGAGCAAAGACAACTGGTTCCTGCTATACCTTGC  399

seq1  CTACATTCCCAGTGCATATCATTATGTGGATTAGTAAAGTGACTGTTGAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTCCCAGTGCATATCATTATGTGGATTAGTAAAGTGACTGTTGAG  449

seq1  CCACTAAGTTTTGGGGTAGTTAGTTGCAGTCACAGATAACCAAACAGCTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAAGTTTTGGGGTAGTTAGTTGCAGTCACAGATAACCAAACAGCTC  499

seq1  TACAAGTTCTTCTGAATGAAAATTTCCCATGTATCTTCTCGGTATGGATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGTTCTTCTGAATGAAAATTTCCCATGTATCTTCTCGGTATGGATT  549

seq1  TGCATGGTTCATCTCAAACTGCAACTAGTTTGTGTCTTAAAACCTACTCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGGTTCATCTCAAACTGCAACTAGTTTGTGTCTTAAAACCTACTCA  599

seq1  CTGGAAAATCGTAGGCTAAAAATAACTTTGATGCAAATGTCACCACACGC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAAATCGTAGGCTAAAAATAACTTTGATGCAAATGTCACCACACGC  649

seq1  AGTAGGGCTAACTGATTCACCTTCTCTGACTAAATGATACCTATGAAGCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGGCTAACTGATTCACCTTCTCTGACTAAATGATACCTATGAAGCC  699

seq1  AAGGGAGTTATAACTCCTAACTTAAAAGCAACCATATGAGTAGCTGAAAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAGTTATAACTCCTAACTTAAAAGCAACCATATGAGTAGCTGAAAG  749

seq1  CTACAAATGACTCAGAACAGAACTGACATTAAAATGATACCAGTGTGGTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAAATGACTCAGAACAGAACTGACATTAAAATGATACCAGTGTGGTC  799

seq1  TTCCCTCGGTCACAGGGTTTGAGGCATGTGTCAGTGTCGGGGCAGGAGCT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCGGTCACAGGGTTTGAGGCATGTGTCAGTGTCGGGGCAGGAGCT  849

seq1  CTGGAACCTTTAGACCAAGCTAACTTCACAGATAATTGAATTAGAGCTGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACCTTTAGACCAAGCTAACTTCACAGATAATTGAATTAGAGCTGC  899

seq1  CAGGGAACTTAGTAATGAGCTAATTTGAGTTCATGAATAACAAATATGAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAACTTAGTAATGAGCTAATTTGAGTTCATGAATAACAAATATGAG  949

seq1  TAATATCTAAGAATTC  963
      ||||||||||||||||
seq2  TAATATCTAAGAATTC  965

seq1: chr16_22492226_22493292
seq2: B6Ng01-199H23.g_63_1149

seq1  GAATTCCATGTTTGGAAAGCTAGAACTTAGACTCTAGATCCAGACCCAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGTTTGGAAAGCTAGAACTTAGACTCTAGATCCAGACCCAGC  50

seq1  AATTGAGCTGTGTAACTTCTCCACACGTCATTTTTCTAGTATATAAAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAGCTGTGTAACTTCTCCACACGTCATTTTTCTAGTATATAAAACT  100

seq1  TTATCATGACATTTTTGGGGGGTTGAGGGAGGAGCCAGGCCAACCAGCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATGACATTTTTGGGGGGTTGAGGGAGGAGCCAGGCCAACCAGCAA  150

seq1  AGTCCTCCCCATGACTGGAGAGGGTGCTGGGAATGCAGATTCTGATCCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTCCCCATGACTGGAGAGGGTGCTGGGAATGCAGATTCTGATCCAG  200

seq1  CATGTCTGTGTGGGCCTTGACAGTCTGCACTGCACTCAAGTGATGCCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCTGTGTGGGCCTTGACAGTCTGCACTGCACTCAAGTGATGCCCAT  250

seq1  CCTCTTGGGTCATGGACCATTTGAAGTTCTAGAGCACAGACTAGCTGGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTGGGTCATGGACCATTTGAAGTTCTAGAGCACAGACTAGCTGGCC  300

seq1  ATGGCATGAAGGCCAAATACAGCCCGCTATTTGTTTTTGTTAATAAAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATGAAGGCCAAATACAGCCCGCTATTTGTTTTTGTTAATAAAGCT  350

seq1  TTATTGAAACTCAGACCCATACACTCATTCAATTATTCTCCAGGGCTACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGAAACTCAGACCCATACACTCATTCAATTATTCTCCAGGGCTACT  400

seq1  TTTACGGCTAAGTCAACTGAGTTGGGAAGTTGCATTGGAGACTCTGGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACGGCTAAGTCAACTGAGTTGGGAAGTTGCATTGGAGACTCTGGCAC  450

seq1  ACAAAGCCTAGTTACATATCTTAATATAGAAAATATTTTCTGCCCCCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCCTAGTTACATATCTTAATATAGAAAATATTTTCTGCCCCCTAG  500

seq1  GAGACTGAAGAGGAGTGAAGATTGTTCTCTGTGGACTAGAAGACCTATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTGAAGAGGAGTGAAGATTGTTCTCTGTGGACTAGAAGACCTATAT  550

seq1  TTCAATCCAAGTTTGACCAAGGGCAAGCCGCTCTACCTTGCTGTCTCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCCAAGTTTGACCAAGGGCAAGCCGCTCTACCTTGCTGTCTCTTT  600

seq1  CTCCTCATCTAGAGGATAAAATTATCACTAAAAATTTAAGAGACCTATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCATCTAGAGGATAAAATTATCACTAAAAATTTAAGAGACCTATGG  650

seq1  TTCCGGTTTCAGAACTACGTAGAAAAGTGTGTTTCTACTG-AAGCAGGCA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTCCGGTTTCAGAACTACGTAGAAAAGTGTGTTTCTACTGAAAGCAGGCA  700

seq1  TCTAAAACCCACATTGTGCAGCCTTCATCTGGACACTACAAAAAATGGGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAACCCACATTGTGCAGCCTTCATCTGGACACTACAAAAAATGGGG  750

seq1  GTGGGGCGGGAGGATTGGCCTTACCTGCAGAATCCTGCTGGTCAC-TTCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTGGGGCGGGAGGATTGGCCTTACCTGCAGAATCCTGCTGGTCACTTTCA  800

seq1  TAGACCACAGTT-CCTTTCTGACAGAGTCAATTGGGAATAGAGAGGAGCT  847
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TAGACCACAGTTCCCTTTCTGACAGAGTCAATTGGGAATAGAGAAGAGCT  850

seq1  TAGAGGGGGAGGCCAGAGGCAGGCTTTCCCAAGCTGCAACACAGGCTGT-  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TAGAGGGGGAGGCCAGAGGCAGGCTTTCCCAAGCTGCAACACAGGCTGTC  900

seq1  CACTGTCAGAGA-GGTCCT-GGGATCCTGAGTGCTGCCATC-ATTCTTCA  943
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CACTGTCAGAGAGGGTCCTGGGGATCCTGAGTGCTGCCATCAATTCTTCA  950

seq1  CAAGAAC-TCCATTTT--CCTGATAGTCCAA-CTTAAAAACAG-CCCCCT  988
      || |||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||
seq2  CAGGAACTTCCATTTTTCCTTGATAGTCCAACCTTAAAAACAGTCTCCCT  1000

seq1  AGCACACC--ATGACTCCA-TGTGTCCCCGCT-CAT-GTGACCAACCAGT  1033
      ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  AGCACACCCAATGACTCCATTGTGTCCCCGCTCCATGGTGACCAACCAGT  1050

seq1  AC-TCAGAAGCCCAT-CTGAGGCCTCAGAGA-CTCTG  1067
      || |||||||||||| |||||  |||||||| |||||
seq2  ACTTCAGAAGCCCATCCTGAGCTCTCAGAGACCTCTG  1087