BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203D23
Chromosome16 (Build37)
Map Location 34,076,702 - 34,252,656
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKalrn
Upstream geneLmln, LOC638791, Osbpl11, Snx4, Zfp148, Slc12a8, 4632417D23Rik, Heg1, Muc13, Itgb5, Umps, LOC100043670
Downstream geneRopn1, Ccdc14, Mylk, Ptplb, Adcy5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203D23.bB6Ng01-203D23.g
ACCGA023515GA023516
length4611,165
definitionB6Ng01-203D23.b B6Ng01-203D23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(34,252,190 - 34,252,656)(34,076,702 - 34,077,885)
sequence
atccctagttctcttgcaaaaaagatggtgtcaggtcatggcagcacttc
cgtagattggtttgttaacagctaacctgattcacagccactttgccacc
atgctcctccgtcacttttaatatagcaaggcctctccctctctccttcc
cccactctgccacagggactcagcgatgtccaacaacaagacaccccaca
gtagctctatcagccatattgagtctgtcctccagcagctggacgatgct
caggtacagatggaagagctgtttcacgagcggaagatcaagctggacat
cttcctacagctgcgcatctttgaacagtacaccattgaggtaggagcgg
ggagcgggaggagaagatggggaaggaggagaagggggatagtgtatgtt
ctgagggaactattccaggcggggccactgctgcatccatggaaaaatta
aatggattgtg
gaattccagtcctcagaatctacaagtcagaggctcacagagcagatagg
ctagcatgcatgatgaacagaagagagcctgcctcaaacatgatggcagg
tgaagatggacacctgagattgctctctgacctccagacacactgcagca
catgcccaacacacatgtgtatacacacacacacacacacacacacacac
acacacagaacaaacaagcaaacaaaagaccccatattcttaaaatccac
tggcttatctggtcaaattccttctcatttatttatatattaatagacta
ctttaataaactgccttttaaagtcttgtttcttcataatgtttatatat
ctacttattacagggggtattattttgttactttgaatcatagtaagata
tacatatctttaaaaaaatcaccatttaaaactatgcataatttggtggc
attaaaaaatcttcataatgttgtgcaaccattgctgctatctctataaa
ttctcctatgctgccctgtgctgagaacatacaacacaaagacctgtgct
gagaacatacaacacaaagacgtgttgaacacctcagggccctatttgtt
tcacaccaacaattctctgtgtacacaggtgctagtgtttgcctatttta
gcactgagactgatatgaaggggttaagttccttatggtggatcacaggg
tcagcagatgtcagggctaatactcaaggcttgtctgaagggcttcagag
tctacgccttccgtggtttggggttccactcagatcaaggaacagagagg
aatgaaagtaacccaacctattatctctacatagaagatgaatttaaaaa
tacctccatgggaactgtgaattaggaagaggtctgaagattttcaagtc
tgatagaatgggaaattgcatagaactttcccctctttatttaatggaat
aattcattttaagaatcataaaacaatatttataagctttcatgagctca
tatgaagctcatctctcagactattttccaccataagacactcactttga
aacttctatcacgtgtatgcagaaaacagcttgtgttggaacagagaaat
agtcacatgcatcaggaagctctctccagctcaagccagtgactttccca
gatcactctagctcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_34252190_34252656
seq2: B6Ng01-203D23.b_45_511 (reverse)

seq1  CACAATCCCTCTGATTTTTCCATGGATGCAGCAGTGGCCCCGCCTGGAAT  50
      |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATCCATTTAATTTTTCCATGGATGCAGCAGTGGCCCCGCCTGGAAT  50

seq1  GGTTCCCTCAGGACATACACTATCCCCCTTCTCCTCCTTCCCCATCTTCT  100
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCCTCAGAACATACACTATCCCCCTTCTCCTCCTTCCCCATCTTCT  100

seq1  CCTCCCGCTCCCCGCTCCTACCTCAATGGTGTACTGTTCAAAGATGCGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCGCTCCCCGCTCCTACCTCAATGGTGTACTGTTCAAAGATGCGCA  150

seq1  GCTGTAGGAAGATGTCCAGCTTGATCTTCCGCTCGTGAAACAGCTCTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAGGAAGATGTCCAGCTTGATCTTCCGCTCGTGAAACAGCTCTTCC  200

seq1  ATCTGTACCTGAGCATCGTCCAGCTGCTGGAGGACAGACTCAATATGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTACCTGAGCATCGTCCAGCTGCTGGAGGACAGACTCAATATGGCT  250

seq1  GATAGAGCTACTGTGGGGTGTCTTGTTGTTGGACATCGCTGAGTCCCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGAGCTACTGTGGGGTGTCTTGTTGTTGGACATCGCTGAGTCCCTGT  300

seq1  GGCAGAGTGGGGGAAGGAGAGAGGGAGAGGCCTTGCTATATTAAAAGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGTGGGGGAAGGAGAGAGGGAGAGGCCTTGCTATATTAAAAGTGA  350

seq1  CGGAGGAGCATGGTGGCAAAGTGGCTGTGAATCAGGTTAGCTGTTAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGGAGCATGGTGGCAAAGTGGCTGTGAATCAGGTTAGCTGTTAACAA  400

seq1  ACCAATCTACGGAAGTGCTGCCATGACCTGACACCATCTTTTTTGCAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATCTACGGAAGTGCTGCCATGACCTGACACCATCTTTTTTGCAAGA  450

seq1  GAACTAGGGATGAATTC  467
      |||||||||||||||||
seq2  GAACTAGGGATGAATTC  467

seq1: chr16_34076702_34077885
seq2: B6Ng01-203D23.g_64_1228

seq1  GAATTCCAGTCCTCAGAATCTACAAGTCAGAGGCTCACAGAGCAGATAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTCCTCAGAATCTACAAGTCAGAGGCTCACAGAGCAGATAGG  50

seq1  CTAGCATGCATGATGAACAGAAGAGAGCCTGCCTCAAACATGATGGCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCATGCATGATGAACAGAAGAGAGCCTGCCTCAAACATGATGGCAGG  100

seq1  TGAAGATGGACACCTGAGATTGCTCTCTGACCTCCAGACACACTGCAGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATGGACACCTGAGATTGCTCTCTGACCTCCAGACACACTGCAGCA  150

seq1  CATGCCCAACACACATGTGTATACACACACACACACACACACACACACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCCAACACACATGTGTATACACACACACACACACACACACACACAC  200

seq1  ACACACAGAACAAACAAGCAAACAAAAGACCCCATATTCTTAAAATCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAGAACAAACAAGCAAACAAAAGACCCCATATTCTTAAAATCCAC  250

seq1  TGGCTTATCTGGTCAAATTCCTTCTCATTTATTTATATATTAATAGACTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTATCTGGTCAAATTCCTTCTCATTTATTTATATATTAATAGACTA  300

seq1  CTTTAATAAACTGCCTTTTAAAGTCTTGTTTCTTCATAATGTTTATATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAATAAACTGCCTTTTAAAGTCTTGTTTCTTCATAATGTTTATATAT  350

seq1  CTACTTATTACAGGGGGTATTATTTTGTTACTTTGAATCATAGTAAGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTATTACAGGGGGTATTATTTTGTTACTTTGAATCATAGTAAGATA  400

seq1  TACATATCTTTAAAAAAATCACCATTTAAAACTATGCATAATTTGGTGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATCTTTAAAAAAATCACCATTTAAAACTATGCATAATTTGGTGGC  450

seq1  ATTAAAAAATCTTCATAATGTTGTGCAACCATTGCTGCTATCTCTATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAAATCTTCATAATGTTGTGCAACCATTGCTGCTATCTCTATAAA  500

seq1  TTCTCCTATGCTGCCCTGTGCTGAGAACATACAACACAAAGACCTGTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTATGCTGCCCTGTGCTGAGAACATACAACACAAAGACCTGTGCT  550

seq1  GAGAACATACAACACAAAGACGTGTTGAACACCTCAGGGCCCTATTTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACATACAACACAAAGACGTGTTGAACACCTCAGGGCCCTATTTGTT  600

seq1  TCACACCAACAATTCTCTGTGTACACAGGTGCTAGTGTTTGCCTATTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACCAACAATTCTCTGTGTACACAGGTGCTAGTGTTTGCCTATTTTA  650

seq1  GCACTGAGACTGATATGAAGGGGTTAAGTTCCTTATGGTGGATCACAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAGACTGATATGAAGGGGTTAAGTTCCTTATGGTGGATCACAGGG  700

seq1  TCAGCAGATGTCAGGGCTAATACTCAAGGCTTGTCTGAAGGGCTTCAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGATGTCAGGGCTAATACTCAAGGCTTGTCTGAAGGGCTTCAGAG  750

seq1  TCTACGCCTTCCGTGGTTTGGGGTTCCACTCAGATCAAGGAACAGAGAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACGCCTTCCGTGGTTTGGGGTTCCACTCAGATCAAGGAACAGAGAGG  800

seq1  AATGAAAGTAACCCAACCTATTATCTCTACATAGAAGATGAATTTAAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAAGTAACCCAACCTATTATCTCTACATAGAAGATGAATTTAAAAA  850

seq1  TACCTCCAT-GGAACTGTGAATTAGGAAGAGGTCTGAAGATTTTCAAGTC  899
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCCATGGGAACTGTGAATTAGGAAGAGGTCTGAAGATTTTCAAGTC  900

seq1  TGATAGAAT-GGAAATTGCATAGAACTTTCCCCTCTTTATTTAATGGAAT  948
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAATGGGAAATTGCATAGAACTTTCCCCTCTTTATTTAATGGAAT  950

seq1  AATTCATTTTAAGAATCATAAAACAATATTTATAAGGCTTTCATGAGCTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AATTCATTTTAAGAATCATAAAACAATATTTATAA-GCTTTCATGAGCTC  999

seq1  ATATGAAGCCTTCATCTCTCAGACCTATTTTCCACCATTAGACACCTCAA  1048
      |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |
seq2  ATATGAAGC--TCATCTCTCAGA-CTATTTTCCACCATAAGACA-CTC-A  1044

seq1  CTTTGAAACCTTCTATCACGTGGTTATGCAG-AAACAGCCTTTGTGGTTG  1097
      |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||
seq2  CTTTGAAA-CTTCTATCACGTG--TATGCAGAAAACAGC--TTGT-GTTG  1088

seq1  GGGAACAGAAATAGTTCAACAGTGGCATCAGGAAAAGCTCTCTCCAGGGC  1147
      |   | |||||||||    ||   ||||||||  ||||||||||||  ||
seq2  GAACAGAGAAATAGT----CACATGCATCAGG--AAGCTCTCTCCA--GC  1130

seq1  TCAGAGGCCAGTGACTTCCACAGTCCACTCTAGCTCG  1184
      ||  | ||||||||||| | |||  ||||||||||||
seq2  TC--AAGCCAGTGACTTTCCCAGATCACTCTAGCTCG  1165