BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-206F18
Chromosome16 (Build37)
Map Location 34,153,875 - 34,295,566
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKalrn
Upstream geneOsbpl11, Snx4, Zfp148, Slc12a8, 4632417D23Rik, Heg1, Muc13, Itgb5, Umps, LOC100043670
Downstream geneRopn1, Ccdc14, Mylk, Ptplb, Adcy5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-206F18.bB6Ng01-206F18.g
ACCGA025795GA025796
length1,1531,116
definitionB6Ng01-206F18.b B6Ng01-206F18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(34,153,875 - 34,155,034)(34,294,446 - 34,295,566)
sequence
gaattcacatccatctcttttcaactcatgagacctccccccattgacca
gtcctgcagtggtttctcaatgtctcagacaaatatctaacaagggcagc
aggaacagcgttggcaggagagtaatacacaacagaccctactggcagag
atctcttacgcttacacagtacccctgttatacttttcttaaactctttc
agggtctcgcgccctaccaagcctagatgtaacatttaattgagaaagag
aaatatagaaaaggctgcctgttcctgtagatgtttgatggcaatggact
taaaaatgtgtgatttttgtgtatggctagagcccatgacatgcggcaac
ctgtagtttccctatggtatggggctggtttggccagactacaaggcagt
ctgaaggagtaaattgctaagtgggctagtgagtgtgggcagattagaaa
cccagtatctaggtgaaacaatgggttattgttcctctaaggaaaaatgg
caagcttctagtagccactagcagagtagaggattttaaatggcaatggg
tcccagggaagagaacagtgcagggtctcgacttcaggtttcacatggag
tccagggctgccttacacctgtcccatggaaatgagagatccgggtcaaa
actctcccaggcagaatttcagccgaggagaggaaacgtgggcatattta
ttctagctgtcctgagctcagggaaggtgggtgacactccagaaggcaga
gggagaagagattttcaagaaagcctggagctgcctatgtgctcatggaa
gtcactcagggtgcccaatgacatcactatagtatgcttaaagggctcaa
gaatatgaaagcacaatttcctcagtctaatgttgtcctaataggaacaa
aggaaaggggcgtgtgtcagcgatgctcactcaatagtcaatagtctcat
gccatgttgctaccattcctaggctagttaatatatgcgctatacagccc
aaagaatctatctcaatggtagattggataattttataaacattggattt
gccttctgttatctttattacatgactaatagtttacagaattttgatct
tcatgtgccaagagctgagggtttaacatgcatcgtgccacatacttttt
gtg
gaattccagagccgcatgtgaaactccagtgtgtggtataactgacagta
ctgctagggtccactgagaagcccatcagcctgctgtatgtatagatgtg
cccacaaagctaggttacactgaaggctgtggatttgagtggagagtttg
tggtctgcacacactctcttgtgtaatatgcacacagagacacagatgct
aatactttccaaactgcaggcattaagttatctcagtggctaaaggagta
actcctcagagaccgagacatgtgctgcctccctttcccttggacacatt
catatttgtgaggctggttgtgagatgtaaacggtgcattttaaaacttt
ggttccttgtgtatttcaaggtgtctatgcaccttcccaagcgtccctta
gaataagtgtttatttcttactttaacacctcactcctccctcgacagcc
agagccactgctgctctgagcttcaacactaaggaaaacgtcttcgggct
aagtctctagatttttaagcctgtgagaatacggagcctctactacattc
agcaagataaatactctcagccttaggatgcagagaccttgcctgattaa
attgttggttggttggagagaggtggcaagaaggcacgggggcctattat
cctcctgatcgcatgtgttgcttacccggctcaggtgcaagactgaaggg
aacctccagggtgcgctatatgacacaagagtgtgtgcagaccctgtgac
tggtactactgctgtgaagttttatggtagagtgaggggcaagtggccta
gtcctacctcactgctgtctcctgcctcatttcctaccaatatagctgac
tttcctggatggggtggaagccatgaggatatttgcctgtgtagcctcgg
attgcttatttagaaaaacagactggtatgtggggaacccctgatttcat
ccccagcttccaagtaataacagcaagtactataaataaaatatgggcat
gacaagggctctaaaaaaaaaaaaaaggtaatggaagctgaactgcgttg
gtttaattaaggtagaactatccattgcccaatgacttgtgttcacgggc
gataagcatttctatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_34153875_34155034
seq2: B6Ng01-206F18.b_48_1200

seq1  GAATTCACATCCATCTCTTTTCAACTCATGAGACCTCCCCCCATTGACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATCCATCTCTTTTCAACTCATGAGACCTCCCCCCATTGACCA  50

seq1  GTCCTGCAGTGGTTTCTCAATGTCTCAGACAAATATCTAACAAGGGCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGCAGTGGTTTCTCAATGTCTCAGACAAATATCTAACAAGGGCAGC  100

seq1  AGGAACAGCGTTGGCAGGAGAGTAATACACAACAGACCCTACTGGCAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACAGCGTTGGCAGGAGAGTAATACACAACAGACCCTACTGGCAGAG  150

seq1  ATCTCTTACGCTTACACAGTACCCCTGTTATACTTTTCTTAAACTCTTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTTACGCTTACACAGTACCCCTGTTATACTTTTCTTAAACTCTTTC  200

seq1  AGGGTCTCGCGCCCTACCAAGCCTAGATGTAACATTTAATTGAGAAAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCTCGCGCCCTACCAAGCCTAGATGTAACATTTAATTGAGAAAGAG  250

seq1  AAATATAGAAAAGGCTGCCTGTTCCTGTAGATGTTTGATGGCAATGGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATAGAAAAGGCTGCCTGTTCCTGTAGATGTTTGATGGCAATGGACT  300

seq1  TAAAAATGTGTGATTTTTGTGTATGGCTAGAGCCCATGACATGCGGCAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATGTGTGATTTTTGTGTATGGCTAGAGCCCATGACATGCGGCAAC  350

seq1  CTGTAGTTTCCCTATGGTATGGGGCTGGTTTGGCCAGACTACAAGGCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGTTTCCCTATGGTATGGGGCTGGTTTGGCCAGACTACAAGGCAGT  400

seq1  CTGAAGGAGTAAATTGCTAAGTGGGCTAGTGAGTGTGGGCAGATTAGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGAGTAAATTGCTAAGTGGGCTAGTGAGTGTGGGCAGATTAGAAA  450

seq1  CCCAGTATCTAGGTGAAACAATGGGTTATTGTTCCTCTAAGGAAAAATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTATCTAGGTGAAACAATGGGTTATTGTTCCTCTAAGGAAAAATGG  500

seq1  CAAGCTTCTAGTAGCCACTAGCAGAGTAGAGGATTTTAAATGGCAATGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTTCTAGTAGCCACTAGCAGAGTAGAGGATTTTAAATGGCAATGGG  550

seq1  TCCCAGGGAAGAGAACAGTGCAGGGTCTCGACTTCAGGTTTCACATGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGGAAGAGAACAGTGCAGGGTCTCGACTTCAGGTTTCACATGGAG  600

seq1  TCCAGGGCTGCCTTACACCTGTCCCATGGAAATGAGAGATCCGGGTCAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGCTGCCTTACACCTGTCCCATGGAAATGAGAGATCCGGGTCAAA  650

seq1  ACTCTCCCAGGCAGAATTTCAGCCGAGGAGAGGAAACGTGGGCATATTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCCCAGGCAGAATTTCAGCCGAGGAGAGGAAACGTGGGCATATTTA  700

seq1  TTCTAGCTGTCCTGAGCTCAGGGAAGGTGGGTGACACTCCAGAAGGCAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGCTGTCCTGAGCTCAGGGAAGGTGGGTGACACTCCAGAAGGCAGA  750

seq1  GGGAGAAGAGATTTTCAAGAAAGCCTGGAGCTGCCTATGTGCTCATGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAGAGATTTTCAAGAAAGCCTGGAGCTGCCTATGTGCTCATGGAA  800

seq1  GTCACTCAGGGTGCCCAATGACATCACTATAGTATGCTTAAAGGGCTCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTCAGGGTGCCCAATGACATCACTATAGTATGCTTAAAGGGCTCAA  850

seq1  GAATATGAAAGCACAATTTCCTCAGTCTAATGTTGTCCTAATAGGAACAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATGAAAGCACAATTTCCTCAGTCTAATGTTGTCCTAATAGGAACAA  900

seq1  AGG-AAGGGGCGTGTGTCAGCGATGCTCACTCAATAGTCAATAGTCTCAT  949
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGGGCGTGTGTCAGCGATGCTCACTCAATAGTCAATAGTCTCAT  950

seq1  GCCATGTTTGCTACCATTCCTAGGCTAGTTAATATATGCGCTATACAGCC  999
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATG-TTGCTACCATTCCTAGGCTAGTTAATATATGCGCTATACAGCC  999

seq1  CAAAGAATCTATCTCAATGGTAGAATTGGATAATTTTATAAACATTGGAT  1049
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAAAGAATCTATCTCAATGGTAG-ATTGGATAATTTTATAAACATTGGA-  1047

seq1  TTTGCCTTCTGTTAATCTTTATTTACCATGACTAATAGTTTACAGAATTT  1099
      ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTTCTGTT-ATCTTTATT--ACATGACTAATAGTTTACAGAATTT  1094

seq1  TGAATCTTTCATGTGCCAAAGAGCTGAGGGTTT-ACATGCATCGTGCCAC  1148
      || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TG-ATC-TTCATGTGCC-AAGAGCTGAGGGTTTAACATGCATCGTGCCAC  1141

seq1  ATACTTTTTGTG  1160
      ||||||||||||
seq2  ATACTTTTTGTG  1153

seq1: chr16_34294446_34295566
seq2: B6Ng01-206F18.g_69_1184 (reverse)

seq1  GATAGAAATGCTTAATCCACCGTGAACACAAGTCATT-GGCAATGGGATA  49
      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  GATAGAAATGCTT-ATCGCCCGTGAACACAAGTCATTGGGCAAT-GGATA  48

seq1  GTTCTACCCTTAACTAAACCCAACGCAGTCCAGCTTCCCATTACCTTTTT  99
      |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||
seq2  GTTCTA-CCTTAATTAAA-CCAACGCAGTTCAGCTT-CCATTACC-TTTT  94

seq1  TTTTTTTTTTAGAGCCCTTGTCATGCCATTATTTTATTTATTAGTACTTG  149
      |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||
seq2  TTTTTTTTTTAGAGCCCTTGTCATGCCCATATTTTATTTA-TAGTACTTG  143

seq1  CTGTTATTACTTTGGAGCTGGGGATTGAATTCA-GGGTTTCCCACATACC  198
      |||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||
seq2  CTGTTATTACTTGGAAGCTGGGGA-TGAAATCAGGGGTTCCCCACATACC  192

seq1  AGTCTGTTTTTCTAAATAAGCAA-CCGAGGCTACACAGGCAAATATCCTC  247
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTTTTTCTAAATAAGCAATCCGAGGCTACACAGGCAAATATCCTC  242

seq1  ATGGCTTCCACCCCATCCAGGAAAGTCAGCTATATTGGTAGGAAATGAGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTTCCACCCCATCCAGGAAAGTCAGCTATATTGGTAGGAAATGAGG  292

seq1  CAGGAGACAGCAGTGAGGTAGGACTAGGCCACTTGCCCCTCACTCTACCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGACAGCAGTGAGGTAGGACTAGGCCACTTGCCCCTCACTCTACCA  342

seq1  TAAAACTTCACAGCAGTAGTACCAGTCACAGGGTCTGCACACACTCTTGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACTTCACAGCAGTAGTACCAGTCACAGGGTCTGCACACACTCTTGT  392

seq1  GTCATATAGCGCACCCTGGAGGTTCCCTTCAGTCTTGCACCTGAGCCGGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATATAGCGCACCCTGGAGGTTCCCTTCAGTCTTGCACCTGAGCCGGG  442

seq1  TAAGCAACACATGCGATCAGGAGGATAATAGGCCCCCGTGCCTTCTTGCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAACACATGCGATCAGGAGGATAATAGGCCCCCGTGCCTTCTTGCC  492

seq1  ACCTCTCTCCAACCAACCAACAATTTAATCAGGCAAGGTCTCTGCATCCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTCTCCAACCAACCAACAATTTAATCAGGCAAGGTCTCTGCATCCT  542

seq1  AAGGCTGAGAGTATTTATCTTGCTGAATGTAGTAGAGGCTCCGTATTCTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTGAGAGTATTTATCTTGCTGAATGTAGTAGAGGCTCCGTATTCTC  592

seq1  ACAGGCTTAAAAATCTAGAGACTTAGCCCGAAGACGTTTTCCTTAGTGTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCTTAAAAATCTAGAGACTTAGCCCGAAGACGTTTTCCTTAGTGTT  642

seq1  GAAGCTCAGAGCAGCAGTGGCTCTGGCTGTCGAGGGAGGAGTGAGGTGTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTCAGAGCAGCAGTGGCTCTGGCTGTCGAGGGAGGAGTGAGGTGTT  692

seq1  AAAGTAAGAAATAAACACTTATTCTAAGGGACGCTTGGGAAGGTGCATAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAGAAATAAACACTTATTCTAAGGGACGCTTGGGAAGGTGCATAG  742

seq1  ACACCTTGAAATACACAAGGAACCAAAGTTTTAAAATGCACCGTTTACAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTGAAATACACAAGGAACCAAAGTTTTAAAATGCACCGTTTACAT  792

seq1  CTCACAACCAGCCTCACAAATATGAATGTGTCCAAGGGAAAGGGAGGCAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAACCAGCCTCACAAATATGAATGTGTCCAAGGGAAAGGGAGGCAG  842

seq1  CACATGTCTCGGTCTCTGAGGAGTTACTCCTTTAGCCACTGAGATAACTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTCTCGGTCTCTGAGGAGTTACTCCTTTAGCCACTGAGATAACTT  892

seq1  AATGCCTGCAGTTTGGAAAGTATTAGCATCTGTGTCTCTGTGTGCATATT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCTGCAGTTTGGAAAGTATTAGCATCTGTGTCTCTGTGTGCATATT  942

seq1  ACACAAGAGAGTGTGTGCAGACCACAAACTCTCCACTCAAATCCACAGCC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGAGAGTGTGTGCAGACCACAAACTCTCCACTCAAATCCACAGCC  992

seq1  TTCAGTGTAACCTAGCTTTGTGGGCACATCTATACATACAGCAGGCTGAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTGTAACCTAGCTTTGTGGGCACATCTATACATACAGCAGGCTGAT  1042

seq1  GGGCTTCTCAGTGGACCCTAGCAGTACTGTCAGTTATACCACACACTGGA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTCTCAGTGGACCCTAGCAGTACTGTCAGTTATACCACACACTGGA  1092

seq1  GTTTCACATGCGGCTCTGGAATTC  1121
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCACATGCGGCTCTGGAATTC  1116