BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213F18
Chromosome16 (Build37)
Map Location 5,318,812 - 5,467,861
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAdcy9, EG620313, Srl, Tcfap4, Glis2, Magmas, Coro7, Vasn, Dnaja3, Nmral1, Hmox2, 5730403B10Rik, 4930562C15Rik, 1500031H01Rik, Mgrn1, Nudt16l1, Anks3, 4930451G09Rik, Sept12, EG432995, Rogdi, 3930401K13Rik, Ubn1, Ppl, Sec14l5, Nagpa, AU021092, Alg1, 5730409G15Rik
Downstream geneLOC100042436, A2bp1, LOC100042445
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213F18.bB6Ng01-213F18.g
ACCGA030910GA030911
length837409
definitionB6Ng01-213F18.b B6Ng01-213F18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(5,318,812 - 5,319,644)(5,467,447 - 5,467,861)
sequence
gaattctctgttcagatccaaaatacaagttttcttgactctctgttttt
tgagttctttatgtattctggatgttaaccccctgtcagatatatagctg
gaaaagattccaacccctcttcactcagtttgttgtttccttagctatac
agaaactttctagtgtcatgaggtcccacttgtcaattgttgggcaggct
taattcccaggcaaacggagtcctcttcagaaagtcctttctgtgttgtt
tctttggtgtactggttaccatgttggtggaattgcaaaactgggcagcc
actatggaaggcacataggtgtgagaattggggaggtccaagcaagttag
ggtcacatggattggctcacctgggtggccagagtccagtctgtggtggg
gagcacaggcattgcattgttgggtgggcttaaaaggcaagattcttggt
aagcagccccagggagaccagagtggggagtctgaggagggttgtttgat
tgttcattgatgaaggaggccctgcccactgtgggcggtgtcattccctg
ggtaggtgacctgaattatataagaaagttagcgaaggatgaacctgttg
gagccagttagctttggctgtgagtgagttccatgattataggtaatgct
gcctgaaacagaaagcaggcctgccttcaggttcctgtgacctgaaagtg
taaagcaaaataaatccctttctccacgtgttgcttttggtcaggtttta
tatatacaacaagagaaaggaaactaaaatactgggatgtatgagacctt
gtcttaaaaataaggtgtatgaatgggttttttggac
aaaactggagaatcctgtaggctaagagctggtagaggagaggccctggg
agctaagctggccactcttgcttcagccctggagtaggccctgtaacaag
ctgaagactcacctttgtcagcaccctagagaaattctttcagaaaaagc
ctggtagcaacattccattcttcctcctcacctctggaagtcccagcaca
cacaaggggggggggggggacacgtagttaacaggcagggcaatctgctt
ccaaatcattgctctggcactgggacaccggaggtgagcaactcgtcatt
gctgattgctgttctatgggaggtggccccaatgacctcacagagtcttg
tgaggacttaatgacttggacaagtcaaatgggcttgtcccaggaccggg
taaagcact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_5318812_5319644
seq2: B6Ng01-213F18.b_48_884

seq1  GAATTCTCTGTTCAGATCCAAAATACAAGTTTTCTTGACTCTCTGTTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTTCAGATCCAAAATACAAGTTTTCTTGACTCTCTGTTTTT  50

seq1  TGAGTTCTTTATGTATTCTGGATGTTAACCCCCTGTCAGATATATAGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCTTTATGTATTCTGGATGTTAACCCCCTGTCAGATATATAGCTG  100

seq1  GAAAAGATTCCAACCCCTCTTCACTCAGTTTGTTGTTTCCTTAGCTATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGATTCCAACCCCTCTTCACTCAGTTTGTTGTTTCCTTAGCTATAC  150

seq1  AGAAACTTTCTAGTGTCATGAGGTCCCACTTGTCAATTGTTGGGCAGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTTTCTAGTGTCATGAGGTCCCACTTGTCAATTGTTGGGCAGGCT  200

seq1  TAATTCCCAGGCAAACGGAGTCCTCTTCAGAAAGTCCTTTCTGTGTTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCCCAGGCAAACGGAGTCCTCTTCAGAAAGTCCTTTCTGTGTTGTT  250

seq1  TCTTTGGTGTACTGGTTACCATGTTGGTGGAATTGCAAAACTGGGCAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGGTGTACTGGTTACCATGTTGGTGGAATTGCAAAACTGGGCAGCC  300

seq1  ACTATGGAAGGCACATAGGTGTGAGAATTGGGGAGGTCCAAGCAAGTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGGAAGGCACATAGGTGTGAGAATTGGGGAGGTCCAAGCAAGTTAG  350

seq1  GGTCACATGGATTGGCTCACCTGGGTGGCCAGAGTCCAGTCTGTGGTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACATGGATTGGCTCACCTGGGTGGCCAGAGTCCAGTCTGTGGTGGG  400

seq1  GAGCACAGGCATTGCATTGTTGGGTGGGCTTAAAAGGCAAGATTCTTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACAGGCATTGCATTGTTGGGTGGGCTTAAAAGGCAAGATTCTTGGT  450

seq1  AAGCAGCCCCAGGGAGACCAGAGTGGGGAGTCTGAGGAGGGTTGTTTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCCCCAGGGAGACCAGAGTGGGGAGTCTGAGGAGGGTTGTTTGAT  500

seq1  TGTTCATTGATGAAGGAGGCCCTGCCCACTGTGGGCGGTGTCATTCCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCATTGATGAAGGAGGCCCTGCCCACTGTGGGCGGTGTCATTCCCTG  550

seq1  GGTAGGTGACCTGAATTATATAAGAAAGTTAGCGAAGGATGAACCTGTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGTGACCTGAATTATATAAGAAAGTTAGCGAAGGATGAACCTGTTG  600

seq1  GAGCCAGTTAGCTTTGGCTGTGAGTGAGTTCCATGATTATAGGTAATGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGTTAGCTTTGGCTGTGAGTGAGTTCCATGATTATAGGTAATGCT  650

seq1  GCCTGAAACAGAAAGCAGGCCTGCCTTCAGGTTCCTGTGACCTGAAAGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGAAACAGAAAGCAGGCCTGCCTTCAGGTTCCTGTGACCTGAAAGTG  700

seq1  T-AAGCAAAATAAATCCCTTTCTCCACGTGTTGCTTTTGGTCAGG-TTTA  748
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TAAAGCAAAATAAATCCCTTTCTCCACGTGTTGCTTTTGGTCAGGTTTTA  750

seq1  TATATACAACAAGAGAAAGGAAACTAAAATACTGGGATGTATGAGACCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATACAACAAGAGAAAGGAAACTAAAATACTGGGATGTATGAGACCTT  800

seq1  GTCTTAAAAAAAAGGTGTATG-ATGGG-TTTTTGGAC  833
      |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||
seq2  GTCTTAAAAATAAGGTGTATGAATGGGTTTTTTGGAC  837

seq1: chr16_5467447_5467861
seq2: B6Ng01-213F18.g_68_482 (reverse)

seq1  AGTGCTTTACCCAGTCCTGGGACAAGCCCATTTGACTTGTCCAAGTCATT  50
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTTTACCCGGTCCTGGGACAAGCCCATTTGACTTGTCCAAGTCATT  50

seq1  AAGTCCTCACAAGACTCTGTGAGGTCATTGGGGCCACCTCCCATAGAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCTCACAAGACTCTGTGAGGTCATTGGGGCCACCTCCCATAGAACA  100

seq1  GCAATCAGCAATGACGAGTTGCTCACCTCCGGTGTCCCAGTGCCAGAGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATCAGCAATGACGAGTTGCTCACCTCCGGTGTCCCAGTGCCAGAGCA  150

seq1  ATGATTTGGAAGCAGATTGCCCTGCCTGTTAACTACGTGTCCCCCCCCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTGGAAGCAGATTGCCCTGCCTGTTAACTACGTGTCCCCCCCCCC  200

seq1  CCCCTTGTGTGTGCTGGGACTTCCAGAGGTGAGGAGGAAGAATGGAATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTGTGTGTGCTGGGACTTCCAGAGGTGAGGAGGAAGAATGGAATGT  250

seq1  TGCTACCAGGCTTTTTCTGAAAGAATTTCTCTAGGGTGCTGACAAAGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACCAGGCTTTTTCTGAAAGAATTTCTCTAGGGTGCTGACAAAGGTG  300

seq1  AGTCTTCAGCTTGTTACAGGGCCTACTCCAGGGCTGAAGCAAGAGTGGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCAGCTTGTTACAGGGCCTACTCCAGGGCTGAAGCAAGAGTGGCC  350

seq1  AGCTTAGCTCCCAGGGCCTCTCCTCTACCAGCTCTTAGCCTACAGGATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAGCTCCCAGGGCCTCTCCTCTACCAGCTCTTAGCCTACAGGATTC  400

seq1  TCCAGTTTTGAATTC  415
      |||||||||||||||
seq2  TCCAGTTTTGAATTC  415