BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-243I21
Chromosome16 (Build37)
Map Location 79,608,122 - 79,634,987
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930570E03Rik, Chodl, Prss7
Downstream geneEG383172, 1700066C05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-243I21.bB6Ng01-243I21.g
ACCGA052908GA052909
length2721,109
definitionB6Ng01-243I21.b B6Ng01-243I21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,608,122 - 79,608,393)(79,633,878 - 79,634,987)
sequence
tgaccctctacctcacatgtacagaaattataagtctttaaaaattattt
aaaaatttgacaataatatttatcaaacaaatgatgtcttatagttaaat
tctgtctcctaaattgaggtaaatagagattgtttcagttcattgttata
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atatattctaagttaactgaatgccttagaatccaagtattgctttttat
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atgtggtatacaatcaccacactgggcagttttctataactgcatataca
ttactctagggcttacaccaccatttactttatttgatcggtttaaatta
aatcagtagtgttatatcctcagagagaaactgctctactaggaatacct
ccattagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_79608122_79608393
seq2: B6Ng01-243I21.b_49_320

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG  272
      ||||||||||||||||||||||
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seq1: chr16_79633878_79634987
seq2: B6Ng01-243I21.g_64_1172 (reverse)

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      ||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||| |||||| |||||
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      |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATACCACATTTGATGTATTTTCAGAACCTATTTCATAGTAGGGTA  195

seq1  TTCAATTACATGAA--TAAAAGCAATACTTGGATTCTAAGGCATTCAGTT  246
      ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAGAATATATTTATTAAAACTAAAGAGAATTATTTACAATTCTTTT  295

seq1  CTTTTTGGACTATACTATATATATAAATACATAAATAATAGAATATATAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTGGACTATACTATATATATAAATACATAAATAATAGAATATATAT  345

seq1  TAATTAAAATAATTTTTAAATATTTCTTTTTATTTCAAACTCAATCTGTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAAAATAATTTTTAAATATTTCTTTTTATTTCAAACTCAATCTGTG  395

seq1  AGTTCACATTTCAGCATGAGAATTAATAGACCACATTAATTATCAGAATG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GAAGATATGTAGTAGTCTTTGCTACATATCATTAGATGATGATAAATTAT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATATGTAGTAGTCTTTGCTACATATCATTAGATGATGATAAATTAT  495

seq1  AAGCTTAAATTTAGAAAACAAACCAATAATCATATTATTTTCTCCTCATG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTAAATTTAGAAAACAAACCAATAATCATATTATTTTCTCCTCATG  545

seq1  ATCTTAAAATCAAGCATATGTAATGATCATTATTGTATTAAAGTTAAGTA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAAAATCAAGCATATGTAATGATCATTATTGTATTAAAGTTAAGTA  595

seq1  GATACTTTTCAGACAACTTTATAATATATGCTGTTGTGAAATTATTCCCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CCTATATATTAGGTATATAATAAATTATATTGACTTATCCATAAGTATTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATATTAGGTATATAATAAATTATATTGACTTATCCATAAGTATTC  695

seq1  ACCAATGTTAATATGCTACCTGATCATTTTGAACTTTTTTCTATGTGTAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATGTTAATATGCTACCTGATCATTTTGAACTTTTTTCTATGTGTAA  745

seq1  GGTGAGTACTAGTGAGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTACTAGTGAGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  795

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTGAGGTGTGTGAGGTGATACATCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GTATGTGCATGTTGTCCAGTTTTGTCCCTTTGTGTTCATGGTTCGTTGGT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TATGCATGTGTGTTATATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTAGTTCAGAAGGAAAACTTCTAAATTTTCATACA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTAGTTCAGAAGGAAAACTTCTAAATTTTCATACA  995

seq1  GACTCTGTCCCGCTCCCTGGAAAAGCAGATGGTATTTTTCCATAATTAAG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTGTCCCGCTCCCTGGAAAAGCAGATGGTATTTTTCCATAATTAAG  1045

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTAAGTGTACCTAATTTACCTGTGGAAAGGTGTCATTTTAGACTCT  1095

seq1  TCAGTACTGAATTC  1110
      ||||||||||||||
seq2  TCAGTACTGAATTC  1109