BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-249D13
Chromosome16 (Build37)
Map Location 56,644,775 - 56,750,570
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAbi3bp, Tfg, Gpr128
Upstream geneNfkbiz, Gm1752, Lrriq2, EG667966, LOC629242, Rpl24, Zbtb11, Pcnp, Rg9mtd1, Senp7, Impg2, LOC672835
Downstream geneTmem45a, LOC668026, LOC668036, 2310005G13Rik, Tomm70a, Nit2, Tbc1d23, Tmem30c, 2610528E23Rik, 4631422O05Rik, Col8a1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-249D13.bB6Ng01-249D13.g
ACCGA057098GA057099
length1,1581,192
definitionB6Ng01-249D13.b B6Ng01-249D13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,644,775 - 56,645,934)(56,749,359 - 56,750,570)
sequence
gaattctggtaaaatgatgaatgattaattaaaaaataataattagtgaa
taaagcagggataaaatgtgtcaaatatttttaagtgactgtcactaaat
aaataaggtatgttaaaacttgttgatataaaattaatataatactctag
gttatggagagatggctcagaggttaagagcactctctgcttttctggag
gtcctgagttcaattcccagcaaccacatggtggcttgcaaccatctgta
atgagatctactgctctcttctgccttgcaggatacatgaaggcagaacg
ttgtatataataaataaatacatctctaaaaaattaatactctataaaat
tgaatagttgttaaaattacatggtaaacagctatcaagattttattaaa
catgtagcataagacaagagttatagataaggataaatggaaattttaaa
gacaataaaatgataaatatgaagtgagacatgctaggagtccagacttc
tagactataaatttctggatacaaagttaagtgaaggggatataaactac
taggaaaaatttattaatgattttctctttttgaagaatattttttgtac
ttaataaacttcagtgcagtaaattaacatccttctatgattaaacagta
aattttaaatttgcttaattttaaattagctttttaacaaacacaagata
taaaagctcagaatgaagagaactaacccagttcactccatgctaactct
ggagggctggagggctggcaaactataaggacagagggttttggctttgt
tccagctgagccagcttccagtccgttggcctgggcaataaatagcagct
gcaactcaaatgtttctgaccttatcagtgatgtttaatacgggaaaact
aacaatggaaatcaaaacatactagaatgattttttttttaagtgataga
acttagatctccctttttctacatgagactatgtttctttaaaaaaaaaa
tccaaatatacattagattttatagcctttcagatgtgctcatgtgcaca
ataagtattttaaatattatgtttatatttatttactttatataggggtg
gtgggtgtgtccatgtatggttgtggtgccactgcacagtgtgaggtcag
aggaaaag
gaattcctccgttgcaactgcagccacacgaccaatttcgctgtattgat
ggtaagcatgcgcaaaacaatcaatctcttttgagacaaggctttccctt
atacacaggtctaggatacatcagccaaggacaccgttgaggtattattt
acatagattgtaaattcagataaaataggaaaggggataaagcgataggg
ctaaaaaggagcatgctcgaaagtaacagaggtcttggttgttgtttacc
atggggtttcaggacagacagacaagtttagtttagcactgtgtttgtaa
gcattgaaaagatgcatatgtgggaagaagttggcacattccactagaca
aactgtgttaagagtgagatccttatggagtggaacgctttagtacatac
ctggccatatgtaggccacttggatttcctgaacctctttccattgcagc
tgtcctaattgctgctcttgctgatatgtagaaaagaaacagctcttgaa
ttctttacgtctctccgataggttcactctccatcccttaagcttattaa
ccatcaggtatccctgtacagggccagaagctgatctgacatatgcacct
ctggccattttcagaaggtctcctctacatgccaattctgaaaaacattc
ttataaagcaacgtgttggtttgaatgaggacgtgtgtagaatgttagaa
tcaaatattaacaggggtagctactgaacagcactcgttcatgaatccct
ggagggaaaaccatgttttcatcctgcaagagctgacatgtggccaggtt
taggatggagattcacagaatacactgacacagtgtagacaatcaaatag
aactttattttcagacatgtttgagacaactgtatctccctcactttagc
tgttaaacctttcttatttgggttgattttaattacttcttgtctaactt
acattgagagcagattttcctatcagaagacactagcataaaaatttcca
tttttgacttcaagtcgtattagctatgaagaattagctttgatgttaaa
tgatacagaaagctttgtacagttaatatataagccccctgtttccagtg
agccttcccacctctcacattctgcctaaccacagttgtactttgactgg
attgtcatgaatgtgattgccaatttaagccaaatagactct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_56644775_56645934
seq2: B6Ng01-249D13.b_43_1200

seq1  GAATTCTGGTAAAATGATGAATGATTAATTAAAAAATAATAATTAGTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGTAAAATGATGAATGATTAATTAAAAAATAATAATTAGTGAA  50

seq1  TAAAGCAGGGATAAAATGTGTCAAATATTTTTAAGTGACTGTCACTAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCAGGGATAAAATGTGTCAAATATTTTTAAGTGACTGTCACTAAAT  100

seq1  AAATAAGGTATGTTAAAACTTGTTGATATAAAATTAATATAATACTCTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGGTATGTTAAAACTTGTTGATATAAAATTAATATAATACTCTAG  150

seq1  GTTATGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTCTCTGCTTTTCTGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTCTCTGCTTTTCTGGAG  200

seq1  GTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTTGCAACCATCTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTTGCAACCATCTGTA  250

seq1  ATGAGATCTACTGCTCTCTTCTGCCTTGCAGGATACATGAAGGCAGAACG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGATCTACTGCTCTCTTCTGCCTTGCAGGATACATGAAGGCAGAACG  300

seq1  TTGTATATAATAAATAAATACATCTCTAAAAAATTAATACTCTATAAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATATAATAAATAAATACATCTCTAAAAAATTAATACTCTATAAAAT  350

seq1  TGAATAGTTGTTAAAATTACATGGTAAACAGCTATCAAGATTTTATTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAGTTGTTAAAATTACATGGTAAACAGCTATCAAGATTTTATTAAA  400

seq1  CATGTAGCATAAGACAAGAGTTATAGATAAGGATAAATGGAAATTTTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAGCATAAGACAAGAGTTATAGATAAGGATAAATGGAAATTTTAAA  450

seq1  GACAATAAAATGATAAATATGAAGTGAGACATGCTAGGAGTCCAGACTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATAAAATGATAAATATGAAGTGAGACATGCTAGGAGTCCAGACTTC  500

seq1  TAGACTATAAATTTCTGGATACAAAGTTAAGTGAAGGGGATATAAACTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTATAAATTTCTGGATACAAAGTTAAGTGAAGGGGATATAAACTAC  550

seq1  TAGGAAAAATTTATTAATGATTTTCTCTTTTTGAAGAATATTTTTTGTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAAAATTTATTAATGATTTTCTCTTTTTGAAGAATATTTTTTGTAC  600

seq1  TTAATAAACTTCAGTGCAGTAAATTAACATCCTTCTATGATTAAACAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAAACTTCAGTGCAGTAAATTAACATCCTTCTATGATTAAACAGTA  650

seq1  AATTTTAAATTTGCTTAATTTTAAATTAGCTTTTTAACAAACACAAGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTAAATTTGCTTAATTTTAAATTAGCTTTTTAACAAACACAAGATA  700

seq1  TAAAAGCTCAGAATGAAGAGAACTAACCCAGTTCACTCCATGCTAACTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGCTCAGAATGAAGAGAACTAACCCAGTTCACTCCATGCTAACTCT  750

seq1  GGAGGGCTGGAGGGCTGGCAAACTATAAGGACAGAGGGTTTTGGCTTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGCTGGAGGGCTGGCAAACTATAAGGACAGAGGGTTTTGGCTTTGT  800

seq1  TCCAGCTGAGCCAGCTTCCAGTCCGTTGGCCTGGGCAATAAATAGCAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTGAGCCAGCTTCCAGTCCGTTGGCCTGGGCAATAAATAGCAGCT  850

seq1  GCAACTCAAATGTTTCTGACCTTATCAGTGATGTTTAATACGGGAAAACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTCAAATGTTTCTGACCTTATCAGTGATGTTTAATACGGGAAAACT  900

seq1  AACAATGGAAATCAAAACATACTAGAATGA-TTTTTTTTTAAGTGATAGA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AACAATGGAAATCAAAACATACTAGAATGATTTTTTTTTTAAGTGATAGA  950

seq1  ACTTAGATCTCCCTTTTTCTACATGAGACTATGTTTCTTTAAAAAAAAAA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACTTAGATCTCCCTTTTTCTACATGAGACTATGTTTCTTT-AAAAAAAAA  999

seq1  ATCCAAATAATACATTAGATTTTATAGCCTTTCAAGAATGTGCTCATGTG  1049
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  ATCCAAAT-ATACATTAGATTTTATAGCCTTTCA--GATGTGCTCATGTG  1046

seq1  CAC-ATAAGTATTTTAAAATATTATTGTTTTATATTTTATTTACTTTATA  1098
      ||| ||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||
seq2  CACAATAAGTATTTT-AAATATTAT--GTTTATA-TTTATTTACTTTATA  1092

seq1  TAAG---TGTGTGTGTGTCCATGTATG--TGT-GTGCCACTGCACAAGTG  1142
      || |    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||
seq2  TAGGGGTGGTGGGTGTGTCCATGTATGGTTGTGGTGCCACTGCAC-AGTG  1141

seq1  TGAAAGTCAGAGGAAAAG  1160
      || | |||||||||||||
seq2  TG-AGGTCAGAGGAAAAG  1158

seq1: chr16_56749359_56750570
seq2: B6Ng01-249D13.g_66_1257 (reverse)

seq1  AGAGTCTATTTGGCTTAATTTGCAATTCAACTATTCATTTGACAAATTTC  50
      |||||||||||||||||| |||  | |||   |||||  ||||||   ||
seq2  AGAGTCTATTTGGCTTAAATTGGCAATCA--CATTCA--TGACAA---TC  43

seq1  ACAGCTCAAAAGTTTTACAACTGTGGTTAGGCAGATATTGGTGAGAGGTT  100
       ||| |||||     |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| 
seq2  -CAG-TCAAA----GTACAACTGTGGTTAGGCAGA-AT--GTGAGAGGT-  83

seq1  GGGGAAGCCTCACCTGGAAACAGGGGGGCTTATATA-TAACTGTTACAAA  149
       |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  -GGGAAGGCTCA-CTGGAAACA-GGGGGCTTATATATTAACTG-TACAAA  129

seq1  GCTTTCTGTATCATTTAACATCCAAGCTAA-TCTTCATAGCTAATACGAC  198
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTGTATCATTTAACATCAAAGCTAATTCTTCATAGCTAATACGAC  179

seq1  TTGAAGTCAAAAATGGAAATTTTTATTGCTAGTGTCTTCTGATAGGAAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGTCAAAAATGGAAATTTTTA-TGCTAGTGTCTTCTGATAGGAAAA  228

seq1  TCTGCTCTCAATGTAAGTTAGACAAGAAGTAATTAAAATCAACCAAAATA  298
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCTGCTCTCAATGTAAGTTAGACAAGAAGTAATTAAAATCAACCCAAATA  278

seq1  AGAAAGGTTTAACAGCTAAAGTGAGGGAGATACAGTTGTCTCAAACATGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGTTTAACAGCTAAAGTGAGGGAGATACAGTTGTCTCAAACATGT  328

seq1  CTGAAAATAAAGTTCTATTTGATTGTCTACACTGTGTCAGTGTATTCTGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAATAAAGTTCTATTTGATTGTCTACACTGTGTCAGTGTATTCTGT  378

seq1  GAATCTCCATCCTAAACCTGGCCACATGTCAGCTCTTGCAGGATGAAAAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCCATCCTAAACCTGGCCACATGTCAGCTCTTGCAGGATGAAAAC  428

seq1  ATGGTTTTCCCTCCAGGGATTCATGAACGAGTGCTGTTCAGTAGCTACCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTTCCCTCCAGGGATTCATGAACGAGTGCTGTTCAGTAGCTACCC  478

seq1  CTGTTAATATTTGATTCTAACATTCTACACACGTCCTCATTCAAACCAAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAATATTTGATTCTAACATTCTACACACGTCCTCATTCAAACCAAC  528

seq1  ACGTTGCTTTATAAGAATGTTTTTCAGAATTGGCATGTAGAGGAGACCTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTGCTTTATAAGAATGTTTTTCAGAATTGGCATGTAGAGGAGACCTT  578

seq1  CTGAAAATGGCCAGAGGTGCATATGTCAGATCAGCTTCTGGCCCTGTACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAATGGCCAGAGGTGCATATGTCAGATCAGCTTCTGGCCCTGTACA  628

seq1  GGGATACCTGATGGTTAATAAGCTTAAGGGATGGAGAGTGAACCTATCGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATACCTGATGGTTAATAAGCTTAAGGGATGGAGAGTGAACCTATCGG  678

seq1  AGAGACGTAAAGAATTCAAGAGCTGTTTCTTTTCTACATATCAGCAAGAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACGTAAAGAATTCAAGAGCTGTTTCTTTTCTACATATCAGCAAGAG  728

seq1  CAGCAATTAGGACAGCTGCAATGGAAAGAGGTTCAGGAAATCCAAGTGGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATTAGGACAGCTGCAATGGAAAGAGGTTCAGGAAATCCAAGTGGC  778

seq1  CTACATATGGCCAGGTATGTACTAAAGCGTTCCACTCCATAAGGATCTCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATATGGCCAGGTATGTACTAAAGCGTTCCACTCCATAAGGATCTCA  828

seq1  CTCTTAACACAGTTTGTCTAGTGGAATGTGCCAACTTCTTCCCACATATG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTAACACAGTTTGTCTAGTGGAATGTGCCAACTTCTTCCCACATATG  878

seq1  CATCTTTTCAATGCTTACAAACACAGTGCTAAACTAAACTTGTCTGTCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTTCAATGCTTACAAACACAGTGCTAAACTAAACTTGTCTGTCTG  928

seq1  TCCTGAAACCCCATGGTAAACAACAACCAAGACCTCTGTTACTTTCGAGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAAACCCCATGGTAAACAACAACCAAGACCTCTGTTACTTTCGAGC  978

seq1  ATGCTCCTTTTTAGCCCTATCGCTTTATCCCCTTTCCTATTTTATCTGAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCCTTTTTAGCCCTATCGCTTTATCCCCTTTCCTATTTTATCTGAA  1028

seq1  TTTACAATCTATGTAAATAATACCTCAACGGTGTCCTTGGCTGATGTATC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAATCTATGTAAATAATACCTCAACGGTGTCCTTGGCTGATGTATC  1078

seq1  CTAGACCTGTGTATAAGGGAAAGCCTTGTCTCAAAAGAGATTGATTGTTT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACCTGTGTATAAGGGAAAGCCTTGTCTCAAAAGAGATTGATTGTTT  1128

seq1  TGCGCATGCTTACCATCAATACAGCGAAATTGGTCGTGTGGCTGCAGTTG  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGCATGCTTACCATCAATACAGCGAAATTGGTCGTGTGGCTGCAGTTG  1178

seq1  CAACGGAGGAATTC  1212
      ||||||||||||||
seq2  CAACGGAGGAATTC  1192