BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256A04
Chromosome16 (Build37)
Map Location 46,618,653 - 46,727,678
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGcet2, BC016579, Tmprss7, Tagln3, Abhd10, Phldb2, EG667418, Plcxd2, 4930546O09Rik, Cd96, AL024110, Pvrl3
Downstream geneLOC628757, LOC628776
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256A04.bB6Ng01-256A04.g
ACCGA062078GA062079
length1,128489
definitionB6Ng01-256A04.b B6Ng01-256A04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,726,551 - 46,727,678)(46,618,653 - 46,619,146)
sequence
gaattctctaatattctattgcaggaaaaatcctcatatggttgttatgg
caagactagctgaaagcacttctgtcgaagttttgaggtaatagatccca
caagtgtgcatgcccatggttggtcctctttgtgtgcttatagtgtgact
gggcatgggtgagttttaagttattgttctacaatttgtggtctaagaag
taataatacattgaaggaaaagttcaaaattatacctagcccactcactt
catgaaagcatagcccgtccagtgacctaactatctcttaaggagtctgt
catttctcggtgctgctgtgcagggaccaaatgtcaacatgagttgaatg
agaacaacccatattcaaactatagctatacttaagactttgttccaagt
gacagggttagccaaaacctacaatgcctggttacatgatcaaaataagg
aagcttggcaagccccacgctgtgaagatataataaatgtctccccagat
gggaagaattcccttgccaccaacaaaggtctatgtggacctaggagaca
agaggagtcctgtttagctattaccaagctgctggactttgctagaaata
tacaatgatagctttctttgcctccagcagttttccccctaaaccacaaa
ttgtcacaaatatctgagtggtaagtttgctttcctctttattcatagct
atgcatacacataacacataaaagaattttaatgtaaggagccacattgg
gtgaggacaatcatattgatataaacataaatcactgaccagccaaccct
cgcgcctctcctgatatgtctagattcttatgacgttcatgcaaagctca
taaaaagttacacttattaagaagctcccatatacactcaagagacatta
gaagcaatctggagtttaggattcagaaatgaagcaaaacatagccatct
gttatagggatcctgttaaaaggagcagatttaattgtccagagcatgct
ggattacattaaactgttctaatttggccaagtagactcaaaaatgtctg
catacttccaccctgaacattacagaactaatgtcagaaagaccttgttt
ttatctgacctttctaccaggagctggc
ttgaaaaaaatcagcaaaaagtaatttcagacttaatcacccactgagtg
gtttggtttttgttgtttgtttgtcttatttttgttgttgttgtttttgt
tgttgttttttttgttgttgttaatctttcattagactcagtaaaaagct
caaatctgttttcatcactttggattttcagttgatgaaggtgaggtttt
aaaatgtgatgatggaagtttagaaaaagtgagaccttaataaagatgta
gcactcaaacatattattcagaaaggcaaaactacaccatgaccctttaa
atgctatgagaccttctcaggcattctgagattggaaccaggagaaggat
ggtgtagagaattcgccctgagacaaagaccttctgtcagttccagagac
ggtacgttatcttcatgttaagaatatctagggggaaggaatagagggtt
ttcagaaaggaaactaggataaggggacaacatttaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_46726551_46727678
seq2: B6Ng01-256A04.b_46_1173 (reverse)

seq1  GCCAGCTCCTGGTAGAA--GTCAGATTAAAACCAGGTC-TTCTGACATTT  47
      |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||
seq2  GCCAGCTCCTGGTAGAAAGGTCAGATAAAAACAAGGTCTTTCTGACA-TT  49

seq1  AGTTCTGTTATG-TCA-GGTGGAAGTAATGCAGACAATTTTTGAGTCTTA  95
      |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
seq2  AGTTCTGTAATGTTCAGGGTGGAAGT-ATGCAGAC-ATTTTTGAGTC-TA  96

seq1  CTTGGCCAAATTAGAACAGTTTTAATGTAATCCAGCATGCTCTGGACAAT  145
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCAAATTAGAACAG-TTTAATGTAATCCAGCATGCTCTGGACAAT  145

seq1  TAAATCTGCTCCTTTTAACAGGATCCCTATAACAGATGGCTATGTTTTGC  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCTGCTCCTTTTAACAGGATCCCTATAACAGATGGCTATGTTTTGC  195

seq1  TTCATTTCTGAATCCTAAACTCCAGATTGCTTCTAATGTCTCTTGAGTGT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTCTGAATCCTAAACTCCAGATTGCTTCTAATGTCTCTTGAGTGT  245

seq1  ATATGGGAGCTTCTTAATAAGTGTAACTTTTTATGAGCTTTGCATGAACG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGGAGCTTCTTAATAAGTGTAACTTTTTATGAGCTTTGCATGAACG  295

seq1  TCATAAGAATCTAGACATATCAGGAGAGGCGCGAGGGTTGGCTGGTCAGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAGAATCTAGACATATCAGGAGAGGCGCGAGGGTTGGCTGGTCAGT  345

seq1  GATTTATGTTTATATCAATATGATTGTCCTCACCCAATGTGGCTCCTTAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATGTTTATATCAATATGATTGTCCTCACCCAATGTGGCTCCTTAC  395

seq1  ATTAAAATTCTTTTATGTGTTATGTGTATGCATAGCTATGAATAAAGAGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATTCTTTTATGTGTTATGTGTATGCATAGCTATGAATAAAGAGG  445

seq1  AAAGCAAACTTACCACTCAGATATTTGTGACAATTTGTGGTTTAGGGGGA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAACTTACCACTCAGATATTTGTGACAATTTGTGGTTTAGGGGGA  495

seq1  AAACTGCTGGAGGCAAAGAAAGCTATCATTGTATATTTCTAGCAAAGTCC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGCTGGAGGCAAAGAAAGCTATCATTGTATATTTCTAGCAAAGTCC  545

seq1  AGCAGCTTGGTAATAGCTAAACAGGACTCCTCTTGTCTCCTAGGTCCACA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTTGGTAATAGCTAAACAGGACTCCTCTTGTCTCCTAGGTCCACA  595

seq1  TAGACCTTTGTTGGTGGCAAGGGAATTCTTCCCATCTGGGGAGACATTTA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCTTTGTTGGTGGCAAGGGAATTCTTCCCATCTGGGGAGACATTTA  645

seq1  TTATATCTTCACAGCGTGGGGCTTGCCAAGCTTCCTTATTTTGATCATGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATCTTCACAGCGTGGGGCTTGCCAAGCTTCCTTATTTTGATCATGT  695

seq1  AACCAGGCATTGTAGGTTTTGGCTAACCCTGTCACTTGGAACAAAGTCTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGGCATTGTAGGTTTTGGCTAACCCTGTCACTTGGAACAAAGTCTT  745

seq1  AAGTATAGCTATAGTTTGAATATGGGTTGTTCTCATTCAACTCATGTTGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATAGCTATAGTTTGAATATGGGTTGTTCTCATTCAACTCATGTTGA  795

seq1  CATTTGGTCCCTGCACAGCAGCACCGAGAAATGACAGACTCCTTAAGAGA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGGTCCCTGCACAGCAGCACCGAGAAATGACAGACTCCTTAAGAGA  845

seq1  TAGTTAGGTCACTGGACGGGCTATGCTTTCATGAAGTGAGTGGGCTAGGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAGGTCACTGGACGGGCTATGCTTTCATGAAGTGAGTGGGCTAGGT  895

seq1  ATAATTTTGAACTTTTCCTTCAATGTATTATTACTTCTTAGACCACAAAT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTTGAACTTTTCCTTCAATGTATTATTACTTCTTAGACCACAAAT  945

seq1  TGTAGAACAATAACTTAAAACTCACCCATGCCCAGTCACACTATAAGCAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAACAATAACTTAAAACTCACCCATGCCCAGTCACACTATAAGCAC  995

seq1  ACAAAGAGGACCAACCATGGGCATGCACACTTGTGGGATCTATTACCTCA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAGGACCAACCATGGGCATGCACACTTGTGGGATCTATTACCTCA  1045

seq1  AAACTTCGACAGAAGTGCTTTCAGCTAGTCTTGCCATAACAACCATATGA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTCGACAGAAGTGCTTTCAGCTAGTCTTGCCATAACAACCATATGA  1095

seq1  GGATTTTTCCTGCAATAGAATATTAGAGAATTC  1128
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTTCCTGCAATAGAATATTAGAGAATTC  1128

seq1: chr16_46618653_46619146
seq2: B6Ng01-256A04.g_64_558

seq1  GAATTCTTGAAAAAAATCAGCAAAAAGTAATTTCAGACTTAATCACCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAAAAAAATCAGCAAAAAGTAATTTCAGACTTAATCACCCAC  50

seq1  TGAGTGGTTTGGTTTTTGTTGTTTGTTTGTCTTATTTTTGTTGTTGTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGGTTTGGTTTTTGTTGTTTGTTTGTCTTATTTTTGTTGTTGTTGT  100

seq1  TTTTGTTGTTGTTTTTTTTGTTGTTGTTAATCTTTCATTAGACTCAGTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTGTTGTTTTTTTTGTTGTTGTTAATCTTTCATTAGACTCAGTAA  150

seq1  AAAGCTCAAATCTGTTTTCATCACTTTGGATTTTCAGTTGATGAAGGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTCAAATCTGTTTTCATCACTTTGGATTTTCAGTTGATGAAGGTGA  200

seq1  GGTTTTAAAATGTGATGATGGAAGTTTAGAAAAAGTGAGACCTTAATAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTAAAATGTGATGATGGAAGTTTAGAAAAAGTGAGACCTTAATAAA  250

seq1  GATGTAGCACTCAAACATATTATTCAGAAAGGCAAAACTACACCATGACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAGCACTCAAACATATTATTCAGAAAGGCAAAACTACACCATGACC  300

seq1  CTTTAAATGCTATGAGACCTTCTCAGGCATTCTGAGATTGGAACCAGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAATGCTATGAGACCTTCTCAGGCATTCTGAGATTGGAACCAGGAG  350

seq1  AAGGATGGTGTAGAGAATTCGCCCTGAGACAAAGACCTTCTGTCAGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATGGTGTAGAGAATTCGCCCTGAGACAAAGACCTTCTGTCAGTTCC  400

seq1  AGAGACGGTACGTTATCTTCATGTTAAGAATATCTAGGGGGAAGGAATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACGGTACGTTATCTTCATGTTAAGAATATCTAGGGGGAAGGAATAG  450

seq1  AGGGTTTTCAGAAAGGAAACTAGGA-AAGGGGACAACATTTAAAA  494
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTTTCAGAAAGGAAACTAGGATAAGGGGACAACATTTAAAA  495