BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262M01
Chromosome16 (Build37)
Map Location 23,061,726 - 23,201,477
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKng1, LOC666493, Eif4a2, Rfc4, Adipoq, LOC100043541, EG625835
Upstream geneIgf2bp2, EG545152, EG666421, Sfrs10, LOC100043507, Etv5, Dgkg, LOC671242, LOC666459, Crygs, Tbccd1, Dnajb11, Ahsg, Fetub, Hrg, Kng2, LOC624311, LOC666486, LOC666489
Downstream geneBC106179, St6gal1, Rtp1, Masp1, LOC100043018, Rtp4, EG625969, LOC100043023, Sst, Rtp2, Bcl6, EG433009
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262M01.bB6Ng01-262M01.g
ACCGA067086GA067087
length1,197960
definitionB6Ng01-262M01.b B6Ng01-262M01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,200,290 - 23,201,477)(23,061,726 - 23,062,656)
sequence
gaattcagaagaaaaaaaaaagtcccttgggacaccatgatcttggatga
gaactacttctgtcagtaaatcacctagtctgtagtactttctgagtact
tcagcagccccagcgacaatctattacatctcacacacaaataaactgta
ggtggacaggattcagatatatcgccctactcttcccaaccttctgtaga
cgatggtactaccccgtgcttcacagtctggatgactgctgctgtttcca
gctgcaggttagtggacattccaagtcagcacacatggagttgcttcatt
ctttcaaaaatccagtttttcatggcatggatgcttggtgatttatttaa
tcctttctttattagttgatttcaaaagaaacagttaaggttgcaagcct
caaaacatgagtttgattcctgcaatacaaataaagggggacagaaagaa
cagactatacaaaattgtctgttcatatgcacacacatcatggtacatgc
acctttacacacacacacattccatacacacacacacaccatacacacac
ataaacactcatacccataccatacatacacacacacatcatggcacatg
caccttcacacacacacacacacacacacaccatacacacaccatacata
cacatatacacacatatatacacacaccatccacatacacaccatacata
cacacacacacacacatcatggcacatgtaccttcacacacacacataca
cacacatacacaaacacacacacacacatcatggcacatgcatcttcata
catgcacacactccatacacacagacaccatatacacacaatacacacac
aaacaggcacgtgcatcttttcatacacacacacaccatatacacacata
cccacacacacacatacacaaacacatatacacacatacactatatacac
acatatacacattatacacacactgtacatacaatacacactcacacatg
catcatattcataattagttttaaaactcctcctaatggggcctgaaagc
tggctaccaagtaataaatgttgggctaacaatcagaaagaaccaattga
attcctaggagagcctcatggaaatccacacaccatcctgttaactccag
ggtccgagagaaccacaaccccctcttgtgaactctaagccactgta
gaattcttcatagtcacccagacctgcaagattgctccaagtgggtgata
catctggggacctggcctgttggtggcagtgtgtgggagcctgggggttg
tggaatgttgatgttaatcattcctatgtatcaagaacacgacccagact
agctggcttcaccctcccagaaggtggcaacagtatctgcagtgttggga
ttgtggtagatgttgggcagagtagaactgcaccaagttcttggattggg
ccaggcttgtgtcagtcatcccctgagacctatcctaactcctgtgctct
tagaggcaggtggaggcaggggttctgggctggctgacaaagaatgaggc
accatgaatctgactccattcctacagagcatcctacatgtaggctttga
ggtgtgccctggtctagaatcattccttctttgttgtagaagttatttaa
gcctgccccagggttttacctcaccttaggtcatttagttcctggataaa
agacacagtcaaccttcatgtttgcaataagccttaaacagtacaaatgc
caggcagccgcctaccctctattctgctagaatcttctttcctataaata
atgctgagttattaattactatttagtatgtttcatctggattgttctta
cctccactgggccagcccacagggctgtgtccttgtggctcacctaacac
atggcagcttctccttcttctacatctgcttttccctggtgattcttctc
tgacccaaaagcccaggaaacccaaatgctacctatgtaccttctgccca
gctattggctgttggcatctttatttaccaataagaattgctgggtccaa
gatgtgtgtgtggactctctagtctctgggacaccaagtcttggggtcct
caacttagtattacaaatagaccaaacctcaaaacaactttttctcttct
tctccttcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_23200290_23201477
seq2: B6Ng01-262M01.b_45_1241 (reverse)

seq1  TACAGTGGCTATGGAGTTCACAAGAGGGTGT--TGGCTC-CTCTGACACT  47
      |||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| || ||| ||| ||
seq2  TACAGTGGCT-TAGAGTTCACAAGAGGGGGTTGTGGTTCTCTCGGACCCT  49

seq1  GGAGTT-ACA-GATGGT-TGTTGGATACCATGAGG--CTCCTAGGAATCA  92
      |||||| ||| |||||| ||| |  | ||||||||  |||||||||||  
seq2  GGAGTTAACAGGATGGTGTGTGGATTTCCATGAGGCTCTCCTAGGAATTC  99

seq1  AATTTGGGTC-TTCTGGAATTG-TAG-CCAACA-TTATTAACTGGTAAGC  138
      || |||| || |||||  |||| ||| |||||| ||||||  |||| |||
seq2  AA-TTGGTTCTTTCTG--ATTGTTAGCCCAACATTTATTACTTGGT-AGC  145

seq1  CAGCTTTCAGGCCCCATTAG--AGAGTTTTAAAAACTAATTATGAATATG  186
      ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTCAGGCCCCATTAGGAGGAGTTTT-AAAACTAATTATGAATATG  194

seq1  ATGCATGTGTGAGTGTGTATTGTATGTACAGTGTGTGTATAATGTGTATA  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGTGTGAGTGTGTATTGTATGTACAGTGTGTGTATAATGTGTATA  244

seq1  TGTGTGTATATAGTGTATGTGTGTATATGTGTTTGTGTATGTGTGTGTGT  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATATAGTGTATGTGTGTATATGTGTTTGTGTATGTGTGTGTGT  294

seq1  GGGTATGTGTGTATATGGTGTGTGTGTGTATGAAAAGATGCACGTGCCTG  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGTGTGTATATGGTGTGTGTGTGTATGAAAAGATGCACGTGCCTG  344

seq1  -TTGTGTGTGTATTGTGTGTATATGGTGTCTGTGTGTATGGAGTGTGTGC  385
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGTGTGTATTGTGTGTATATGGTGTCTGTGTGTATGGAGTGTGTGC  394

seq1  ATGTATGAAGATGCATGTGCCATGATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTATGT  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGAAGATGCATGTGCCATGATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTATGT  444

seq1  GTGTGTATGTGTGTGTGTGAAGGTACATGTGCCATGATGTGTGTGTGTGT  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATGTGTGTGTGTGAAGGTACATGTGCCATGATGTGTGTGTGTGT  494

seq1  GTGTATGTATGGTGTGTATGTGGATGGTGTGTGTATATATGTGTGTATAT  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTATGGTGTGTATGTGGATGGTGTGTGTATATATGTGTGTATAT  544

seq1  GTGTATGTATGGTGTGTGTATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAG  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTATGGTGTGTGTATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAG  594

seq1  GTGCATGTGCCATGATGTGTGTGTGTATGTATGGTATGGGTATGAGTGTT  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATGTGCCATGATGTGTGTGTGTATGTATGGTATGGGTATGAGTGTT  644

seq1  TATGTGTGTGTATGGTGTGTGTGTGTGTATGGAATGTGTGTGTGTGTAAA  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTGTGTATGGTGTGTGTGTGTGTATGGAATGTGTGTGTGTGTAAA  694

seq1  GGTGCATGTACCATGATGTGTGTGCATATGAACAGACAATTTTGTATAGT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCATGTACCATGATGTGTGTGCATATGAACAGACAATTTTGTATAGT  744

seq1  CTGTTCTTTCTGTCCCCCTTTATTTGTATTGCAGGAATCAAACTCATGTT  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCTTTCTGTCCCCCTTTATTTGTATTGCAGGAATCAAACTCATGTT  794

seq1  TTGAGGCTTGCAACCTTAACTGTTTCTTTTGAAATCAACTAATAAAGAAA  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGCTTGCAACCTTAACTGTTTCTTTTGAAATCAACTAATAAAGAAA  844

seq1  GGATTAAATAAATCACCAAGCATCCATGCCATGAAAAACTGGATTTTTGA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAAATAAATCACCAAGCATCCATGCCATGAAAAACTGGATTTTTGA  894

seq1  AAGAATGAAGCAACTCCATGTGTGCTGACTTGGAATGTCCACTAACCTGC  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGAAGCAACTCCATGTGTGCTGACTTGGAATGTCCACTAACCTGC  944

seq1  AGCTGGAAACAGCAGCAGTCATCCAGACTGTGAAGCACGGGGTAGTACCA  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAAACAGCAGCAGTCATCCAGACTGTGAAGCACGGGGTAGTACCA  994

seq1  TCGTCTACAGAAGGTTGGGAAGAGTAGGGCGATATATCTGAATCCTGTCC  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTCTACAGAAGGTTGGGAAGAGTAGGGCGATATATCTGAATCCTGTCC  1044

seq1  ACCTACAGTTTATTTGTGTGTGAGATGTAATAGATTGTCGCTGGGGCTGC  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACAGTTTATTTGTGTGTGAGATGTAATAGATTGTCGCTGGGGCTGC  1094

seq1  TGAAGTACTCAGAAAGTACTACAGACTAGGTGATTTACTGACAGAAGTAG  1135
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTACTCAGAAAGTACTACAGACTAGGTGATTTACTGACAGAAGTAG  1144

seq1  TTCTCATCCAAGATCATGGTGTCCCAAGGGACTTTTTTTTTTCTTCTGAA  1185
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCATCCAAGATCATGGTGTCCCAAGGGACTTTTTTTTTTCTTCTGAA  1194

seq1  TTC  1188
      |||
seq2  TTC  1197

seq1: chr16_23061726_23062656
seq2: B6Ng01-262M01.g_65_993

seq1  GAATTCTTCATAGTCACCCAGACCTGCAAGATTGCTCCAAGTGGGTGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATAGTCACCCAGACCTGCAAGATTGCTCCAAGTGGGTGATA  50

seq1  CATCTGGGGACCTGGCCTGTTGGTGGCAGTGTGTGGGAGCCTGGGGGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGGGACCTGGCCTGTTGGTGGCAGTGTGTGGGAGCCTGGGGGTTG  100

seq1  TGGAATGTTGATGTTAATCATTCCTATGTATCAAGAACACGACCCAGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATGTTGATGTTAATCATTCCTATGTATCAAGAACACGACCCAGACT  150

seq1  AGCTGGCTTCACCCTCCCAGAAGGTGGCAACAGTATCTGCAGTGTTGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGCTTCACCCTCCCAGAAGGTGGCAACAGTATCTGCAGTGTTGGGA  200

seq1  TTGTGGTAGATGTTGGGCAGAGTAGAACTGCACCAAGTTCTTGGATTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGTAGATGTTGGGCAGAGTAGAACTGCACCAAGTTCTTGGATTGGG  250

seq1  CCAGGCTTGTGTCAGTCATCCCCTGAGACCTATCCTAACTCCTGTGCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTTGTGTCAGTCATCCCCTGAGACCTATCCTAACTCCTGTGCTCT  300

seq1  TAGAGGCAGGTGGAGGCAGGGGTTCTGGGCTGGCTGACAAAGAATGAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGCAGGTGGAGGCAGGGGTTCTGGGCTGGCTGACAAAGAATGAGGC  350

seq1  ACCATGAATCTGACTCCATTCCTACAGAGCATCCTACATGTAGGCTTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGAATCTGACTCCATTCCTACAGAGCATCCTACATGTAGGCTTTGA  400

seq1  GGTGTGCCCTGGTCTAGAATCATTCCTTCTTTGTTGTAGAAGTTATTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGCCCTGGTCTAGAATCATTCCTTCTTTGTTGTAGAAGTTATTTAA  450

seq1  GCCTGCCCCAGGGTTTTACCTCACCTTAGGTCATTTAGTTCCTGGATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCCCCAGGGTTTTACCTCACCTTAGGTCATTTAGTTCCTGGATAAA  500

seq1  AGACACAGTCAACCTTCATGTTTGCAATAAGCCTTAAACAGTACAAATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGTCAACCTTCATGTTTGCAATAAGCCTTAAACAGTACAAATGC  550

seq1  CAGGCAGCCGCCTACCCTCTATTCTGCTAGAATCTTCTTTCCTATAAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGCCGCCTACCCTCTATTCTGCTAGAATCTTCTTTCCTATAAATA  600

seq1  ATGCTGAGTTATTAATTACTATTTAGTATGTTTCATCTGGATTGTTCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGAGTTATTAATTACTATTTAGTATGTTTCATCTGGATTGTTCTTA  650

seq1  CCTCCACTGGGCCAGCCCACAGGGCTGTGTCCTTGTGGCTCACCTAACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACTGGGCCAGCCCACAGGGCTGTGTCCTTGTGGCTCACCTAACAC  700

seq1  ATGGCAGCTTCTCCTTCTTCTACATCTGCTTTTCCCTGGTGATTCTTCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGCTTCTCCTTCTTCTACATCTGCTTTTCCCTGGTGATTCTTCTC  750

seq1  TGACCCAAAAGCCCAGGAAACCCAAATGCTACCTATGTACCTTCTGCCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCAAAAGCCCAGGAAACCCAAATGCTACCTATGTACCTTCTGCCCA  800

seq1  GCTATTGGCTGTTGGCATCTTTATTTACCAATAAGAATTGCTGGGTCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTGGCTGTTGGCATCTTTATTTACCAATAAGAATTGCTGGGTCCAA  850

seq1  GATGTGTGTGTGGACTCTCTAGTCTCTGGGACAACCAAGTCTTGGGGTCC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GATGTGTGTGTGGACTCTCTAGTCTCTGGGAC-ACCAAGTCTTGGGGTCC  899

seq1  TCAACTTAGTATTACAAAATAGACCAAACCT  931
      ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TCAACTTAGTATTAC-AAATAGACCAAACCT  929