BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274H22
Chromosome16 (Build37)
Map Location 92,182,244 - 92,336,691
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKcne2, 1190017O12Rik, 4930563D23Rik
Upstream geneOlig2, Olig1, Ifnar2, Il10rb, Ifnar1, LOC665939, LOC665947, Ifngr2, Tmem50b, ORF28, Gart, Son, Donson, Cryzl1, LOC100040653, Itsn1, Atp5o, Mrps6, Slc5a3
Downstream geneKcne1, Dscr1, 2410124H12Rik, Clic6, Runx1, EG666023
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274H22.bB6Ng01-274H22.g
ACCGA075782GA075783
length428938
definitionB6Ng01-274H22.b B6Ng01-274H22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,182,244 - 92,182,671)(92,335,759 - 92,336,691)
sequence
gaattcccattttagaggcaacagagcaggttctctgggtcagcctgggg
cattgaagtgacctcagctcctgctgagtgtatacatacaccaaggttct
gctcgggctaataaaatctttatgtttagggcgcagagctgcctccacag
gccaccgggcagcttcacaggctgcaacagctcagcgaataaagtgccta
ctgtgcacacaagaggacttgagttcatatcctcagaacccatgaaaagc
taagtgtaggagtgtgtgtgtctgtaaccctagcactggggcagacacag
gaagctcctttgaactctctggacagttggcctaacttaactgattagct
tctggtttactgaggcatcctgtcaatgatgatggcgatggtgatgatga
tgatggtggtaatggtgatgatgatgat
gaattccggtccaggcaagctgcgtgcatggcttactttgctgcctctta
attctccttctggggatagaatgttgcttacacaggacattccgacaaga
aaatgcagatcaggcacacagaaggctaggggaatcggatttaaaatgct
taaagtcaagaatttgccgcatacgcagaaagctgaatccctgagagcgc
taacatgctagttacaaacttttcatcttaaaaacggactctccctttca
ctggctaataaacatagggtaaaaacaaacaagccatttgaaagcgtgtg
atctgcgggcggcactgataggagctctctcttcttccaaggatactttt
gtacatacaagaacatccagtgtttgtatgcaagcagtggtctagcccac
accaacctgcatcatgcttattttttcctcttcctaagcaatatactgaa
gattgttcctcagtgcccagcatcctccctgttctcttaaccagcaaagg
agctggttgtgtggagtatactcgcccctcagcctggttctctcctgatg
gacatttaagtggtcttcagtctttggctgttactaacaatgggacagta
gccacatctgcaccaaggtctcttaaacacgtccagacccaaatatccta
aattcccaggagatgtgtgacgggctggaaggtgtgtgtgctgtaaactg
tgatatacccacggtccttgatgatggtaatgataacaggcggcttccat
gagctgtttgtgctgtgtggacaaggttctgaatgctgcacctttcttca
gctacaagcagtgaaatacctgtgcgttttcatcagcatttatgttgcta
ttatctgtagaaaggggcatcgtggaaggttgaaggcttagctcatgtta
gagcatctgcttggcatgtgcaagggtctacccaacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_92182244_92182671
seq2: B6Ng01-274H22.b_45_472

seq1  GAATTCCCATTTTAGAGGCAACAGAGCAGGTTCTCTGGGTCAGCCTGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCATTTTAGAGGCAACAGAGCAGGTTCTCTGGGTCAGCCTGGGG  50

seq1  CATTGAAGTGACCTCAGCTCCTGCTGAGTGTATACATACACCAAGGTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAAGTGACCTCAGCTCCTGCTGAGTGTATACATACACCAAGGTTCT  100

seq1  GCTCGGGCTAATAAAATCTTTATGTTTAGGGCGCAGAGCTGCCTCCACAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGGGCTAATAAAATCTTTATGTTTAGGGCGCAGAGCTGCCTCCACAG  150

seq1  GCCACCGGGCAGCTTCACAGGCTGCAACAGCTCAGCGAATAAAGTGCCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCGGGCAGCTTCACAGGCTGCAACAGCTCAGCGAATAAAGTGCCTA  200

seq1  CTGTGCACACAAGAGGACTTGAGTTCATATCCTCAGAACCCATGAAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCACACAAGAGGACTTGAGTTCATATCCTCAGAACCCATGAAAAGC  250

seq1  TAAGTGTAGGAGTGTGTGTGTCTGTAACCCTAGCACTGGGGCAGACACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTAGGAGTGTGTGTGTCTGTAACCCTAGCACTGGGGCAGACACAG  300

seq1  GAAGCTCCTTTGAACTCTCTGGACAGTTGGCCTAACTTAACTGATTAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTCCTTTGAACTCTCTGGACAGTTGGCCTAACTTAACTGATTAGCT  350

seq1  TCTGGTTTACTGAGGCATCCTGTCAATGATGATGGCGATGGTGATGATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTTACTGAGGCATCCTGTCAATGATGATGGCGATGGTGATGATGA  400

seq1  TGATGGTGGTAATGGTGATGATGATGAT  428
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGTGGTAATGGTGATGATGATGAT  428

seq1: chr16_92335759_92336691
seq2: B6Ng01-274H22.g_71_1008 (reverse)

seq1  GTGTTGGGTAGA-CCTTGCACATGCCAAGCAGATGCTCTAACACTGAGCT  49
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTGTTGGGTAGACCCTTGCACATGCCAAGCAGATGCTCTAACA-TGAGCT  49

seq1  AAGCCTTCAACC-TCCACGATG-CCCTTTCTACAGATAATAGCAACATAA  97
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTCAACCTTCCACGATGCCCCTTTCTACAGATAATAGCAACATAA  99

seq1  ATGCTGATGAAAACGCACAGGTATTTCACTGCTTGTAGCTG-AGAAAGGT  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATGCTGATGAAAACGCACAGGTATTTCACTGCTTGTAGCTGAAGAAAGGT  149

seq1  GCAGCATTCAGAACCTTGTCCACACAGCAC-AACAGCTCATGGAAGCCGC  195
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GCAGCATTCAGAACCTTGTCCACACAGCACAAACAGCTCATGGAAGCCGC  199

seq1  CTGTTATCATTACCATCATCAAGGACCGTGGGTATATCACAGTTTACAGC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTATCATTACCATCATCAAGGACCGTGGGTATATCACAGTTTACAGC  249

seq1  ACACACACCTTCCAGCCCGTCACACATCTCCTGGGAATTTAGGATA-TTG  294
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACACACACCTTCCAGCCCGTCACACATCTCCTGGGAATTTAGGATATTTG  299

seq1  GGTCTGGACGTGTTTAAGAGACCTTGGTGCAGATGTGGCTACTGTCCCAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGGACGTGTTTAAGAGACCTTGGTGCAGATGTGGCTACTGTCCCAT  349

seq1  TGTTAGTAACAGCCAAAGACTGAAGACCACTTAAATGTCCATCAGGAGAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGTAACAGCCAAAGACTGAAGACCACTTAAATGTCCATCAGGAGAG  399

seq1  AACCAGGCTGAGGGGCGAGTATACTCCACACAACCAGCTCCTTTGCTGGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGGCTGAGGGGCGAGTATACTCCACACAACCAGCTCCTTTGCTGGT  449

seq1  TAAGAGAACAGGGAGGATGCTGGGCACTGAGGAACAATCTTCAGTATATT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGAACAGGGAGGATGCTGGGCACTGAGGAACAATCTTCAGTATATT  499

seq1  GCTTAGGAAGAGGAAAAAATAAGCATGATGCAGGTTGGTGTGGGCTAGAC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGGAAGAGGAAAAAATAAGCATGATGCAGGTTGGTGTGGGCTAGAC  549

seq1  CACTGCTTGCATACAAACACTGGATGTTCTTGTATGTACAAAAGTATCCT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTTGCATACAAACACTGGATGTTCTTGTATGTACAAAAGTATCCT  599

seq1  TGGAAGAAGAGAGAGCTCCTATCAGTGCCGCCCGCAGATCACACGCTTTC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGAAGAGAGAGCTCCTATCAGTGCCGCCCGCAGATCACACGCTTTC  649

seq1  AAATGGCTTGTTTGTTTTTACCCTATGTTTATTAGCCAGTGAAAGGGAGA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCTTGTTTGTTTTTACCCTATGTTTATTAGCCAGTGAAAGGGAGA  699

seq1  GTCCGTTTTTAAGATGAAAAGTTTGTAACTAGCATGTTAGCGCTCTCAGG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCGTTTTTAAGATGAAAAGTTTGTAACTAGCATGTTAGCGCTCTCAGG  749

seq1  GATTCAGCTTTCTGCGTATGCGGCAAATTCTTGACTTTAAGCATTTTAAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAGCTTTCTGCGTATGCGGCAAATTCTTGACTTTAAGCATTTTAAA  799

seq1  TCCGATTCCCCTAGCCTTCTGTGTGCCTGATCTGCATTTTCTTGTCGGAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGATTCCCCTAGCCTTCTGTGTGCCTGATCTGCATTTTCTTGTCGGAA  849

seq1  TGTCCTGTGTAAGCAACATTCTATCCCCAGAAGGAGAATTAAGAGGCAGC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGTGTAAGCAACATTCTATCCCCAGAAGGAGAATTAAGAGGCAGC  899

seq1  AAAGTAAGCCATGCACGCAGCTTGCCTGGACCGGAATTC  933
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAGCCATGCACGCAGCTTGCCTGGACCGGAATTC  938